MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_014334	ATG	2	6	879984	879989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065968
14002	NC_014334	CAA	2	6	880009	880014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065968
14003	NC_014334	CGG	2	6	880056	880061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065968
14004	NC_014334	AAT	3	9	880136	880144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065968
14005	NC_014334	ATG	2	6	880154	880159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065968
14006	NC_014334	GCA	2	6	880201	880206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065968
14007	NC_014334	CA	3	6	880205	880210	50 %	0 %	0 %	50 %	301065968
14008	NC_014334	AGTT	2	8	880221	880228	25 %	50 %	25 %	0 %	301065968
14009	NC_014334	AGC	2	6	880230	880235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065968
14010	NC_014334	TTA	2	6	880241	880246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065968
14011	NC_014334	GCG	2	6	880298	880303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065968
14012	NC_014334	CTG	2	6	880328	880333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065968
14013	NC_014334	GATT	2	8	880360	880367	25 %	50 %	25 %	0 %	301065968
14014	NC_014334	AAG	2	6	880416	880421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065968
14015	NC_014334	ATT	2	6	880481	880486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065968
14016	NC_014334	ATTT	2	8	880563	880570	25 %	75 %	0 %	0 %	301065968
14017	NC_014334	T	6	6	880576	880581	0 %	100 %	0 %	0 %	301065968
14018	NC_014334	GCT	2	6	880631	880636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065968
14019	NC_014334	CTG	2	6	880668	880673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065968
14020	NC_014334	CGG	2	6	880680	880685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065968
14021	NC_014334	T	6	6	880709	880714	0 %	100 %	0 %	0 %	301065968
14022	NC_014334	GGT	2	6	880924	880929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065969
14023	NC_014334	CTG	2	6	880967	880972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065969
14024	NC_014334	CAAC	2	8	880985	880992	50 %	0 %	0 %	50 %	301065969
14025	NC_014334	CGG	2	6	881060	881065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065969
14026	NC_014334	GGC	2	6	881243	881248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065969
14027	NC_014334	CAG	2	6	881252	881257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065969
14028	NC_014334	TGA	2	6	881280	881285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065969
14029	NC_014334	ATC	2	6	881286	881291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065969
14030	NC_014334	ATT	2	6	881297	881302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065969
14031	NC_014334	CCG	2	6	881332	881337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065969
14032	NC_014334	CAT	2	6	881350	881355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065969
14033	NC_014334	CAAG	2	8	881380	881387	50 %	0 %	25 %	25 %	301065969
14034	NC_014334	AAGC	2	8	881429	881436	50 %	0 %	25 %	25 %	301065969
14035	NC_014334	GC	3	6	881539	881544	0 %	0 %	50 %	50 %	301065970
14036	NC_014334	TGC	2	6	881574	881579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065970
14037	NC_014334	TCGGC	2	10	881614	881623	0 %	20 %	40 %	40 %	301065970
14038	NC_014334	ATA	2	6	881639	881644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065970
14039	NC_014334	CGG	2	6	881655	881660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065970
14040	NC_014334	GTTT	2	8	881667	881674	0 %	75 %	25 %	0 %	301065970
14041	NC_014334	A	6	6	881713	881718	100 %	0 %	0 %	0 %	301065970
14042	NC_014334	CAA	2	6	881749	881754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065970
14043	NC_014334	AACC	2	8	881785	881792	50 %	0 %	0 %	50 %	301065970
14044	NC_014334	GGC	2	6	881861	881866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065970
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14046	NC_014334	GATTT	2	10	881902	881911	20 %	60 %	20 %	0 %	301065970
14047	NC_014334	GGC	2	6	881940	881945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065970
14048	NC_014334	CGT	2	6	881964	881969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065970
14049	NC_014334	TCG	2	6	881978	881983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065970
14050	NC_014334	CAC	2	6	882030	882035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065970
14051	NC_014334	GAA	2	6	882054	882059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065970
14052	NC_014334	GAA	2	6	882111	882116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065970
14053	NC_014334	CAG	2	6	882148	882153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065970
14054	NC_014334	AG	3	6	882152	882157	50 %	0 %	50 %	0 %	301065970
14055	NC_014334	TGAA	2	8	882158	882165	50 %	25 %	25 %	0 %	301065970
14056	NC_014334	GTG	2	6	882235	882240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065970
14057	NC_014334	TTGGT	2	10	882251	882260	0 %	60 %	40 %	0 %	301065970
14058	NC_014334	TTGC	2	8	882418	882425	0 %	50 %	25 %	25 %	301065970
14059	NC_014334	TGAAT	2	10	882456	882465	40 %	40 %	20 %	0 %	301065970
14060	NC_014334	TGG	2	6	882517	882522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065970
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14062	NC_014334	ACG	2	6	882573	882578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065970
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14064	NC_014334	CG	3	6	882622	882627	0 %	0 %	50 %	50 %	301065970
14065	NC_014334	GAT	2	6	882753	882758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065970
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14067	NC_014334	GTG	2	6	883012	883017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065970
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14089	NC_014334	TTTG	2	8	884748	884755	0 %	75 %	25 %	0 %	301065972
14090	NC_014334	GAT	2	6	884867	884872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065973
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14092	NC_014334	ACCA	2	8	884914	884921	50 %	0 %	0 %	50 %	301065973
14093	NC_014334	AAGA	2	8	884976	884983	75 %	0 %	25 %	0 %	301065973
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14106	NC_014334	GTC	2	6	885308	885313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065973
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14109	NC_014334	TCGAG	2	10	885518	885527	20 %	20 %	40 %	20 %	301065973
14110	NC_014334	AGCG	2	8	885652	885659	25 %	0 %	50 %	25 %	301065973
14111	NC_014334	TGC	2	6	885671	885676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065973
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14115	NC_014334	ATGG	2	8	885819	885826	25 %	25 %	50 %	0 %	301065973
14116	NC_014334	ACC	2	6	885842	885847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065973
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14119	NC_014334	AAC	2	6	886030	886035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065973
14120	NC_014334	GTT	2	6	886136	886141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065973
14121	NC_014334	TGA	2	6	886181	886186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065973
14122	NC_014334	TTG	2	6	886189	886194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065973
14123	NC_014334	TCA	2	6	886234	886239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065973
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14128	NC_014334	TCA	2	6	886534	886539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065973
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14152	NC_014334	GTT	2	6	887703	887708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065975
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14357	NC_014334	TGT	2	6	902525	902530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065987
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14361	NC_014334	CGA	2	6	902666	902671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065987
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14475	NC_014334	TGA	2	6	909149	909154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065992
14476	NC_014334	CAA	2	6	909163	909168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065992
14477	NC_014334	A	6	6	909189	909194	100 %	0 %	0 %	0 %	301065992
14478	NC_014334	CAA	2	6	909224	909229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065992
14479	NC_014334	AAT	2	6	909243	909248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065992
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