MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28003	NC_014334	CTT	2	6	1728658	1728663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066821
28004	NC_014334	TCA	2	6	1728669	1728674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066821
28005	NC_014334	CATT	2	8	1728711	1728718	25 %	50 %	0 %	25 %	301066821
28006	NC_014334	CAT	2	6	1728719	1728724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066821
28007	NC_014334	ATT	2	6	1728734	1728739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066821
28008	NC_014334	CTTTGT	2	12	1728769	1728780	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	301066821
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28011	NC_014334	ATCA	2	8	1728818	1728825	50 %	25 %	0 %	25 %	301066821
28012	NC_014334	ACC	2	6	1728842	1728847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066821
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28021	NC_014334	CAT	2	6	1729087	1729092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066821
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28028	NC_014334	TA	3	6	1729364	1729369	50 %	50 %	0 %	0 %	301066822
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28102	NC_014334	CG	3	6	1733296	1733301	0 %	0 %	50 %	50 %	301066827
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28113	NC_014334	TAAT	2	8	1733806	1733813	50 %	50 %	0 %	0 %	301066827
28114	NC_014334	GCG	2	6	1733923	1733928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066827
28115	NC_014334	T	6	6	1733933	1733938	0 %	100 %	0 %	0 %	301066827
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28117	NC_014334	GCT	2	6	1734274	1734279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066829
28118	NC_014334	AAAC	2	8	1734313	1734320	75 %	0 %	0 %	25 %	301066829
28119	NC_014334	ATA	2	6	1734329	1734334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066829
28120	NC_014334	TCT	2	6	1734354	1734359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066829
28121	NC_014334	TGCA	2	8	1734449	1734456	25 %	25 %	25 %	25 %	301066829
28122	NC_014334	A	6	6	1734491	1734496	100 %	0 %	0 %	0 %	301066829
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28126	NC_014334	GCA	2	6	1734750	1734755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066829
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28128	NC_014334	A	7	7	1734809	1734815	100 %	0 %	0 %	0 %	301066829
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28132	NC_014334	TG	3	6	1734978	1734983	0 %	50 %	50 %	0 %	301066829
28133	NC_014334	CTG	2	6	1734991	1734996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066829
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28144	NC_014334	TAC	2	6	1735505	1735510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066830
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28201	NC_014334	GAT	2	6	1738749	1738754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066833
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28217	NC_014334	ATG	2	6	1739653	1739658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066834
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28220	NC_014334	T	6	6	1739737	1739742	0 %	100 %	0 %	0 %	301066834
28221	NC_014334	AAT	2	6	1739749	1739754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066834
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28223	NC_014334	ATG	3	9	1739896	1739904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066834
28224	NC_014334	ATG	2	6	1739912	1739917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066834
28225	NC_014334	CAA	2	6	1739928	1739933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066834
28226	NC_014334	TGA	2	6	1739940	1739945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066834
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28228	NC_014334	T	6	6	1740280	1740285	0 %	100 %	0 %	0 %	301066835
28229	NC_014334	TGC	2	6	1740325	1740330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066835
28230	NC_014334	CTG	2	6	1740347	1740352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066835
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28234	NC_014334	TTCA	2	8	1740820	1740827	25 %	50 %	0 %	25 %	301066835
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28337	NC_014334	TGC	2	6	1747268	1747273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066842
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28464	NC_014334	ATT	2	6	1754737	1754742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066848
28465	NC_014334	TTG	2	6	1754790	1754795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066848
28466	NC_014334	CTT	2	6	1754899	1754904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066848
28467	NC_014334	GGT	2	6	1754910	1754915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066848
28468	NC_014334	GT	3	6	1754914	1754919	0 %	50 %	50 %	0 %	301066848
28469	NC_014334	CTG	2	6	1754927	1754932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066848
28470	NC_014334	TGGCT	2	10	1754960	1754969	0 %	40 %	40 %	20 %	301066848
28471	NC_014334	CAT	2	6	1755085	1755090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066848
28472	NC_014334	TTG	2	6	1755371	1755376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066848
28473	NC_014334	CAC	2	6	1755406	1755411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066848
28474	NC_014334	TGC	2	6	1755470	1755475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066848
28475	NC_014334	ACA	2	6	1755519	1755524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066848
28476	NC_014334	TGC	2	6	1755532	1755537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066848
28477	NC_014334	GCC	2	6	1755659	1755664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066848
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28480	NC_014334	GGC	2	6	1755767	1755772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066848
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28483	NC_014334	ATC	2	6	1755989	1755994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066848
28484	NC_014334	GAT	2	6	1756009	1756014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066848
28485	NC_014334	A	6	6	1756082	1756087	100 %	0 %	0 %	0 %	301066848
28486	NC_014334	A	6	6	1756127	1756132	100 %	0 %	0 %	0 %	301066848
28487	NC_014334	TCA	2	6	1756138	1756143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066848
28488	NC_014334	TG	3	6	1756191	1756196	0 %	50 %	50 %	0 %	301066848
28489	NC_014334	TCA	2	6	1756198	1756203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066848
28490	NC_014334	CG	3	6	1756421	1756426	0 %	0 %	50 %	50 %	301066849
28491	NC_014334	TTG	2	6	1756986	1756991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066850
28492	NC_014334	T	6	6	1757016	1757021	0 %	100 %	0 %	0 %	301066850
28493	NC_014334	T	6	6	1757055	1757060	0 %	100 %	0 %	0 %	301066850
28494	NC_014334	CCG	3	9	1757090	1757098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066850
28495	NC_014334	AAGTTT	2	12	1757169	1757180	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	301066850
28496	NC_014334	TTG	2	6	1757195	1757200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066850
28497	NC_014334	CCTTG	2	10	1757240	1757249	0 %	40 %	20 %	40 %	301066850
28498	NC_014334	ATGA	2	8	1757515	1757522	50 %	25 %	25 %	0 %	301066850
28499	NC_014334	ATTCG	2	10	1757882	1757891	20 %	40 %	20 %	20 %	301066851
28500	NC_014334	TGT	2	6	1757972	1757977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066851

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