MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10003	NC_014334	TGA	2	6	624303	624308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065721
10004	NC_014334	AAG	2	6	624314	624319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065721
10005	NC_014334	GAC	2	6	624325	624330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065721
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10007	NC_014334	TGC	2	6	624354	624359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065721
10008	NC_014334	ACG	2	6	624607	624612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065722
10009	NC_014334	AGTA	2	8	624752	624759	50 %	25 %	25 %	0 %	301065722
10010	NC_014334	TCA	2	6	624777	624782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065722
10011	NC_014334	CTTG	2	8	625273	625280	0 %	50 %	25 %	25 %	301065723
10012	NC_014334	GAC	2	6	625304	625309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065723
10013	NC_014334	TTGTT	2	10	625317	625326	0 %	80 %	20 %	0 %	301065723
10014	NC_014334	TGGT	2	8	625367	625374	0 %	50 %	50 %	0 %	301065723
10015	NC_014334	TGC	2	6	625375	625380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065723
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10017	NC_014334	A	7	7	625485	625491	100 %	0 %	0 %	0 %	301065723
10018	NC_014334	CAT	2	6	625522	625527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065723
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10020	NC_014334	GAA	2	6	625568	625573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065723
10021	NC_014334	TTCAC	2	10	625578	625587	20 %	40 %	0 %	40 %	301065723
10022	NC_014334	TGA	2	6	625593	625598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065723
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10028	NC_014334	AACC	2	8	626101	626108	50 %	0 %	0 %	50 %	301065724
10029	NC_014334	ACG	2	6	626193	626198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065724
10030	NC_014334	GCC	2	6	626285	626290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065724
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10032	NC_014334	CAG	2	6	626372	626377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065724
10033	NC_014334	ATC	2	6	626409	626414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065724
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10052	NC_014334	CCT	3	9	627277	627285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065725
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10100	NC_014334	TCAG	2	8	629591	629598	25 %	25 %	25 %	25 %	301065728
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10119	NC_014334	AGC	2	6	631025	631030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065730
10120	NC_014334	GCT	2	6	631090	631095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065730
10121	NC_014334	GTT	2	6	631149	631154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065730
10122	NC_014334	CGG	2	6	631178	631183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065730
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10124	NC_014334	TGTT	2	8	631226	631233	0 %	75 %	25 %	0 %	301065730
10125	NC_014334	TGC	2	6	631292	631297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065730
10126	NC_014334	TTTA	2	8	631395	631402	25 %	75 %	0 %	0 %	301065730
10127	NC_014334	T	7	7	631434	631440	0 %	100 %	0 %	0 %	301065730
10128	NC_014334	GCT	2	6	631441	631446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065730
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10130	NC_014334	GAT	2	6	631510	631515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065730
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10142	NC_014334	ATGCAG	2	12	632080	632091	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	301065731
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10147	NC_014334	GCTA	2	8	632381	632388	25 %	25 %	25 %	25 %	301065731
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10222	NC_014334	CG	3	6	636852	636857	0 %	0 %	50 %	50 %	301065736
10223	NC_014334	AG	3	6	636862	636867	50 %	0 %	50 %	0 %	301065736
10224	NC_014334	ATG	2	6	637114	637119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065737
10225	NC_014334	ACAA	2	8	637120	637127	75 %	0 %	0 %	25 %	301065737
10226	NC_014334	GCC	2	6	637140	637145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065737
10227	NC_014334	GGC	2	6	637155	637160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065737
10228	NC_014334	TCATG	2	10	637236	637245	20 %	40 %	20 %	20 %	301065737
10229	NC_014334	TGC	2	6	637259	637264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065737
10230	NC_014334	TTA	2	6	637293	637298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065737
10231	NC_014334	TTA	2	6	637386	637391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065737
10232	NC_014334	TTG	2	6	637430	637435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065737
10233	NC_014334	GGC	2	6	637444	637449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065737
10234	NC_014334	TGCC	2	8	637544	637551	0 %	25 %	25 %	50 %	301065737
10235	NC_014334	GTT	2	6	637584	637589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065737
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10238	NC_014334	GCTG	2	8	637905	637912	0 %	25 %	50 %	25 %	301065737
10239	NC_014334	ATG	2	6	637960	637965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065737
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10344	NC_014334	CAAAA	2	10	643736	643745	80 %	0 %	0 %	20 %	301065747
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10357	NC_014334	GAT	2	6	644563	644568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065748
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10472	NC_014334	A	7	7	652842	652848	100 %	0 %	0 %	0 %	301065756
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10476	NC_014334	A	6	6	652943	652948	100 %	0 %	0 %	0 %	301065756
10477	NC_014334	ACC	2	6	652957	652962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065756
10478	NC_014334	ATG	2	6	652964	652969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065756
10479	NC_014334	CACTG	2	10	652983	652992	20 %	20 %	20 %	40 %	301065756
10480	NC_014334	TGT	2	6	653007	653012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065756
10481	NC_014334	GGC	2	6	653037	653042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065756
10482	NC_014334	GAAA	2	8	653073	653080	75 %	0 %	25 %	0 %	301065756
10483	NC_014334	GTC	2	6	653089	653094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065756
10484	NC_014334	CGA	2	6	653105	653110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065756
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10486	NC_014334	GAA	2	6	653202	653207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065756
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10490	NC_014334	CTG	2	6	653619	653624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065757
10491	NC_014334	GCG	2	6	653690	653695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065757
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