MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_014334	CAA	2	6	1150605	1150610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066252
18503	NC_014334	GAT	2	6	1150754	1150759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066252
18504	NC_014334	ACA	2	6	1150798	1150803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066252
18505	NC_014334	GT	3	6	1151097	1151102	0 %	50 %	50 %	0 %	301066253
18506	NC_014334	AGT	2	6	1151135	1151140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066253
18507	NC_014334	CAG	2	6	1151148	1151153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066253
18508	NC_014334	GCC	2	6	1151156	1151161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066253
18509	NC_014334	ATT	2	6	1151284	1151289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066253
18510	NC_014334	GAT	2	6	1151303	1151308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066253
18511	NC_014334	ATC	2	6	1151388	1151393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066253
18512	NC_014334	TGC	2	6	1151412	1151417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066253
18513	NC_014334	ACC	2	6	1151427	1151432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066253
18514	NC_014334	GGC	2	6	1151459	1151464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066253
18515	NC_014334	GAT	2	6	1151557	1151562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066253
18516	NC_014334	ATT	2	6	1151654	1151659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066253
18517	NC_014334	GAC	2	6	1151666	1151671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066253
18518	NC_014334	GAT	2	6	1151678	1151683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066253
18519	NC_014334	ACTT	2	8	1151726	1151733	25 %	50 %	0 %	25 %	301066253
18520	NC_014334	ATTG	2	8	1151809	1151816	25 %	50 %	25 %	0 %	301066254
18521	NC_014334	TGC	2	6	1151842	1151847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066254
18522	NC_014334	ACGG	2	8	1151881	1151888	25 %	0 %	50 %	25 %	301066254
18523	NC_014334	AAG	2	6	1151946	1151951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066254
18524	NC_014334	GGC	2	6	1151987	1151992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066254
18525	NC_014334	GAA	2	6	1151998	1152003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066254
18526	NC_014334	CAG	2	6	1152126	1152131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066254
18527	NC_014334	CTGG	2	8	1152146	1152153	0 %	25 %	50 %	25 %	301066254
18528	NC_014334	TTGC	2	8	1152158	1152165	0 %	50 %	25 %	25 %	301066254
18529	NC_014334	AAT	2	6	1152248	1152253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066254
18530	NC_014334	GGC	2	6	1152275	1152280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066254
18531	NC_014334	GGC	3	9	1152313	1152321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066254
18532	NC_014334	AGCA	2	8	1152354	1152361	50 %	0 %	25 %	25 %	301066254
18533	NC_014334	GT	3	6	1152439	1152444	0 %	50 %	50 %	0 %	301066254
18534	NC_014334	AACGC	2	10	1152447	1152456	40 %	0 %	20 %	40 %	301066254
18535	NC_014334	GAT	2	6	1152475	1152480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066254
18536	NC_014334	TGA	2	6	1152526	1152531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066254
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18539	NC_014334	TGA	2	6	1152900	1152905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066255
18540	NC_014334	CAA	2	6	1152953	1152958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066255
18541	NC_014334	GAA	2	6	1153013	1153018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066255
18542	NC_014334	ATG	2	6	1153020	1153025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066255
18543	NC_014334	AGG	2	6	1153062	1153067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301066255
18544	NC_014334	CAA	2	6	1153178	1153183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066255
18545	NC_014334	GTC	2	6	1153259	1153264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066255
18546	NC_014334	TGG	2	6	1153303	1153308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066255
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18551	NC_014334	CAGA	2	8	1153934	1153941	50 %	0 %	25 %	25 %	301066256
18552	NC_014334	GTT	2	6	1154001	1154006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066256
18553	NC_014334	TCG	2	6	1154028	1154033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066256
18554	NC_014334	CGG	2	6	1154110	1154115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066256
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18556	NC_014334	GCT	2	6	1154321	1154326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066256
18557	NC_014334	ATC	2	6	1154348	1154353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066256
18558	NC_014334	ATC	2	6	1154397	1154402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066256
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18582	NC_014334	ATT	2	6	1155789	1155794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066258
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18589	NC_014334	ATG	2	6	1156119	1156124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066258
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18595	NC_014334	GTGGC	2	10	1156338	1156347	0 %	20 %	60 %	20 %	301066258
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18603	NC_014334	GT	3	6	1157196	1157201	0 %	50 %	50 %	0 %	301066259
18604	NC_014334	TTG	2	6	1157223	1157228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066259
18605	NC_014334	CA	3	6	1157483	1157488	50 %	0 %	0 %	50 %	301066260
18606	NC_014334	ACTG	2	8	1157584	1157591	25 %	25 %	25 %	25 %	301066260
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18610	NC_014334	AAT	2	6	1157693	1157698	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066260
18611	NC_014334	CTGG	2	8	1157777	1157784	0 %	25 %	50 %	25 %	301066260
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18615	NC_014334	TGA	2	6	1157849	1157854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066260
18616	NC_014334	GAA	2	6	1157866	1157871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066260
18617	NC_014334	GTT	2	6	1157905	1157910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066260
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18729	NC_014334	CTT	2	6	1165559	1165564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066266
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18732	NC_014334	AGC	2	6	1165816	1165821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066267
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18832	NC_014334	GCA	2	6	1173318	1173323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066277
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18962	NC_014334	TGG	2	6	1181667	1181672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066283
18963	NC_014334	TAAAG	2	10	1181807	1181816	60 %	20 %	20 %	0 %	301066284
18964	NC_014334	TTA	2	6	1181827	1181832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066284
18965	NC_014334	TCA	2	6	1181881	1181886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066284
18966	NC_014334	CATGT	2	10	1181917	1181926	20 %	40 %	20 %	20 %	301066284
18967	NC_014334	TTAG	2	8	1182114	1182121	25 %	50 %	25 %	0 %	301066285
18968	NC_014334	T	6	6	1182171	1182176	0 %	100 %	0 %	0 %	301066285
18969	NC_014334	GAT	2	6	1182200	1182205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066285
18970	NC_014334	CTGC	2	8	1182260	1182267	0 %	25 %	25 %	50 %	301066285
18971	NC_014334	AAG	2	6	1182347	1182352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066285
18972	NC_014334	GTGATC	2	12	1182427	1182438	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	301066285
18973	NC_014334	TTA	2	6	1182454	1182459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066285
18974	NC_014334	CTG	2	6	1182468	1182473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066285
18975	NC_014334	GAC	2	6	1182587	1182592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066285
18976	NC_014334	TTGC	2	8	1182636	1182643	0 %	50 %	25 %	25 %	301066285
18977	NC_014334	AGA	2	6	1183438	1183443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066286
18978	NC_014334	CTG	2	6	1183473	1183478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066286
18979	NC_014334	CACC	2	8	1183513	1183520	25 %	0 %	0 %	75 %	301066286
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18981	NC_014334	AC	3	6	1183594	1183599	50 %	0 %	0 %	50 %	301066286
18982	NC_014334	TCAG	2	8	1183699	1183706	25 %	25 %	25 %	25 %	301066286
18983	NC_014334	CCG	2	6	1183843	1183848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066286
18984	NC_014334	TGC	2	6	1183880	1183885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066286
18985	NC_014334	GCA	2	6	1183902	1183907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066286
18986	NC_014334	GGC	2	6	1183983	1183988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066286
18987	NC_014334	CAG	2	6	1183994	1183999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066286
18988	NC_014334	GGT	2	6	1184025	1184030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066286
18989	NC_014334	CCAAG	2	10	1184053	1184062	40 %	0 %	20 %	40 %	301066286
18990	NC_014334	CAAG	2	8	1184098	1184105	50 %	0 %	25 %	25 %	301066286
18991	NC_014334	CCAGCA	2	12	1184152	1184163	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	301066286
18992	NC_014334	GCA	4	12	1184200	1184211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066286
18993	NC_014334	CAAG	2	8	1184257	1184264	50 %	0 %	25 %	25 %	301066286
18994	NC_014334	GCA	2	6	1184308	1184313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066286
18995	NC_014334	CTG	2	6	1184341	1184346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066286
18996	NC_014334	CGA	2	6	1184404	1184409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066286
18997	NC_014334	AAG	2	6	1184419	1184424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066286
18998	NC_014334	CAG	2	6	1184489	1184494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066286
18999	NC_014334	TCA	2	6	1184527	1184532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066286
19000	NC_014334	CGTTCA	2	12	1184533	1184544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	301066286

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