MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8501	NC_014334	TGT	2	6	526886	526891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065631
8502	NC_014334	AGCG	2	8	526945	526952	25 %	0 %	50 %	25 %	301065631
8503	NC_014334	GACA	2	8	526965	526972	50 %	0 %	25 %	25 %	301065631
8504	NC_014334	AAG	2	6	527018	527023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065631
8505	NC_014334	GCC	2	6	527086	527091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065631
8506	NC_014334	ATA	2	6	527149	527154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065631
8507	NC_014334	GCT	2	6	527227	527232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065631
8508	NC_014334	GAA	2	6	527263	527268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065631
8509	NC_014334	GCT	2	6	527294	527299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065631
8510	NC_014334	CG	3	6	527316	527321	0 %	0 %	50 %	50 %	301065631
8511	NC_014334	ATA	2	6	527405	527410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065631
8512	NC_014334	TGC	3	9	527538	527546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065631
8513	NC_014334	CCA	2	6	527570	527575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	301065631
8514	NC_014334	ATT	2	6	527786	527791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065632
8515	NC_014334	GGC	2	6	528003	528008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065632
8516	NC_014334	T	6	6	528099	528104	0 %	100 %	0 %	0 %	301065632
8517	NC_014334	GCA	2	6	528112	528117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065632
8518	NC_014334	CAA	2	6	528137	528142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065632
8519	NC_014334	GTG	2	6	528229	528234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065632
8520	NC_014334	CTG	2	6	528508	528513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065632
8521	NC_014334	AACG	2	8	528543	528550	50 %	0 %	25 %	25 %	301065632
8522	NC_014334	CAA	2	6	528560	528565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065632
8523	NC_014334	TAA	2	6	528570	528575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065632
8524	NC_014334	CGTGA	2	10	528665	528674	20 %	20 %	40 %	20 %	301065633
8525	NC_014334	AAAGC	2	10	528726	528735	60 %	0 %	20 %	20 %	301065633
8526	NC_014334	AAT	2	6	528752	528757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065633
8527	NC_014334	CAG	2	6	528771	528776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065633
8528	NC_014334	CTG	2	6	528781	528786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065633
8529	NC_014334	CGA	2	6	528804	528809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065633
8530	NC_014334	GCC	2	6	528821	528826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065633
8531	NC_014334	CAG	2	6	528976	528981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065633
8532	NC_014334	CGC	2	6	528982	528987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065633
8533	NC_014334	TGA	2	6	529032	529037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065633
8534	NC_014334	AGA	2	6	529110	529115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065633
8535	NC_014334	AAC	2	6	529121	529126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065633
8536	NC_014334	GAAGC	2	10	529169	529178	40 %	0 %	40 %	20 %	301065633
8537	NC_014334	CAATG	2	10	529237	529246	40 %	20 %	20 %	20 %	301065633
8538	NC_014334	CGC	3	9	529300	529308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065633
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8540	NC_014334	A	6	6	530053	530058	100 %	0 %	0 %	0 %	301065634
8541	NC_014334	GCTTG	2	10	530085	530094	0 %	40 %	40 %	20 %	301065634
8542	NC_014334	GCA	2	6	530134	530139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065634
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8544	NC_014334	ACA	2	6	530240	530245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065634
8545	NC_014334	GAT	3	9	530278	530286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065634
8546	NC_014334	GCA	2	6	530350	530355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065634
8547	NC_014334	GCA	2	6	530433	530438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065634
8548	NC_014334	GAT	2	6	530440	530445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065634
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8550	NC_014334	AAGC	2	8	530510	530517	50 %	0 %	25 %	25 %	301065634
8551	NC_014334	CGA	2	6	530531	530536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065634
8552	NC_014334	TTG	2	6	530561	530566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065634
8553	NC_014334	AG	3	6	530628	530633	50 %	0 %	50 %	0 %	301065634
8554	NC_014334	CTT	2	6	530639	530644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065634
8555	NC_014334	AGC	2	6	530663	530668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065634
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8557	NC_014334	TTGA	2	8	530701	530708	25 %	50 %	25 %	0 %	301065634
8558	NC_014334	TGAT	2	8	530744	530751	25 %	50 %	25 %	0 %	301065634
8559	NC_014334	TTC	2	6	530838	530843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065634
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8561	NC_014334	GATC	2	8	530919	530926	25 %	25 %	25 %	25 %	301065634
8562	NC_014334	GTT	2	6	530931	530936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065634
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8570	NC_014334	CGA	3	9	531470	531478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065636
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8582	NC_014334	CATC	2	8	532004	532011	25 %	25 %	0 %	50 %	301065636
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8586	NC_014334	TAGGA	2	10	532192	532201	40 %	20 %	40 %	0 %	301065636
8587	NC_014334	GGC	3	9	532206	532214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065636
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8589	NC_014334	GCA	2	6	532265	532270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065636
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8592	NC_014334	AC	3	6	532433	532438	50 %	0 %	0 %	50 %	301065636
8593	NC_014334	AGC	2	6	532441	532446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065636
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8596	NC_014334	GAA	2	6	532548	532553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065636
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8600	NC_014334	A	6	6	533378	533383	100 %	0 %	0 %	0 %	301065637
8601	NC_014334	AAG	2	6	533390	533395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065637
8602	NC_014334	TTC	2	6	533398	533403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065637
8603	NC_014334	AATA	2	8	533423	533430	75 %	25 %	0 %	0 %	301065637
8604	NC_014334	TGA	2	6	533833	533838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065638
8605	NC_014334	A	6	6	533838	533843	100 %	0 %	0 %	0 %	301065638
8606	NC_014334	GCT	2	6	533916	533921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065638
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8608	NC_014334	ATA	2	6	534058	534063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065638
8609	NC_014334	GTTG	2	8	534156	534163	0 %	50 %	50 %	0 %	301065638
8610	NC_014334	GGT	2	6	534201	534206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065638
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8612	NC_014334	GTCT	2	8	534326	534333	0 %	50 %	25 %	25 %	301065638
8613	NC_014334	TGC	2	6	534344	534349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065638
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8616	NC_014334	CAG	2	6	534448	534453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065638
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8619	NC_014334	ATCA	2	8	534701	534708	50 %	25 %	0 %	25 %	301065639
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8621	NC_014334	AC	3	6	534858	534863	50 %	0 %	0 %	50 %	301065639
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8986	NC_014334	GGACA	2	10	558567	558576	40 %	0 %	40 %	20 %	301065663
8987	NC_014334	GGC	2	6	558599	558604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065663
8988	NC_014334	TTA	2	6	558616	558621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065663
8989	NC_014334	TGG	2	6	558656	558661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065663
8990	NC_014334	AAG	2	6	558712	558717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065663
8991	NC_014334	TGA	2	6	558788	558793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065663
8992	NC_014334	TGA	2	6	558815	558820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065663
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