MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei str. Zhang chromosome

Total Repeats: 46512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_014334	TTTG	2	8	499240	499247	0 %	75 %	25 %	0 %	301065614
8002	NC_014334	T	6	6	499258	499263	0 %	100 %	0 %	0 %	301065614
8003	NC_014334	GTT	2	6	499479	499484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065614
8004	NC_014334	GTT	2	6	499494	499499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065614
8005	NC_014334	TGT	2	6	499532	499537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065614
8006	NC_014334	GTG	2	6	499554	499559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065614
8007	NC_014334	TTGC	2	8	499569	499576	0 %	50 %	25 %	25 %	301065614
8008	NC_014334	TTTGC	2	10	499610	499619	0 %	60 %	20 %	20 %	301065614
8009	NC_014334	TGT	2	6	499625	499630	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065614
8010	NC_014334	CTG	2	6	499648	499653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065614
8011	NC_014334	TTTTG	2	10	499661	499670	0 %	80 %	20 %	0 %	301065614
8012	NC_014334	GCAA	2	8	499686	499693	50 %	0 %	25 %	25 %	301065614
8013	NC_014334	GTT	2	6	499713	499718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065614
8014	NC_014334	T	6	6	499727	499732	0 %	100 %	0 %	0 %	301065614
8015	NC_014334	CCT	2	6	499761	499766	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065614
8016	NC_014334	GTC	2	6	499796	499801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065614
8017	NC_014334	GGAT	2	8	499892	499899	25 %	25 %	50 %	0 %	301065614
8018	NC_014334	TGC	2	6	499921	499926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065614
8019	NC_014334	TGT	2	6	499931	499936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065614
8020	NC_014334	TCA	2	6	499953	499958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065614
8021	NC_014334	CTG	2	6	500014	500019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065614
8022	NC_014334	GCG	2	6	500076	500081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	301065614
8023	NC_014334	ATT	2	6	500156	500161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065614
8024	NC_014334	GTT	2	6	500238	500243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065614
8025	NC_014334	TGC	2	6	500273	500278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065614
8026	NC_014334	CAG	2	6	500416	500421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065614
8027	NC_014334	CCT	2	6	500509	500514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065614
8028	NC_014334	AAC	2	6	500534	500539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065614
8029	NC_014334	GTC	2	6	500598	500603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065614
8030	NC_014334	TTG	2	6	500673	500678	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065614
8031	NC_014334	ATC	2	6	500732	500737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065614
8032	NC_014334	GCT	2	6	500760	500765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065614
8033	NC_014334	TGG	2	6	500776	500781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065614
8034	NC_014334	GTC	2	6	500838	500843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065614
8035	NC_014334	CCTT	2	8	500883	500890	0 %	50 %	0 %	50 %	301065614
8036	NC_014334	GTC	2	6	500933	500938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065614
8037	NC_014334	GCTAG	2	10	500997	501006	20 %	20 %	40 %	20 %	301065614
8038	NC_014334	TCA	2	6	501024	501029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065614
8039	NC_014334	TCA	2	6	501045	501050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065614
8040	NC_014334	CTT	2	6	501061	501066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065614
8041	NC_014334	ACT	2	6	501081	501086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065614
8042	NC_014334	TGA	2	6	501098	501103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065614
8043	NC_014334	GTG	2	6	501132	501137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065614
8044	NC_014334	CTTT	2	8	501138	501145	0 %	75 %	0 %	25 %	301065614
8045	NC_014334	GGT	2	6	501176	501181	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065614
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8047	NC_014334	TCA	2	6	501297	501302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065614
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8049	NC_014334	TGT	2	6	501323	501328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065614
8050	NC_014334	GTTT	2	8	501329	501336	0 %	75 %	25 %	0 %	301065614
8051	NC_014334	CCT	2	6	501364	501369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	301065614
8052	NC_014334	TTG	2	6	501405	501410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065614
8053	NC_014334	TTC	2	6	501458	501463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065614
8054	NC_014334	TCT	2	6	501516	501521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065614
8055	NC_014334	TGC	2	6	501684	501689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065615
8056	NC_014334	TG	3	6	501769	501774	0 %	50 %	50 %	0 %	301065615
8057	NC_014334	TGT	2	6	501779	501784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065615
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8059	NC_014334	GTCA	2	8	501819	501826	25 %	25 %	25 %	25 %	301065615
8060	NC_014334	GTG	2	6	501859	501864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065615
8061	NC_014334	AGGT	2	8	501868	501875	25 %	25 %	50 %	0 %	301065615
8062	NC_014334	CAT	2	6	501878	501883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065615
8063	NC_014334	GCC	2	6	501957	501962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	301065615
8064	NC_014334	TCT	2	6	501968	501973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065615
8065	NC_014334	GTTCC	2	10	502014	502023	0 %	40 %	20 %	40 %	301065615
8066	NC_014334	GCATG	2	10	502035	502044	20 %	20 %	40 %	20 %	301065615
8067	NC_014334	TGT	3	9	502226	502234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065615
8068	NC_014334	AATGC	2	10	502246	502255	40 %	20 %	20 %	20 %	301065615
8069	NC_014334	TGA	2	6	502259	502264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065615
8070	NC_014334	TGG	2	6	502277	502282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065615
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8075	NC_014334	GAT	2	6	502674	502679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065615
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8078	NC_014334	TTGA	2	8	502886	502893	25 %	50 %	25 %	0 %	301065615
8079	NC_014334	GGTT	2	8	503028	503035	0 %	50 %	50 %	0 %	301065615
8080	NC_014334	GATT	2	8	503214	503221	25 %	50 %	25 %	0 %	301065615
8081	NC_014334	TGC	2	6	503243	503248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065615
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8101	NC_014334	GCA	2	6	504352	504357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065615
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8105	NC_014334	ATC	2	6	504552	504557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065615
8106	NC_014334	CAT	2	6	504614	504619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065615
8107	NC_014334	CG	3	6	504628	504633	0 %	0 %	50 %	50 %	301065615
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8111	NC_014334	TTAG	2	8	505027	505034	25 %	50 %	25 %	0 %	301065615
8112	NC_014334	TGGAT	2	10	505050	505059	20 %	40 %	40 %	0 %	301065615
8113	NC_014334	TGC	2	6	505098	505103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065615
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8115	NC_014334	GGCT	2	8	505120	505127	0 %	25 %	50 %	25 %	301065615
8116	NC_014334	T	6	6	505133	505138	0 %	100 %	0 %	0 %	301065615
8117	NC_014334	GTT	2	6	505156	505161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065615
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8119	NC_014334	ACT	2	6	505240	505245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065615
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8234	NC_014334	GCTGG	2	10	511294	511303	0 %	20 %	60 %	20 %	301065616
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8237	NC_014334	AAC	2	6	512149	512154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	301065617
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8239	NC_014334	TGA	2	6	512254	512259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065617
8240	NC_014334	ATG	2	6	512345	512350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065617
8241	NC_014334	TTA	2	6	512365	512370	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065617
8242	NC_014334	ATT	2	6	512396	512401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	301065617
8243	NC_014334	TGA	2	6	512449	512454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065617
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8245	NC_014334	CGA	2	6	512494	512499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065617
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8250	NC_014334	CAAAC	2	10	512683	512692	60 %	0 %	0 %	40 %	301065617
8251	NC_014334	CTTTG	2	10	512701	512710	0 %	60 %	20 %	20 %	301065617
8252	NC_014334	CCTC	2	8	512877	512884	0 %	25 %	0 %	75 %	301065617
8253	NC_014334	GTG	2	6	512962	512967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065617
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8260	NC_014334	TGG	2	6	513396	513401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065617
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8270	NC_014334	TGA	2	6	513925	513930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065617
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8352	NC_014334	TGA	2	6	519038	519043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065621
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8355	NC_014334	AC	3	6	519312	519317	50 %	0 %	0 %	50 %	301065621
8356	NC_014334	GTTGTC	2	12	519367	519378	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	301065622
8357	NC_014334	AAGA	2	8	519460	519467	75 %	0 %	25 %	0 %	301065622
8358	NC_014334	CAG	2	6	519479	519484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065622
8359	NC_014334	AAG	2	6	519487	519492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065622
8360	NC_014334	AGATGA	2	12	519543	519554	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	301065622
8361	NC_014334	TGC	2	6	519561	519566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065622
8362	NC_014334	CAT	2	6	519745	519750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065622
8363	NC_014334	GCA	2	6	519884	519889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065622
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8365	NC_014334	TGA	2	6	520062	520067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065622
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8367	NC_014334	GGT	2	6	520123	520128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065622
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8382	NC_014334	TGG	3	9	520952	520960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	301065624
8383	NC_014334	TTGA	2	8	520993	521000	25 %	50 %	25 %	0 %	301065624
8384	NC_014334	AGC	2	6	521061	521066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065624
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8391	NC_014334	TCT	2	6	521474	521479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065625
8392	NC_014334	CAT	2	6	521487	521492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065625
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8401	NC_014334	TGCCAT	2	12	521745	521756	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	301065625
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8448	NC_014334	GGATT	2	10	524401	524410	20 %	40 %	40 %	0 %	301065628
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8477	NC_014334	GAA	2	6	525394	525399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065629
8478	NC_014334	ATG	2	6	525745	525750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065630
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8480	NC_014334	CATGAT	2	12	525841	525852	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	301065630
8481	NC_014334	TTC	2	6	525875	525880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	301065630
8482	NC_014334	ATAA	2	8	525967	525974	75 %	25 %	0 %	0 %	301065630
8483	NC_014334	CAT	2	6	526041	526046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065630
8484	NC_014334	GTT	2	6	526076	526081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	301065630
8485	NC_014334	TAA	2	6	526156	526161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065630
8486	NC_014334	TAA	2	6	526191	526196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	301065630
8487	NC_014334	CGAAA	2	10	526221	526230	60 %	0 %	20 %	20 %	301065630
8488	NC_014334	GAA	2	6	526243	526248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	301065630
8489	NC_014334	GCA	2	6	526256	526261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	301065630
8490	NC_014334	AGT	2	6	526265	526270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	301065630
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8493	NC_014334	ATC	2	6	526582	526587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	301065631
8494	NC_014334	CTG	2	6	526597	526602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	301065631
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