MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 38382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_014106	GCACTG	2	12	218998	219009	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295692076
4003	NC_014106	ATG	2	6	219377	219382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692077
4004	NC_014106	AGC	2	6	219388	219393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692077
4005	NC_014106	AAG	2	6	219398	219403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692077
4006	NC_014106	CTA	2	6	219498	219503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692077
4007	NC_014106	GAA	2	6	219512	219517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692077
4008	NC_014106	AGA	2	6	219521	219526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692077
4009	NC_014106	TTA	2	6	219617	219622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692077
4010	NC_014106	ATT	2	6	219692	219697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692077
4011	NC_014106	TTA	2	6	219705	219710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692077
4012	NC_014106	AAGATT	2	12	219746	219757	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295692077
4013	NC_014106	TAC	2	6	219796	219801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692077
4014	NC_014106	AGT	2	6	219847	219852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692077
4015	NC_014106	TAAT	2	8	219864	219871	50 %	50 %	0 %	0 %	295692077
4016	NC_014106	CGGC	2	8	219876	219883	0 %	0 %	50 %	50 %	295692077
4017	NC_014106	TCA	2	6	219935	219940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692077
4018	NC_014106	TAA	2	6	219987	219992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692077
4019	NC_014106	ATT	2	6	220014	220019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692077
4020	NC_014106	GAC	2	6	220048	220053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692077
4021	NC_014106	AAG	2	6	220116	220121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692077
4022	NC_014106	A	6	6	220139	220144	100 %	0 %	0 %	0 %	295692077
4023	NC_014106	TGAAA	2	10	220168	220177	60 %	20 %	20 %	0 %	295692077
4024	NC_014106	ATC	2	6	220214	220219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692077
4025	NC_014106	ACT	2	6	220222	220227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692077
4026	NC_014106	TGC	2	6	220314	220319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692077
4027	NC_014106	ATT	2	6	220322	220327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692077
4028	NC_014106	GTG	2	6	220371	220376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692077
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4030	NC_014106	TGA	2	6	220597	220602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692077
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4032	NC_014106	TGA	2	6	220642	220647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692077
4033	NC_014106	ATG	2	6	220698	220703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692077
4034	NC_014106	TTA	2	6	220721	220726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692077
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4041	NC_014106	ATT	2	6	221204	221209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692077
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4056	NC_014106	TAT	2	6	222184	222189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692078
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4059	NC_014106	TGA	2	6	222297	222302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692078
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4066	NC_014106	ATTT	2	8	222499	222506	25 %	75 %	0 %	0 %	295692078
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4103	NC_014106	GGT	2	6	224589	224594	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692079
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4121	NC_014106	A	7	7	225574	225580	100 %	0 %	0 %	0 %	295692081
4122	NC_014106	GAT	2	6	225581	225586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692081
4123	NC_014106	ACT	2	6	225631	225636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692081
4124	NC_014106	TGA	2	6	225670	225675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692081
4125	NC_014106	TGA	2	6	225718	225723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692081
4126	NC_014106	AGA	2	6	225784	225789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692081
4127	NC_014106	T	6	6	225800	225805	0 %	100 %	0 %	0 %	295692081
4128	NC_014106	TAC	2	6	225845	225850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692081
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4130	NC_014106	TGA	2	6	225912	225917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692081
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4133	NC_014106	GTT	2	6	226073	226078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692081
4134	NC_014106	AAAAG	2	10	226090	226099	80 %	0 %	20 %	0 %	295692081
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4140	NC_014106	AGA	2	6	226575	226580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692082
4141	NC_014106	GAG	2	6	226600	226605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295692082
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4143	NC_014106	GA	3	6	226667	226672	50 %	0 %	50 %	0 %	295692082
4144	NC_014106	AT	3	6	226692	226697	50 %	50 %	0 %	0 %	295692082
4145	NC_014106	TAGTCA	2	12	226860	226871	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295692082
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4150	NC_014106	GTTT	2	8	227100	227107	0 %	75 %	25 %	0 %	295692082
4151	NC_014106	ATC	2	6	227182	227187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692082
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4157	NC_014106	TGAT	2	8	227411	227418	25 %	50 %	25 %	0 %	295692082
4158	NC_014106	TCG	2	6	227475	227480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692082
4159	NC_014106	GCT	2	6	227537	227542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692082
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4165	NC_014106	TCA	2	6	227775	227780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692082
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4168	NC_014106	AGT	2	6	228045	228050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692083
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4177	NC_014106	A	6	6	228571	228576	100 %	0 %	0 %	0 %	295692084
4178	NC_014106	GGT	2	6	228640	228645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692084
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4181	NC_014106	T	6	6	228792	228797	0 %	100 %	0 %	0 %	295692084
4182	NC_014106	TTC	2	6	228870	228875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692084
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4231	NC_014106	ACT	2	6	231250	231255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692086
4232	NC_014106	TCA	2	6	231265	231270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692086
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4236	NC_014106	ATT	2	6	231455	231460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692086
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4241	NC_014106	AAG	2	6	231728	231733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
4242	NC_014106	ACT	2	6	231734	231739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
4243	NC_014106	GCA	2	6	231749	231754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692087
4244	NC_014106	CAA	2	6	231757	231762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692087
4245	NC_014106	ACT	2	6	231842	231847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
4246	NC_014106	TAC	2	6	231905	231910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
4247	NC_014106	TGG	3	9	231916	231924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692087
4248	NC_014106	TCA	2	6	231965	231970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
4249	NC_014106	TCA	2	6	231974	231979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
4250	NC_014106	GTTT	2	8	232003	232010	0 %	75 %	25 %	0 %	295692087
4251	NC_014106	ACT	2	6	232094	232099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
4252	NC_014106	AAG	2	6	232124	232129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
4253	NC_014106	AAG	2	6	232145	232150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
4254	NC_014106	ATC	2	6	232207	232212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
4255	NC_014106	ATG	2	6	232221	232226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692087
4256	NC_014106	A	6	6	232238	232243	100 %	0 %	0 %	0 %	295692087
4257	NC_014106	ACT	2	6	232248	232253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
4258	NC_014106	AGA	2	6	232260	232265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
4259	NC_014106	ATA	2	6	232281	232286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692087
4260	NC_014106	CAA	2	6	232300	232305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692087
4261	NC_014106	TAC	2	6	232382	232387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
4262	NC_014106	GAA	3	9	232465	232473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
4263	NC_014106	AAG	3	9	232505	232513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
4264	NC_014106	AAG	2	6	232520	232525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
4265	NC_014106	TAC	2	6	232574	232579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
4266	NC_014106	GCT	2	6	232607	232612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692087
4267	NC_014106	TGC	2	6	232666	232671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692087
4268	NC_014106	ATA	2	6	232689	232694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692087
4269	NC_014106	ACA	2	6	232746	232751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692087
4270	NC_014106	CAA	2	6	232799	232804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692087
4271	NC_014106	AT	3	6	232819	232824	50 %	50 %	0 %	0 %	295692087
4272	NC_014106	ATT	2	6	232852	232857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692087
4273	NC_014106	AGA	2	6	232954	232959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692087
4274	NC_014106	AAC	2	6	233108	233113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692087
4275	NC_014106	CTA	2	6	233124	233129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
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4277	NC_014106	AG	3	6	233190	233195	50 %	0 %	50 %	0 %	295692087
4278	NC_014106	TAT	2	6	233242	233247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692087
4279	NC_014106	GCTAAT	2	12	233258	233269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	295692087
4280	NC_014106	ACT	2	6	233297	233302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692087
4281	NC_014106	AAC	2	6	233384	233389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692087
4282	NC_014106	ATG	2	6	233638	233643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692088
4283	NC_014106	TGA	2	6	233760	233765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692088
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4285	NC_014106	CGT	2	6	233860	233865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692088
4286	NC_014106	TAC	2	6	233899	233904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692088
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4290	NC_014106	TGT	2	6	234120	234125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692088
4291	NC_014106	GGT	2	6	234142	234147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692088
4292	NC_014106	CGT	2	6	234208	234213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692088
4293	NC_014106	ATC	2	6	234274	234279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692088
4294	NC_014106	TGA	2	6	234282	234287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692088
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4296	NC_014106	CTG	2	6	234299	234304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692088
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4298	NC_014106	TCAA	3	12	234445	234456	50 %	25 %	0 %	25 %	295692088
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4303	NC_014106	AGA	2	6	235025	235030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692089
4304	NC_014106	A	6	6	235041	235046	100 %	0 %	0 %	0 %	295692089
4305	NC_014106	ATG	2	6	235048	235053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692089
4306	NC_014106	ATG	2	6	235072	235077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692089
4307	NC_014106	AGC	2	6	235082	235087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692089
4308	NC_014106	CTG	2	6	235156	235161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692089
4309	NC_014106	GGC	2	6	235164	235169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295692089
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4312	NC_014106	GTT	2	6	235288	235293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692089
4313	NC_014106	A	6	6	235311	235316	100 %	0 %	0 %	0 %	295692089
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4317	NC_014106	AAT	2	6	235554	235559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692089
4318	NC_014106	AAT	2	6	235569	235574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692089
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4321	NC_014106	ATGA	2	8	235857	235864	50 %	25 %	25 %	0 %	295692090
4322	NC_014106	TCT	2	6	235966	235971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692090
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4325	NC_014106	TCT	2	6	236077	236082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692091
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4329	NC_014106	GTC	2	6	236269	236274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692091
4330	NC_014106	CAT	2	6	236325	236330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692091
4331	NC_014106	GCTT	2	8	236384	236391	0 %	50 %	25 %	25 %	295692091
4332	NC_014106	TTC	2	6	236428	236433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692091
4333	NC_014106	CTAG	2	8	236447	236454	25 %	25 %	25 %	25 %	295692091
4334	NC_014106	CAT	2	6	236544	236549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692091
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4336	NC_014106	GCAT	2	8	236750	236757	25 %	25 %	25 %	25 %	295692091
4337	NC_014106	TTG	2	6	236762	236767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692091
4338	NC_014106	ATCC	2	8	236872	236879	25 %	25 %	0 %	50 %	295692091
4339	NC_014106	GTCAGC	2	12	236881	236892	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	295692091
4340	NC_014106	T	6	6	237036	237041	0 %	100 %	0 %	0 %	295692091
4341	NC_014106	TG	3	6	237070	237075	0 %	50 %	50 %	0 %	295692091
4342	NC_014106	ATC	2	6	237136	237141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692091
4343	NC_014106	T	6	6	237178	237183	0 %	100 %	0 %	0 %	295692091
4344	NC_014106	TTC	2	6	237201	237206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692091
4345	NC_014106	AAC	2	6	237337	237342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692091
4346	NC_014106	AAC	2	6	237385	237390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692091
4347	NC_014106	GATT	2	8	237555	237562	25 %	50 %	25 %	0 %	295692092
4348	NC_014106	GAA	2	6	237631	237636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692092
4349	NC_014106	GAA	2	6	237664	237669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692092
4350	NC_014106	GAAT	2	8	237702	237709	50 %	25 %	25 %	0 %	295692092
4351	NC_014106	CGC	2	6	237718	237723	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295692092
4352	NC_014106	AAT	2	6	237736	237741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692092
4353	NC_014106	CTTG	2	8	237831	237838	0 %	50 %	25 %	25 %	295692092
4354	NC_014106	GAT	2	6	237853	237858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692092
4355	NC_014106	GAA	2	6	238136	238141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692093
4356	NC_014106	TGA	2	6	238252	238257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692093
4357	NC_014106	ACC	2	6	238266	238271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295692093
4358	NC_014106	GAA	3	9	238280	238288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692093
4359	NC_014106	AAG	2	6	238310	238315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692093
4360	NC_014106	CTT	2	6	238324	238329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692093
4361	NC_014106	TGA	3	9	238345	238353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692093
4362	NC_014106	GAT	2	6	238373	238378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692093
4363	NC_014106	AGA	2	6	238381	238386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692093
4364	NC_014106	GAC	2	6	238388	238393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692093
4365	NC_014106	GAT	2	6	238409	238414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692093
4366	NC_014106	TGA	2	6	238417	238422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692093
4367	NC_014106	CGA	2	6	238432	238437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692093
4368	NC_014106	ATG	2	6	238449	238454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692093
4369	NC_014106	ACG	2	6	238461	238466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692093
4370	NC_014106	TGA	2	6	238471	238476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692093
4371	NC_014106	ATG	5	15	238518	238532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692093
4372	NC_014106	ACG	2	6	238533	238538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692093
4373	NC_014106	TAAT	2	8	238543	238550	50 %	50 %	0 %	0 %	295692093
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4375	NC_014106	AT	3	6	238791	238796	50 %	50 %	0 %	0 %	295692094
4376	NC_014106	CGA	2	6	238851	238856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692094
4377	NC_014106	ACT	2	6	238933	238938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692094
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4379	NC_014106	CGT	2	6	238972	238977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692094
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4382	NC_014106	ATT	2	6	239077	239082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692094
4383	NC_014106	TGG	2	6	239091	239096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692094
4384	NC_014106	ATGTA	2	10	239171	239180	40 %	40 %	20 %	0 %	295692094
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4386	NC_014106	GCT	2	6	239212	239217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692094
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4388	NC_014106	CAACA	2	10	239237	239246	60 %	0 %	0 %	40 %	295692094
4389	NC_014106	GTA	2	6	239264	239269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692094
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4392	NC_014106	ATT	2	6	239397	239402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692094
4393	NC_014106	AG	3	6	239466	239471	50 %	0 %	50 %	0 %	295692094
4394	NC_014106	GAA	2	6	239502	239507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692094
4395	NC_014106	TGA	2	6	239511	239516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692094
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4399	NC_014106	TGG	2	6	239727	239732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692094
4400	NC_014106	TTTG	2	8	239810	239817	0 %	75 %	25 %	0 %	295692094
4401	NC_014106	ACGTG	2	10	239847	239856	20 %	20 %	40 %	20 %	295692094
4402	NC_014106	CTG	2	6	239879	239884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692094
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4434	NC_014106	GTA	2	6	241239	241244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692095
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4482	NC_014106	ATTA	2	8	243989	243996	50 %	50 %	0 %	0 %	295692098
4483	NC_014106	T	6	6	244001	244006	0 %	100 %	0 %	0 %	295692098
4484	NC_014106	GCG	2	6	244042	244047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295692098
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