MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_014334	GTT	2	6	683223	683228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065788
11003	NC_014334	CGT	2	6	683325	683330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065788
11004	NC_014334	GAC	2	6	683415	683420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065788
11005	NC_014334	GT	3	6	683565	683570	0 %	50 %	50 %	0 %	301065788
11006	NC_014334	CTG	3	9	683593	683601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065788
11007	NC_014334	GAA	2	6	683636	683641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065788
11008	NC_014334	CGA	2	6	683710	683715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065788
11009	NC_014334	GGT	2	6	683930	683935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065789
11010	NC_014334	GTG	2	6	683948	683953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065789
11011	NC_014334	ATA	2	6	683980	683985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065789
11012	NC_014334	GCC	2	6	683986	683991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065789
11013	NC_014334	CAGC	2	8	684015	684022	25 %	0 %	25 %	50 %	301065789
11014	NC_014334	GGC	2	6	684058	684063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065789
11015	NC_014334	GGC	2	6	684086	684091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065789
11016	NC_014334	CGT	2	6	684198	684203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065789
11017	NC_014334	GCC	2	6	684206	684211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065789
11018	NC_014334	AAT	2	6	684214	684219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065789
11019	NC_014334	GGC	2	6	684343	684348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065789
11020	NC_014334	AGT	2	6	684417	684422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065790
11021	NC_014334	AAC	2	6	684431	684436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065790
11022	NC_014334	TGA	2	6	684511	684516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065790
11023	NC_014334	GCT	2	6	684537	684542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065790
11024	NC_014334	CTT	2	6	684560	684565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065790
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11028	NC_014334	CGA	2	6	685076	685081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065791
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11031	NC_014334	GATT	2	8	685175	685182	25 %	50 %	25 %	0 %	301065791
11032	NC_014334	AAC	2	6	685203	685208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065791
11033	NC_014334	CAATA	2	10	685228	685237	60 %	20 %	0 %	20 %	301065791
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11037	NC_014334	ATG	2	6	685412	685417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065791
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11040	NC_014334	GCT	2	6	685536	685541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065791
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11052	NC_014334	TG	3	6	685964	685969	0 %	50 %	50 %	0 %	301065792
11053	NC_014334	CGTC	2	8	685970	685977	0 %	25 %	25 %	50 %	301065792
11054	NC_014334	TGC	2	6	686152	686157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065793
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11101	NC_014334	TGA	2	6	688908	688913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065794
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11120	NC_014334	ATGC	2	8	689902	689909	25 %	25 %	25 %	25 %	301065795
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11123	NC_014334	TGA	2	6	690077	690082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065795
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11226	NC_014334	ACC	2	6	695799	695804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065800
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11228	NC_014334	TCA	2	6	696043	696048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065800
11229	NC_014334	TA	4	8	696259	696266	50 %	50 %	0 %	0 %	301065801
11230	NC_014334	AAT	2	6	696278	696283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065801
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11232	NC_014334	GCA	2	6	696323	696328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065801
11233	NC_014334	TTC	2	6	696329	696334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065801
11234	NC_014334	GAT	2	6	696356	696361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065801
11235	NC_014334	GAA	2	6	696482	696487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065801
11236	NC_014334	AACT	2	8	696496	696503	50 %	25 %	0 %	25 %	301065801
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11238	NC_014334	ACCGA	2	10	696557	696566	40 %	0 %	20 %	40 %	301065801
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11358	NC_014334	TTC	2	6	703585	703590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065808
11359	NC_014334	TTA	2	6	703753	703758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065808
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11471	NC_014334	A	6	6	709787	709792	100 %	0 %	0 %	0 %	301065816
11472	NC_014334	GCA	2	6	709795	709800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065816
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11475	NC_014334	CAG	2	6	710134	710139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065817
11476	NC_014334	TGC	2	6	710211	710216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065817
11477	NC_014334	GTTA	2	8	710267	710274	25 %	50 %	25 %	0 %	301065817
11478	NC_014334	CAG	2	6	710309	710314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065817
11479	NC_014334	ATA	2	6	710367	710372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065817
11480	NC_014334	CAA	2	6	710401	710406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065817
11481	NC_014334	TGA	2	6	710491	710496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065817
11482	NC_014334	CCT	2	6	710527	710532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065818
11483	NC_014334	GGT	2	6	710567	710572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065818
11484	NC_014334	TTG	2	6	710592	710597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065818
11485	NC_014334	TTG	2	6	710690	710695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065818
11486	NC_014334	CACC	2	8	710698	710705	25 %	0 %	0 %	75 %	301065818
11487	NC_014334	TGCGG	2	10	710762	710771	0 %	20 %	60 %	20 %	301065818
11488	NC_014334	TCAA	2	8	710814	710821	50 %	25 %	0 %	25 %	301065818
11489	NC_014334	TTTG	2	8	710849	710856	0 %	75 %	25 %	0 %	301065818
11490	NC_014334	TG	3	6	710855	710860	0 %	50 %	50 %	0 %	301065818
11491	NC_014334	A	6	6	710871	710876	100 %	0 %	0 %	0 %	301065818
11492	NC_014334	ATG	4	12	710913	710924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065818
11493	NC_014334	AGT	2	6	710945	710950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065818
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11495	NC_014334	GGT	2	6	711307	711312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065819
11496	NC_014334	GCTT	2	8	711535	711542	0 %	50 %	25 %	25 %	301065820
11497	NC_014334	GCG	2	6	711561	711566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065820
11498	NC_014334	CAA	2	6	711570	711575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065820
11499	NC_014334	CCG	2	6	711695	711700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065820
11500	NC_014334	GAT	2	6	711747	711752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065820

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