MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_014334	CTT	2	6	1492308	1492313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066581
24003	NC_014334	TCA	2	6	1492410	1492415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066581
24004	NC_014334	TCA	2	6	1492418	1492423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066581
24005	NC_014334	GTGAA	2	10	1492596	1492605	40 %	20 %	40 %	0 %	301066581
24006	NC_014334	ACCG	2	8	1492720	1492727	25 %	0 %	25 %	50 %	301066581
24007	NC_014334	GCA	2	6	1492871	1492876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066581
24008	NC_014334	CTT	2	6	1492965	1492970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066581
24009	NC_014334	TTC	2	6	1493017	1493022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066581
24010	NC_014334	CAA	2	6	1493212	1493217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066581
24011	NC_014334	T	7	7	1493256	1493262	0 %	100 %	0 %	0 %	301066581
24012	NC_014334	TCG	2	6	1493339	1493344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066581
24013	NC_014334	TCA	2	6	1493388	1493393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066581
24014	NC_014334	TCG	2	6	1493524	1493529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066581
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24016	NC_014334	CAT	2	6	1493718	1493723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066581
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24018	NC_014334	CGA	2	6	1493769	1493774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066581
24019	NC_014334	CAT	2	6	1493775	1493780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066581
24020	NC_014334	GGAT	2	8	1493849	1493856	25 %	25 %	50 %	0 %	301066581
24021	NC_014334	CGA	2	6	1493925	1493930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066581
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24116	NC_014334	TCA	2	6	1499342	1499347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066588
24117	NC_014334	CTT	2	6	1499391	1499396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066588
24118	NC_014334	TCATAA	2	12	1499713	1499724	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	301066589
24119	NC_014334	CAT	2	6	1499762	1499767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066589
24120	NC_014334	GAC	2	6	1499871	1499876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066589
24121	NC_014334	T	6	6	1499901	1499906	0 %	100 %	0 %	0 %	301066589
24122	NC_014334	CGC	2	6	1500385	1500390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066590
24123	NC_014334	ATC	2	6	1500393	1500398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066590
24124	NC_014334	GGC	2	6	1500419	1500424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066590
24125	NC_014334	ACTG	2	8	1500430	1500437	25 %	25 %	25 %	25 %	301066590
24126	NC_014334	TTC	2	6	1500522	1500527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066590
24127	NC_014334	T	6	6	1500528	1500533	0 %	100 %	0 %	0 %	301066590
24128	NC_014334	ATT	2	6	1500566	1500571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066591
24129	NC_014334	ACG	2	6	1500578	1500583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066591
24130	NC_014334	CA	3	6	1500682	1500687	50 %	0 %	0 %	50 %	301066591
24131	NC_014334	AGC	2	6	1500711	1500716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066591
24132	NC_014334	CCA	2	6	1500776	1500781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066591
24133	NC_014334	ATG	2	6	1500852	1500857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066591
24134	NC_014334	GCA	2	6	1500858	1500863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066591
24135	NC_014334	AAGGCA	2	12	1500876	1500887	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	301066591
24136	NC_014334	CTA	2	6	1501121	1501126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066592
24137	NC_014334	AAAT	2	8	1501139	1501146	75 %	25 %	0 %	0 %	301066592
24138	NC_014334	TGG	2	6	1501179	1501184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066592
24139	NC_014334	TGC	2	6	1501301	1501306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066592
24140	NC_014334	CTGA	2	8	1501372	1501379	25 %	25 %	25 %	25 %	301066592
24141	NC_014334	A	7	7	1501420	1501426	100 %	0 %	0 %	0 %	301066592
24142	NC_014334	TCT	2	6	1501457	1501462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066592
24143	NC_014334	CAA	2	6	1501479	1501484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066592
24144	NC_014334	AGAT	2	8	1501514	1501521	50 %	25 %	25 %	0 %	301066592
24145	NC_014334	ATTC	2	8	1501596	1501603	25 %	50 %	0 %	25 %	301066592
24146	NC_014334	AC	3	6	1502349	1502354	50 %	0 %	0 %	50 %	301066593
24147	NC_014334	TTG	2	6	1502929	1502934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066594
24148	NC_014334	T	7	7	1502949	1502955	0 %	100 %	0 %	0 %	301066594
24149	NC_014334	GCC	2	6	1502974	1502979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066594
24150	NC_014334	TTTG	2	8	1503012	1503019	0 %	75 %	25 %	0 %	301066594
24151	NC_014334	GT	3	6	1503021	1503026	0 %	50 %	50 %	0 %	301066594
24152	NC_014334	AAT	2	6	1503062	1503067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066594
24153	NC_014334	CGAAGT	2	12	1503085	1503096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	301066594
24154	NC_014334	TGT	2	6	1503113	1503118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066594
24155	NC_014334	CTT	2	6	1503177	1503182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066594
24156	NC_014334	TCA	2	6	1503183	1503188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066594
24157	NC_014334	CAT	2	6	1503222	1503227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066594
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24159	NC_014334	ATG	2	6	1503245	1503250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066594
24160	NC_014334	CAT	2	6	1503342	1503347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066594
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24162	NC_014334	TTA	2	6	1503655	1503660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066595
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24167	NC_014334	ATCT	2	8	1504195	1504202	25 %	50 %	0 %	25 %	301066596
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24169	NC_014334	CTT	2	6	1504243	1504248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066596
24170	NC_014334	ATCGT	2	10	1504277	1504286	20 %	40 %	20 %	20 %	301066596
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24172	NC_014334	GCA	2	6	1504386	1504391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066596
24173	NC_014334	CGG	2	6	1504396	1504401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066596
24174	NC_014334	GTT	2	6	1504428	1504433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066596
24175	NC_014334	GGTCAT	2	12	1504435	1504446	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	301066596
24176	NC_014334	TAAG	2	8	1504517	1504524	50 %	25 %	25 %	0 %	301066596
24177	NC_014334	AAT	2	6	1504585	1504590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066596
24178	NC_014334	CG	3	6	1504632	1504637	0 %	0 %	50 %	50 %	301066596
24179	NC_014334	CGT	2	6	1504757	1504762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066596
24180	NC_014334	CAG	2	6	1504855	1504860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066596
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24182	NC_014334	TGCA	2	8	1504913	1504920	25 %	25 %	25 %	25 %	301066596
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24185	NC_014334	ATA	2	6	1505152	1505157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066597
24186	NC_014334	CGC	2	6	1505205	1505210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066597
24187	NC_014334	TGAT	2	8	1505221	1505228	25 %	50 %	25 %	0 %	301066597
24188	NC_014334	TG	3	6	1505263	1505268	0 %	50 %	50 %	0 %	301066597
24189	NC_014334	CA	3	6	1505388	1505393	50 %	0 %	0 %	50 %	301066597
24190	NC_014334	CAACC	2	10	1505418	1505427	40 %	0 %	0 %	60 %	301066597
24191	NC_014334	CGC	2	6	1505435	1505440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066597
24192	NC_014334	TAT	2	6	1505504	1505509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066597
24193	NC_014334	CCT	2	6	1505521	1505526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301066597
24194	NC_014334	TGA	2	6	1505597	1505602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066597
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24198	NC_014334	T	6	6	1505705	1505710	0 %	100 %	0 %	0 %	301066597
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24200	NC_014334	ATT	2	6	1505787	1505792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066597
24201	NC_014334	GTC	2	6	1505817	1505822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066597
24202	NC_014334	TGA	2	6	1505897	1505902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066597
24203	NC_014334	GGC	2	6	1505941	1505946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066597
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24205	NC_014334	GTTTG	2	10	1505990	1505999	0 %	60 %	40 %	0 %	301066597
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24209	NC_014334	CGC	2	6	1506215	1506220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066597
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24212	NC_014334	CTT	2	6	1506878	1506883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066598
24213	NC_014334	GCA	2	6	1506887	1506892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066598
24214	NC_014334	CGT	3	9	1506911	1506919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066598
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24217	NC_014334	TCGA	2	8	1507083	1507090	25 %	25 %	25 %	25 %	301066598
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24220	NC_014334	CGG	2	6	1507286	1507291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066599
24221	NC_014334	GT	3	6	1507370	1507375	0 %	50 %	50 %	0 %	301066599
24222	NC_014334	T	6	6	1507461	1507466	0 %	100 %	0 %	0 %	301066599
24223	NC_014334	ACG	2	6	1507492	1507497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066599
24224	NC_014334	ACC	2	6	1507501	1507506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066599
24225	NC_014334	TTG	2	6	1507516	1507521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066599
24226	NC_014334	T	6	6	1507655	1507660	0 %	100 %	0 %	0 %	301066599
24227	NC_014334	TCA	2	6	1507778	1507783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066600
24228	NC_014334	CATG	2	8	1507867	1507874	25 %	25 %	25 %	25 %	301066600
24229	NC_014334	GCT	2	6	1507936	1507941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066600
24230	NC_014334	TCAA	2	8	1508100	1508107	50 %	25 %	0 %	25 %	301066601
24231	NC_014334	GCC	2	6	1508129	1508134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066601
24232	NC_014334	AGC	2	6	1508159	1508164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066601
24233	NC_014334	GCC	2	6	1508171	1508176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066601
24234	NC_014334	TCG	2	6	1508190	1508195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066601
24235	NC_014334	T	6	6	1508306	1508311	0 %	100 %	0 %	0 %	301066601
24236	NC_014334	CAA	2	6	1508359	1508364	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066601
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24238	NC_014334	AGC	2	6	1508420	1508425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066601
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24241	NC_014334	GC	3	6	1508603	1508608	0 %	0 %	50 %	50 %	301066602
24242	NC_014334	A	6	6	1508746	1508751	100 %	0 %	0 %	0 %	301066602
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24244	NC_014334	GCA	2	6	1508966	1508971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066602
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24252	NC_014334	GCC	2	6	1509604	1509609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066602
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24269	NC_014334	T	6	6	1510599	1510604	0 %	100 %	0 %	0 %	301066602
24270	NC_014334	GCA	2	6	1510737	1510742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066602
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24309	NC_014334	ATG	2	6	1513304	1513309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066607
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24317	NC_014334	ATC	2	6	1513979	1513984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066607
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24322	NC_014334	GT	3	6	1514196	1514201	0 %	50 %	50 %	0 %	301066607
24323	NC_014334	CACGTT	2	12	1514280	1514291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	301066607
24324	NC_014334	GAT	2	6	1514401	1514406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066607
24325	NC_014334	TCT	2	6	1514444	1514449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066607
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24329	NC_014334	TTCAA	2	10	1514875	1514884	40 %	40 %	0 %	20 %	301066608
24330	NC_014334	AGAT	2	8	1514956	1514963	50 %	25 %	25 %	0 %	301066608
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24332	NC_014334	CTG	2	6	1515060	1515065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066608
24333	NC_014334	GCC	2	6	1515186	1515191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066608
24334	NC_014334	TCA	2	6	1515215	1515220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066608
24335	NC_014334	ACTGG	2	10	1515286	1515295	20 %	20 %	40 %	20 %	301066608
24336	NC_014334	GGAT	2	8	1515435	1515442	25 %	25 %	50 %	0 %	301066608
24337	NC_014334	CAC	2	6	1515452	1515457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066608
24338	NC_014334	CCG	2	6	1515517	1515522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066608
24339	NC_014334	ACCAGC	2	12	1515546	1515557	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	301066608
24340	NC_014334	GCC	2	6	1515558	1515563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066608
24341	NC_014334	CAG	2	6	1515581	1515586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066608
24342	NC_014334	GCC	2	6	1515604	1515609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066608
24343	NC_014334	TTC	2	6	1515703	1515708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066608
24344	NC_014334	TCA	2	6	1515739	1515744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066608
24345	NC_014334	ATA	2	6	1515774	1515779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066608
24346	NC_014334	AGCAT	2	10	1515839	1515848	40 %	20 %	20 %	20 %	301066609
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24348	NC_014334	CCGCG	2	10	1515870	1515879	0 %	0 %	40 %	60 %	301066609
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24462	NC_014334	GCA	2	6	1522216	1522221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066615
24463	NC_014334	AAACCG	2	12	1522290	1522301	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	301066615
24464	NC_014334	A	6	6	1522322	1522327	100 %	0 %	0 %	0 %	301066615
24465	NC_014334	GC	4	8	1522396	1522403	0 %	0 %	50 %	50 %	301066615
24466	NC_014334	CCG	2	6	1522436	1522441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066615
24467	NC_014334	CGG	2	6	1522449	1522454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066615
24468	NC_014334	TG	3	6	1522459	1522464	0 %	50 %	50 %	0 %	301066615
24469	NC_014334	GCA	2	6	1522489	1522494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066615
24470	NC_014334	CAA	2	6	1522538	1522543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066615
24471	NC_014334	GTC	2	6	1522567	1522572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066615
24472	NC_014334	GCA	2	6	1522661	1522666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066615
24473	NC_014334	T	7	7	1522706	1522712	0 %	100 %	0 %	0 %	301066615
24474	NC_014334	TA	3	6	1522772	1522777	50 %	50 %	0 %	0 %	301066615
24475	NC_014334	T	6	6	1522820	1522825	0 %	100 %	0 %	0 %	301066616
24476	NC_014334	ATAC	2	8	1522826	1522833	50 %	25 %	0 %	25 %	301066616
24477	NC_014334	ATG	3	9	1522835	1522843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066616
24478	NC_014334	CAC	2	6	1522889	1522894	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066616
24479	NC_014334	A	6	6	1522903	1522908	100 %	0 %	0 %	0 %	301066616
24480	NC_014334	ATCA	2	8	1522928	1522935	50 %	25 %	0 %	25 %	301066616
24481	NC_014334	GGT	2	6	1523021	1523026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066616
24482	NC_014334	CCA	2	6	1523038	1523043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066616
24483	NC_014334	GCC	2	6	1523112	1523117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066616
24484	NC_014334	CTT	2	6	1523214	1523219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066616
24485	NC_014334	TGC	2	6	1523267	1523272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066616
24486	NC_014334	TAA	2	6	1523300	1523305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066616
24487	NC_014334	AATA	2	8	1523337	1523344	75 %	25 %	0 %	0 %	301066616
24488	NC_014334	T	7	7	1523372	1523378	0 %	100 %	0 %	0 %	301066616
24489	NC_014334	GCT	2	6	1523398	1523403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066616
24490	NC_014334	GCG	2	6	1523412	1523417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066616
24491	NC_014334	ACG	2	6	1523421	1523426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066616
24492	NC_014334	GCAT	2	8	1523443	1523450	25 %	25 %	25 %	25 %	301066616
24493	NC_014334	GAA	2	6	1523522	1523527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066616
24494	NC_014334	TCCT	2	8	1523563	1523570	0 %	50 %	0 %	50 %	301066616
24495	NC_014334	ATT	3	9	1523580	1523588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066616
24496	NC_014334	T	9	9	1523713	1523721	0 %	100 %	0 %	0 %	301066616
24497	NC_014334	TTC	2	6	1523916	1523921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066617
24498	NC_014334	CGT	2	6	1523922	1523927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066617
24499	NC_014334	TGCG	2	8	1523950	1523957	0 %	25 %	50 %	25 %	301066617
24500	NC_014334	GCT	2	6	1524072	1524077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066617

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