MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_014334	ATG	2	6	154100	154105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065282
2502	NC_014334	CAA	2	6	154110	154115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065282
2503	NC_014334	A	6	6	154128	154133	100 %	0 %	0 %	0 %	301065282
2504	NC_014334	TG	3	6	154482	154487	0 %	50 %	50 %	0 %	301065283
2505	NC_014334	ATG	2	6	154488	154493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065283
2506	NC_014334	TTG	2	6	154518	154523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065283
2507	NC_014334	CAA	2	6	154541	154546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065283
2508	NC_014334	CAG	2	6	154646	154651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065283
2509	NC_014334	GTT	2	6	154673	154678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065283
2510	NC_014334	GCCA	2	8	154774	154781	25 %	0 %	25 %	50 %	301065283
2511	NC_014334	TCA	2	6	154810	154815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065283
2512	NC_014334	TTG	2	6	154851	154856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065283
2513	NC_014334	AGC	2	6	154994	154999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065284
2514	NC_014334	CAG	2	6	155090	155095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065284
2515	NC_014334	GTTC	2	8	155109	155116	0 %	50 %	25 %	25 %	301065284
2516	NC_014334	GCA	2	6	155264	155269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065284
2517	NC_014334	GTT	2	6	155376	155381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065284
2518	NC_014334	GGC	2	6	155414	155419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065284
2519	NC_014334	GGC	2	6	155498	155503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065284
2520	NC_014334	CTG	2	6	155548	155553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065284
2521	NC_014334	GGC	2	6	155558	155563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065284
2522	NC_014334	TGA	3	9	155620	155628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065284
2523	NC_014334	GCG	2	6	155642	155647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065284
2524	NC_014334	TGC	2	6	155654	155659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065284
2525	NC_014334	TGG	2	6	155681	155686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065284
2526	NC_014334	GCCG	2	8	155711	155718	0 %	0 %	50 %	50 %	301065284
2527	NC_014334	GCC	2	6	155820	155825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065284
2528	NC_014334	TCAG	2	8	155860	155867	25 %	25 %	25 %	25 %	301065284
2529	NC_014334	CAGG	2	8	156061	156068	25 %	0 %	50 %	25 %	301065285
2530	NC_014334	TTGC	2	8	156084	156091	0 %	50 %	25 %	25 %	301065285
2531	NC_014334	CGC	2	6	156120	156125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065285
2532	NC_014334	ACG	2	6	156137	156142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065285
2533	NC_014334	GCA	2	6	156192	156197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065285
2534	NC_014334	ACA	2	6	156218	156223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065285
2535	NC_014334	GTT	2	6	156276	156281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065285
2536	NC_014334	AAGC	2	8	156288	156295	50 %	0 %	25 %	25 %	301065285
2537	NC_014334	CA	3	6	156655	156660	50 %	0 %	0 %	50 %	301065286
2538	NC_014334	ACC	2	6	156745	156750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065286
2539	NC_014334	CAA	2	6	156753	156758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065286
2540	NC_014334	GC	3	6	156765	156770	0 %	0 %	50 %	50 %	301065286
2541	NC_014334	AAAGC	2	10	156772	156781	60 %	0 %	20 %	20 %	301065286
2542	NC_014334	ATC	2	6	156832	156837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065286
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2544	NC_014334	T	6	6	157199	157204	0 %	100 %	0 %	0 %	301065287
2545	NC_014334	AT	3	6	157213	157218	50 %	50 %	0 %	0 %	301065287
2546	NC_014334	TTC	2	6	157373	157378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065287
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2549	NC_014334	CTT	2	6	157579	157584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065287
2550	NC_014334	GGCG	2	8	157639	157646	0 %	0 %	75 %	25 %	301065287
2551	NC_014334	GTT	2	6	157676	157681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065287
2552	NC_014334	ATC	2	6	157754	157759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065287
2553	NC_014334	A	6	6	157778	157783	100 %	0 %	0 %	0 %	301065287
2554	NC_014334	CTG	2	6	157811	157816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065287
2555	NC_014334	CAT	2	6	157822	157827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065287
2556	NC_014334	AGC	2	6	157880	157885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065287
2557	NC_014334	CAT	2	6	157893	157898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065287
2558	NC_014334	GGGAT	2	10	157934	157943	20 %	20 %	60 %	0 %	301065287
2559	NC_014334	TGC	2	6	158203	158208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065287
2560	NC_014334	TGG	2	6	158221	158226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065287
2561	NC_014334	GCTCA	2	10	158269	158278	20 %	20 %	20 %	40 %	301065287
2562	NC_014334	ATG	3	9	158348	158356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065287
2563	NC_014334	CATC	2	8	158415	158422	25 %	25 %	0 %	50 %	301065287
2564	NC_014334	ACA	2	6	158439	158444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065287
2565	NC_014334	AC	3	6	158584	158589	50 %	0 %	0 %	50 %	301065287
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2570	NC_014334	GTG	2	6	158980	158985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065288
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2573	NC_014334	TGGGTA	2	12	159024	159035	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	301065288
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2581	NC_014334	CAAC	2	8	159367	159374	50 %	0 %	0 %	50 %	301065289
2582	NC_014334	TGA	2	6	159516	159521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065289
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2593	NC_014334	TGA	2	6	160145	160150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065290
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2595	NC_014334	CGC	2	6	160224	160229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065290
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2599	NC_014334	TAG	2	6	160395	160400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065290
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2601	NC_014334	AGT	2	6	160445	160450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065290
2602	NC_014334	TCA	2	6	160452	160457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065290
2603	NC_014334	A	6	6	160563	160568	100 %	0 %	0 %	0 %	301065291
2604	NC_014334	CTT	2	6	160598	160603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065291
2605	NC_014334	T	6	6	160641	160646	0 %	100 %	0 %	0 %	301065291
2606	NC_014334	TGC	2	6	160677	160682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065291
2607	NC_014334	AG	3	6	160740	160745	50 %	0 %	50 %	0 %	301065291
2608	NC_014334	ATGA	2	8	160777	160784	50 %	25 %	25 %	0 %	301065291
2609	NC_014334	GCA	2	6	160924	160929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065291
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2612	NC_014334	TAC	2	6	161105	161110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065291
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2618	NC_014334	TGA	2	6	161486	161491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065292
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2620	NC_014334	ACA	2	6	161540	161545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065292
2621	NC_014334	CCAA	2	8	161599	161606	50 %	0 %	0 %	50 %	301065292
2622	NC_014334	ATG	2	6	161684	161689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065292
2623	NC_014334	GAA	2	6	161718	161723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065292
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2988	NC_014334	AAG	2	6	184061	184066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065313
2989	NC_014334	CGG	2	6	184135	184140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065313
2990	NC_014334	GGCA	2	8	184228	184235	25 %	0 %	50 %	25 %	301065313
2991	NC_014334	TGC	2	6	184248	184253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065313
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2993	NC_014334	GGA	2	6	184465	184470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065313
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