MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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38002	NC_014334	AACC	2	8	2334082	2334089	50 %	0 %	0 %	50 %	301067412
38003	NC_014334	ATG	2	6	2334131	2334136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067412
38004	NC_014334	TGG	2	6	2334162	2334167	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067412
38005	NC_014334	GAA	2	6	2334260	2334265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067412
38006	NC_014334	GAA	2	6	2334289	2334294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067412
38007	NC_014334	CAC	2	6	2334312	2334317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067412
38008	NC_014334	AGCA	2	8	2334347	2334354	50 %	0 %	25 %	25 %	301067412
38009	NC_014334	AAC	2	6	2334358	2334363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067412
38010	NC_014334	CAT	2	6	2334423	2334428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067412
38011	NC_014334	AAT	2	6	2334508	2334513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067412
38012	NC_014334	GAAT	2	8	2334582	2334589	50 %	25 %	25 %	0 %	301067412
38013	NC_014334	TCGGA	2	10	2334612	2334621	20 %	20 %	40 %	20 %	301067412
38014	NC_014334	CAA	3	9	2334669	2334677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067412
38015	NC_014334	CAG	3	9	2334712	2334720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067412
38016	NC_014334	AAC	2	6	2334773	2334778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067412
38017	NC_014334	GCA	2	6	2334794	2334799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067412
38018	NC_014334	TCAG	2	8	2334839	2334846	25 %	25 %	25 %	25 %	301067412
38019	NC_014334	CTT	2	6	2334868	2334873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067412
38020	NC_014334	AGTA	2	8	2334989	2334996	50 %	25 %	25 %	0 %	301067412
38021	NC_014334	CAAC	2	8	2335059	2335066	50 %	0 %	0 %	50 %	301067412
38022	NC_014334	TTC	2	6	2335141	2335146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067412
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38024	NC_014334	ATC	2	6	2335201	2335206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067412
38025	NC_014334	AT	3	6	2335312	2335317	50 %	50 %	0 %	0 %	301067413
38026	NC_014334	AAT	2	6	2335336	2335341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067413
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38028	NC_014334	GAA	2	6	2335602	2335607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067414
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38030	NC_014334	CA	3	6	2335636	2335641	50 %	0 %	0 %	50 %	301067414
38031	NC_014334	GCA	2	6	2335655	2335660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067414
38032	NC_014334	GTCCC	2	10	2335671	2335680	0 %	20 %	20 %	60 %	301067414
38033	NC_014334	AGA	2	6	2335700	2335705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067414
38034	NC_014334	ATC	2	6	2335800	2335805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067414
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38036	NC_014334	ATC	2	6	2335896	2335901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067414
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38038	NC_014334	A	6	6	2335939	2335944	100 %	0 %	0 %	0 %	301067414
38039	NC_014334	GTC	2	6	2336031	2336036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067414
38040	NC_014334	TTGATA	2	12	2336080	2336091	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	301067414
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38044	NC_014334	TGG	2	6	2336219	2336224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067414
38045	NC_014334	GGCATC	2	12	2336229	2336240	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	301067414
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38052	NC_014334	GCT	2	6	2336562	2336567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067414
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38054	NC_014334	GCAA	2	8	2336657	2336664	50 %	0 %	25 %	25 %	301067414
38055	NC_014334	TGAT	2	8	2336725	2336732	25 %	50 %	25 %	0 %	301067414
38056	NC_014334	ACTG	2	8	2336762	2336769	25 %	25 %	25 %	25 %	301067414
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38108	NC_014334	T	6	6	2339846	2339851	0 %	100 %	0 %	0 %	301067416
38109	NC_014334	AGGA	2	8	2339901	2339908	50 %	0 %	50 %	0 %	301067416
38110	NC_014334	CCAGT	2	10	2339912	2339921	20 %	20 %	20 %	40 %	301067416
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38116	NC_014334	AAT	2	6	2340161	2340166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067416
38117	NC_014334	ATC	2	6	2340321	2340326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067416
38118	NC_014334	TCA	2	6	2340331	2340336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067416
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38225	NC_014334	TAAA	2	8	2346632	2346639	75 %	25 %	0 %	0 %	301067424
38226	NC_014334	TG	3	6	2346645	2346650	0 %	50 %	50 %	0 %	301067424
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38232	NC_014334	CCGC	2	8	2347033	2347040	0 %	0 %	25 %	75 %	301067424
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38331	NC_014334	GGGT	2	8	2352974	2352981	0 %	25 %	75 %	0 %	301067432
38332	NC_014334	AGA	2	6	2353009	2353014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067432
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38349	NC_014334	CGT	2	6	2353931	2353936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067432
38350	NC_014334	GCA	2	6	2354297	2354302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067433
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38451	NC_014334	GC	3	6	2359298	2359303	0 %	0 %	50 %	50 %	301067438
38452	NC_014334	TTTGC	2	10	2359478	2359487	0 %	60 %	20 %	20 %	301067438
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38455	NC_014334	ATAA	2	8	2359662	2359669	75 %	25 %	0 %	0 %	301067438
38456	NC_014334	TTG	2	6	2359672	2359677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067438
38457	NC_014334	TCC	2	6	2359705	2359710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067438
38458	NC_014334	CT	3	6	2359746	2359751	0 %	50 %	0 %	50 %	301067438
38459	NC_014334	CAG	2	6	2359850	2359855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067438
38460	NC_014334	CAT	2	6	2359862	2359867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067438
38461	NC_014334	GTT	2	6	2359873	2359878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067438
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38463	NC_014334	AT	3	6	2359918	2359923	50 %	50 %	0 %	0 %	301067438
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38490	NC_014334	TGC	2	6	2362261	2362266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067442
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38494	NC_014334	GCAA	2	8	2362397	2362404	50 %	0 %	25 %	25 %	301067442
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