MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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37002	NC_014334	TGA	2	6	2269278	2269283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067340
37003	NC_014334	GCT	2	6	2269305	2269310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067340
37004	NC_014334	TACG	2	8	2269316	2269323	25 %	25 %	25 %	25 %	301067340
37005	NC_014334	CAT	2	6	2269345	2269350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067340
37006	NC_014334	GGCC	2	8	2269435	2269442	0 %	0 %	50 %	50 %	301067340
37007	NC_014334	CAA	2	6	2269448	2269453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067340
37008	NC_014334	CTT	2	6	2269469	2269474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067340
37009	NC_014334	GCT	2	6	2269516	2269521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067340
37010	NC_014334	GCG	3	9	2269554	2269562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067340
37011	NC_014334	TCA	2	6	2269574	2269579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067340
37012	NC_014334	AGC	2	6	2269612	2269617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067340
37013	NC_014334	CTA	2	6	2269621	2269626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067340
37014	NC_014334	GCT	2	6	2269653	2269658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067340
37015	NC_014334	ATAC	2	8	2269764	2269771	50 %	25 %	0 %	25 %	301067340
37016	NC_014334	GGC	2	6	2269780	2269785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067340
37017	NC_014334	TCA	2	6	2269811	2269816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067340
37018	NC_014334	ATT	2	6	2269887	2269892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067340
37019	NC_014334	TGC	2	6	2269901	2269906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067340
37020	NC_014334	CGT	2	6	2270010	2270015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067340
37021	NC_014334	AGG	2	6	2270084	2270089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301067340
37022	NC_014334	ATG	2	6	2270094	2270099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067340
37023	NC_014334	CCA	2	6	2270120	2270125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067341
37024	NC_014334	GCT	2	6	2270126	2270131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067341
37025	NC_014334	ACACC	2	10	2270209	2270218	40 %	0 %	0 %	60 %	301067341
37026	NC_014334	TG	3	6	2270306	2270311	0 %	50 %	50 %	0 %	301067341
37027	NC_014334	A	6	6	2270375	2270380	100 %	0 %	0 %	0 %	301067341
37028	NC_014334	TGC	2	6	2270432	2270437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067341
37029	NC_014334	TAT	2	6	2270481	2270486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067341
37030	NC_014334	GATGCT	2	12	2270508	2270519	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	301067341
37031	NC_014334	TGT	2	6	2270531	2270536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067341
37032	NC_014334	TCA	2	6	2270594	2270599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067341
37033	NC_014334	TGGC	2	8	2270639	2270646	0 %	25 %	50 %	25 %	301067341
37034	NC_014334	GTT	2	6	2270654	2270659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067341
37035	NC_014334	TCA	2	6	2270662	2270667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067341
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37046	NC_014334	TCG	2	6	2271444	2271449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067342
37047	NC_014334	TGC	2	6	2271486	2271491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067342
37048	NC_014334	GAT	2	6	2271611	2271616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067342
37049	NC_014334	TAT	2	6	2271653	2271658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067342
37050	NC_014334	ATCA	2	8	2271728	2271735	50 %	25 %	0 %	25 %	301067342
37051	NC_014334	GGC	2	6	2271793	2271798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067342
37052	NC_014334	ATC	2	6	2271980	2271985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067342
37053	NC_014334	CAG	2	6	2272007	2272012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067342
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37102	NC_014334	CTG	2	6	2274858	2274863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067344
37103	NC_014334	CAT	2	6	2274906	2274911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067344
37104	NC_014334	GAA	2	6	2274961	2274966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067344
37105	NC_014334	GCA	2	6	2274971	2274976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067344
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37107	NC_014334	TTGAT	2	10	2275073	2275082	20 %	60 %	20 %	0 %	301067344
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37109	NC_014334	TCG	2	6	2275166	2275171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067344
37110	NC_014334	GCAT	2	8	2275187	2275194	25 %	25 %	25 %	25 %	301067344
37111	NC_014334	CAC	2	6	2275248	2275253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067344
37112	NC_014334	GCG	2	6	2275380	2275385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067344
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37114	NC_014334	T	6	6	2275458	2275463	0 %	100 %	0 %	0 %	301067344
37115	NC_014334	GCG	2	6	2275476	2275481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067344
37116	NC_014334	AATC	2	8	2275510	2275517	50 %	25 %	0 %	25 %	301067344
37117	NC_014334	TGCT	2	8	2275600	2275607	0 %	50 %	25 %	25 %	301067344
37118	NC_014334	CGC	2	6	2275702	2275707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067344
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37226	NC_014334	TTTCT	2	10	2283852	2283861	0 %	80 %	0 %	20 %	301067350
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37228	NC_014334	T	6	6	2284093	2284098	0 %	100 %	0 %	0 %	301067351
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37461	NC_014334	CGTCA	2	10	2297858	2297867	20 %	20 %	20 %	40 %	301067367
37462	NC_014334	TGGC	2	8	2298005	2298012	0 %	25 %	50 %	25 %	301067367
37463	NC_014334	GAA	2	6	2298155	2298160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067367
37464	NC_014334	CAC	2	6	2298164	2298169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067367
37465	NC_014334	GGC	2	6	2298310	2298315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067367
37466	NC_014334	TTG	2	6	2298375	2298380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067367
37467	NC_014334	TCAAT	2	10	2298457	2298466	40 %	40 %	0 %	20 %	301067367
37468	NC_014334	GTC	2	6	2298498	2298503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067367
37469	NC_014334	CTT	2	6	2298535	2298540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067367
37470	NC_014334	GTA	3	9	2298548	2298556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067367
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37473	NC_014334	GC	3	6	2298826	2298831	0 %	0 %	50 %	50 %	301067367
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37475	NC_014334	CACT	2	8	2298846	2298853	25 %	25 %	0 %	50 %	301067367
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37477	NC_014334	CAGT	2	8	2298996	2299003	25 %	25 %	25 %	25 %	301067367
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37480	NC_014334	GGA	2	6	2299177	2299182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301067367
37481	NC_014334	AGAAA	2	10	2299202	2299211	80 %	0 %	20 %	0 %	301067367
37482	NC_014334	TGAT	2	8	2299344	2299351	25 %	50 %	25 %	0 %	301067367
37483	NC_014334	TCT	2	6	2299392	2299397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067367
37484	NC_014334	GAA	2	6	2299434	2299439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067367
37485	NC_014334	TTTC	2	8	2299465	2299472	0 %	75 %	0 %	25 %	301067367
37486	NC_014334	GCT	2	6	2299502	2299507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067367
37487	NC_014334	TG	3	6	2299618	2299623	0 %	50 %	50 %	0 %	301067367
37488	NC_014334	CTGT	2	8	2299632	2299639	0 %	50 %	25 %	25 %	301067367
37489	NC_014334	T	6	6	2299750	2299755	0 %	100 %	0 %	0 %	301067367
37490	NC_014334	TCATAT	2	12	2299791	2299802	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	301067367
37491	NC_014334	ATTT	2	8	2299832	2299839	25 %	75 %	0 %	0 %	301067367
37492	NC_014334	CAA	2	6	2299888	2299893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067367
37493	NC_014334	CTG	2	6	2299955	2299960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067367
37494	NC_014334	CCG	2	6	2299996	2300001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067367
37495	NC_014334	ACA	2	6	2300028	2300033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067367
37496	NC_014334	TGC	2	6	2300105	2300110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067367
37497	NC_014334	GGAT	2	8	2300186	2300193	25 %	25 %	50 %	0 %	301067367
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37500	NC_014334	CTG	2	6	2300975	2300980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067368

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