MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_014334	CAT	2	6	1524094	1524099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066617
24502	NC_014334	TGG	2	6	1524118	1524123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066617
24503	NC_014334	CAA	2	6	1524197	1524202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066617
24504	NC_014334	GTTA	2	8	1524315	1524322	25 %	50 %	25 %	0 %	301066618
24505	NC_014334	ATC	2	6	1524362	1524367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066618
24506	NC_014334	ACC	2	6	1524542	1524547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066618
24507	NC_014334	TTC	2	6	1524611	1524616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066618
24508	NC_014334	GGTT	2	8	1524620	1524627	0 %	50 %	50 %	0 %	301066618
24509	NC_014334	CTT	2	6	1524655	1524660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066618
24510	NC_014334	ATG	2	6	1524756	1524761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066618
24511	NC_014334	TGA	2	6	1524819	1524824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066618
24512	NC_014334	ATA	2	6	1524825	1524830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066618
24513	NC_014334	GCCA	2	8	1524869	1524876	25 %	0 %	25 %	50 %	301066618
24514	NC_014334	TGA	3	9	1524907	1524915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066618
24515	NC_014334	CTT	2	6	1524922	1524927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066618
24516	NC_014334	CCTT	2	8	1524936	1524943	0 %	50 %	0 %	50 %	301066618
24517	NC_014334	TGGT	2	8	1524975	1524982	0 %	50 %	50 %	0 %	301066618
24518	NC_014334	TTC	3	9	1524992	1525000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066618
24519	NC_014334	TTC	2	6	1525019	1525024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066618
24520	NC_014334	CAG	2	6	1525027	1525032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066618
24521	NC_014334	CG	3	6	1525035	1525040	0 %	0 %	50 %	50 %	301066618
24522	NC_014334	ACA	2	6	1525059	1525064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066618
24523	NC_014334	CCG	2	6	1525139	1525144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066618
24524	NC_014334	TTG	2	6	1525223	1525228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066618
24525	NC_014334	ACCCTT	2	12	1525250	1525261	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	301066618
24526	NC_014334	CAA	2	6	1525352	1525357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066618
24527	NC_014334	CGC	2	6	1525408	1525413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066618
24528	NC_014334	GAT	2	6	1525505	1525510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066618
24529	NC_014334	CTGC	2	8	1525522	1525529	0 %	25 %	25 %	50 %	301066618
24530	NC_014334	ATG	2	6	1525532	1525537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066618
24531	NC_014334	CAT	2	6	1525567	1525572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066618
24532	NC_014334	ACC	2	6	1525581	1525586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066618
24533	NC_014334	CAA	2	6	1525591	1525596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066618
24534	NC_014334	CAC	2	6	1525612	1525617	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066618
24535	NC_014334	CCG	2	6	1525719	1525724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066618
24536	NC_014334	TG	4	8	1525743	1525750	0 %	50 %	50 %	0 %	301066618
24537	NC_014334	AAC	2	6	1525805	1525810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066618
24538	NC_014334	GGC	2	6	1525812	1525817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066618
24539	NC_014334	TCT	2	6	1525848	1525853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066618
24540	NC_014334	CAA	2	6	1525925	1525930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066618
24541	NC_014334	TTTGGT	2	12	1525954	1525965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066618
24542	NC_014334	CTT	2	6	1525991	1525996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066618
24543	NC_014334	CTT	2	6	1526108	1526113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066618
24544	NC_014334	TTG	2	6	1526123	1526128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066618
24545	NC_014334	TTC	2	6	1526139	1526144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066618
24546	NC_014334	TTG	2	6	1526145	1526150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066618
24547	NC_014334	GTT	2	6	1526156	1526161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066618
24548	NC_014334	TGC	2	6	1526194	1526199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066618
24549	NC_014334	TGC	2	6	1526273	1526278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066618
24550	NC_014334	GCT	2	6	1526280	1526285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066618
24551	NC_014334	GTT	2	6	1526319	1526324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066618
24552	NC_014334	GCTG	2	8	1526328	1526335	0 %	25 %	50 %	25 %	301066618
24553	NC_014334	TCCG	2	8	1526352	1526359	0 %	25 %	25 %	50 %	301066618
24554	NC_014334	GCT	2	6	1526419	1526424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066618
24555	NC_014334	TGCC	2	8	1526461	1526468	0 %	25 %	25 %	50 %	301066618
24556	NC_014334	CGA	2	6	1526547	1526552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066618
24557	NC_014334	CGTT	2	8	1526571	1526578	0 %	50 %	25 %	25 %	301066618
24558	NC_014334	ATT	2	6	1526585	1526590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066618
24559	NC_014334	GTT	2	6	1526624	1526629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066618
24560	NC_014334	ATT	2	6	1526630	1526635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066618
24561	NC_014334	GTT	2	6	1526636	1526641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066618
24562	NC_014334	GCC	2	6	1526693	1526698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066618
24563	NC_014334	TG	3	6	1526730	1526735	0 %	50 %	50 %	0 %	301066618
24564	NC_014334	TTG	2	6	1526752	1526757	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066618
24565	NC_014334	GAT	2	6	1526768	1526773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066618
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24567	NC_014334	T	7	7	1526838	1526844	0 %	100 %	0 %	0 %	301066618
24568	NC_014334	CAG	2	6	1526854	1526859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066618
24569	NC_014334	CTT	2	6	1526900	1526905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066618
24570	NC_014334	AGC	2	6	1526906	1526911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066618
24571	NC_014334	TG	3	6	1526917	1526922	0 %	50 %	50 %	0 %	301066618
24572	NC_014334	GCT	2	6	1526940	1526945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066618
24573	NC_014334	GCC	2	6	1526961	1526966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066618
24574	NC_014334	TGA	2	6	1526969	1526974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066618
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24576	NC_014334	GATC	2	8	1527034	1527041	25 %	25 %	25 %	25 %	301066618
24577	NC_014334	T	6	6	1527054	1527059	0 %	100 %	0 %	0 %	301066618
24578	NC_014334	TTC	2	6	1527075	1527080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066618
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24580	NC_014334	T	6	6	1527140	1527145	0 %	100 %	0 %	0 %	301066618
24581	NC_014334	AGC	2	6	1527179	1527184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066619
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24585	NC_014334	CTT	2	6	1527319	1527324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066619
24586	NC_014334	CAT	2	6	1527342	1527347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066619
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24588	NC_014334	TGA	2	6	1527505	1527510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066620
24589	NC_014334	TCA	2	6	1527529	1527534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066620
24590	NC_014334	GGTT	2	8	1527540	1527547	0 %	50 %	50 %	0 %	301066620
24591	NC_014334	TGC	2	6	1527564	1527569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066620
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24593	NC_014334	TGC	2	6	1527591	1527596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066620
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24597	NC_014334	T	6	6	1527705	1527710	0 %	100 %	0 %	0 %	301066620
24598	NC_014334	CAT	2	6	1527714	1527719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066620
24599	NC_014334	CCT	2	6	1527774	1527779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301066621
24600	NC_014334	GAT	2	6	1527793	1527798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066621
24601	NC_014334	CGT	2	6	1527862	1527867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066621
24602	NC_014334	CAT	2	6	1527871	1527876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066621
24603	NC_014334	CTG	2	6	1527877	1527882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066621
24604	NC_014334	TGC	2	6	1527920	1527925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066621
24605	NC_014334	CAG	2	6	1527946	1527951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066621
24606	NC_014334	TCA	4	12	1527978	1527989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066621
24607	NC_014334	GCA	2	6	1528044	1528049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066621
24608	NC_014334	TCA	2	6	1528134	1528139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066621
24609	NC_014334	TTGAA	2	10	1528140	1528149	40 %	40 %	20 %	0 %	301066621
24610	NC_014334	TCC	2	6	1528203	1528208	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301066621
24611	NC_014334	ACG	2	6	1528248	1528253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066621
24612	NC_014334	CG	3	6	1528261	1528266	0 %	0 %	50 %	50 %	301066621
24613	NC_014334	CAC	2	6	1528267	1528272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066621
24614	NC_014334	AAC	2	6	1528410	1528415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066621
24615	NC_014334	GAA	2	6	1528618	1528623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066621
24616	NC_014334	ATA	2	6	1528689	1528694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066621
24617	NC_014334	ATTTG	2	10	1528750	1528759	20 %	60 %	20 %	0 %	301066621
24618	NC_014334	CTT	2	6	1528795	1528800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066621
24619	NC_014334	CTTC	2	8	1528843	1528850	0 %	50 %	0 %	50 %	301066621
24620	NC_014334	T	6	6	1528973	1528978	0 %	100 %	0 %	0 %	301066621
24621	NC_014334	CTT	2	6	1529181	1529186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066622
24622	NC_014334	TGC	2	6	1529302	1529307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066622
24623	NC_014334	CA	3	6	1529364	1529369	50 %	0 %	0 %	50 %	301066622
24624	NC_014334	GCC	2	6	1529385	1529390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066622
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24627	NC_014334	CGC	2	6	1529423	1529428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066622
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24629	NC_014334	ATG	2	6	1529463	1529468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066622
24630	NC_014334	GTC	2	6	1529469	1529474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066622
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24679	NC_014334	GATC	2	8	1532737	1532744	25 %	25 %	25 %	25 %	301066623
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24686	NC_014334	TTG	2	6	1533437	1533442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066623
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24707	NC_014334	ACCG	2	8	1534319	1534326	25 %	0 %	25 %	50 %	301066624
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24715	NC_014334	CAA	2	6	1534985	1534990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066624
24716	NC_014334	CAC	2	6	1535023	1535028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066624
24717	NC_014334	TTTCT	2	10	1535084	1535093	0 %	80 %	0 %	20 %	301066624
24718	NC_014334	TTC	2	6	1535168	1535173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066624
24719	NC_014334	ACC	2	6	1535300	1535305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066624
24720	NC_014334	CCG	2	6	1535313	1535318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066624
24721	NC_014334	GAT	2	6	1535324	1535329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066624
24722	NC_014334	ATG	2	6	1535442	1535447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066624
24723	NC_014334	TCA	2	6	1535487	1535492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066624
24724	NC_014334	ACA	2	6	1535515	1535520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066624
24725	NC_014334	TTC	2	6	1535576	1535581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066624
24726	NC_014334	TTC	2	6	1535619	1535624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066624
24727	NC_014334	TAAA	2	8	1535629	1535636	75 %	25 %	0 %	0 %	301066624
24728	NC_014334	TTC	2	6	1535666	1535671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066624
24729	NC_014334	CATTTT	2	12	1535699	1535710	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	301066624
24730	NC_014334	AAT	2	6	1535741	1535746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066624
24731	NC_014334	CAT	2	6	1535834	1535839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066624
24732	NC_014334	CTT	2	6	1535872	1535877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066624
24733	NC_014334	AAT	2	6	1536050	1536055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066625
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24835	NC_014334	TAAT	2	8	1541771	1541778	50 %	50 %	0 %	0 %	301066631
24836	NC_014334	TGT	2	6	1541792	1541797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066631
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24843	NC_014334	CTT	2	6	1542150	1542155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066631
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24845	NC_014334	CTTC	2	8	1542167	1542174	0 %	50 %	0 %	50 %	301066631
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24848	NC_014334	ACC	2	6	1542270	1542275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066631
24849	NC_014334	CAAC	2	8	1542276	1542283	50 %	0 %	0 %	50 %	301066631
24850	NC_014334	CTT	2	6	1542317	1542322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066631
24851	NC_014334	AAG	2	6	1542364	1542369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066631
24852	NC_014334	ACC	2	6	1542372	1542377	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066631
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24854	NC_014334	CGT	2	6	1542410	1542415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066631
24855	NC_014334	ATC	2	6	1542418	1542423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066631
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24861	NC_014334	GTG	2	6	1542744	1542749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066632
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24884	NC_014334	CAT	2	6	1544202	1544207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066635
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24963	NC_014334	CGA	2	6	1548374	1548379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066638
24964	NC_014334	TCT	2	6	1548520	1548525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066638
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24973	NC_014334	GCT	2	6	1548869	1548874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066639
24974	NC_014334	TAAT	2	8	1548921	1548928	50 %	50 %	0 %	0 %	301066639
24975	NC_014334	GCAT	2	8	1548986	1548993	25 %	25 %	25 %	25 %	301066639
24976	NC_014334	CTGAG	2	10	1548996	1549005	20 %	20 %	40 %	20 %	301066639
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24983	NC_014334	AGCC	2	8	1549212	1549219	25 %	0 %	25 %	50 %	301066639
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24985	NC_014334	TGT	2	6	1549277	1549282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066639
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24992	NC_014334	TCG	2	6	1549638	1549643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066639
24993	NC_014334	GCC	2	6	1549807	1549812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066639
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24995	NC_014334	TGA	2	6	1549824	1549829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066639
24996	NC_014334	ATCA	2	8	1549876	1549883	50 %	25 %	0 %	25 %	301066639
24997	NC_014334	GCC	2	6	1550024	1550029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066639
24998	NC_014334	AAT	2	6	1550087	1550092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066639
24999	NC_014334	CAA	2	6	1550109	1550114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066639
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