MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_014334	TGAT	2	8	820852	820859	25 %	50 %	25 %	0 %	301065912
13002	NC_014334	TCAT	2	8	820873	820880	25 %	50 %	0 %	25 %	301065912
13003	NC_014334	CGC	2	6	820912	820917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065912
13004	NC_014334	GAT	2	6	820988	820993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065912
13005	NC_014334	GCA	2	6	821041	821046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065912
13006	NC_014334	T	6	6	821161	821166	0 %	100 %	0 %	0 %	301065912
13007	NC_014334	TAAG	2	8	821181	821188	50 %	25 %	25 %	0 %	301065912
13008	NC_014334	CAC	2	6	821241	821246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065912
13009	NC_014334	A	6	6	821351	821356	100 %	0 %	0 %	0 %	301065912
13010	NC_014334	TGT	2	6	821402	821407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065912
13011	NC_014334	CAG	2	6	821495	821500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065912
13012	NC_014334	ACC	2	6	821544	821549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065912
13013	NC_014334	G	6	6	821557	821562	0 %	0 %	100 %	0 %	301065912
13014	NC_014334	CTGC	2	8	821666	821673	0 %	25 %	25 %	50 %	301065912
13015	NC_014334	AGT	2	6	821728	821733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065912
13016	NC_014334	GAT	2	6	821790	821795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065912
13017	NC_014334	CAA	2	6	821816	821821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065912
13018	NC_014334	GGC	2	6	821831	821836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065912
13019	NC_014334	TGA	2	6	821888	821893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065912
13020	NC_014334	CGGG	2	8	821904	821911	0 %	0 %	75 %	25 %	301065912
13021	NC_014334	CTG	2	6	821972	821977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065912
13022	NC_014334	TCA	2	6	822010	822015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065912
13023	NC_014334	CGATCA	2	12	822088	822099	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	301065912
13024	NC_014334	GCT	2	6	822148	822153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065912
13025	NC_014334	ATC	2	6	822406	822411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065913
13026	NC_014334	GAT	2	6	822492	822497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065913
13027	NC_014334	GCT	2	6	822498	822503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065913
13028	NC_014334	CAA	2	6	822688	822693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065914
13029	NC_014334	TTG	2	6	822763	822768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065914
13030	NC_014334	CGA	2	6	822867	822872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065914
13031	NC_014334	CAA	2	6	822891	822896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065914
13032	NC_014334	GTA	2	6	823040	823045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065914
13033	NC_014334	CAG	2	6	823049	823054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065914
13034	NC_014334	TGA	2	6	823064	823069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065914
13035	NC_014334	GTC	2	6	823177	823182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065914
13036	NC_014334	TGG	2	6	823223	823228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065914
13037	NC_014334	CGG	2	6	823358	823363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065914
13038	NC_014334	AAAC	2	8	823393	823400	75 %	0 %	0 %	25 %	301065914
13039	NC_014334	TGC	2	6	823443	823448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065914
13040	NC_014334	TTG	2	6	823475	823480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065914
13041	NC_014334	GCGTTG	2	12	823579	823590	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	301065914
13042	NC_014334	A	6	6	823606	823611	100 %	0 %	0 %	0 %	301065914
13043	NC_014334	GGC	2	6	823612	823617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065914
13044	NC_014334	GGC	2	6	823623	823628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065914
13045	NC_014334	CGG	2	6	823638	823643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065914
13046	NC_014334	CGG	2	6	823739	823744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065914
13047	NC_014334	CGA	2	6	823818	823823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065914
13048	NC_014334	GCT	2	6	823825	823830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065914
13049	NC_014334	AAC	2	6	823843	823848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065914
13050	NC_014334	GAC	2	6	823851	823856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065914
13051	NC_014334	CGG	2	6	823911	823916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065914
13052	NC_014334	GCA	2	6	823962	823967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065914
13053	NC_014334	TTA	2	6	823970	823975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065914
13054	NC_014334	GTG	2	6	823979	823984	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065914
13055	NC_014334	GGC	2	6	824188	824193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065915
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13057	NC_014334	TGCC	2	8	824265	824272	0 %	25 %	25 %	50 %	301065915
13058	NC_014334	GGGTGA	2	12	824299	824310	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	301065915
13059	NC_014334	AG	3	6	824314	824319	50 %	0 %	50 %	0 %	301065915
13060	NC_014334	TGG	2	6	824342	824347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065915
13061	NC_014334	ATG	2	6	824397	824402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065915
13062	NC_014334	GC	3	6	824416	824421	0 %	0 %	50 %	50 %	301065915
13063	NC_014334	CCG	2	6	824444	824449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065915
13064	NC_014334	CAAG	2	8	824465	824472	50 %	0 %	25 %	25 %	301065915
13065	NC_014334	ATG	2	6	824507	824512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065915
13066	NC_014334	ATC	2	6	824610	824615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065915
13067	NC_014334	ATG	2	6	824706	824711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065915
13068	NC_014334	GGCA	2	8	824730	824737	25 %	0 %	50 %	25 %	301065915
13069	NC_014334	AGC	2	6	824818	824823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065915
13070	NC_014334	GTTC	2	8	824863	824870	0 %	50 %	25 %	25 %	301065915
13071	NC_014334	TTG	2	6	825017	825022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065915
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13076	NC_014334	A	6	6	825379	825384	100 %	0 %	0 %	0 %	301065916
13077	NC_014334	GAA	2	6	825422	825427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065916
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13084	NC_014334	AGC	2	6	825813	825818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065916
13085	NC_014334	CTG	2	6	825920	825925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065916
13086	NC_014334	CAGA	2	8	825965	825972	50 %	0 %	25 %	25 %	301065916
13087	NC_014334	GATTG	2	10	825980	825989	20 %	40 %	40 %	0 %	301065916
13088	NC_014334	A	7	7	825990	825996	100 %	0 %	0 %	0 %	301065916
13089	NC_014334	CATG	2	8	826105	826112	25 %	25 %	25 %	25 %	301065917
13090	NC_014334	GC	3	6	826116	826121	0 %	0 %	50 %	50 %	301065917
13091	NC_014334	TTG	2	6	826128	826133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065917
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13093	NC_014334	CAA	2	6	826268	826273	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065917
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13099	NC_014334	GCCT	2	8	826529	826536	0 %	25 %	25 %	50 %	301065917
13100	NC_014334	GTT	2	6	826641	826646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065917
13101	NC_014334	AAATT	2	10	826927	826936	60 %	40 %	0 %	0 %	301065918
13102	NC_014334	AC	4	8	826973	826980	50 %	0 %	0 %	50 %	301065918
13103	NC_014334	ATT	2	6	827022	827027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065918
13104	NC_014334	TTG	2	6	827113	827118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065918
13105	NC_014334	GAA	2	6	827175	827180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065918
13106	NC_014334	A	7	7	827266	827272	100 %	0 %	0 %	0 %	301065918
13107	NC_014334	GAA	2	6	827442	827447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065918
13108	NC_014334	AAG	2	6	827452	827457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065918
13109	NC_014334	TGTT	2	8	827467	827474	0 %	75 %	25 %	0 %	301065918
13110	NC_014334	GCA	2	6	827486	827491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065918
13111	NC_014334	ATA	2	6	827561	827566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065919
13112	NC_014334	TGA	2	6	827634	827639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065919
13113	NC_014334	GGT	2	6	827652	827657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065919
13114	NC_014334	CGG	2	6	827667	827672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065919
13115	NC_014334	AGA	2	6	827814	827819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065919
13116	NC_014334	CGGA	2	8	827938	827945	25 %	0 %	50 %	25 %	301065919
13117	NC_014334	TG	4	8	827993	828000	0 %	50 %	50 %	0 %	301065919
13118	NC_014334	CGG	2	6	828039	828044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065919
13119	NC_014334	TAA	2	6	828099	828104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065919
13120	NC_014334	GAT	2	6	828181	828186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065919
13121	NC_014334	TCA	2	6	828212	828217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065919
13122	NC_014334	CCA	2	6	828220	828225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065919
13123	NC_014334	CAAA	2	8	828231	828238	75 %	0 %	0 %	25 %	301065919
13124	NC_014334	CCG	2	6	828366	828371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065920
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13129	NC_014334	ACGGCA	2	12	828464	828475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065920
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13132	NC_014334	CCGG	2	8	828612	828619	0 %	0 %	50 %	50 %	301065920
13133	NC_014334	TTAA	2	8	828684	828691	50 %	50 %	0 %	0 %	301065920
13134	NC_014334	TTG	2	6	828789	828794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065920
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13139	NC_014334	CAC	2	6	829180	829185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065920
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13148	NC_014334	GCT	2	6	829816	829821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065921
13149	NC_014334	T	6	6	829905	829910	0 %	100 %	0 %	0 %	301065921
13150	NC_014334	TAT	2	6	829925	829930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065921
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13152	NC_014334	CAGG	2	8	830012	830019	25 %	0 %	50 %	25 %	301065921
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13161	NC_014334	T	6	6	830342	830347	0 %	100 %	0 %	0 %	301065921
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13180	NC_014334	AG	3	6	831610	831615	50 %	0 %	50 %	0 %	301065923
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13220	NC_014334	TGG	2	6	834746	834751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065927
13221	NC_014334	ATT	2	6	834783	834788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065927
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13231	NC_014334	ATA	2	6	835225	835230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065927
13232	NC_014334	GAT	2	6	835275	835280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065927
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13235	NC_014334	GTT	2	6	835422	835427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065927
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13238	NC_014334	AAG	2	6	835822	835827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065928
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13240	NC_014334	TAA	2	6	835894	835899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065928
13241	NC_014334	TTG	2	6	835931	835936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065928
13242	NC_014334	GAT	2	6	835943	835948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065928
13243	NC_014334	GTC	2	6	835970	835975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065928
13244	NC_014334	TGC	2	6	835996	836001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065928
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13249	NC_014334	GTAG	2	8	836155	836162	25 %	25 %	50 %	0 %	301065928
13250	NC_014334	GCA	2	6	836197	836202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065928
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13311	NC_014334	TGC	2	6	840573	840578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065932
13312	NC_014334	GGC	2	6	840618	840623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065932
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13350	NC_014334	GGC	2	6	842315	842320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065933
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13354	NC_014334	TGA	2	6	842468	842473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065933
13355	NC_014334	GCC	2	6	842520	842525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065933
13356	NC_014334	GGA	2	6	842564	842569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065933
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13358	NC_014334	ATG	2	6	842808	842813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065934
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13476	NC_014334	A	6	6	849380	849385	100 %	0 %	0 %	0 %	301065940
13477	NC_014334	AGC	2	6	849388	849393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065940
13478	NC_014334	A	7	7	849400	849406	100 %	0 %	0 %	0 %	301065940
13479	NC_014334	CTG	2	6	849413	849418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065940
13480	NC_014334	ATC	2	6	849435	849440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065940
13481	NC_014334	CGG	2	6	849476	849481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065940
13482	NC_014334	CGG	2	6	849536	849541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065940
13483	NC_014334	GCA	2	6	849604	849609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065940
13484	NC_014334	CA	3	6	849659	849664	50 %	0 %	0 %	50 %	301065940
13485	NC_014334	GCA	2	6	849706	849711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065940
13486	NC_014334	TGA	2	6	849756	849761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065940
13487	NC_014334	AAAG	2	8	849764	849771	75 %	0 %	25 %	0 %	301065940
13488	NC_014334	CAGCG	2	10	849833	849842	20 %	0 %	40 %	40 %	301065940
13489	NC_014334	GTG	2	6	849875	849880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065940
13490	NC_014334	GAC	2	6	849893	849898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065940
13491	NC_014334	ATC	2	6	849911	849916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065940
13492	NC_014334	ATT	2	6	849971	849976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065940
13493	NC_014334	GAT	2	6	849977	849982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065940
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13496	NC_014334	ATCC	2	8	850073	850080	25 %	25 %	0 %	50 %	301065940
13497	NC_014334	GC	3	6	850109	850114	0 %	0 %	50 %	50 %	301065940
13498	NC_014334	GAC	2	6	850124	850129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065940
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13500	NC_014334	ACTG	2	8	850273	850280	25 %	25 %	25 %	25 %	301065940

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