MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26502	NC_014334	CGG	2	6	1639164	1639169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066729
26503	NC_014334	CAA	2	6	1639170	1639175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066729
26504	NC_014334	CTT	2	6	1639205	1639210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066729
26505	NC_014334	GTC	2	6	1639236	1639241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066729
26506	NC_014334	GGT	2	6	1639264	1639269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066729
26507	NC_014334	GCC	2	6	1639339	1639344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066729
26508	NC_014334	ACA	2	6	1639349	1639354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066729
26509	NC_014334	AACAG	2	10	1639402	1639411	60 %	0 %	20 %	20 %	301066729
26510	NC_014334	ACC	2	6	1639425	1639430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066729
26511	NC_014334	TGAT	2	8	1639503	1639510	25 %	50 %	25 %	0 %	301066729
26512	NC_014334	TTC	2	6	1639625	1639630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066730
26513	NC_014334	ACA	2	6	1639650	1639655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066730
26514	NC_014334	CGA	2	6	1639704	1639709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066730
26515	NC_014334	CTT	4	12	1639723	1639734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066730
26516	NC_014334	AGT	2	6	1639798	1639803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066730
26517	NC_014334	TAA	2	6	1639808	1639813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066730
26518	NC_014334	AATC	2	8	1639900	1639907	50 %	25 %	0 %	25 %	301066730
26519	NC_014334	GC	3	6	1639970	1639975	0 %	0 %	50 %	50 %	301066731
26520	NC_014334	CAATT	2	10	1640003	1640012	40 %	40 %	0 %	20 %	301066731
26521	NC_014334	CTT	2	6	1640020	1640025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066731
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26525	NC_014334	ACA	2	6	1640217	1640222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066731
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26529	NC_014334	ATCA	2	8	1640616	1640623	50 %	25 %	0 %	25 %	301066732
26530	NC_014334	CCAC	2	8	1640633	1640640	25 %	0 %	0 %	75 %	301066732
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26538	NC_014334	GCT	2	6	1641001	1641006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066732
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26542	NC_014334	GAT	2	6	1641198	1641203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066733
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26545	NC_014334	GAT	2	6	1641244	1641249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066733
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26549	NC_014334	ACGC	2	8	1641625	1641632	25 %	0 %	25 %	50 %	301066734
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26551	NC_014334	TGG	2	6	1641791	1641796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066734
26552	NC_014334	ATC	2	6	1641830	1641835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066734
26553	NC_014334	TTCA	2	8	1641956	1641963	25 %	50 %	0 %	25 %	301066734
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26555	NC_014334	ATGA	2	8	1642049	1642056	50 %	25 %	25 %	0 %	301066734
26556	NC_014334	ATCA	2	8	1642067	1642074	50 %	25 %	0 %	25 %	301066734
26557	NC_014334	CAT	2	6	1642084	1642089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066734
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26562	NC_014334	CTG	3	9	1642340	1642348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066734
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26604	NC_014334	CG	3	6	1645352	1645357	0 %	0 %	50 %	50 %	301066737
26605	NC_014334	TTTG	2	8	1645369	1645376	0 %	75 %	25 %	0 %	301066737
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26733	NC_014334	AGC	2	6	1652942	1652947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066747
26734	NC_014334	GCT	2	6	1652961	1652966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066747
26735	NC_014334	CAT	2	6	1652995	1653000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066747
26736	NC_014334	CTT	2	6	1653086	1653091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066747
26737	NC_014334	CT	3	6	1653408	1653413	0 %	50 %	0 %	50 %	301066748
26738	NC_014334	GAT	2	6	1653418	1653423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066748
26739	NC_014334	TTG	2	6	1653427	1653432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066748
26740	NC_014334	CT	3	6	1653503	1653508	0 %	50 %	0 %	50 %	301066748
26741	NC_014334	AG	3	6	1653606	1653611	50 %	0 %	50 %	0 %	301066748
26742	NC_014334	TCCG	2	8	1653639	1653646	0 %	25 %	25 %	50 %	301066748
26743	NC_014334	CAT	2	6	1653674	1653679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066748
26744	NC_014334	CCG	2	6	1653750	1653755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066749
26745	NC_014334	CTT	2	6	1653763	1653768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066749
26746	NC_014334	A	6	6	1653774	1653779	100 %	0 %	0 %	0 %	301066749
26747	NC_014334	ATG	2	6	1653792	1653797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066749
26748	NC_014334	T	6	6	1653895	1653900	0 %	100 %	0 %	0 %	301066749
26749	NC_014334	ATG	2	6	1653921	1653926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066749
26750	NC_014334	TCG	2	6	1653936	1653941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066749
26751	NC_014334	ATC	2	6	1653974	1653979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066749
26752	NC_014334	GC	3	6	1653994	1653999	0 %	0 %	50 %	50 %	301066749
26753	NC_014334	GTT	2	6	1654031	1654036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066749
26754	NC_014334	TTTCA	2	10	1654049	1654058	20 %	60 %	0 %	20 %	301066749
26755	NC_014334	TGA	2	6	1654182	1654187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066749
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26759	NC_014334	TCA	2	6	1654254	1654259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066749
26760	NC_014334	CCT	2	6	1654339	1654344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301066749
26761	NC_014334	TCAA	2	8	1654386	1654393	50 %	25 %	0 %	25 %	301066749
26762	NC_014334	CCA	2	6	1654405	1654410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066749
26763	NC_014334	TTCG	2	8	1654462	1654469	0 %	50 %	25 %	25 %	301066749
26764	NC_014334	CAT	2	6	1654510	1654515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066749
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26768	NC_014334	GCT	2	6	1654703	1654708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066750
26769	NC_014334	TTTTC	2	10	1654737	1654746	0 %	80 %	0 %	20 %	301066750
26770	NC_014334	CTT	2	6	1654758	1654763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066750
26771	NC_014334	AGC	2	6	1654867	1654872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066750
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26775	NC_014334	GCT	2	6	1655013	1655018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066750
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26782	NC_014334	GTC	2	6	1655165	1655170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066750
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26792	NC_014334	CAG	2	6	1655797	1655802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066750
26793	NC_014334	CCTG	2	8	1655966	1655973	0 %	25 %	25 %	50 %	301066750
26794	NC_014334	TGCA	2	8	1655996	1656003	25 %	25 %	25 %	25 %	301066750
26795	NC_014334	CTT	2	6	1656083	1656088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066751
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26800	NC_014334	TCT	2	6	1656352	1656357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066751
26801	NC_014334	TTC	2	6	1656368	1656373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066751
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26804	NC_014334	ATT	2	6	1656668	1656673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066752
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26806	NC_014334	TGC	2	6	1656695	1656700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066752
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26810	NC_014334	CTGG	2	8	1656970	1656977	0 %	25 %	50 %	25 %	301066752
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26813	NC_014334	GC	3	6	1657058	1657063	0 %	0 %	50 %	50 %	301066752
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26824	NC_014334	AATC	2	8	1657690	1657697	50 %	25 %	0 %	25 %	301066753
26825	NC_014334	CCGA	2	8	1657702	1657709	25 %	0 %	25 %	50 %	301066753
26826	NC_014334	AACGT	2	10	1657757	1657766	40 %	20 %	20 %	20 %	301066753
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26830	NC_014334	TCT	2	6	1658172	1658177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066754
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26832	NC_014334	GTGA	2	8	1658356	1658363	25 %	25 %	50 %	0 %	301066754
26833	NC_014334	GCC	2	6	1658380	1658385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066754
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26835	NC_014334	AGTT	2	8	1658563	1658570	25 %	50 %	25 %	0 %	301066754
26836	NC_014334	GCC	2	6	1658581	1658586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066754
26837	NC_014334	CCT	2	6	1658674	1658679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301066754
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26839	NC_014334	AAT	2	6	1658786	1658791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066754
26840	NC_014334	TCA	2	6	1658799	1658804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066754
26841	NC_014334	CAA	2	6	1658912	1658917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066754
26842	NC_014334	ACA	2	6	1658922	1658927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066754
26843	NC_014334	GCT	2	6	1659088	1659093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066754
26844	NC_014334	TCT	2	6	1659369	1659374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066754
26845	NC_014334	TCA	2	6	1659411	1659416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066754
26846	NC_014334	TAA	2	6	1659500	1659505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066754
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26848	NC_014334	TTC	2	6	1659662	1659667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066754
26849	NC_014334	ACC	2	6	1659827	1659832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066754
26850	NC_014334	T	7	7	1659835	1659841	0 %	100 %	0 %	0 %	301066754
26851	NC_014334	ATTCAT	2	12	1659851	1659862	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	301066754
26852	NC_014334	ATTG	2	8	1660066	1660073	25 %	50 %	25 %	0 %	301066754
26853	NC_014334	T	6	6	1660090	1660095	0 %	100 %	0 %	0 %	301066754
26854	NC_014334	AAT	2	6	1660157	1660162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066754
26855	NC_014334	GTC	2	6	1660263	1660268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066754
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26947	NC_014334	T	6	6	1665815	1665820	0 %	100 %	0 %	0 %	301066758
26948	NC_014334	GC	3	6	1665883	1665888	0 %	0 %	50 %	50 %	301066758
26949	NC_014334	CTG	2	6	1665912	1665917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066758
26950	NC_014334	CAT	2	6	1665977	1665982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066758
26951	NC_014334	CAA	3	9	1665997	1666005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066758
26952	NC_014334	TGC	2	6	1666019	1666024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066758
26953	NC_014334	CAC	2	6	1666033	1666038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066758
26954	NC_014334	GAT	2	6	1666087	1666092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066758
26955	NC_014334	GAT	2	6	1666102	1666107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066758
26956	NC_014334	CAA	2	6	1666117	1666122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066758
26957	NC_014334	TCA	2	6	1666149	1666154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066758
26958	NC_014334	CAA	2	6	1666318	1666323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066758
26959	NC_014334	CAC	2	6	1666327	1666332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066758
26960	NC_014334	TTGT	2	8	1666342	1666349	0 %	75 %	25 %	0 %	301066758
26961	NC_014334	GCAA	2	8	1666374	1666381	50 %	0 %	25 %	25 %	301066758
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26963	NC_014334	AC	3	6	1666552	1666557	50 %	0 %	0 %	50 %	301066759
26964	NC_014334	AAC	2	6	1666689	1666694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066759
26965	NC_014334	T	7	7	1666696	1666702	0 %	100 %	0 %	0 %	301066759
26966	NC_014334	TGC	2	6	1666730	1666735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066759
26967	NC_014334	AAG	2	6	1667028	1667033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066760
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26989	NC_014334	AGT	2	6	1668528	1668533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066762
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26991	NC_014334	GTG	2	6	1668605	1668610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066762
26992	NC_014334	CAT	2	6	1668644	1668649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066762
26993	NC_014334	TTG	2	6	1668650	1668655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066762
26994	NC_014334	CGC	2	6	1668717	1668722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066762
26995	NC_014334	ACC	2	6	1668862	1668867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066762
26996	NC_014334	CGCAT	2	10	1669158	1669167	20 %	20 %	20 %	40 %	301066763
26997	NC_014334	CAA	2	6	1669231	1669236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066763
26998	NC_014334	AAC	2	6	1669289	1669294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066763
26999	NC_014334	AGC	2	6	1669302	1669307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066763
27000	NC_014334	AAC	2	6	1669308	1669313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066763

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