MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_014334	AAT	2	6	1462307	1462312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066547
23503	NC_014334	ATA	2	6	1462337	1462342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066547
23504	NC_014334	CAT	2	6	1462356	1462361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066547
23505	NC_014334	TTG	2	6	1462405	1462410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066547
23506	NC_014334	AAC	2	6	1462421	1462426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066547
23507	NC_014334	TTTC	2	8	1462482	1462489	0 %	75 %	0 %	25 %	301066547
23508	NC_014334	GC	3	6	1462532	1462537	0 %	0 %	50 %	50 %	301066547
23509	NC_014334	CAT	2	6	1462647	1462652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066547
23510	NC_014334	GCG	2	6	1462666	1462671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066547
23511	NC_014334	GAT	2	6	1462686	1462691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066547
23512	NC_014334	GCG	2	6	1462749	1462754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066547
23513	NC_014334	CCAA	2	8	1462764	1462771	50 %	0 %	0 %	50 %	301066547
23514	NC_014334	TTC	2	6	1462820	1462825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066547
23515	NC_014334	AGTT	2	8	1462831	1462838	25 %	50 %	25 %	0 %	301066547
23516	NC_014334	GC	3	6	1462858	1462863	0 %	0 %	50 %	50 %	301066547
23517	NC_014334	AATG	2	8	1463000	1463007	50 %	25 %	25 %	0 %	301066548
23518	NC_014334	TGTC	2	8	1463135	1463142	0 %	50 %	25 %	25 %	301066548
23519	NC_014334	TTAA	2	8	1463227	1463234	50 %	50 %	0 %	0 %	301066548
23520	NC_014334	AAT	2	6	1463435	1463440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066549
23521	NC_014334	TCAA	2	8	1463560	1463567	50 %	25 %	0 %	25 %	301066549
23522	NC_014334	CATCC	2	10	1463781	1463790	20 %	20 %	0 %	60 %	301066550
23523	NC_014334	TGG	2	6	1463852	1463857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066550
23524	NC_014334	GATC	2	8	1463862	1463869	25 %	25 %	25 %	25 %	301066550
23525	NC_014334	CGG	2	6	1463880	1463885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066550
23526	NC_014334	GCTT	2	8	1463945	1463952	0 %	50 %	25 %	25 %	301066550
23527	NC_014334	CCG	2	6	1463981	1463986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066550
23528	NC_014334	GCT	2	6	1464056	1464061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066550
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23531	NC_014334	TCAT	2	8	1464191	1464198	25 %	50 %	0 %	25 %	301066550
23532	NC_014334	GAT	2	6	1464327	1464332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066550
23533	NC_014334	CCGG	2	8	1464381	1464388	0 %	0 %	50 %	50 %	301066550
23534	NC_014334	G	6	6	1464477	1464482	0 %	0 %	100 %	0 %	301066550
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23537	NC_014334	T	6	6	1464559	1464564	0 %	100 %	0 %	0 %	301066551
23538	NC_014334	T	7	7	1464652	1464658	0 %	100 %	0 %	0 %	301066551
23539	NC_014334	GCC	2	6	1464679	1464684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066551
23540	NC_014334	TGGC	2	8	1464890	1464897	0 %	25 %	50 %	25 %	301066551
23541	NC_014334	TCA	2	6	1464916	1464921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066551
23542	NC_014334	GACG	2	8	1464997	1465004	25 %	0 %	50 %	25 %	301066551
23543	NC_014334	TGC	3	9	1465101	1465109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066551
23544	NC_014334	A	6	6	1465125	1465130	100 %	0 %	0 %	0 %	301066551
23545	NC_014334	AGTT	2	8	1465280	1465287	25 %	50 %	25 %	0 %	301066552
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23548	NC_014334	TCGC	2	8	1465519	1465526	0 %	25 %	25 %	50 %	301066553
23549	NC_014334	CAT	2	6	1465575	1465580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066553
23550	NC_014334	TTC	2	6	1465609	1465614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066553
23551	NC_014334	TGG	2	6	1465689	1465694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066553
23552	NC_014334	ATC	2	6	1465729	1465734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066553
23553	NC_014334	TTC	2	6	1465831	1465836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066553
23554	NC_014334	CCA	2	6	1465975	1465980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066553
23555	NC_014334	TCA	2	6	1466037	1466042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066553
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23558	NC_014334	CAAGG	2	10	1466179	1466188	40 %	0 %	40 %	20 %	301066553
23559	NC_014334	CTT	2	6	1466193	1466198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066553
23560	NC_014334	CAG	2	6	1466209	1466214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066553
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23562	NC_014334	CTT	2	6	1466311	1466316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066553
23563	NC_014334	CTT	2	6	1466320	1466325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066553
23564	NC_014334	GCT	2	6	1466336	1466341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066553
23565	NC_014334	TCA	2	6	1466354	1466359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066553
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23577	NC_014334	TTG	3	9	1466726	1466734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066554
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23584	NC_014334	CGA	2	6	1467194	1467199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066554
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23586	NC_014334	CG	3	6	1467385	1467390	0 %	0 %	50 %	50 %	301066554
23587	NC_014334	CAC	2	6	1467457	1467462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066554
23588	NC_014334	TCA	2	6	1467477	1467482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066554
23589	NC_014334	ATCC	2	8	1467485	1467492	25 %	25 %	0 %	50 %	301066554
23590	NC_014334	GAT	2	6	1467529	1467534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066554
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23593	NC_014334	GCTT	2	8	1467607	1467614	0 %	50 %	25 %	25 %	301066554
23594	NC_014334	ATG	2	6	1467624	1467629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066554
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23599	NC_014334	ATT	2	6	1467998	1468003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066554
23600	NC_014334	CTA	2	6	1468012	1468017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066554
23601	NC_014334	TTC	2	6	1468028	1468033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066554
23602	NC_014334	TCA	2	6	1468068	1468073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066554
23603	NC_014334	AAT	2	6	1468093	1468098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066554
23604	NC_014334	TCA	2	6	1468126	1468131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066554
23605	NC_014334	ATG	2	6	1468136	1468141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066554
23606	NC_014334	TTGC	2	8	1468175	1468182	0 %	50 %	25 %	25 %	301066554
23607	NC_014334	TGC	2	6	1468202	1468207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066554
23608	NC_014334	T	6	6	1468253	1468258	0 %	100 %	0 %	0 %	301066554
23609	NC_014334	GCC	2	6	1468313	1468318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066554
23610	NC_014334	TTCA	2	8	1468355	1468362	25 %	50 %	0 %	25 %	301066554
23611	NC_014334	ATG	2	6	1468369	1468374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066554
23612	NC_014334	GT	3	6	1468377	1468382	0 %	50 %	50 %	0 %	301066554
23613	NC_014334	TGACT	2	10	1468711	1468720	20 %	40 %	20 %	20 %	301066555
23614	NC_014334	TCG	2	6	1468794	1468799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066555
23615	NC_014334	TCA	3	9	1468881	1468889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066555
23616	NC_014334	CTT	2	6	1468892	1468897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066555
23617	NC_014334	CAT	2	6	1468915	1468920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066555
23618	NC_014334	CTG	2	6	1468976	1468981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066555
23619	NC_014334	CTT	2	6	1468982	1468987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066555
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23727	NC_014334	A	6	6	1475728	1475733	100 %	0 %	0 %	0 %	301066562
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23730	NC_014334	GGC	2	6	1475959	1475964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066563
23731	NC_014334	TGCCA	2	10	1476005	1476014	20 %	20 %	20 %	40 %	301066563
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23966	NC_014334	AAC	2	6	1490370	1490375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066578
23967	NC_014334	CAA	2	6	1490404	1490409	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066578
23968	NC_014334	TCAAA	2	10	1490425	1490434	60 %	20 %	0 %	20 %	301066578
23969	NC_014334	AGGC	2	8	1490496	1490503	25 %	0 %	50 %	25 %	301066578
23970	NC_014334	ATC	2	6	1490505	1490510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066578
23971	NC_014334	TGA	2	6	1490513	1490518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066578
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23973	NC_014334	GAT	2	6	1490620	1490625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066579
23974	NC_014334	TGCGG	2	10	1490643	1490652	0 %	20 %	60 %	20 %	301066579
23975	NC_014334	ATC	2	6	1490733	1490738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066579
23976	NC_014334	TGAAT	2	10	1490781	1490790	40 %	40 %	20 %	0 %	301066579
23977	NC_014334	CCACC	2	10	1490827	1490836	20 %	0 %	0 %	80 %	301066579
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23981	NC_014334	TGG	2	6	1490997	1491002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066579
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23986	NC_014334	TGTC	2	8	1491124	1491131	0 %	50 %	25 %	25 %	301066579
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23991	NC_014334	AAT	2	6	1491528	1491533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066580
23992	NC_014334	GC	3	6	1491653	1491658	0 %	0 %	50 %	50 %	301066580
23993	NC_014334	CATC	2	8	1491831	1491838	25 %	25 %	0 %	50 %	301066581
23994	NC_014334	TGT	2	6	1491921	1491926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066581
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23996	NC_014334	CTT	2	6	1492032	1492037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066581
23997	NC_014334	ATCA	2	8	1492054	1492061	50 %	25 %	0 %	25 %	301066581
23998	NC_014334	CCGG	2	8	1492063	1492070	0 %	0 %	50 %	50 %	301066581
23999	NC_014334	CAG	2	6	1492195	1492200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066581
24000	NC_014334	GCT	2	6	1492248	1492253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066581

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