MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_014334	CTTC	2	8	1002226	1002233	0 %	50 %	0 %	50 %	301066099
16002	NC_014334	CCAT	2	8	1002325	1002332	25 %	25 %	0 %	50 %	301066099
16003	NC_014334	AGC	2	6	1002339	1002344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066099
16004	NC_014334	GGTT	2	8	1002353	1002360	0 %	50 %	50 %	0 %	301066099
16005	NC_014334	GAC	2	6	1002432	1002437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066099
16006	NC_014334	TGC	2	6	1002485	1002490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066099
16007	NC_014334	TCA	2	6	1002607	1002612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066099
16008	NC_014334	CCG	2	6	1002655	1002660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066099
16009	NC_014334	CAA	2	6	1002695	1002700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066099
16010	NC_014334	TTG	2	6	1002732	1002737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066099
16011	NC_014334	GCTG	2	8	1002742	1002749	0 %	25 %	50 %	25 %	301066099
16012	NC_014334	AGC	2	6	1002756	1002761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066099
16013	NC_014334	GTC	2	6	1002879	1002884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066099
16014	NC_014334	CAT	2	6	1002929	1002934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066099
16015	NC_014334	TCC	2	6	1002946	1002951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301066100
16016	NC_014334	GCA	2	6	1002970	1002975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066100
16017	NC_014334	CG	3	6	1003013	1003018	0 %	0 %	50 %	50 %	301066100
16018	NC_014334	TCA	2	6	1003069	1003074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066100
16019	NC_014334	TTTG	2	8	1003130	1003137	0 %	75 %	25 %	0 %	301066100
16020	NC_014334	CGG	3	9	1003160	1003168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066100
16021	NC_014334	GTC	2	6	1003195	1003200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066100
16022	NC_014334	TGT	2	6	1003218	1003223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066100
16023	NC_014334	CAGC	2	8	1003271	1003278	25 %	0 %	25 %	50 %	301066100
16024	NC_014334	GCC	2	6	1003293	1003298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066100
16025	NC_014334	TCGT	2	8	1003306	1003313	0 %	50 %	25 %	25 %	301066100
16026	NC_014334	AATCA	2	10	1003329	1003338	60 %	20 %	0 %	20 %	301066100
16027	NC_014334	GTCA	2	8	1003431	1003438	25 %	25 %	25 %	25 %	301066100
16028	NC_014334	GGT	2	6	1003464	1003469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066100
16029	NC_014334	CAAA	2	8	1003493	1003500	75 %	0 %	0 %	25 %	301066100
16030	NC_014334	AG	3	6	1003506	1003511	50 %	0 %	50 %	0 %	301066100
16031	NC_014334	CGT	2	6	1003539	1003544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066100
16032	NC_014334	GCGAA	2	10	1003626	1003635	40 %	0 %	40 %	20 %	301066100
16033	NC_014334	TGT	2	6	1003666	1003671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066100
16034	NC_014334	CAGC	2	8	1003678	1003685	25 %	0 %	25 %	50 %	301066100
16035	NC_014334	CCAA	2	8	1003715	1003722	50 %	0 %	0 %	50 %	301066100
16036	NC_014334	TCT	2	6	1003799	1003804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066101
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16038	NC_014334	CAA	2	6	1003855	1003860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066101
16039	NC_014334	A	6	6	1003900	1003905	100 %	0 %	0 %	0 %	301066101
16040	NC_014334	TGAT	2	8	1003934	1003941	25 %	50 %	25 %	0 %	301066101
16041	NC_014334	CAA	2	6	1004038	1004043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066101
16042	NC_014334	CCA	2	6	1004045	1004050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066101
16043	NC_014334	A	7	7	1004053	1004059	100 %	0 %	0 %	0 %	301066101
16044	NC_014334	GCC	2	6	1004064	1004069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066101
16045	NC_014334	ATGA	2	8	1004578	1004585	50 %	25 %	25 %	0 %	301066102
16046	NC_014334	GAA	2	6	1004692	1004697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066102
16047	NC_014334	GCC	2	6	1004746	1004751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066102
16048	NC_014334	GTTG	2	8	1004778	1004785	0 %	50 %	50 %	0 %	301066102
16049	NC_014334	GC	3	6	1004797	1004802	0 %	0 %	50 %	50 %	301066102
16050	NC_014334	ACG	2	6	1004847	1004852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066102
16051	NC_014334	CTG	2	6	1004900	1004905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066102
16052	NC_014334	TGA	2	6	1005126	1005131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066102
16053	NC_014334	TCA	2	6	1005134	1005139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066102
16054	NC_014334	TG	3	6	1005289	1005294	0 %	50 %	50 %	0 %	301066102
16055	NC_014334	TGGC	2	8	1005321	1005328	0 %	25 %	50 %	25 %	301066102
16056	NC_014334	GTG	2	6	1005329	1005334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066102
16057	NC_014334	A	6	6	1005361	1005366	100 %	0 %	0 %	0 %	301066102
16058	NC_014334	ATG	2	6	1005440	1005445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066102
16059	NC_014334	AAT	2	6	1005454	1005459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066102
16060	NC_014334	GCCAA	2	10	1005467	1005476	40 %	0 %	20 %	40 %	301066102
16061	NC_014334	TGA	2	6	1005540	1005545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066102
16062	NC_014334	ATC	2	6	1005590	1005595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066102
16063	NC_014334	GAA	2	6	1005652	1005657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066102
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16065	NC_014334	GAT	2	6	1005996	1006001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066102
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16067	NC_014334	GATTC	2	10	1006112	1006121	20 %	40 %	20 %	20 %	301066102
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16070	NC_014334	TGA	2	6	1006232	1006237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066102
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16073	NC_014334	GCTTA	2	10	1006355	1006364	20 %	40 %	20 %	20 %	301066102
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16100	NC_014334	ATT	2	6	1008021	1008026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066103
16101	NC_014334	CGA	2	6	1008128	1008133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066103
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16105	NC_014334	TTGGG	2	10	1008409	1008418	0 %	40 %	60 %	0 %	301066103
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16109	NC_014334	GACC	2	8	1008631	1008638	25 %	0 %	25 %	50 %	301066103
16110	NC_014334	TTG	2	6	1008661	1008666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066103
16111	NC_014334	AGC	2	6	1008727	1008732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066103
16112	NC_014334	CCT	2	6	1008782	1008787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301066103
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16116	NC_014334	GTT	2	6	1008941	1008946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066104
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16227	NC_014334	TGG	2	6	1015112	1015117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066110
16228	NC_014334	ATG	2	6	1015154	1015159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066110
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16231	NC_014334	CAT	2	6	1015188	1015193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066110
16232	NC_014334	GAT	3	9	1015221	1015229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066110
16233	NC_014334	CAGT	2	8	1015433	1015440	25 %	25 %	25 %	25 %	301066110
16234	NC_014334	GCT	2	6	1015495	1015500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066110
16235	NC_014334	CTG	2	6	1015610	1015615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066110
16236	NC_014334	GGA	2	6	1015683	1015688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301066110
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16239	NC_014334	GCT	2	6	1015854	1015859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066110
16240	NC_014334	GCC	2	6	1015861	1015866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066110
16241	NC_014334	CCAG	2	8	1015890	1015897	25 %	0 %	25 %	50 %	301066110
16242	NC_014334	GCA	2	6	1015917	1015922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066110
16243	NC_014334	TTGGCG	2	12	1015942	1015953	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	301066110
16244	NC_014334	GCA	2	6	1016558	1016563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066111
16245	NC_014334	AAC	2	6	1016639	1016644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066111
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16247	NC_014334	ATGG	2	8	1016833	1016840	25 %	25 %	50 %	0 %	301066111
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16250	NC_014334	GGTT	2	8	1016980	1016987	0 %	50 %	50 %	0 %	301066111
16251	NC_014334	TGC	2	6	1017013	1017018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066111
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16254	NC_014334	TGCGAC	2	12	1017116	1017127	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	301066111
16255	NC_014334	AGCG	2	8	1017144	1017151	25 %	0 %	50 %	25 %	301066111
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16333	NC_014334	GTT	2	6	1022007	1022012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066115
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16335	NC_014334	T	6	6	1022048	1022053	0 %	100 %	0 %	0 %	301066115
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16341	NC_014334	TCA	2	6	1022399	1022404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066115
16342	NC_014334	TCA	2	6	1022417	1022422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066115
16343	NC_014334	TCG	2	6	1022486	1022491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066115
16344	NC_014334	GAT	2	6	1022592	1022597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066115
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16346	NC_014334	ATG	2	6	1022689	1022694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066115
16347	NC_014334	CGG	2	6	1022702	1022707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066115
16348	NC_014334	TCTT	2	8	1022770	1022777	0 %	75 %	0 %	25 %	301066115
16349	NC_014334	GT	3	6	1022793	1022798	0 %	50 %	50 %	0 %	301066115
16350	NC_014334	GTT	2	6	1022808	1022813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066115
16351	NC_014334	GTTGG	2	10	1022838	1022847	0 %	40 %	60 %	0 %	301066115
16352	NC_014334	GAT	3	9	1022904	1022912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066115
16353	NC_014334	TTG	2	6	1023010	1023015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066115
16354	NC_014334	TGC	2	6	1023140	1023145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066115
16355	NC_014334	CCAG	2	8	1023317	1023324	25 %	0 %	25 %	50 %	301066116
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16357	NC_014334	GGC	2	6	1023460	1023465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066116
16358	NC_014334	CAT	2	6	1023487	1023492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066116
16359	NC_014334	TGA	2	6	1023493	1023498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066116
16360	NC_014334	CAA	2	6	1023500	1023505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066116
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16362	NC_014334	TCA	2	6	1023642	1023647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066116
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16364	NC_014334	ATA	2	6	1023694	1023699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066116
16365	NC_014334	CGT	2	6	1023709	1023714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066116
16366	NC_014334	TGGC	2	8	1024093	1024100	0 %	25 %	50 %	25 %	301066117
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16369	NC_014334	GGC	2	6	1024176	1024181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066117
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16375	NC_014334	GAT	2	6	1024445	1024450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066117
16376	NC_014334	TAAA	2	8	1024557	1024564	75 %	25 %	0 %	0 %	301066117
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16411	NC_014334	GCA	2	6	1027124	1027129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066121
16412	NC_014334	TGA	2	6	1027137	1027142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066121
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16427	NC_014334	TTA	2	6	1027842	1027847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066122
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16431	NC_014334	GACC	2	8	1027984	1027991	25 %	0 %	25 %	50 %	301066122
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16433	NC_014334	A	6	6	1028032	1028037	100 %	0 %	0 %	0 %	301066122
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16436	NC_014334	TCG	2	6	1028361	1028366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066123
16437	NC_014334	TCG	2	6	1028388	1028393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066123
16438	NC_014334	TGA	2	6	1028398	1028403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066123
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16442	NC_014334	TTG	2	6	1028529	1028534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066123
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16445	NC_014334	TGA	3	9	1028619	1028627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066123
16446	NC_014334	A	6	6	1028661	1028666	100 %	0 %	0 %	0 %	301066123
16447	NC_014334	GGC	2	6	1029071	1029076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066124
16448	NC_014334	CGA	2	6	1029085	1029090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066124
16449	NC_014334	GC	3	6	1029133	1029138	0 %	0 %	50 %	50 %	301066124
16450	NC_014334	ACG	2	6	1029177	1029182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066124
16451	NC_014334	TGT	2	6	1029212	1029217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066124
16452	NC_014334	GAA	2	6	1029350	1029355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066124
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16454	NC_014334	GTC	2	6	1029411	1029416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066124
16455	NC_014334	CGG	2	6	1029536	1029541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066124
16456	NC_014334	ATG	2	6	1029574	1029579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066124
16457	NC_014334	GCAA	2	8	1029745	1029752	50 %	0 %	25 %	25 %	301066124
16458	NC_014334	TGA	2	6	1029757	1029762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066124
16459	NC_014334	GCT	2	6	1029771	1029776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066124
16460	NC_014334	TCA	2	6	1029926	1029931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066124
16461	NC_014334	AGC	2	6	1030023	1030028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066125
16462	NC_014334	CCG	2	6	1030058	1030063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066125
16463	NC_014334	TGT	2	6	1030092	1030097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066125
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16488	NC_014334	TGA	2	6	1031356	1031361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066126
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