MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35004	NC_014334	GCA	2	6	2152848	2152853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067221
35005	NC_014334	CCA	2	6	2152878	2152883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067221
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35007	NC_014334	CAG	2	6	2152984	2152989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067221
35008	NC_014334	TGC	2	6	2153048	2153053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067221
35009	NC_014334	AAC	2	6	2153100	2153105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067221
35010	NC_014334	CAAC	2	8	2153110	2153117	50 %	0 %	0 %	50 %	301067221
35011	NC_014334	GCCAA	2	10	2153184	2153193	40 %	0 %	20 %	40 %	301067221
35012	NC_014334	CAA	2	6	2153204	2153209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067221
35013	NC_014334	TTTG	2	8	2153232	2153239	0 %	75 %	25 %	0 %	301067221
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35019	NC_014334	TCA	2	6	2153772	2153777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067222
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35116	NC_014334	CTG	2	6	2159449	2159454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067229
35117	NC_014334	GGC	2	6	2159481	2159486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067229
35118	NC_014334	GCG	2	6	2159522	2159527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067229
35119	NC_014334	TCA	2	6	2159540	2159545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067229
35120	NC_014334	CATC	2	8	2159580	2159587	25 %	25 %	0 %	50 %	301067229
35121	NC_014334	CTG	2	6	2159589	2159594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067229
35122	NC_014334	CTTG	2	8	2159649	2159656	0 %	50 %	25 %	25 %	301067229
35123	NC_014334	TGC	2	6	2159702	2159707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067229
35124	NC_014334	GCC	2	6	2159745	2159750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301067230
35125	NC_014334	GCT	2	6	2159769	2159774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067230
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35128	NC_014334	CAT	2	6	2159944	2159949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067230
35129	NC_014334	CAT	2	6	2160010	2160015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067230
35130	NC_014334	TGC	2	6	2160044	2160049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067230
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35132	NC_014334	ATC	2	6	2160095	2160100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067230
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35139	NC_014334	TGC	2	6	2160455	2160460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067230
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35145	NC_014334	GCTG	2	8	2160850	2160857	0 %	25 %	50 %	25 %	301067231
35146	NC_014334	TTGG	2	8	2160867	2160874	0 %	50 %	50 %	0 %	301067231
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35152	NC_014334	ATT	2	6	2161083	2161088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067231
35153	NC_014334	GCT	2	6	2161117	2161122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067231
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35169	NC_014334	TGA	2	6	2161696	2161701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067231
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35187	NC_014334	CTG	2	6	2162544	2162549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067232
35188	NC_014334	TTA	2	6	2162749	2162754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301067232
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35200	NC_014334	CAT	2	6	2163167	2163172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067232
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35202	NC_014334	GGCT	2	8	2163229	2163236	0 %	25 %	50 %	25 %	301067232
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35217	NC_014334	A	6	6	2163925	2163930	100 %	0 %	0 %	0 %	301067233
35218	NC_014334	TTTG	2	8	2164084	2164091	0 %	75 %	25 %	0 %	301067233
35219	NC_014334	TTG	2	6	2164161	2164166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067233
35220	NC_014334	TCA	2	6	2164213	2164218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067234
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35222	NC_014334	TATT	2	8	2164613	2164620	25 %	75 %	0 %	0 %	301067236
35223	NC_014334	TTGAC	2	10	2164693	2164702	20 %	40 %	20 %	20 %	301067236
35224	NC_014334	AGT	2	6	2164704	2164709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067236
35225	NC_014334	GTC	2	6	2164815	2164820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067236
35226	NC_014334	CTG	2	6	2164826	2164831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067236
35227	NC_014334	ACC	2	6	2164889	2164894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301067236
35228	NC_014334	ATC	2	6	2164905	2164910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067236
35229	NC_014334	TAA	2	6	2164943	2164948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067236
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35231	NC_014334	CGG	2	6	2164975	2164980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067236
35232	NC_014334	GTG	2	6	2165146	2165151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301067236
35233	NC_014334	AAT	2	6	2165309	2165314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301067237
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35320	NC_014334	CCCG	2	8	2170566	2170573	0 %	0 %	25 %	75 %	301067240
35321	NC_014334	GTC	2	6	2170598	2170603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067240
35322	NC_014334	CTT	2	6	2170716	2170721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301067240
35323	NC_014334	TTG	2	6	2170953	2170958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067240
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35331	NC_014334	TAC	2	6	2171302	2171307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067240
35332	NC_014334	TCC	2	6	2171341	2171346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301067240
35333	NC_014334	ACT	2	6	2171868	2171873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067241
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35335	NC_014334	GC	3	6	2171930	2171935	0 %	0 %	50 %	50 %	301067241
35336	NC_014334	TTGGT	2	10	2171945	2171954	0 %	60 %	40 %	0 %	301067241
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35338	NC_014334	T	6	6	2171974	2171979	0 %	100 %	0 %	0 %	301067241
35339	NC_014334	GGC	2	6	2172028	2172033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301067241
35340	NC_014334	GC	3	6	2172037	2172042	0 %	0 %	50 %	50 %	301067241
35341	NC_014334	ATG	2	6	2172087	2172092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067241
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35343	NC_014334	CG	3	6	2172127	2172132	0 %	0 %	50 %	50 %	301067241
35344	NC_014334	CG	4	8	2172232	2172239	0 %	0 %	50 %	50 %	301067241
35345	NC_014334	TGC	2	6	2172276	2172281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067241
35346	NC_014334	TGT	2	6	2172293	2172298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301067241
35347	NC_014334	ATC	2	6	2172524	2172529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301067241
35348	NC_014334	AC	3	6	2172558	2172563	50 %	0 %	0 %	50 %	301067241
35349	NC_014334	AAC	2	6	2172793	2172798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301067241
35350	NC_014334	GTA	2	6	2172799	2172804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067241
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35352	NC_014334	ATG	2	6	2172935	2172940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067241
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35354	NC_014334	CAGT	2	8	2173014	2173021	25 %	25 %	25 %	25 %	301067241
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35375	NC_014334	A	6	6	2174171	2174176	100 %	0 %	0 %	0 %	301067242
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35378	NC_014334	CTG	3	9	2174786	2174794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301067243
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35454	NC_014334	TGA	2	6	2178377	2178382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301067246
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35460	NC_014334	CAAG	2	8	2178716	2178723	50 %	0 %	25 %	25 %	301067247
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35463	NC_014334	AGC	2	6	2178800	2178805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301067247
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35486	NC_014334	TTTG	2	8	2179569	2179576	0 %	75 %	25 %	0 %	301067247
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