MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30003	NC_014334	CAG	2	6	1850964	1850969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066941
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30005	NC_014334	GGCTTC	2	12	1851046	1851057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066941
30006	NC_014334	CAG	2	6	1851072	1851077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066941
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30011	NC_014334	TGT	2	6	1851248	1851253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066941
30012	NC_014334	CGT	2	6	1851322	1851327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066941
30013	NC_014334	TCG	2	6	1851465	1851470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066941
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30015	NC_014334	CTGA	2	8	1851535	1851542	25 %	25 %	25 %	25 %	301066941
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30018	NC_014334	TGCA	2	8	1851610	1851617	25 %	25 %	25 %	25 %	301066941
30019	NC_014334	CTG	2	6	1851648	1851653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066941
30020	NC_014334	CCAA	2	8	1851684	1851691	50 %	0 %	0 %	50 %	301066941
30021	NC_014334	ATG	2	6	1851694	1851699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066941
30022	NC_014334	GTC	2	6	1851756	1851761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066941
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30025	NC_014334	CGG	2	6	1852291	1852296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066942
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30027	NC_014334	TAC	2	6	1852445	1852450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066942
30028	NC_014334	TGA	2	6	1852456	1852461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066942
30029	NC_014334	A	6	6	1852589	1852594	100 %	0 %	0 %	0 %	301066942
30030	NC_014334	CAG	2	6	1852602	1852607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066942
30031	NC_014334	GGC	2	6	1852637	1852642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066942
30032	NC_014334	ATT	2	6	1852649	1852654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066942
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30035	NC_014334	CAGT	2	8	1852786	1852793	25 %	25 %	25 %	25 %	301066942
30036	NC_014334	TTTA	2	8	1852895	1852902	25 %	75 %	0 %	0 %	301066943
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30039	NC_014334	GC	3	6	1853102	1853107	0 %	0 %	50 %	50 %	301066944
30040	NC_014334	TGC	2	6	1853109	1853114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066944
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30042	NC_014334	T	6	6	1853231	1853236	0 %	100 %	0 %	0 %	301066944
30043	NC_014334	CAT	2	6	1853249	1853254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066944
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30054	NC_014334	TGC	2	6	1854210	1854215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066945
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30099	NC_014334	TCA	2	6	1857203	1857208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066947
30100	NC_014334	CAG	2	6	1857249	1857254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066947
30101	NC_014334	GCAG	2	8	1857262	1857269	25 %	0 %	50 %	25 %	301066947
30102	NC_014334	ATC	3	9	1857278	1857286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066947
30103	NC_014334	CAAG	2	8	1857292	1857299	50 %	0 %	25 %	25 %	301066947
30104	NC_014334	AGC	2	6	1857312	1857317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066947
30105	NC_014334	GCCA	2	8	1857321	1857328	25 %	0 %	25 %	50 %	301066947
30106	NC_014334	ACC	2	6	1857333	1857338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066947
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30108	NC_014334	ACCA	2	8	1857495	1857502	50 %	0 %	0 %	50 %	301066947
30109	NC_014334	ATGGCA	2	12	1857513	1857524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	301066947
30110	NC_014334	GTG	2	6	1857562	1857567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066947
30111	NC_014334	CAG	2	6	1857687	1857692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066947
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30114	NC_014334	TTA	2	6	1858320	1858325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066948
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30116	NC_014334	A	7	7	1858405	1858411	100 %	0 %	0 %	0 %	301066948
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30222	NC_014334	GCA	2	6	1866440	1866445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066954
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30224	NC_014334	GGT	2	6	1866453	1866458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066954
30225	NC_014334	ATG	2	6	1866493	1866498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066954
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30227	NC_014334	CAT	2	6	1866617	1866622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066954
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30229	NC_014334	TCA	2	6	1866667	1866672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066954
30230	NC_014334	GGAAT	2	10	1866693	1866702	40 %	20 %	40 %	0 %	301066954
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30232	NC_014334	TCCTT	2	10	1866933	1866942	0 %	60 %	0 %	40 %	301066955
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30345	NC_014334	TTTC	2	8	1872877	1872884	0 %	75 %	0 %	25 %	301066961
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30349	NC_014334	CTT	2	6	1873035	1873040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066961
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30463	NC_014334	GCTG	2	8	1880300	1880307	0 %	25 %	50 %	25 %	301066967
30464	NC_014334	CTAAAG	2	12	1880489	1880500	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	301066967
30465	NC_014334	GTA	2	6	1880730	1880735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066967
30466	NC_014334	GCAA	2	8	1880743	1880750	50 %	0 %	25 %	25 %	301066967
30467	NC_014334	GTT	2	6	1880792	1880797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066967
30468	NC_014334	CAA	2	6	1880826	1880831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066967
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30470	NC_014334	GAA	2	6	1880898	1880903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066967
30471	NC_014334	CAT	2	6	1881102	1881107	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066967
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30483	NC_014334	ATG	2	6	1882021	1882026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066968
30484	NC_014334	CGA	2	6	1882028	1882033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066968
30485	NC_014334	GTTT	2	8	1882078	1882085	0 %	75 %	25 %	0 %	301066968
30486	NC_014334	T	6	6	1882092	1882097	0 %	100 %	0 %	0 %	301066968
30487	NC_014334	ATA	2	6	1882147	1882152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066968
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30489	NC_014334	AT	3	6	1882478	1882483	50 %	50 %	0 %	0 %	301066969
30490	NC_014334	CAT	2	6	1882538	1882543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066969
30491	NC_014334	ATC	2	6	1882587	1882592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066969
30492	NC_014334	TCT	2	6	1882600	1882605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066969
30493	NC_014334	CTA	2	6	1882712	1882717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066969
30494	NC_014334	GCCT	2	8	1882744	1882751	0 %	25 %	25 %	50 %	301066969
30495	NC_014334	CGT	2	6	1882754	1882759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066969
30496	NC_014334	GTC	2	6	1882776	1882781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066969
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