MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus crispatus ST1

Total Repeats: 38382

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014106	ATT	2	6	279909	279914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692133
5002	NC_014106	GGA	2	6	279929	279934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	295692133
5003	NC_014106	AAAATA	2	12	279935	279946	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	295692133
5004	NC_014106	AGA	2	6	280000	280005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692134
5005	NC_014106	A	6	6	280011	280016	100 %	0 %	0 %	0 %	295692134
5006	NC_014106	GCA	2	6	280123	280128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692134
5007	NC_014106	AGT	2	6	280206	280211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692134
5008	NC_014106	TGC	2	6	280389	280394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692134
5009	NC_014106	TAA	2	6	280395	280400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692134
5010	NC_014106	GAT	2	6	280471	280476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692134
5011	NC_014106	ACTT	2	8	280477	280484	25 %	50 %	0 %	25 %	295692134
5012	NC_014106	TTG	2	6	280522	280527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692134
5013	NC_014106	TCA	2	6	280669	280674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692134
5014	NC_014106	AACT	2	8	280709	280716	50 %	25 %	0 %	25 %	295692134
5015	NC_014106	ATT	2	6	280786	280791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692134
5016	NC_014106	TTA	2	6	280823	280828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692134
5017	NC_014106	TAAAGT	2	12	280845	280856	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295692134
5018	NC_014106	TCA	2	6	280949	280954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692134
5019	NC_014106	ATA	2	6	280979	280984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692134
5020	NC_014106	GCC	2	6	280990	280995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	295692134
5021	NC_014106	TGTT	2	8	281032	281039	0 %	75 %	25 %	0 %	295692134
5022	NC_014106	T	6	6	281137	281142	0 %	100 %	0 %	0 %	295692135
5023	NC_014106	TCA	2	6	281181	281186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692135
5024	NC_014106	ATA	2	6	281190	281195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692135
5025	NC_014106	CAA	2	6	281257	281262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692135
5026	NC_014106	TTC	2	6	281311	281316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692135
5027	NC_014106	CAG	2	6	281341	281346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692135
5028	NC_014106	GT	3	6	281379	281384	0 %	50 %	50 %	0 %	295692135
5029	NC_014106	ACA	2	6	281482	281487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692135
5030	NC_014106	TGAG	2	8	281501	281508	25 %	25 %	50 %	0 %	295692135
5031	NC_014106	TCA	2	6	281535	281540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692135
5032	NC_014106	GAA	2	6	281585	281590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692135
5033	NC_014106	TAAG	3	12	281626	281637	50 %	25 %	25 %	0 %	295692135
5034	NC_014106	CA	3	6	281738	281743	50 %	0 %	0 %	50 %	295692135
5035	NC_014106	TCT	2	6	281757	281762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692135
5036	NC_014106	TGT	2	6	281804	281809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692135
5037	NC_014106	T	6	6	281819	281824	0 %	100 %	0 %	0 %	295692135
5038	NC_014106	TAA	2	6	281839	281844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692135
5039	NC_014106	ATT	2	6	282018	282023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692136
5040	NC_014106	CTT	2	6	282067	282072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692136
5041	NC_014106	TCA	2	6	282093	282098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692136
5042	NC_014106	CAA	2	6	282156	282161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692136
5043	NC_014106	CTT	2	6	282304	282309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692136
5044	NC_014106	ATG	2	6	282314	282319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692136
5045	NC_014106	CCA	2	6	282410	282415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295692136
5046	NC_014106	TTG	2	6	282419	282424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692136
5047	NC_014106	GAC	2	6	282525	282530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692136
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5049	NC_014106	CAA	2	6	282657	282662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692136
5050	NC_014106	TGA	2	6	282676	282681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692136
5051	NC_014106	CAG	2	6	282744	282749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692136
5052	NC_014106	ACT	2	6	282755	282760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692136
5053	NC_014106	AAT	2	6	282877	282882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692136
5054	NC_014106	TTC	2	6	282889	282894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692136
5055	NC_014106	TTG	2	6	282904	282909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692136
5056	NC_014106	CAA	2	6	282951	282956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692136
5057	NC_014106	ATAA	2	8	282989	282996	75 %	25 %	0 %	0 %	295692136
5058	NC_014106	AAT	2	6	283123	283128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692137
5059	NC_014106	ATA	2	6	283182	283187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692137
5060	NC_014106	ATT	2	6	283209	283214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692137
5061	NC_014106	TGAA	2	8	283215	283222	50 %	25 %	25 %	0 %	295692137
5062	NC_014106	GATAAA	2	12	283238	283249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	295692137
5063	NC_014106	A	6	6	283272	283277	100 %	0 %	0 %	0 %	295692137
5064	NC_014106	ATGA	2	8	283319	283326	50 %	25 %	25 %	0 %	295692137
5065	NC_014106	CTT	2	6	283357	283362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295692137
5066	NC_014106	CAG	2	6	283374	283379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692137
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5069	NC_014106	ATTAGA	2	12	283424	283435	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295692137
5070	NC_014106	TGG	2	6	283450	283455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692137
5071	NC_014106	CAT	2	6	283474	283479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692137
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5091	NC_014106	GTG	2	6	284209	284214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692138
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5101	NC_014106	GAC	2	6	284773	284778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692138
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5103	NC_014106	TTG	2	6	284968	284973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692138
5104	NC_014106	TTG	2	6	284986	284991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295692138
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5106	NC_014106	TAA	2	6	285083	285088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692138
5107	NC_014106	A	7	7	285102	285108	100 %	0 %	0 %	0 %	295692138
5108	NC_014106	ACTGA	2	10	285150	285159	40 %	20 %	20 %	20 %	295692138
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5111	NC_014106	TACC	2	8	285260	285267	25 %	25 %	0 %	50 %	295692138
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5116	NC_014106	GAT	2	6	285423	285428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692138
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5118	NC_014106	GCTTT	2	10	285466	285475	0 %	60 %	20 %	20 %	295692138
5119	NC_014106	TGA	3	9	285482	285490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692138
5120	NC_014106	TAG	2	6	285604	285609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692138
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5122	NC_014106	ATA	2	6	285670	285675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692138
5123	NC_014106	CAC	2	6	285698	285703	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	295692138
5124	NC_014106	CAA	2	6	285714	285719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295692138
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5132	NC_014106	GTA	2	6	286116	286121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692138
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5135	NC_014106	ATT	2	6	286335	286340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692138
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5142	NC_014106	GAA	2	6	286821	286826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692138
5143	NC_014106	ATCG	2	8	286851	286858	25 %	25 %	25 %	25 %	295692138
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5152	NC_014106	A	6	6	287397	287402	100 %	0 %	0 %	0 %	295692139
5153	NC_014106	AGCT	2	8	287425	287432	25 %	25 %	25 %	25 %	295692139
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5232	NC_014106	A	7	7	290886	290892	100 %	0 %	0 %	0 %	295692143
5233	NC_014106	ATT	2	6	290957	290962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692143
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5240	NC_014106	CGG	2	6	291327	291332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	295692144
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5242	NC_014106	AATC	2	8	291481	291488	50 %	25 %	0 %	25 %	295692144
5243	NC_014106	ATA	2	6	291491	291496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295692144
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5246	NC_014106	A	6	6	291599	291604	100 %	0 %	0 %	0 %	295692144
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5486	NC_014106	AAG	2	6	304531	304536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692152
5487	NC_014106	AAG	2	6	304591	304596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692152
5488	NC_014106	GCA	2	6	304621	304626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295692152
5489	NC_014106	AGT	2	6	304797	304802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692152
5490	NC_014106	A	6	6	304810	304815	100 %	0 %	0 %	0 %	295692152
5491	NC_014106	TAACT	2	10	305141	305150	40 %	40 %	0 %	20 %	295692153
5492	NC_014106	AAG	2	6	305197	305202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295692153
5493	NC_014106	TGA	2	6	305207	305212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692153
5494	NC_014106	TGA	2	6	305294	305299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692153
5495	NC_014106	ATG	2	6	305311	305316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295692153
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5497	NC_014106	GTC	2	6	305521	305526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295692153
5498	NC_014106	TAC	2	6	305537	305542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295692153
5499	NC_014106	GTG	2	6	305557	305562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295692153
5500	NC_014106	ATT	2	6	305679	305684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295692153

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