MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_014334	ACGATG	2	12	943950	943961	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	301066024
15002	NC_014334	AAG	2	6	944393	944398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066025
15003	NC_014334	GCGA	2	8	944405	944412	25 %	0 %	50 %	25 %	301066025
15004	NC_014334	T	7	7	944478	944484	0 %	100 %	0 %	0 %	301066025
15005	NC_014334	T	7	7	944520	944526	0 %	100 %	0 %	0 %	301066025
15006	NC_014334	GAT	2	6	944563	944568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066025
15007	NC_014334	GAA	2	6	944587	944592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066025
15008	NC_014334	AATGAA	2	12	944629	944640	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	301066025
15009	NC_014334	GTT	2	6	944722	944727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066025
15010	NC_014334	CTG	2	6	944746	944751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066025
15011	NC_014334	AAAG	2	8	944772	944779	75 %	0 %	25 %	0 %	301066025
15012	NC_014334	CGC	2	6	944826	944831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066025
15013	NC_014334	GTA	2	6	944840	944845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066025
15014	NC_014334	TGCT	2	8	944848	944855	0 %	50 %	25 %	25 %	301066025
15015	NC_014334	TTAT	2	8	944871	944878	25 %	75 %	0 %	0 %	301066025
15016	NC_014334	GTT	2	6	944998	945003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066026
15017	NC_014334	AAC	2	6	945025	945030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066026
15018	NC_014334	ATG	2	6	945102	945107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066026
15019	NC_014334	TGCC	2	8	945108	945115	0 %	25 %	25 %	50 %	301066026
15020	NC_014334	GGTTGC	2	12	945195	945206	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	301066026
15021	NC_014334	AGCA	2	8	945215	945222	50 %	0 %	25 %	25 %	301066026
15022	NC_014334	GGT	2	6	945305	945310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301066026
15023	NC_014334	CAA	2	6	945311	945316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066026
15024	NC_014334	TGC	2	6	945363	945368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066026
15025	NC_014334	AC	3	6	945470	945475	50 %	0 %	0 %	50 %	301066026
15026	NC_014334	AAG	3	9	945480	945488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066026
15027	NC_014334	CAA	2	6	945536	945541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066026
15028	NC_014334	ATG	2	6	945564	945569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066026
15029	NC_014334	CAT	2	6	945613	945618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066026
15030	NC_014334	GTT	2	6	945713	945718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066026
15031	NC_014334	AGA	2	6	945727	945732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066026
15032	NC_014334	ACT	2	6	945801	945806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066026
15033	NC_014334	ACG	2	6	945822	945827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066026
15034	NC_014334	GAAT	2	8	945835	945842	50 %	25 %	25 %	0 %	301066026
15035	NC_014334	CAAC	2	8	945855	945862	50 %	0 %	0 %	50 %	301066026
15036	NC_014334	GAA	2	6	945938	945943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066026
15037	NC_014334	A	6	6	946085	946090	100 %	0 %	0 %	0 %	301066027
15038	NC_014334	CCA	2	6	946092	946097	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066027
15039	NC_014334	CGC	2	6	946102	946107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301066027
15040	NC_014334	AC	3	6	946113	946118	50 %	0 %	0 %	50 %	301066027
15041	NC_014334	ATGTG	2	10	946122	946131	20 %	40 %	40 %	0 %	301066027
15042	NC_014334	ATT	2	6	946138	946143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066027
15043	NC_014334	TAT	2	6	946246	946251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066027
15044	NC_014334	TGC	2	6	946329	946334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066027
15045	NC_014334	ATT	2	6	946370	946375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066027
15046	NC_014334	TTG	2	6	946394	946399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066027
15047	NC_014334	TCAG	2	8	946428	946435	25 %	25 %	25 %	25 %	301066027
15048	NC_014334	TGC	2	6	946519	946524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066027
15049	NC_014334	GAA	2	6	946571	946576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066027
15050	NC_014334	TGC	2	6	946597	946602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066027
15051	NC_014334	CGG	2	6	946735	946740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066027
15052	NC_014334	CGA	2	6	946812	946817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066027
15053	NC_014334	TCG	2	6	946833	946838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066027
15054	NC_014334	TCA	3	9	946845	946853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066027
15055	NC_014334	AAG	3	9	946874	946882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066027
15056	NC_014334	GCG	2	6	946888	946893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066027
15057	NC_014334	GAT	2	6	947063	947068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066028
15058	NC_014334	TAT	2	6	947101	947106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066028
15059	NC_014334	TGT	2	6	947171	947176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066028
15060	NC_014334	CAA	2	6	947198	947203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066028
15061	NC_014334	TCT	2	6	947251	947256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066028
15062	NC_014334	TGA	2	6	947296	947301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066028
15063	NC_014334	TGA	2	6	947335	947340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066028
15064	NC_014334	TGC	2	6	947381	947386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066028
15065	NC_014334	CG	3	6	947422	947427	0 %	0 %	50 %	50 %	301066028
15066	NC_014334	T	6	6	947455	947460	0 %	100 %	0 %	0 %	301066028
15067	NC_014334	GAT	2	6	947493	947498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066028
15068	NC_014334	CTT	2	6	947510	947515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066028
15069	NC_014334	CTG	2	6	947628	947633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066028
15070	NC_014334	TAC	2	6	947643	947648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066028
15071	NC_014334	TTCA	2	8	947649	947656	25 %	50 %	0 %	25 %	301066028
15072	NC_014334	CAAA	2	8	947681	947688	75 %	0 %	0 %	25 %	301066028
15073	NC_014334	AAAC	2	8	947884	947891	75 %	0 %	0 %	25 %	301066029
15074	NC_014334	CAA	2	6	947950	947955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066029
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15080	NC_014334	AACC	2	8	948297	948304	50 %	0 %	0 %	50 %	301066029
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15085	NC_014334	CG	3	6	948482	948487	0 %	0 %	50 %	50 %	301066029
15086	NC_014334	GCA	2	6	948491	948496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066029
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15091	NC_014334	ACC	2	6	948729	948734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301066029
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15100	NC_014334	T	6	6	949683	949688	0 %	100 %	0 %	0 %	301066032
15101	NC_014334	CA	3	6	949743	949748	50 %	0 %	0 %	50 %	301066032
15102	NC_014334	T	7	7	949838	949844	0 %	100 %	0 %	0 %	301066032
15103	NC_014334	GCG	2	6	949847	949852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066032
15104	NC_014334	GAA	2	6	949875	949880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066032
15105	NC_014334	TCTG	2	8	949904	949911	0 %	50 %	25 %	25 %	301066032
15106	NC_014334	GGTG	2	8	949969	949976	0 %	25 %	75 %	0 %	301066032
15107	NC_014334	GAA	2	6	950015	950020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066032
15108	NC_014334	CCAC	2	8	950036	950043	25 %	0 %	0 %	75 %	301066032
15109	NC_014334	AG	3	6	950064	950069	50 %	0 %	50 %	0 %	301066032
15110	NC_014334	CAG	2	6	950152	950157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066032
15111	NC_014334	ACT	2	6	950195	950200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066032
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15114	NC_014334	GAA	2	6	950357	950362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066032
15115	NC_014334	GCG	2	6	950374	950379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066032
15116	NC_014334	TGA	2	6	950429	950434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066032
15117	NC_014334	AACA	2	8	950457	950464	75 %	0 %	0 %	25 %	301066032
15118	NC_014334	A	7	7	950510	950516	100 %	0 %	0 %	0 %	301066032
15119	NC_014334	AG	3	6	950528	950533	50 %	0 %	50 %	0 %	301066032
15120	NC_014334	CAA	2	6	950546	950551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066032
15121	NC_014334	TGC	2	6	950636	950641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066033
15122	NC_014334	TTA	2	6	950668	950673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066033
15123	NC_014334	CAT	2	6	950707	950712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066033
15124	NC_014334	TCA	2	6	950733	950738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066033
15125	NC_014334	AGA	3	9	950746	950754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066033
15126	NC_014334	GAT	2	6	950788	950793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066033
15127	NC_014334	AGA	2	6	950880	950885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066033
15128	NC_014334	AAG	2	6	950906	950911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066033
15129	NC_014334	AAAT	2	8	950926	950933	75 %	25 %	0 %	0 %	301066033
15130	NC_014334	GCAGAG	2	12	951143	951154	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	301066033
15131	NC_014334	GCT	2	6	951169	951174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066033
15132	NC_014334	ATAC	2	8	951341	951348	50 %	25 %	0 %	25 %	301066033
15133	NC_014334	GAA	2	6	951349	951354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066033
15134	NC_014334	ATG	2	6	951355	951360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066033
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15136	NC_014334	CAA	2	6	951705	951710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066035
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15140	NC_014334	AAG	2	6	951797	951802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066035
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15144	NC_014334	GAA	2	6	952084	952089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066035
15145	NC_014334	ATG	2	6	952199	952204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066035
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15148	NC_014334	CTT	2	6	952407	952412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066035
15149	NC_014334	GGC	2	6	952417	952422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066035
15150	NC_014334	T	6	6	952519	952524	0 %	100 %	0 %	0 %	301066035
15151	NC_014334	CAT	2	6	952536	952541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066035
15152	NC_014334	T	6	6	952655	952660	0 %	100 %	0 %	0 %	301066035
15153	NC_014334	TCT	2	6	952664	952669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301066035
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15158	NC_014334	TCAG	2	8	953024	953031	25 %	25 %	25 %	25 %	301066035
15159	NC_014334	GCA	2	6	953073	953078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066035
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15163	NC_014334	ATT	2	6	953401	953406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066035
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15172	NC_014334	GC	3	6	954019	954024	0 %	0 %	50 %	50 %	301066035
15173	NC_014334	TGCC	2	8	954042	954049	0 %	25 %	25 %	50 %	301066035
15174	NC_014334	TTG	2	6	954094	954099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066035
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15180	NC_014334	TCA	2	6	954432	954437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066035
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15183	NC_014334	GCA	2	6	954696	954701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066036
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15188	NC_014334	GAA	2	6	955044	955049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301066036
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15199	NC_014334	TGC	2	6	955640	955645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066037
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15211	NC_014334	GCT	2	6	955946	955951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066037
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15216	NC_014334	ATAA	2	8	956338	956345	75 %	25 %	0 %	0 %	301066037
15217	NC_014334	TGC	2	6	956432	956437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066038
15218	NC_014334	ATC	2	6	956534	956539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066038
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15222	NC_014334	CAA	2	6	956683	956688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301066038
15223	NC_014334	TGA	2	6	956700	956705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066038
15224	NC_014334	GCGA	2	8	956714	956721	25 %	0 %	50 %	25 %	301066038
15225	NC_014334	AAT	2	6	956745	956750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301066038
15226	NC_014334	GAC	2	6	956785	956790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066038
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15228	NC_014334	TTTG	2	8	956808	956815	0 %	75 %	25 %	0 %	301066038
15229	NC_014334	A	6	6	956851	956856	100 %	0 %	0 %	0 %	301066038
15230	NC_014334	TTTG	2	8	957143	957150	0 %	75 %	25 %	0 %	301066038
15231	NC_014334	CTCA	2	8	957189	957196	25 %	25 %	0 %	50 %	301066039
15232	NC_014334	TCA	2	6	957246	957251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066039
15233	NC_014334	TTG	2	6	957267	957272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066039
15234	NC_014334	GCT	2	6	957294	957299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066039
15235	NC_014334	TTA	2	6	957438	957443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066040
15236	NC_014334	TCG	2	6	957478	957483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066040
15237	NC_014334	TGC	2	6	957563	957568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066040
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15239	NC_014334	CGGT	2	8	957604	957611	0 %	25 %	50 %	25 %	301066040
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15358	NC_014334	ATC	2	6	964413	964418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066045
15359	NC_014334	ATC	2	6	964430	964435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301066045
15360	NC_014334	GCT	2	6	964521	964526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066045
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15476	NC_014334	CTG	2	6	971327	971332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066056
15477	NC_014334	ATT	2	6	971339	971344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301066056
15478	NC_014334	GCA	2	6	971458	971463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301066056
15479	NC_014334	GCG	2	6	971490	971495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301066056
15480	NC_014334	CTG	2	6	971527	971532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066056
15481	NC_014334	TGC	2	6	971551	971556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301066056
15482	NC_014334	GAT	2	6	971557	971562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301066056
15483	NC_014334	GTT	2	6	971606	971611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301066056
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