MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22002	NC_014334	GAC	2	6	1369865	1369870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066459
22003	NC_014334	CAC	2	6	1369945	1369950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066459
22004	NC_014334	ACCA	2	8	1370002	1370009	50 %	0 %	0 %	50 %	301066459
22005	NC_014334	ATCAA	2	10	1370031	1370040	60 %	20 %	0 %	20 %	301066459
22006	NC_014334	CTT	2	6	1370131	1370136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066459
22007	NC_014334	GAC	2	6	1370247	1370252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066460
22008	NC_014334	CAGG	2	8	1370326	1370333	25 %	0 %	50 %	25 %	301066460
22009	NC_014334	CGAAC	2	10	1370364	1370373	40 %	0 %	20 %	40 %	301066460
22010	NC_014334	TCATG	2	10	1370451	1370460	20 %	40 %	20 %	20 %	301066460
22011	NC_014334	CAA	2	6	1370482	1370487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066460
22012	NC_014334	GATT	2	8	1370514	1370521	25 %	50 %	25 %	0 %	301066460
22013	NC_014334	TGT	2	6	1370523	1370528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066460
22014	NC_014334	CAT	2	6	1370533	1370538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066460
22015	NC_014334	GCA	2	6	1370594	1370599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066460
22016	NC_014334	TGT	2	6	1370696	1370701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066460
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22022	NC_014334	CG	3	6	1371099	1371104	0 %	0 %	50 %	50 %	301066460
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22045	NC_014334	TAT	2	6	1373110	1373115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066463
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22057	NC_014334	TGA	2	6	1374075	1374080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066465
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22061	NC_014334	GC	3	6	1374224	1374229	0 %	0 %	50 %	50 %	301066465
22062	NC_014334	GCG	2	6	1374271	1374276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066465
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22235	NC_014334	AAG	2	6	1384433	1384438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066477
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22239	NC_014334	GCT	2	6	1384650	1384655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066478
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22242	NC_014334	CAT	2	6	1384778	1384783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066478
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22245	NC_014334	CTG	2	6	1384862	1384867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066478
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22333	NC_014334	A	7	7	1390357	1390363	100 %	0 %	0 %	0 %	301066484
22334	NC_014334	TGC	2	6	1390373	1390378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066484
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22343	NC_014334	A	6	6	1390971	1390976	100 %	0 %	0 %	0 %	301066484
22344	NC_014334	CTT	2	6	1391085	1391090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066484
22345	NC_014334	GCT	2	6	1391156	1391161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066484
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22347	NC_014334	TTGTT	2	10	1391939	1391948	0 %	80 %	20 %	0 %	301066485
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22349	NC_014334	GATT	2	8	1392166	1392173	25 %	50 %	25 %	0 %	301066485
22350	NC_014334	CAT	2	6	1392184	1392189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066485
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22464	NC_014334	TGC	2	6	1398818	1398823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066491
22465	NC_014334	GTC	2	6	1398927	1398932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066491
22466	NC_014334	T	6	6	1398968	1398973	0 %	100 %	0 %	0 %	301066491
22467	NC_014334	ATG	2	6	1399005	1399010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066491
22468	NC_014334	TCA	2	6	1399081	1399086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066492
22469	NC_014334	TGC	2	6	1399090	1399095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066492
22470	NC_014334	TTC	2	6	1399123	1399128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066492
22471	NC_014334	ATG	2	6	1399259	1399264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066492
22472	NC_014334	TAA	2	6	1399291	1399296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066492
22473	NC_014334	TGC	3	9	1399315	1399323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066492
22474	NC_014334	GCA	2	6	1399406	1399411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066492
22475	NC_014334	GTC	2	6	1399456	1399461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066492
22476	NC_014334	TCG	2	6	1399571	1399576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066492
22477	NC_014334	CGT	2	6	1399608	1399613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066492
22478	NC_014334	GAC	2	6	1399630	1399635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066492
22479	NC_014334	GCC	2	6	1399690	1399695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066492
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22481	NC_014334	TGC	2	6	1399752	1399757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066492
22482	NC_014334	ACC	2	6	1399873	1399878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066492
22483	NC_014334	GT	3	6	1399899	1399904	0 %	50 %	50 %	0 %	301066492
22484	NC_014334	CCG	2	6	1399973	1399978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066492
22485	NC_014334	TTC	2	6	1400020	1400025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066492
22486	NC_014334	TTG	2	6	1400035	1400040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066492
22487	NC_014334	CTGGAT	2	12	1400242	1400253	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	301066493
22488	NC_014334	TCG	2	6	1400346	1400351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066493
22489	NC_014334	TTG	3	9	1400357	1400365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066493
22490	NC_014334	TTC	2	6	1400405	1400410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066493
22491	NC_014334	ATC	2	6	1400432	1400437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066493
22492	NC_014334	GAA	2	6	1400442	1400447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066493
22493	NC_014334	TCAA	2	8	1400475	1400482	50 %	25 %	0 %	25 %	301066493
22494	NC_014334	TGCT	2	8	1400516	1400523	0 %	50 %	25 %	25 %	301066493
22495	NC_014334	ATT	2	6	1400654	1400659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066493
22496	NC_014334	ACG	2	6	1400664	1400669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066493
22497	NC_014334	ACT	2	6	1400673	1400678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066493
22498	NC_014334	CAC	2	6	1400773	1400778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066493
22499	NC_014334	GAG	2	6	1400835	1400840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301066493
22500	NC_014334	TGC	2	6	1400863	1400868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066493

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