MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_014334	TGA	2	6	1336326	1336331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066430
21502	NC_014334	TTTG	2	8	1336364	1336371	0 %	75 %	25 %	0 %	301066430
21503	NC_014334	GAC	2	6	1336402	1336407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066430
21504	NC_014334	CGC	2	6	1336528	1336533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066430
21505	NC_014334	CAT	2	6	1336597	1336602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066430
21506	NC_014334	CAA	2	6	1336657	1336662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066430
21507	NC_014334	TGT	2	6	1336688	1336693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066430
21508	NC_014334	CAA	2	6	1336707	1336712	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066430
21509	NC_014334	GCC	2	6	1336720	1336725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066430
21510	NC_014334	GGT	2	6	1336726	1336731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066430
21511	NC_014334	CAG	2	6	1336942	1336947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066430
21512	NC_014334	CCA	2	6	1336975	1336980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066430
21513	NC_014334	CGC	2	6	1337010	1337015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066430
21514	NC_014334	CAA	2	6	1337099	1337104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066430
21515	NC_014334	GTG	2	6	1337111	1337116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066430
21516	NC_014334	CCAG	2	8	1337245	1337252	25 %	0 %	25 %	50 %	301066431
21517	NC_014334	A	8	8	1337278	1337285	100 %	0 %	0 %	0 %	301066431
21518	NC_014334	GGC	2	6	1337318	1337323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066431
21519	NC_014334	CCGAA	2	10	1337491	1337500	40 %	0 %	20 %	40 %	301066431
21520	NC_014334	AGA	2	6	1337557	1337562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066431
21521	NC_014334	ATG	2	6	1337607	1337612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066431
21522	NC_014334	TTTG	2	8	1337626	1337633	0 %	75 %	25 %	0 %	301066431
21523	NC_014334	GCA	2	6	1337650	1337655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066431
21524	NC_014334	CCA	2	6	1337656	1337661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066431
21525	NC_014334	GAT	2	6	1337713	1337718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066431
21526	NC_014334	TTCGA	2	10	1337727	1337736	20 %	40 %	20 %	20 %	301066431
21527	NC_014334	AGCC	2	8	1337760	1337767	25 %	0 %	25 %	50 %	301066431
21528	NC_014334	CGC	2	6	1337827	1337832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066431
21529	NC_014334	GGC	2	6	1337923	1337928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066431
21530	NC_014334	GGC	2	6	1337998	1338003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066431
21531	NC_014334	CTG	2	6	1338185	1338190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066431
21532	NC_014334	CAG	3	9	1338206	1338214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066431
21533	NC_014334	A	6	6	1338251	1338256	100 %	0 %	0 %	0 %	301066431
21534	NC_014334	GTCC	2	8	1338296	1338303	0 %	25 %	25 %	50 %	301066431
21535	NC_014334	TCAA	2	8	1338327	1338334	50 %	25 %	0 %	25 %	301066431
21536	NC_014334	AGC	2	6	1338339	1338344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066431
21537	NC_014334	GTC	2	6	1338347	1338352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066431
21538	NC_014334	A	6	6	1338376	1338381	100 %	0 %	0 %	0 %	301066431
21539	NC_014334	GTT	2	6	1338382	1338387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066431
21540	NC_014334	ATG	2	6	1338629	1338634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066432
21541	NC_014334	CGG	2	6	1338687	1338692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066432
21542	NC_014334	GTCAA	2	10	1338757	1338766	40 %	20 %	20 %	20 %	301066432
21543	NC_014334	GCA	2	6	1338946	1338951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066432
21544	NC_014334	GAT	2	6	1338994	1338999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066432
21545	NC_014334	ACA	2	6	1339108	1339113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066433
21546	NC_014334	ACAA	2	8	1339156	1339163	75 %	0 %	0 %	25 %	301066433
21547	NC_014334	GATT	2	8	1339175	1339182	25 %	50 %	25 %	0 %	301066433
21548	NC_014334	T	6	6	1339181	1339186	0 %	100 %	0 %	0 %	301066433
21549	NC_014334	GCGA	2	8	1339198	1339205	25 %	0 %	50 %	25 %	301066433
21550	NC_014334	A	6	6	1339459	1339464	100 %	0 %	0 %	0 %	301066433
21551	NC_014334	AAG	2	6	1339501	1339506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066433
21552	NC_014334	TGA	2	6	1339559	1339564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066433
21553	NC_014334	GGT	2	6	1339593	1339598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066433
21554	NC_014334	CGA	2	6	1339666	1339671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066433
21555	NC_014334	ATGC	2	8	1339926	1339933	25 %	25 %	25 %	25 %	301066433
21556	NC_014334	ACA	2	6	1339958	1339963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066433
21557	NC_014334	GC	3	6	1339965	1339970	0 %	0 %	50 %	50 %	301066433
21558	NC_014334	CAG	2	6	1340025	1340030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066433
21559	NC_014334	A	6	6	1340067	1340072	100 %	0 %	0 %	0 %	301066433
21560	NC_014334	CAT	2	6	1340085	1340090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066433
21561	NC_014334	ATT	2	6	1340208	1340213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066433
21562	NC_014334	CAAA	2	8	1340219	1340226	75 %	0 %	0 %	25 %	301066433
21563	NC_014334	CTA	2	6	1340273	1340278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066433
21564	NC_014334	CAT	2	6	1340315	1340320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066433
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21569	NC_014334	CAA	2	6	1340709	1340714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066433
21570	NC_014334	AGC	2	6	1340719	1340724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066433
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21572	NC_014334	CCAAA	2	10	1340731	1340740	60 %	0 %	0 %	40 %	301066433
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21577	NC_014334	AGC	2	6	1341041	1341046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066434
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21583	NC_014334	GTG	2	6	1341503	1341508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066434
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21588	NC_014334	TTTTGA	2	12	1341906	1341917	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	301066434
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21592	NC_014334	ATG	2	6	1342226	1342231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066435
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21598	NC_014334	AAAGC	2	10	1343036	1343045	60 %	0 %	20 %	20 %	301066436
21599	NC_014334	GC	3	6	1343168	1343173	0 %	0 %	50 %	50 %	301066436
21600	NC_014334	TA	3	6	1343212	1343217	50 %	50 %	0 %	0 %	301066436
21601	NC_014334	GAT	2	6	1343219	1343224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066436
21602	NC_014334	ATT	2	6	1343360	1343365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066436
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21607	NC_014334	TGAT	2	8	1343696	1343703	25 %	50 %	25 %	0 %	301066437
21608	NC_014334	GAT	2	6	1343740	1343745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066437
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21610	NC_014334	CAG	2	6	1343834	1343839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066437
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21612	NC_014334	GCT	2	6	1343989	1343994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066437
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21614	NC_014334	CTGCAA	2	12	1344166	1344177	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	301066437
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21616	NC_014334	CGAC	2	8	1344373	1344380	25 %	0 %	25 %	50 %	301066437
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21733	NC_014334	CAGG	2	8	1351436	1351443	25 %	0 %	50 %	25 %	301066446
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