MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_014334	TCA	2	6	1669386	1669391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066763
27003	NC_014334	GAA	3	9	1669397	1669405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066763
27004	NC_014334	AGAAT	2	10	1669435	1669444	60 %	20 %	20 %	0 %	301066763
27005	NC_014334	CCA	2	6	1669463	1669468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066763
27006	NC_014334	CAC	3	9	1669534	1669542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066763
27007	NC_014334	CTTG	2	8	1669583	1669590	0 %	50 %	25 %	25 %	301066763
27008	NC_014334	CGA	2	6	1669626	1669631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066763
27009	NC_014334	CAA	2	6	1669733	1669738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066763
27010	NC_014334	CAA	2	6	1669748	1669753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066763
27011	NC_014334	TCAGCG	2	12	1669783	1669794	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	301066763
27012	NC_014334	TGA	2	6	1669852	1669857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066763
27013	NC_014334	GAT	2	6	1669897	1669902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066763
27014	NC_014334	CA	3	6	1669947	1669952	50 %	0 %	0 %	50 %	301066763
27015	NC_014334	TAG	2	6	1669955	1669960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066763
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27018	NC_014334	CAT	2	6	1670054	1670059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066763
27019	NC_014334	CAA	2	6	1670078	1670083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066763
27020	NC_014334	AAG	2	6	1670115	1670120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066763
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27116	NC_014334	GAA	2	6	1677473	1677478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066771
27117	NC_014334	CAT	2	6	1677494	1677499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066771
27118	NC_014334	TA	3	6	1677537	1677542	50 %	50 %	0 %	0 %	301066771
27119	NC_014334	TGA	2	6	1677605	1677610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066771
27120	NC_014334	CAA	2	6	1677682	1677687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066771
27121	NC_014334	TAGC	2	8	1677745	1677752	25 %	25 %	25 %	25 %	301066771
27122	NC_014334	TCA	2	6	1678151	1678156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066772
27123	NC_014334	TAACG	2	10	1678301	1678310	40 %	20 %	20 %	20 %	301066772
27124	NC_014334	CG	3	6	1678356	1678361	0 %	0 %	50 %	50 %	301066772
27125	NC_014334	TGC	2	6	1678402	1678407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066772
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27221	NC_014334	TGA	2	6	1684439	1684444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066778
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27225	NC_014334	TCA	2	6	1684843	1684848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066779
27226	NC_014334	TGA	2	6	1684855	1684860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066779
27227	NC_014334	TTG	2	6	1684863	1684868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066779
27228	NC_014334	TCA	2	6	1684936	1684941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066779
27229	NC_014334	ATC	2	6	1684959	1684964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066779
27230	NC_014334	T	7	7	1684966	1684972	0 %	100 %	0 %	0 %	301066779
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27463	NC_014334	ATTG	2	8	1698123	1698130	25 %	50 %	25 %	0 %	301066791
27464	NC_014334	AGC	2	6	1698133	1698138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066791
27465	NC_014334	CAT	3	9	1698173	1698181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066791
27466	NC_014334	T	6	6	1698224	1698229	0 %	100 %	0 %	0 %	301066791
27467	NC_014334	CGG	2	6	1698230	1698235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066791
27468	NC_014334	GAT	2	6	1698264	1698269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066791
27469	NC_014334	CCA	2	6	1698271	1698276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066791
27470	NC_014334	CAG	2	6	1698293	1698298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066791
27471	NC_014334	GCA	2	6	1698412	1698417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066791
27472	NC_014334	TGT	2	6	1698431	1698436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066791
27473	NC_014334	CAT	2	6	1698623	1698628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066791
27474	NC_014334	AGC	2	6	1698654	1698659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066791
27475	NC_014334	GCT	2	6	1698760	1698765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066791
27476	NC_014334	GGC	2	6	1698843	1698848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066791
27477	NC_014334	ATC	2	6	1698924	1698929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066791
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27481	NC_014334	CTT	2	6	1699172	1699177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066792
27482	NC_014334	TTC	2	6	1699186	1699191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066792
27483	NC_014334	GTA	2	6	1699397	1699402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066792
27484	NC_014334	TGA	2	6	1699418	1699423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066792
27485	NC_014334	T	7	7	1699424	1699430	0 %	100 %	0 %	0 %	301066792
27486	NC_014334	GAT	2	6	1699458	1699463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066792
27487	NC_014334	GCC	2	6	1699528	1699533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066792
27488	NC_014334	TTA	2	6	1699537	1699542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066792
27489	NC_014334	GC	3	6	1699581	1699586	0 %	0 %	50 %	50 %	301066792
27490	NC_014334	TGAT	2	8	1699614	1699621	25 %	50 %	25 %	0 %	301066792
27491	NC_014334	GCG	2	6	1699633	1699638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066792
27492	NC_014334	CGA	2	6	1699731	1699736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066793
27493	NC_014334	TAC	2	6	1699873	1699878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066793
27494	NC_014334	GTT	2	6	1699884	1699889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066793
27495	NC_014334	AAC	2	6	1699923	1699928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066793
27496	NC_014334	CTG	2	6	1700045	1700050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066793
27497	NC_014334	TCA	2	6	1700104	1700109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066793
27498	NC_014334	CAG	2	6	1700156	1700161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066793
27499	NC_014334	CAG	2	6	1700227	1700232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066793
27500	NC_014334	ATG	2	6	1700297	1700302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066793

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