MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_014334	TTG	2	6	1184686	1184691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066286
19003	NC_014334	CGA	2	6	1184759	1184764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066286
19004	NC_014334	TGA	2	6	1186233	1186238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066287
19005	NC_014334	GAA	2	6	1186245	1186250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066287
19006	NC_014334	ACA	2	6	1186356	1186361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066287
19007	NC_014334	AGC	2	6	1186378	1186383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066287
19008	NC_014334	CTT	2	6	1186417	1186422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066287
19009	NC_014334	GCT	2	6	1186459	1186464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066287
19010	NC_014334	GCG	2	6	1186508	1186513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066287
19011	NC_014334	TGA	2	6	1186527	1186532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066287
19012	NC_014334	ATC	2	6	1186920	1186925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066288
19013	NC_014334	TTGT	2	8	1186929	1186936	0 %	75 %	25 %	0 %	301066288
19014	NC_014334	TTG	2	6	1186949	1186954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066288
19015	NC_014334	TA	3	6	1186968	1186973	50 %	50 %	0 %	0 %	301066288
19016	NC_014334	TGG	2	6	1186989	1186994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066288
19017	NC_014334	TAT	2	6	1187067	1187072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066288
19018	NC_014334	TGT	2	6	1187080	1187085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066288
19019	NC_014334	CAA	2	6	1187087	1187092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066288
19020	NC_014334	GAT	2	6	1187144	1187149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066288
19021	NC_014334	AGATCT	2	12	1187215	1187226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	301066288
19022	NC_014334	TCC	2	6	1187227	1187232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301066288
19023	NC_014334	GAT	2	6	1187669	1187674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066289
19024	NC_014334	GTT	2	6	1187696	1187701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066289
19025	NC_014334	GACT	2	8	1187752	1187759	25 %	25 %	25 %	25 %	301066289
19026	NC_014334	TGA	2	6	1187869	1187874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066289
19027	NC_014334	CG	3	6	1187912	1187917	0 %	0 %	50 %	50 %	301066289
19028	NC_014334	CTT	2	6	1187930	1187935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066289
19029	NC_014334	ACC	2	6	1188024	1188029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066290
19030	NC_014334	GTTT	2	8	1188098	1188105	0 %	75 %	25 %	0 %	301066290
19031	NC_014334	T	6	6	1188130	1188135	0 %	100 %	0 %	0 %	301066290
19032	NC_014334	ATT	2	6	1188170	1188175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066290
19033	NC_014334	T	6	6	1188192	1188197	0 %	100 %	0 %	0 %	301066290
19034	NC_014334	T	7	7	1188237	1188243	0 %	100 %	0 %	0 %	301066290
19035	NC_014334	GTTA	2	8	1188272	1188279	25 %	50 %	25 %	0 %	301066290
19036	NC_014334	TGA	2	6	1188290	1188295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066290
19037	NC_014334	TGA	2	6	1188331	1188336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066290
19038	NC_014334	TCA	2	6	1188433	1188438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066290
19039	NC_014334	TTG	2	6	1188460	1188465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066290
19040	NC_014334	GTT	2	6	1188516	1188521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066290
19041	NC_014334	GAC	2	6	1188528	1188533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066290
19042	NC_014334	ATT	2	6	1188594	1188599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066290
19043	NC_014334	TCG	2	6	1188602	1188607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066290
19044	NC_014334	TGA	2	6	1188665	1188670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066290
19045	NC_014334	GAC	2	6	1188755	1188760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066290
19046	NC_014334	TC	3	6	1188781	1188786	0 %	50 %	0 %	50 %	301066290
19047	NC_014334	A	7	7	1188864	1188870	100 %	0 %	0 %	0 %	301066290
19048	NC_014334	TAG	2	6	1188913	1188918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066290
19049	NC_014334	CAT	2	6	1188977	1188982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066290
19050	NC_014334	A	6	6	1189028	1189033	100 %	0 %	0 %	0 %	301066291
19051	NC_014334	A	7	7	1189035	1189041	100 %	0 %	0 %	0 %	301066291
19052	NC_014334	GAT	2	6	1189081	1189086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066291
19053	NC_014334	GAT	2	6	1189151	1189156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066291
19054	NC_014334	TCTG	2	8	1189233	1189240	0 %	50 %	25 %	25 %	301066291
19055	NC_014334	ATT	2	6	1189265	1189270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066291
19056	NC_014334	GTT	2	6	1189319	1189324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066291
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19058	NC_014334	ATGGG	2	10	1189468	1189477	20 %	20 %	60 %	0 %	301066291
19059	NC_014334	A	6	6	1189485	1189490	100 %	0 %	0 %	0 %	301066291
19060	NC_014334	CAGT	2	8	1189505	1189512	25 %	25 %	25 %	25 %	301066291
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19062	NC_014334	ATTT	2	8	1189533	1189540	25 %	75 %	0 %	0 %	301066291
19063	NC_014334	T	6	6	1189551	1189556	0 %	100 %	0 %	0 %	301066291
19064	NC_014334	TG	3	6	1189830	1189835	0 %	50 %	50 %	0 %	301066292
19065	NC_014334	TTGC	2	8	1189897	1189904	0 %	50 %	25 %	25 %	301066292
19066	NC_014334	TAAAT	2	10	1189928	1189937	60 %	40 %	0 %	0 %	301066292
19067	NC_014334	GGC	2	6	1189946	1189951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066292
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19069	NC_014334	ATT	2	6	1190097	1190102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066292
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19074	NC_014334	TCGA	2	8	1190267	1190274	25 %	25 %	25 %	25 %	301066292
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19082	NC_014334	TTAA	2	8	1190691	1190698	50 %	50 %	0 %	0 %	301066292
19083	NC_014334	AAT	2	6	1190766	1190771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066292
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19089	NC_014334	AGG	2	6	1191340	1191345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301066294
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19099	NC_014334	GA	3	6	1191841	1191846	50 %	0 %	50 %	0 %	301066294
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19101	NC_014334	AAG	2	6	1191959	1191964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066294
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19104	NC_014334	AT	3	6	1192169	1192174	50 %	50 %	0 %	0 %	301066294
19105	NC_014334	ATT	2	6	1192216	1192221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066294
19106	NC_014334	ACATT	2	10	1192222	1192231	40 %	40 %	0 %	20 %	301066294
19107	NC_014334	A	8	8	1192240	1192247	100 %	0 %	0 %	0 %	301066294
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19114	NC_014334	GC	3	6	1192751	1192756	0 %	0 %	50 %	50 %	301066295
19115	NC_014334	CGTT	2	8	1192778	1192785	0 %	50 %	25 %	25 %	301066295
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19117	NC_014334	ACG	2	6	1192849	1192854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066295
19118	NC_014334	GTT	2	6	1192855	1192860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066295
19119	NC_014334	GAC	2	6	1192887	1192892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066295
19120	NC_014334	GAC	2	6	1192932	1192937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066295
19121	NC_014334	GCA	2	6	1193169	1193174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066296
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19231	NC_014334	GAT	2	6	1200131	1200136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066302
19232	NC_014334	GAT	2	6	1200217	1200222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066302
19233	NC_014334	CCG	2	6	1200231	1200236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066302
19234	NC_014334	ATC	2	6	1200320	1200325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066302
19235	NC_014334	ATGA	2	8	1200440	1200447	50 %	25 %	25 %	0 %	301066302
19236	NC_014334	TGG	2	6	1200516	1200521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066302
19237	NC_014334	AAGG	2	8	1200533	1200540	50 %	0 %	50 %	0 %	301066302
19238	NC_014334	A	6	6	1200689	1200694	100 %	0 %	0 %	0 %	301066302
19239	NC_014334	ATGG	2	8	1200736	1200743	25 %	25 %	50 %	0 %	301066302
19240	NC_014334	TGG	2	6	1200779	1200784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066302
19241	NC_014334	TCA	2	6	1200787	1200792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066302
19242	NC_014334	ACA	2	6	1200807	1200812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066302
19243	NC_014334	GCA	2	6	1200868	1200873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066302
19244	NC_014334	CTA	2	6	1200967	1200972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066302
19245	NC_014334	ATT	2	6	1201004	1201009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066302
19246	NC_014334	GATG	2	8	1201150	1201157	25 %	25 %	50 %	0 %	301066302
19247	NC_014334	ACAA	2	8	1201239	1201246	75 %	0 %	0 %	25 %	301066302
19248	NC_014334	TGA	3	9	1201299	1201307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066302
19249	NC_014334	CAA	2	6	1201331	1201336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066302
19250	NC_014334	AACGA	2	10	1201388	1201397	60 %	0 %	20 %	20 %	301066302
19251	NC_014334	ATCT	2	8	1201413	1201420	25 %	50 %	0 %	25 %	301066302
19252	NC_014334	AAG	2	6	1201506	1201511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066302
19253	NC_014334	GCTT	2	8	1201630	1201637	0 %	50 %	25 %	25 %	301066302
19254	NC_014334	ATG	2	6	1201686	1201691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066302
19255	NC_014334	ATC	2	6	1201730	1201735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066302
19256	NC_014334	ATT	2	6	1201802	1201807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066302
19257	NC_014334	TGGC	2	8	1201923	1201930	0 %	25 %	50 %	25 %	301066302
19258	NC_014334	CAA	2	6	1201950	1201955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066302
19259	NC_014334	TGG	2	6	1201977	1201982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066302
19260	NC_014334	TGA	2	6	1201987	1201992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066302
19261	NC_014334	GC	3	6	1201996	1202001	0 %	0 %	50 %	50 %	301066302
19262	NC_014334	AAG	2	6	1202021	1202026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066302
19263	NC_014334	ATCG	2	8	1202039	1202046	25 %	25 %	25 %	25 %	301066302
19264	NC_014334	GTT	2	6	1202099	1202104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066302
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19266	NC_014334	GCA	2	6	1202124	1202129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066302
19267	NC_014334	CA	3	6	1202152	1202157	50 %	0 %	0 %	50 %	301066302
19268	NC_014334	GCA	2	6	1202176	1202181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066302
19269	NC_014334	ATTC	2	8	1202507	1202514	25 %	50 %	0 %	25 %	301066303
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19285	NC_014334	GC	3	6	1203170	1203175	0 %	0 %	50 %	50 %	301066303
19286	NC_014334	GACT	2	8	1203195	1203202	25 %	25 %	25 %	25 %	301066303
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19312	NC_014334	TGC	2	6	1205063	1205068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066305
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19319	NC_014334	TAT	2	6	1205283	1205288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066305
19320	NC_014334	CG	4	8	1205294	1205301	0 %	0 %	50 %	50 %	301066305
19321	NC_014334	TTTGGA	2	12	1205464	1205475	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	301066306
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19323	NC_014334	GATC	2	8	1205490	1205497	25 %	25 %	25 %	25 %	301066306
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19330	NC_014334	GCA	2	6	1205906	1205911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066306
19331	NC_014334	GTT	2	6	1205914	1205919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066306
19332	NC_014334	GGC	3	9	1205926	1205934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066306
19333	NC_014334	TGA	2	6	1206009	1206014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066306
19334	NC_014334	ATC	2	6	1206019	1206024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066306
19335	NC_014334	TTG	2	6	1206154	1206159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066306
19336	NC_014334	GAA	2	6	1206259	1206264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066306
19337	NC_014334	TGC	2	6	1206279	1206284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066306
19338	NC_014334	GAA	2	6	1206432	1206437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066306
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19340	NC_014334	A	6	6	1206572	1206577	100 %	0 %	0 %	0 %	301066307
19341	NC_014334	TAA	2	6	1206643	1206648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066307
19342	NC_014334	CAA	2	6	1206757	1206762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066307
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19344	NC_014334	ATT	2	6	1206903	1206908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066307
19345	NC_014334	GCT	2	6	1206983	1206988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066307
19346	NC_014334	GTT	2	6	1207040	1207045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066307
19347	NC_014334	TGT	2	6	1207077	1207082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066307
19348	NC_014334	ATCGC	2	10	1207104	1207113	20 %	20 %	20 %	40 %	301066307
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19463	NC_014334	CCA	2	6	1212894	1212899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066315
19464	NC_014334	A	6	6	1212997	1213002	100 %	0 %	0 %	0 %	301066315
19465	NC_014334	ATC	2	6	1213082	1213087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066315
19466	NC_014334	ATT	2	6	1213099	1213104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066315
19467	NC_014334	GC	3	6	1213219	1213224	0 %	0 %	50 %	50 %	301066315
19468	NC_014334	GGAAC	2	10	1213238	1213247	40 %	0 %	40 %	20 %	301066315
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19472	NC_014334	AGC	2	6	1213343	1213348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066315
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19491	NC_014334	TCGT	2	8	1214650	1214657	0 %	50 %	25 %	25 %	301066317
19492	NC_014334	CCA	2	6	1214695	1214700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066317
19493	NC_014334	TGG	2	6	1214706	1214711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066317
19494	NC_014334	T	6	6	1214730	1214735	0 %	100 %	0 %	0 %	301066317
19495	NC_014334	ATT	2	6	1214968	1214973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066318
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19497	NC_014334	A	7	7	1215102	1215108	100 %	0 %	0 %	0 %	301066318
19498	NC_014334	T	6	6	1215134	1215139	0 %	100 %	0 %	0 %	301066318
19499	NC_014334	GTT	2	6	1215195	1215200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066318
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