MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_014334	AGA	2	6	1432636	1432641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066523
23003	NC_014334	GTT	2	6	1432762	1432767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066523
23004	NC_014334	TGA	2	6	1432774	1432779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066523
23005	NC_014334	CAAAGA	2	12	1432792	1432803	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	301066523
23006	NC_014334	AGA	2	6	1432819	1432824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066523
23007	NC_014334	GAT	2	6	1432850	1432855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066523
23008	NC_014334	ACA	2	6	1432860	1432865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066523
23009	NC_014334	CAC	2	6	1432900	1432905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066523
23010	NC_014334	AAG	2	6	1432907	1432912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066523
23011	NC_014334	AAGG	2	8	1432958	1432965	50 %	0 %	50 %	0 %	301066523
23012	NC_014334	CAG	2	6	1433058	1433063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066523
23013	NC_014334	CGC	2	6	1433340	1433345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066524
23014	NC_014334	TGC	2	6	1433435	1433440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066524
23015	NC_014334	TTC	2	6	1433473	1433478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066524
23016	NC_014334	CG	3	6	1433657	1433662	0 %	0 %	50 %	50 %	301066525
23017	NC_014334	GCG	2	6	1433774	1433779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066525
23018	NC_014334	CCA	2	6	1433837	1433842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066525
23019	NC_014334	GCA	3	9	1433851	1433859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066525
23020	NC_014334	AGC	2	6	1433892	1433897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066525
23021	NC_014334	GTT	2	6	1433939	1433944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066525
23022	NC_014334	TCA	2	6	1433968	1433973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066525
23023	NC_014334	TGA	2	6	1434011	1434016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066525
23024	NC_014334	CTG	2	6	1434032	1434037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066525
23025	NC_014334	CGC	2	6	1434048	1434053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066525
23026	NC_014334	TCA	2	6	1434059	1434064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066525
23027	NC_014334	CTG	2	6	1434179	1434184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066525
23028	NC_014334	TGGC	2	8	1434254	1434261	0 %	25 %	50 %	25 %	301066525
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23030	NC_014334	GCA	2	6	1434445	1434450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066525
23031	NC_014334	TTG	2	6	1434474	1434479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066525
23032	NC_014334	CAT	2	6	1434488	1434493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066525
23033	NC_014334	GT	3	6	1434517	1434522	0 %	50 %	50 %	0 %	301066525
23034	NC_014334	GCT	2	6	1434526	1434531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066525
23035	NC_014334	GCT	2	6	1434545	1434550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066525
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23038	NC_014334	TGC	2	6	1434815	1434820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066526
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23042	NC_014334	TTG	2	6	1435044	1435049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066526
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23050	NC_014334	T	6	6	1435521	1435526	0 %	100 %	0 %	0 %	301066526
23051	NC_014334	CGAA	2	8	1435563	1435570	50 %	0 %	25 %	25 %	301066526
23052	NC_014334	GGTA	2	8	1435606	1435613	25 %	25 %	50 %	0 %	301066526
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23058	NC_014334	TGA	2	6	1435974	1435979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066527
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23101	NC_014334	CAA	2	6	1438918	1438923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066531
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23105	NC_014334	CTCA	2	8	1439281	1439288	25 %	25 %	0 %	50 %	301066531
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23114	NC_014334	CGG	2	6	1440065	1440070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066531
23115	NC_014334	GAC	2	6	1440105	1440110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066531
23116	NC_014334	CAA	2	6	1440133	1440138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066531
23117	NC_014334	CGG	2	6	1440402	1440407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066531
23118	NC_014334	AGC	2	6	1440454	1440459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066531
23119	NC_014334	AGTTCA	2	12	1440535	1440546	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	301066531
23120	NC_014334	GTA	2	6	1440565	1440570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066531
23121	NC_014334	CCT	2	6	1440581	1440586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301066531
23122	NC_014334	GGT	2	6	1440661	1440666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066531
23123	NC_014334	AAC	2	6	1440670	1440675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066531
23124	NC_014334	ATT	2	6	1440790	1440795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066532
23125	NC_014334	ATG	2	6	1440821	1440826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066532
23126	NC_014334	A	6	6	1440932	1440937	100 %	0 %	0 %	0 %	301066532
23127	NC_014334	TCA	2	6	1441056	1441061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066532
23128	NC_014334	GCTC	2	8	1441143	1441150	0 %	25 %	25 %	50 %	301066532
23129	NC_014334	A	6	6	1441188	1441193	100 %	0 %	0 %	0 %	301066532
23130	NC_014334	AAT	2	6	1441272	1441277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066533
23131	NC_014334	CTG	2	6	1441305	1441310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066533
23132	NC_014334	GC	3	6	1441328	1441333	0 %	0 %	50 %	50 %	301066533
23133	NC_014334	AAC	2	6	1441522	1441527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066533
23134	NC_014334	CAG	2	6	1441710	1441715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066533
23135	NC_014334	GGTT	2	8	1441828	1441835	0 %	50 %	50 %	0 %	301066533
23136	NC_014334	TGATC	2	10	1441857	1441866	20 %	40 %	20 %	20 %	301066533
23137	NC_014334	GTT	2	6	1441872	1441877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066533
23138	NC_014334	CCT	2	6	1441905	1441910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301066533
23139	NC_014334	ATG	2	6	1441920	1441925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066533
23140	NC_014334	TGA	2	6	1441984	1441989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066534
23141	NC_014334	CTG	2	6	1442010	1442015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066534
23142	NC_014334	GCG	2	6	1442031	1442036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066534
23143	NC_014334	CAA	2	6	1442046	1442051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066534
23144	NC_014334	AT	3	6	1442062	1442067	50 %	50 %	0 %	0 %	301066534
23145	NC_014334	GTC	2	6	1442186	1442191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066534
23146	NC_014334	TTGC	2	8	1442240	1442247	0 %	50 %	25 %	25 %	301066534
23147	NC_014334	CCA	2	6	1442269	1442274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066534
23148	NC_014334	GACCAT	2	12	1442330	1442341	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	301066534
23149	NC_014334	TGA	2	6	1442455	1442460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066534
23150	NC_014334	TGCC	2	8	1442466	1442473	0 %	25 %	25 %	50 %	301066534
23151	NC_014334	CTGCC	2	10	1442562	1442571	0 %	20 %	20 %	60 %	301066534
23152	NC_014334	TCA	2	6	1442649	1442654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066535
23153	NC_014334	ATC	2	6	1442671	1442676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066535
23154	NC_014334	GGAAT	2	10	1442681	1442690	40 %	20 %	40 %	0 %	301066535
23155	NC_014334	ATTCGT	2	12	1442798	1442809	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	301066535
23156	NC_014334	TTC	2	6	1442839	1442844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066535
23157	NC_014334	GT	3	6	1442846	1442851	0 %	50 %	50 %	0 %	301066535
23158	NC_014334	ATC	2	6	1442934	1442939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066535
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23162	NC_014334	CAAG	2	8	1443164	1443171	50 %	0 %	25 %	25 %	301066535
23163	NC_014334	CT	3	6	1443244	1443249	0 %	50 %	0 %	50 %	301066535
23164	NC_014334	ATC	2	6	1443280	1443285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066535
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23166	NC_014334	T	6	6	1443414	1443419	0 %	100 %	0 %	0 %	301066535
23167	NC_014334	AAT	2	6	1443425	1443430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066535
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23174	NC_014334	TGA	2	6	1443715	1443720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066535
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23178	NC_014334	AAT	2	6	1443976	1443981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066536
23179	NC_014334	CGT	2	6	1444006	1444011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066536
23180	NC_014334	GCAA	2	8	1444111	1444118	50 %	0 %	25 %	25 %	301066536
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23182	NC_014334	AATA	2	8	1444183	1444190	75 %	25 %	0 %	0 %	301066536
23183	NC_014334	TAA	2	6	1444239	1444244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066536
23184	NC_014334	A	6	6	1444250	1444255	100 %	0 %	0 %	0 %	301066536
23185	NC_014334	CTG	2	6	1444299	1444304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066536
23186	NC_014334	GCA	2	6	1444327	1444332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066536
23187	NC_014334	GCT	2	6	1444345	1444350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066536
23188	NC_014334	GGT	2	6	1444359	1444364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066536
23189	NC_014334	GCA	2	6	1444411	1444416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066536
23190	NC_014334	TAAAT	2	10	1444531	1444540	60 %	40 %	0 %	0 %	301066536
23191	NC_014334	TCG	2	6	1444552	1444557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066536
23192	NC_014334	ATG	2	6	1444572	1444577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066536
23193	NC_014334	CAAT	2	8	1444595	1444602	50 %	25 %	0 %	25 %	301066536
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23195	NC_014334	GCC	2	6	1444684	1444689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066536
23196	NC_014334	ATC	2	6	1444695	1444700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066536
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23199	NC_014334	GCA	2	6	1444993	1444998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066536
23200	NC_014334	TCA	2	6	1445008	1445013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066536
23201	NC_014334	TTTA	2	8	1445206	1445213	25 %	75 %	0 %	0 %	301066537
23202	NC_014334	TAGTT	2	10	1445266	1445275	20 %	60 %	20 %	0 %	301066537
23203	NC_014334	TGC	2	6	1445377	1445382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066537
23204	NC_014334	TGC	2	6	1445389	1445394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066537
23205	NC_014334	T	6	6	1445438	1445443	0 %	100 %	0 %	0 %	301066537
23206	NC_014334	TAC	2	6	1445480	1445485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066537
23207	NC_014334	ACC	2	6	1445519	1445524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066537
23208	NC_014334	T	6	6	1445567	1445572	0 %	100 %	0 %	0 %	301066537
23209	NC_014334	GTT	2	6	1445588	1445593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066537
23210	NC_014334	AAT	2	6	1445634	1445639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066537
23211	NC_014334	CAAT	2	8	1445645	1445652	50 %	25 %	0 %	25 %	301066537
23212	NC_014334	CGA	2	6	1445686	1445691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066537
23213	NC_014334	A	6	6	1445774	1445779	100 %	0 %	0 %	0 %	301066538
23214	NC_014334	GTG	2	6	1446108	1446113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066539
23215	NC_014334	TCGGTT	2	12	1446150	1446161	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	301066539
23216	NC_014334	CTG	2	6	1446238	1446243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066539
23217	NC_014334	GGC	2	6	1446275	1446280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066539
23218	NC_014334	AATC	2	8	1446340	1446347	50 %	25 %	0 %	25 %	301066539
23219	NC_014334	AAG	2	6	1446354	1446359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066539
23220	NC_014334	ACCG	2	8	1446389	1446396	25 %	0 %	25 %	50 %	301066539
23221	NC_014334	CCG	2	6	1446418	1446423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066539
23222	NC_014334	ACAAT	2	10	1446520	1446529	60 %	20 %	0 %	20 %	301066539
23223	NC_014334	CAA	2	6	1446551	1446556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066539
23224	NC_014334	CGC	2	6	1446563	1446568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066539
23225	NC_014334	AACG	2	8	1446732	1446739	50 %	0 %	25 %	25 %	301066539
23226	NC_014334	AAC	2	6	1446789	1446794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066539
23227	NC_014334	CAT	2	6	1446850	1446855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066539
23228	NC_014334	AAG	2	6	1446874	1446879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066539
23229	NC_014334	GC	3	6	1446914	1446919	0 %	0 %	50 %	50 %	301066539
23230	NC_014334	GATC	2	8	1446946	1446953	25 %	25 %	25 %	25 %	301066539
23231	NC_014334	AGC	2	6	1447127	1447132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066539
23232	NC_014334	AT	3	6	1447196	1447201	50 %	50 %	0 %	0 %	301066539
23233	NC_014334	TGC	2	6	1447206	1447211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066539
23234	NC_014334	GTT	3	9	1447236	1447244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066539
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23236	NC_014334	GCC	2	6	1447354	1447359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066539
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23238	NC_014334	TAT	2	6	1447402	1447407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066539
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23259	NC_014334	CAAC	2	8	1448239	1448246	50 %	0 %	0 %	50 %	301066539
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23327	NC_014334	GCA	2	6	1451853	1451858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066540
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23332	NC_014334	GATCAA	2	12	1452159	1452170	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	301066540
23333	NC_014334	TAG	2	6	1452176	1452181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066540
23334	NC_014334	CAC	2	6	1452276	1452281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066540
23335	NC_014334	GTC	2	6	1452291	1452296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066540
23336	NC_014334	CTT	2	6	1452310	1452315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066540
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23338	NC_014334	CAAC	2	8	1452429	1452436	50 %	0 %	0 %	50 %	301066540
23339	NC_014334	GGT	2	6	1452439	1452444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066540
23340	NC_014334	CAG	2	6	1452456	1452461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066540
23341	NC_014334	CGT	2	6	1452486	1452491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066540
23342	NC_014334	GCT	2	6	1452500	1452505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066540
23343	NC_014334	TCC	2	6	1452541	1452546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301066541
23344	NC_014334	GAT	2	6	1452551	1452556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066541
23345	NC_014334	TG	3	6	1452565	1452570	0 %	50 %	50 %	0 %	301066541
23346	NC_014334	ATA	2	6	1452661	1452666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066541
23347	NC_014334	GCA	2	6	1452754	1452759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066541
23348	NC_014334	AAT	2	6	1452762	1452767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066541
23349	NC_014334	TCT	2	6	1452802	1452807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066541
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23351	NC_014334	CAT	2	6	1452870	1452875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066541
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23366	NC_014334	ACC	2	6	1454296	1454301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066541
23367	NC_014334	GCCG	2	8	1454346	1454353	0 %	0 %	50 %	50 %	301066541
23368	NC_014334	CA	3	6	1454500	1454505	50 %	0 %	0 %	50 %	301066541
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23370	NC_014334	GCA	2	6	1454594	1454599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066541
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23450	NC_014334	CGG	2	6	1458946	1458951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066544
23451	NC_014334	TCG	2	6	1458979	1458984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066544
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23453	NC_014334	GC	3	6	1459049	1459054	0 %	0 %	50 %	50 %	301066544
23454	NC_014334	GGC	2	6	1459082	1459087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066544
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23456	NC_014334	TGT	2	6	1459105	1459110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066544
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23459	NC_014334	ATA	2	6	1459855	1459860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066545
23460	NC_014334	CAG	2	6	1459918	1459923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066545
23461	NC_014334	CTTG	2	8	1459945	1459952	0 %	50 %	25 %	25 %	301066545
23462	NC_014334	ATC	2	6	1460017	1460022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066545
23463	NC_014334	TTC	2	6	1460066	1460071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066545
23464	NC_014334	GCAC	2	8	1460096	1460103	25 %	0 %	25 %	50 %	301066545
23465	NC_014334	ATC	2	6	1460126	1460131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066545
23466	NC_014334	GTT	2	6	1460132	1460137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066545
23467	NC_014334	GAAA	2	8	1460147	1460154	75 %	0 %	25 %	0 %	301066545
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23490	NC_014334	TTTA	2	8	1461650	1461657	25 %	75 %	0 %	0 %	301066546
23491	NC_014334	ATT	2	6	1461731	1461736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066546
23492	NC_014334	ACC	2	6	1461774	1461779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066546
23493	NC_014334	CAA	2	6	1461886	1461891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066546
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23499	NC_014334	TCGT	2	8	1462180	1462187	0 %	50 %	25 %	25 %	301066547
23500	NC_014334	CCG	2	6	1462231	1462236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066547

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