MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014334	AT	3	6	30725	30730	50 %	50 %	0 %	0 %	301065157
502	NC_014334	GTT	2	6	30865	30870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065157
503	NC_014334	GCA	2	6	30879	30884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065157
504	NC_014334	CAA	2	6	30944	30949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065157
505	NC_014334	TGA	2	6	30955	30960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065157
506	NC_014334	TTGC	2	8	31177	31184	0 %	50 %	25 %	25 %	301065157
507	NC_014334	TGC	2	6	31308	31313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065157
508	NC_014334	CGC	2	6	31333	31338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065157
509	NC_014334	CAAA	2	8	31366	31373	75 %	0 %	0 %	25 %	301065157
510	NC_014334	GCC	2	6	31374	31379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065157
511	NC_014334	TAT	2	6	31453	31458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065157
512	NC_014334	ATT	2	6	31469	31474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065157
513	NC_014334	CTAC	2	8	31557	31564	25 %	25 %	0 %	50 %	301065157
514	NC_014334	TTG	2	6	31660	31665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065157
515	NC_014334	TTG	2	6	31725	31730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065157
516	NC_014334	GCT	2	6	32141	32146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065158
517	NC_014334	GAT	2	6	32167	32172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065158
518	NC_014334	GGC	2	6	32196	32201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065158
519	NC_014334	GAT	2	6	32206	32211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065158
520	NC_014334	TGG	2	6	32277	32282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065158
521	NC_014334	GGC	2	6	32314	32319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065158
522	NC_014334	TTC	2	6	32333	32338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065158
523	NC_014334	GAT	2	6	32350	32355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065158
524	NC_014334	AAGGTT	2	12	32375	32386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065158
525	NC_014334	CTT	2	6	32466	32471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065158
526	NC_014334	GTGC	2	8	32486	32493	0 %	25 %	50 %	25 %	301065158
527	NC_014334	AGT	2	6	32540	32545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065158
528	NC_014334	ATG	2	6	32561	32566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065158
529	NC_014334	CAA	2	6	32611	32616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065158
530	NC_014334	TAC	2	6	32631	32636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065158
531	NC_014334	GCC	2	6	32658	32663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065158
532	NC_014334	CGG	2	6	32764	32769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065158
533	NC_014334	GCAA	2	8	32780	32787	50 %	0 %	25 %	25 %	301065158
534	NC_014334	AAGCC	2	10	32808	32817	40 %	0 %	20 %	40 %	301065158
535	NC_014334	GTC	2	6	33205	33210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065159
536	NC_014334	GGT	2	6	33231	33236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065159
537	NC_014334	ACT	2	6	33264	33269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065159
538	NC_014334	T	6	6	33312	33317	0 %	100 %	0 %	0 %	301065159
539	NC_014334	ATT	2	6	33396	33401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065159
540	NC_014334	CAT	2	6	33405	33410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065159
541	NC_014334	ATTT	2	8	33435	33442	25 %	75 %	0 %	0 %	301065159
542	NC_014334	AAC	2	6	33464	33469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065159
543	NC_014334	A	6	6	33471	33476	100 %	0 %	0 %	0 %	301065159
544	NC_014334	GGA	2	6	33501	33506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	301065159
545	NC_014334	CG	3	6	33511	33516	0 %	0 %	50 %	50 %	301065159
546	NC_014334	GTT	2	6	33541	33546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065159
547	NC_014334	TGC	3	9	33563	33571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065159
548	NC_014334	TTG	2	6	33584	33589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065159
549	NC_014334	AAT	2	6	33622	33627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065159
550	NC_014334	CAAAG	2	10	33652	33661	60 %	0 %	20 %	20 %	301065159
551	NC_014334	AGC	2	6	33669	33674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065159
552	NC_014334	A	6	6	34012	34017	100 %	0 %	0 %	0 %	301065160
553	NC_014334	TTC	2	6	34064	34069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065160
554	NC_014334	GGT	2	6	34081	34086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065160
555	NC_014334	GGC	2	6	34105	34110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065160
556	NC_014334	GGC	2	6	34120	34125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065160
557	NC_014334	CAG	2	6	34145	34150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065160
558	NC_014334	T	6	6	34529	34534	0 %	100 %	0 %	0 %	301065161
559	NC_014334	CAT	2	6	34634	34639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065161
560	NC_014334	CATT	2	8	34651	34658	25 %	50 %	0 %	25 %	301065161
561	NC_014334	CTT	2	6	34694	34699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065161
562	NC_014334	TGG	2	6	34742	34747	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065161
563	NC_014334	TAA	2	6	34849	34854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065161
564	NC_014334	GTTT	2	8	34883	34890	0 %	75 %	25 %	0 %	301065161
565	NC_014334	TAC	2	6	34908	34913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065161
566	NC_014334	TCT	2	6	35000	35005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065161
567	NC_014334	TAA	2	6	35014	35019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065161
568	NC_014334	GAA	2	6	35039	35044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065161
569	NC_014334	GAT	2	6	35291	35296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065162
570	NC_014334	A	6	6	35354	35359	100 %	0 %	0 %	0 %	301065162
571	NC_014334	ATG	2	6	35415	35420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065162
572	NC_014334	TTA	2	6	35430	35435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065162
573	NC_014334	TCA	2	6	35491	35496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065162
574	NC_014334	ATG	2	6	35520	35525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065162
575	NC_014334	TCC	2	6	35529	35534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065162
576	NC_014334	GTT	2	6	35536	35541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065162
577	NC_014334	TG	3	6	35547	35552	0 %	50 %	50 %	0 %	301065162
578	NC_014334	CAG	2	6	35599	35604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065162
579	NC_014334	TTG	2	6	35614	35619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065162
580	NC_014334	A	6	6	35628	35633	100 %	0 %	0 %	0 %	301065162
581	NC_014334	CAA	2	6	35663	35668	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065162
582	NC_014334	T	6	6	35672	35677	0 %	100 %	0 %	0 %	301065162
583	NC_014334	GT	3	6	35682	35687	0 %	50 %	50 %	0 %	301065162
584	NC_014334	GAC	2	6	35710	35715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065162
585	NC_014334	TGC	2	6	35727	35732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065162
586	NC_014334	AGCA	2	8	35762	35769	50 %	0 %	25 %	25 %	301065162
587	NC_014334	GGC	2	6	35831	35836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065162
588	NC_014334	CAT	2	6	35851	35856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065162
589	NC_014334	TGA	2	6	35869	35874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065162
590	NC_014334	CAG	2	6	35957	35962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065162
591	NC_014334	CT	3	6	35973	35978	0 %	50 %	0 %	50 %	301065162
592	NC_014334	TCG	2	6	36081	36086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065162
593	NC_014334	CG	3	6	36085	36090	0 %	0 %	50 %	50 %	301065162
594	NC_014334	GCG	2	6	36198	36203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065163
595	NC_014334	AAG	2	6	36252	36257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065163
596	NC_014334	CAA	2	6	36319	36324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065163
597	NC_014334	GTG	2	6	36381	36386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065163
598	NC_014334	TGA	2	6	36448	36453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065163
599	NC_014334	A	6	6	36471	36476	100 %	0 %	0 %	0 %	301065163
600	NC_014334	TTA	2	6	36490	36495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065163
601	NC_014334	TCA	2	6	36564	36569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065163
602	NC_014334	GAT	2	6	36596	36601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065163
603	NC_014334	ATG	3	9	36732	36740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065163
604	NC_014334	TGT	2	6	36790	36795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065163
605	NC_014334	CTG	2	6	36796	36801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065163
606	NC_014334	AGA	2	6	37048	37053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065164
607	NC_014334	A	6	6	37055	37060	100 %	0 %	0 %	0 %	301065164
608	NC_014334	ATT	2	6	37076	37081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065164
609	NC_014334	TGA	2	6	37111	37116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065164
610	NC_014334	AGC	2	6	37168	37173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065164
611	NC_014334	TGC	3	9	37305	37313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065164
612	NC_014334	GGC	2	6	37321	37326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065164
613	NC_014334	CAT	2	6	37507	37512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065164
614	NC_014334	GTT	2	6	37580	37585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065164
615	NC_014334	CTG	2	6	37658	37663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065164
616	NC_014334	CAA	2	6	37696	37701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065164
617	NC_014334	TC	3	6	37714	37719	0 %	50 %	0 %	50 %	301065164
618	NC_014334	TTG	2	6	37728	37733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065164
619	NC_014334	CTC	2	6	37768	37773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065164
620	NC_014334	GAA	2	6	37811	37816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065164
621	NC_014334	CCA	2	6	37839	37844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065164
622	NC_014334	CTG	3	9	37889	37897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065164
623	NC_014334	TTC	2	6	37916	37921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065164
624	NC_014334	TCG	2	6	37983	37988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065164
625	NC_014334	TGT	2	6	38016	38021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065164
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627	NC_014334	TTCA	2	8	38099	38106	25 %	50 %	0 %	25 %	301065164
628	NC_014334	TAC	2	6	38183	38188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065164
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996	NC_014334	TTAA	2	8	62945	62952	50 %	50 %	0 %	0 %	301065194
997	NC_014334	TGGC	2	8	62993	63000	0 %	25 %	50 %	25 %	301065194
998	NC_014334	GCTG	2	8	63159	63166	0 %	25 %	50 %	25 %	301065194
999	NC_014334	TTG	2	6	63286	63291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065194
1000	NC_014334	TGC	2	6	63294	63299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065194

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