MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_014334	CCAC	2	8	1061582	1061589	25 %	0 %	0 %	75 %	301066153
17002	NC_014334	T	6	6	1061613	1061618	0 %	100 %	0 %	0 %	301066153
17003	NC_014334	TGT	2	6	1061631	1061636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066153
17004	NC_014334	TAGT	2	8	1061720	1061727	25 %	50 %	25 %	0 %	301066154
17005	NC_014334	AAT	2	6	1061746	1061751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066154
17006	NC_014334	AAT	2	6	1061797	1061802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066154
17007	NC_014334	AGT	2	6	1061864	1061869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066154
17008	NC_014334	CAT	2	6	1061874	1061879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066154
17009	NC_014334	TCG	2	6	1061955	1061960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066154
17010	NC_014334	CCA	2	6	1061972	1061977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066154
17011	NC_014334	GCAC	2	8	1061984	1061991	25 %	0 %	25 %	50 %	301066154
17012	NC_014334	CAA	2	6	1062009	1062014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066154
17013	NC_014334	TGA	2	6	1062066	1062071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066154
17014	NC_014334	CTT	2	6	1062093	1062098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066154
17015	NC_014334	GTA	2	6	1062172	1062177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066154
17016	NC_014334	TTGC	2	8	1062214	1062221	0 %	50 %	25 %	25 %	301066154
17017	NC_014334	CTGAA	2	10	1062232	1062241	40 %	20 %	20 %	20 %	301066154
17018	NC_014334	GAT	2	6	1062249	1062254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066154
17019	NC_014334	GTA	2	6	1062265	1062270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066154
17020	NC_014334	GAA	2	6	1062279	1062284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066154
17021	NC_014334	TGC	2	6	1062299	1062304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066154
17022	NC_014334	GGT	2	6	1062347	1062352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066154
17023	NC_014334	T	6	6	1062409	1062414	0 %	100 %	0 %	0 %	301066154
17024	NC_014334	GAC	2	6	1062511	1062516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066154
17025	NC_014334	T	6	6	1062532	1062537	0 %	100 %	0 %	0 %	301066154
17026	NC_014334	TCGT	2	8	1062569	1062576	0 %	50 %	25 %	25 %	301066155
17027	NC_014334	GCC	2	6	1062590	1062595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066155
17028	NC_014334	GTT	2	6	1062629	1062634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066155
17029	NC_014334	TGG	2	6	1062649	1062654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066155
17030	NC_014334	A	6	6	1062658	1062663	100 %	0 %	0 %	0 %	301066155
17031	NC_014334	GCAG	2	8	1062664	1062671	25 %	0 %	50 %	25 %	301066155
17032	NC_014334	GAA	2	6	1062675	1062680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066155
17033	NC_014334	GC	3	6	1063245	1063250	0 %	0 %	50 %	50 %	301066156
17034	NC_014334	CCAG	2	8	1063347	1063354	25 %	0 %	25 %	50 %	301066156
17035	NC_014334	TTG	2	6	1063397	1063402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066156
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17037	NC_014334	TGT	2	6	1063508	1063513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066156
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17039	NC_014334	GAC	2	6	1063548	1063553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066156
17040	NC_014334	GTT	2	6	1063568	1063573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066156
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17042	NC_014334	TA	3	6	1063616	1063621	50 %	50 %	0 %	0 %	301066156
17043	NC_014334	AGT	2	6	1063677	1063682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066156
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17046	NC_014334	GCT	2	6	1063808	1063813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066156
17047	NC_014334	TCG	2	6	1063841	1063846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066156
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17050	NC_014334	GGT	2	6	1063935	1063940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066156
17051	NC_014334	TTG	2	6	1063992	1063997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066156
17052	NC_014334	AAT	2	6	1064087	1064092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066156
17053	NC_014334	GAA	2	6	1064152	1064157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066156
17054	NC_014334	CTG	2	6	1064160	1064165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066156
17055	NC_014334	GTT	2	6	1064256	1064261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066156
17056	NC_014334	CGGC	2	8	1064269	1064276	0 %	0 %	50 %	50 %	301066156
17057	NC_014334	CTTG	2	8	1064463	1064470	0 %	50 %	25 %	25 %	301066156
17058	NC_014334	ACC	2	6	1064569	1064574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066156
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17062	NC_014334	GAT	2	6	1064736	1064741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066156
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17064	NC_014334	GC	3	6	1064846	1064851	0 %	0 %	50 %	50 %	301066156
17065	NC_014334	ATG	2	6	1064866	1064871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066156
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17069	NC_014334	CGA	2	6	1065197	1065202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066156
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17083	NC_014334	A	8	8	1066062	1066069	100 %	0 %	0 %	0 %	301066157
17084	NC_014334	AAT	2	6	1066122	1066127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066157
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17087	NC_014334	TCA	2	6	1066329	1066334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066158
17088	NC_014334	ACGAT	2	10	1066337	1066346	40 %	20 %	20 %	20 %	301066158
17089	NC_014334	GCG	2	6	1066356	1066361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066158
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17092	NC_014334	GATGGG	2	12	1066500	1066511	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	301066158
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17098	NC_014334	ATC	2	6	1066714	1066719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066158
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17100	NC_014334	GGC	2	6	1066843	1066848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066158
17101	NC_014334	GTTG	2	8	1066857	1066864	0 %	50 %	50 %	0 %	301066158
17102	NC_014334	GCG	2	6	1066869	1066874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066158
17103	NC_014334	GCT	2	6	1066923	1066928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066158
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17105	NC_014334	CGA	2	6	1067000	1067005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066158
17106	NC_014334	GTAT	2	8	1067060	1067067	25 %	50 %	25 %	0 %	301066158
17107	NC_014334	GTT	2	6	1067247	1067252	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066158
17108	NC_014334	GAC	2	6	1067304	1067309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066158
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17110	NC_014334	CGA	2	6	1067432	1067437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066158
17111	NC_014334	TTA	2	6	1067484	1067489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066158
17112	NC_014334	GGC	2	6	1067503	1067508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066158
17113	NC_014334	GAGT	2	8	1067511	1067518	25 %	25 %	50 %	0 %	301066158
17114	NC_014334	AGA	2	6	1067526	1067531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066158
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17116	NC_014334	TCA	2	6	1067583	1067588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066158
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17349	NC_014334	ATG	2	6	1081313	1081318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066173
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17465	NC_014334	ATA	2	6	1088728	1088733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066180
17466	NC_014334	TAA	2	6	1088856	1088861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066180
17467	NC_014334	GTCA	2	8	1088869	1088876	25 %	25 %	25 %	25 %	301066180
17468	NC_014334	TCT	2	6	1088892	1088897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066180
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17471	NC_014334	ATC	2	6	1089013	1089018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066180
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17492	NC_014334	A	6	6	1090984	1090989	100 %	0 %	0 %	0 %	301066183
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17500	NC_014334	TAGA	2	8	1091573	1091580	50 %	25 %	25 %	0 %	301066184

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