MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_014334	GCT	2	6	850289	850294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065940
13502	NC_014334	CG	3	6	850325	850330	0 %	0 %	50 %	50 %	301065940
13503	NC_014334	TCA	2	6	850434	850439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065940
13504	NC_014334	CAT	2	6	850454	850459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065940
13505	NC_014334	AACC	2	8	850470	850477	50 %	0 %	0 %	50 %	301065940
13506	NC_014334	GCA	2	6	850502	850507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065940
13507	NC_014334	GCCC	2	8	850523	850530	0 %	0 %	25 %	75 %	301065940
13508	NC_014334	GC	3	6	850533	850538	0 %	0 %	50 %	50 %	301065940
13509	NC_014334	CT	3	6	850673	850678	0 %	50 %	0 %	50 %	301065940
13510	NC_014334	GAT	2	6	850679	850684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065940
13511	NC_014334	A	6	6	850800	850805	100 %	0 %	0 %	0 %	301065940
13512	NC_014334	TTG	2	6	850909	850914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065941
13513	NC_014334	TCA	2	6	851010	851015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065941
13514	NC_014334	A	6	6	851085	851090	100 %	0 %	0 %	0 %	301065941
13515	NC_014334	GC	3	6	851150	851155	0 %	0 %	50 %	50 %	301065941
13516	NC_014334	GCC	2	6	851234	851239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065941
13517	NC_014334	TGC	2	6	851280	851285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065941
13518	NC_014334	TGA	2	6	851473	851478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065941
13519	NC_014334	T	6	6	851486	851491	0 %	100 %	0 %	0 %	301065941
13520	NC_014334	TTG	2	6	851516	851521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065941
13521	NC_014334	ATG	2	6	851570	851575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065942
13522	NC_014334	TTA	2	6	851828	851833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065942
13523	NC_014334	CAG	2	6	851898	851903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065942
13524	NC_014334	ATTTG	2	10	851913	851922	20 %	60 %	20 %	0 %	301065942
13525	NC_014334	ACA	2	6	851980	851985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065942
13526	NC_014334	ATT	2	6	852142	852147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065942
13527	NC_014334	TGA	2	6	852181	852186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065942
13528	NC_014334	GTT	2	6	852257	852262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065942
13529	NC_014334	GGC	2	6	852295	852300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065942
13530	NC_014334	TCG	2	6	852334	852339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065942
13531	NC_014334	TGA	2	6	852378	852383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065942
13532	NC_014334	A	6	6	852389	852394	100 %	0 %	0 %	0 %	301065942
13533	NC_014334	TGTT	2	8	852468	852475	0 %	75 %	25 %	0 %	301065942
13534	NC_014334	TGC	2	6	852502	852507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065942
13535	NC_014334	ACG	2	6	852614	852619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065942
13536	NC_014334	CGGG	2	8	852727	852734	0 %	0 %	75 %	25 %	301065942
13537	NC_014334	CGA	2	6	852748	852753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065942
13538	NC_014334	ATG	2	6	852818	852823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065942
13539	NC_014334	GGTGAT	2	12	852831	852842	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	301065942
13540	NC_014334	GTT	2	6	853047	853052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065943
13541	NC_014334	TGC	2	6	853158	853163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065943
13542	NC_014334	ATG	2	6	853217	853222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065943
13543	NC_014334	TCG	2	6	853320	853325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065943
13544	NC_014334	CGC	2	6	853340	853345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065943
13545	NC_014334	CAG	2	6	853367	853372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065943
13546	NC_014334	CAAAC	2	10	853384	853393	60 %	0 %	0 %	40 %	301065943
13547	NC_014334	TA	3	6	853415	853420	50 %	50 %	0 %	0 %	301065943
13548	NC_014334	GGAC	2	8	853426	853433	25 %	0 %	50 %	25 %	301065943
13549	NC_014334	TTC	2	6	853723	853728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065944
13550	NC_014334	TCTT	2	8	853813	853820	0 %	75 %	0 %	25 %	301065944
13551	NC_014334	GAA	2	6	853834	853839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065944
13552	NC_014334	GAT	3	9	853999	854007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065944
13553	NC_014334	GTT	2	6	854017	854022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065944
13554	NC_014334	AAG	2	6	854060	854065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065944
13555	NC_014334	CTT	2	6	854097	854102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065944
13556	NC_014334	GCG	2	6	854148	854153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065944
13557	NC_014334	CGA	2	6	854181	854186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065944
13558	NC_014334	GAA	2	6	854317	854322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065945
13559	NC_014334	TGA	2	6	854367	854372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065945
13560	NC_014334	GCG	2	6	854420	854425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065945
13561	NC_014334	TTC	2	6	854528	854533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065945
13562	NC_014334	CAT	2	6	854544	854549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065945
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13564	NC_014334	ATTC	2	8	854634	854641	25 %	50 %	0 %	25 %	301065945
13565	NC_014334	TGA	2	6	854684	854689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065945
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13572	NC_014334	CAAG	2	8	854964	854971	50 %	0 %	25 %	25 %	301065945
13573	NC_014334	CAT	2	6	855013	855018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065945
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13576	NC_014334	GAG	2	6	855113	855118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065945
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13578	NC_014334	GCG	2	6	855200	855205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065945
13579	NC_014334	GGTTG	2	10	855213	855222	0 %	40 %	60 %	0 %	301065945
13580	NC_014334	ACTG	2	8	855241	855248	25 %	25 %	25 %	25 %	301065945
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13582	NC_014334	CA	3	6	855372	855377	50 %	0 %	0 %	50 %	301065945
13583	NC_014334	ATCA	2	8	855412	855419	50 %	25 %	0 %	25 %	301065945
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13585	NC_014334	GGAC	2	8	855504	855511	25 %	0 %	50 %	25 %	301065945
13586	NC_014334	CG	3	6	856041	856046	0 %	0 %	50 %	50 %	301065946
13587	NC_014334	GCA	2	6	856093	856098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065946
13588	NC_014334	TGA	2	6	856104	856109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065946
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13590	NC_014334	TGA	2	6	856167	856172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065946
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13592	NC_014334	CACT	2	8	856346	856353	25 %	25 %	0 %	50 %	301065946
13593	NC_014334	TGT	2	6	856368	856373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065946
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13599	NC_014334	TGAT	2	8	856631	856638	25 %	50 %	25 %	0 %	301065946
13600	NC_014334	GGC	2	6	856666	856671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065946
13601	NC_014334	A	6	6	856676	856681	100 %	0 %	0 %	0 %	301065946
13602	NC_014334	CAT	2	6	856855	856860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065946
13603	NC_014334	CAT	2	6	856887	856892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065946
13604	NC_014334	TTG	2	6	856937	856942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065946
13605	NC_014334	AAG	2	6	857012	857017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065946
13606	NC_014334	CTT	2	6	857070	857075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065946
13607	NC_014334	AAG	2	6	857126	857131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065946
13608	NC_014334	CAA	2	6	857175	857180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065946
13609	NC_014334	GTT	2	6	857245	857250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065946
13610	NC_014334	TGA	2	6	857340	857345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065946
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13612	NC_014334	AAG	2	6	857390	857395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065946
13613	NC_014334	CGA	2	6	857441	857446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065946
13614	NC_014334	GTC	2	6	857537	857542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065946
13615	NC_014334	GAT	2	6	857620	857625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065946
13616	NC_014334	TGA	2	6	857627	857632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065946
13617	NC_014334	GAT	3	9	857686	857694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065946
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13619	NC_014334	GAA	2	6	857775	857780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065946
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13738	NC_014334	GCT	2	6	864103	864108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065952
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13977	NC_014334	TGA	2	6	878531	878536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065966
13978	NC_014334	GAA	2	6	878548	878553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065966
13979	NC_014334	CTG	2	6	878558	878563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065966
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13981	NC_014334	AAGTT	2	10	878729	878738	40 %	40 %	20 %	0 %	301065966
13982	NC_014334	GAA	2	6	878821	878826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065966
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13985	NC_014334	TCA	2	6	879206	879211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065967
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13999	NC_014334	CAG	2	6	879871	879876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065968
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