MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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36003	NC_014334	GAT	2	6	2209319	2209324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067277
36004	NC_014334	CATG	2	8	2209333	2209340	25 %	25 %	25 %	25 %	301067277
36005	NC_014334	GTT	2	6	2209345	2209350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067277
36006	NC_014334	ATC	2	6	2209361	2209366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067277
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36008	NC_014334	ATC	2	6	2209490	2209495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067277
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36011	NC_014334	TTG	2	6	2209754	2209759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067277
36012	NC_014334	CTG	2	6	2209820	2209825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067277
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36017	NC_014334	GCTT	2	8	2210019	2210026	0 %	50 %	25 %	25 %	301067277
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36019	NC_014334	TGC	2	6	2210073	2210078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067277
36020	NC_014334	GCC	2	6	2210085	2210090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067277
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36051	NC_014334	CATCTA	2	12	2211897	2211908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067279
36052	NC_014334	TGTT	2	8	2211915	2211922	0 %	75 %	25 %	0 %	301067279
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36087	NC_014334	CGA	2	6	2214337	2214342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067282
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36100	NC_014334	GTCCT	2	10	2214985	2214994	0 %	40 %	20 %	40 %	301067283
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36111	NC_014334	A	7	7	2215774	2215780	100 %	0 %	0 %	0 %	301067284
36112	NC_014334	GAT	2	6	2215966	2215971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067284
36113	NC_014334	T	6	6	2216019	2216024	0 %	100 %	0 %	0 %	301067284
36114	NC_014334	TCA	2	6	2216085	2216090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067284
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36116	NC_014334	AGC	2	6	2216215	2216220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067284
36117	NC_014334	ATT	2	6	2216222	2216227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067284
36118	NC_014334	A	6	6	2216339	2216344	100 %	0 %	0 %	0 %	301067284
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36121	NC_014334	GCC	2	6	2216630	2216635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067284
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36123	NC_014334	TGC	2	6	2216691	2216696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067284
36124	NC_014334	CTT	2	6	2216701	2216706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067284
36125	NC_014334	TGT	2	6	2216761	2216766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067284
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36128	NC_014334	GGT	2	6	2216810	2216815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067284
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36216	NC_014334	TCG	2	6	2221537	2221542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067288
36217	NC_014334	GCA	2	6	2221628	2221633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067288
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36219	NC_014334	CAC	2	6	2221674	2221679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067288
36220	NC_014334	TGA	2	6	2221910	2221915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067288
36221	NC_014334	ACGAGC	2	12	2221930	2221941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067288
36222	NC_014334	ATC	2	6	2221942	2221947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067288
36223	NC_014334	CAA	2	6	2221953	2221958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067288
36224	NC_014334	GC	3	6	2222161	2222166	0 %	0 %	50 %	50 %	301067288
36225	NC_014334	TAA	2	6	2222207	2222212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067288
36226	NC_014334	GTGG	2	8	2222220	2222227	0 %	25 %	75 %	0 %	301067288
36227	NC_014334	ACG	2	6	2222290	2222295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067288
36228	NC_014334	CATC	2	8	2222297	2222304	25 %	25 %	0 %	50 %	301067288
36229	NC_014334	TGT	2	6	2222340	2222345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067288
36230	NC_014334	ATC	2	6	2222428	2222433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067288
36231	NC_014334	TCA	3	9	2222438	2222446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067288
36232	NC_014334	CAT	2	6	2222453	2222458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067288
36233	NC_014334	CCA	2	6	2222483	2222488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067288
36234	NC_014334	TGC	2	6	2222688	2222693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067288
36235	NC_014334	T	6	6	2222696	2222701	0 %	100 %	0 %	0 %	301067288
36236	NC_014334	TCT	2	6	2222732	2222737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067288
36237	NC_014334	GCT	2	6	2223034	2223039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067289
36238	NC_014334	AGA	2	6	2223063	2223068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067289
36239	NC_014334	ATTG	2	8	2223069	2223076	25 %	50 %	25 %	0 %	301067289
36240	NC_014334	AGC	2	6	2223144	2223149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067289
36241	NC_014334	CTT	2	6	2223264	2223269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067289
36242	NC_014334	AC	3	6	2223288	2223293	50 %	0 %	0 %	50 %	301067289
36243	NC_014334	TCA	2	6	2223329	2223334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067289
36244	NC_014334	CCCG	2	8	2223400	2223407	0 %	0 %	25 %	75 %	301067289
36245	NC_014334	GCA	3	9	2223454	2223462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067289
36246	NC_014334	TGG	2	6	2223504	2223509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067289
36247	NC_014334	CTT	2	6	2223530	2223535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067289
36248	NC_014334	GTGGC	2	10	2223594	2223603	0 %	20 %	60 %	20 %	301067289
36249	NC_014334	CATC	2	8	2223614	2223621	25 %	25 %	0 %	50 %	301067289
36250	NC_014334	CAG	2	6	2223653	2223658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067289
36251	NC_014334	AGCT	2	8	2223686	2223693	25 %	25 %	25 %	25 %	301067289
36252	NC_014334	CGG	2	6	2223824	2223829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067289
36253	NC_014334	AGC	2	6	2223840	2223845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067289
36254	NC_014334	TAC	2	6	2223904	2223909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067289
36255	NC_014334	ATG	2	6	2223910	2223915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067289
36256	NC_014334	CGG	2	6	2223918	2223923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067289
36257	NC_014334	GCC	2	6	2223952	2223957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067289
36258	NC_014334	GCA	2	6	2224036	2224041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067289
36259	NC_014334	TC	3	6	2224050	2224055	0 %	50 %	0 %	50 %	301067289
36260	NC_014334	CGC	2	6	2224074	2224079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067289
36261	NC_014334	TGC	2	6	2224115	2224120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067289
36262	NC_014334	CAA	2	6	2224127	2224132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067289
36263	NC_014334	CGC	2	6	2224200	2224205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067289
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36270	NC_014334	TAT	2	6	2224622	2224627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067290
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36272	NC_014334	ACT	2	6	2224818	2224823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067290
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36292	NC_014334	CTT	2	6	2226669	2226674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067294
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36294	NC_014334	ATC	2	6	2226790	2226795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067294
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36301	NC_014334	TGA	2	6	2227248	2227253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067294
36302	NC_014334	TGC	2	6	2227309	2227314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067294
36303	NC_014334	CAA	2	6	2227356	2227361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067294
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36307	NC_014334	GCT	2	6	2227614	2227619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067294
36308	NC_014334	ATCGTC	2	12	2227645	2227656	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	301067294
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36312	NC_014334	CGC	3	9	2228163	2228171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067294
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36314	NC_014334	TCA	2	6	2228183	2228188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067294
36315	NC_014334	TG	3	6	2228250	2228255	0 %	50 %	50 %	0 %	301067294
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36317	NC_014334	TGTA	2	8	2228449	2228456	25 %	50 %	25 %	0 %	301067294
36318	NC_014334	T	6	6	2228602	2228607	0 %	100 %	0 %	0 %	301067294
36319	NC_014334	CGA	2	6	2228990	2228995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067295
36320	NC_014334	ATG	2	6	2229003	2229008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067295
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36322	NC_014334	TTC	2	6	2229150	2229155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067295
36323	NC_014334	ATC	2	6	2229174	2229179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067295
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36326	NC_014334	TTTG	2	8	2229247	2229254	0 %	75 %	25 %	0 %	301067295
36327	NC_014334	GCG	2	6	2229274	2229279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067295
36328	NC_014334	CGCTGC	2	12	2229344	2229355	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	301067296
36329	NC_014334	CAA	2	6	2229366	2229371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067296
36330	NC_014334	TG	3	6	2229408	2229413	0 %	50 %	50 %	0 %	301067296
36331	NC_014334	CAT	2	6	2229510	2229515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067296
36332	NC_014334	GGC	2	6	2229516	2229521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067296
36333	NC_014334	GCA	2	6	2229611	2229616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067296
36334	NC_014334	TCAT	2	8	2229680	2229687	25 %	50 %	0 %	25 %	301067296
36335	NC_014334	GCA	2	6	2229692	2229697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067296
36336	NC_014334	ACC	2	6	2229760	2229765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067296
36337	NC_014334	GCT	2	6	2229851	2229856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067296
36338	NC_014334	AAC	2	6	2229878	2229883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067296
36339	NC_014334	CTG	2	6	2229891	2229896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067296
36340	NC_014334	ATG	2	6	2229898	2229903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067296
36341	NC_014334	CAA	2	6	2229948	2229953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067296
36342	NC_014334	ACA	2	6	2229959	2229964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067296
36343	NC_014334	GCC	2	6	2229993	2229998	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067296
36344	NC_014334	CAA	2	6	2230105	2230110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067296
36345	NC_014334	AAT	2	6	2230324	2230329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067297
36346	NC_014334	CTT	2	6	2230407	2230412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067297
36347	NC_014334	GTG	2	6	2230422	2230427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067297
36348	NC_014334	GT	3	6	2230476	2230481	0 %	50 %	50 %	0 %	301067297
36349	NC_014334	AAC	2	6	2230486	2230491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067297
36350	NC_014334	TGAT	2	8	2230498	2230505	25 %	50 %	25 %	0 %	301067297
36351	NC_014334	TCA	2	6	2230509	2230514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067297
36352	NC_014334	CAAC	2	8	2230521	2230528	50 %	0 %	0 %	50 %	301067297
36353	NC_014334	TCT	2	6	2230560	2230565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067297
36354	NC_014334	TTC	4	12	2230588	2230599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067297
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36356	NC_014334	ATG	2	6	2230926	2230931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067298
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36362	NC_014334	TCA	2	6	2231183	2231188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067299
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36366	NC_014334	TAA	2	6	2231607	2231612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067300
36367	NC_014334	GCTT	2	8	2231651	2231658	0 %	50 %	25 %	25 %	301067300
36368	NC_014334	TAT	2	6	2231672	2231677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067300
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36370	NC_014334	CG	3	6	2231727	2231732	0 %	0 %	50 %	50 %	301067300
36371	NC_014334	CAGCG	2	10	2231751	2231760	20 %	0 %	40 %	40 %	301067300
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36374	NC_014334	CGG	2	6	2231885	2231890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067300
36375	NC_014334	AGCC	2	8	2231935	2231942	25 %	0 %	25 %	50 %	301067300
36376	NC_014334	AAGGTG	2	12	2231956	2231967	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	301067300
36377	NC_014334	GGGC	2	8	2231999	2232006	0 %	0 %	75 %	25 %	301067300
36378	NC_014334	CAGCA	2	10	2232015	2232024	40 %	0 %	20 %	40 %	301067300
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36382	NC_014334	ATG	2	6	2232178	2232183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067300
36383	NC_014334	AAT	2	6	2232258	2232263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067300
36384	NC_014334	AAT	2	6	2232302	2232307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067300
36385	NC_014334	GCC	2	6	2232445	2232450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067300
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36388	NC_014334	TGA	2	6	2232571	2232576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067301
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36451	NC_014334	AAGA	2	8	2236174	2236181	75 %	0 %	25 %	0 %	301067304
36452	NC_014334	CGC	2	6	2236342	2236347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067304
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36455	NC_014334	AC	3	6	2236457	2236462	50 %	0 %	0 %	50 %	301067304
36456	NC_014334	GAA	2	6	2236602	2236607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301067304
36457	NC_014334	AAC	2	6	2236765	2236770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067304
36458	NC_014334	TGT	2	6	2236800	2236805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067304
36459	NC_014334	AAGCT	2	10	2236907	2236916	40 %	20 %	20 %	20 %	301067304
36460	NC_014334	ACAA	2	8	2236922	2236929	75 %	0 %	0 %	25 %	301067304
36461	NC_014334	CAT	2	6	2236998	2237003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067304
36462	NC_014334	CTT	2	6	2237025	2237030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067304
36463	NC_014334	TGA	2	6	2237039	2237044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067304
36464	NC_014334	TTA	2	6	2237088	2237093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067304
36465	NC_014334	TTC	2	6	2237119	2237124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067304
36466	NC_014334	TTGA	2	8	2237224	2237231	25 %	50 %	25 %	0 %	301067304
36467	NC_014334	CAAGG	2	10	2237248	2237257	40 %	0 %	40 %	20 %	301067304
36468	NC_014334	CAGC	2	8	2237302	2237309	25 %	0 %	25 %	50 %	301067304
36469	NC_014334	GTG	2	6	2237318	2237323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067304
36470	NC_014334	CTG	3	9	2237327	2237335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067304
36471	NC_014334	GCA	2	6	2237353	2237358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067304
36472	NC_014334	GCT	2	6	2237365	2237370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067304
36473	NC_014334	GCA	2	6	2237377	2237382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067304
36474	NC_014334	TCT	2	6	2237399	2237404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067304
36475	NC_014334	ATG	2	6	2237434	2237439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067304
36476	NC_014334	TAC	2	6	2237464	2237469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067304
36477	NC_014334	CTT	2	6	2237508	2237513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067304
36478	NC_014334	CAT	2	6	2237532	2237537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067304
36479	NC_014334	TCT	2	6	2237618	2237623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067304
36480	NC_014334	GAT	2	6	2237658	2237663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067304
36481	NC_014334	ATC	2	6	2238037	2238042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067305
36482	NC_014334	CAG	2	6	2238103	2238108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067305
36483	NC_014334	CAA	2	6	2238109	2238114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067305
36484	NC_014334	GTC	2	6	2238142	2238147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067305
36485	NC_014334	GACT	2	8	2238179	2238186	25 %	25 %	25 %	25 %	301067305
36486	NC_014334	CAAA	2	8	2238380	2238387	75 %	0 %	0 %	25 %	301067305
36487	NC_014334	GGC	2	6	2238388	2238393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067305
36488	NC_014334	AT	3	6	2238452	2238457	50 %	50 %	0 %	0 %	301067306
36489	NC_014334	ATT	2	6	2238489	2238494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067306
36490	NC_014334	CCT	2	6	2238497	2238502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067306
36491	NC_014334	CCGTTC	2	12	2238516	2238527	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	301067306
36492	NC_014334	CAT	2	6	2238572	2238577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067306
36493	NC_014334	CAC	2	6	2238638	2238643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067306
36494	NC_014334	GGC	2	6	2238651	2238656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067306
36495	NC_014334	GCG	2	6	2238679	2238684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067306
36496	NC_014334	GTCTT	2	10	2238693	2238702	0 %	60 %	20 %	20 %	301067306
36497	NC_014334	TGC	2	6	2238712	2238717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067306
36498	NC_014334	TCA	2	6	2238718	2238723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067306
36499	NC_014334	CGG	2	6	2238770	2238775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067306
36500	NC_014334	CTTT	2	8	2238905	2238912	0 %	75 %	0 %	25 %	301067306

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