MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 60814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013766	AACA	2	8	200255	200262	75 %	0 %	0 %	25 %	284800446
4002	NC_013766	CGAC	2	8	200303	200310	25 %	0 %	25 %	50 %	284800446
4003	NC_013766	GATG	2	8	200337	200344	25 %	25 %	50 %	0 %	284800446
4004	NC_013766	CGGT	2	8	200380	200387	0 %	25 %	50 %	25 %	284800446
4005	NC_013766	TGC	2	6	200463	200468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800446
4006	NC_013766	AGA	2	6	200511	200516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800446
4007	NC_013766	GTG	2	6	200650	200655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800446
4008	NC_013766	AGCC	2	8	200657	200664	25 %	0 %	25 %	50 %	284800446
4009	NC_013766	GAA	2	6	200671	200676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800446
4010	NC_013766	CAT	2	6	200709	200714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800446
4011	NC_013766	GCTT	2	8	200780	200787	0 %	50 %	25 %	25 %	284800446
4012	NC_013766	AGA	2	6	200793	200798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800446
4013	NC_013766	TAC	2	6	200882	200887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800446
4014	NC_013766	A	6	6	200911	200916	100 %	0 %	0 %	0 %	284800446
4015	NC_013766	A	6	6	200923	200928	100 %	0 %	0 %	0 %	284800446
4016	NC_013766	TGC	2	6	200937	200942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800446
4017	NC_013766	AGA	2	6	200949	200954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800446
4018	NC_013766	AAT	2	6	200964	200969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800446
4019	NC_013766	A	6	6	200994	200999	100 %	0 %	0 %	0 %	284800446
4020	NC_013766	A	6	6	201064	201069	100 %	0 %	0 %	0 %	284800447
4021	NC_013766	CAGC	2	8	201384	201391	25 %	0 %	25 %	50 %	284800447
4022	NC_013766	A	8	8	201506	201513	100 %	0 %	0 %	0 %	284800447
4023	NC_013766	AGT	2	6	201618	201623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800448
4024	NC_013766	AAC	2	6	201655	201660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800448
4025	NC_013766	AGC	2	6	201696	201701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800448
4026	NC_013766	CAA	2	6	201734	201739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800448
4027	NC_013766	CAA	2	6	201749	201754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800448
4028	NC_013766	ATT	2	6	201772	201777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800448
4029	NC_013766	CTT	2	6	201782	201787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800448
4030	NC_013766	GGTATG	2	12	201796	201807	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	284800448
4031	NC_013766	GAA	2	6	201808	201813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800448
4032	NC_013766	GAA	2	6	201820	201825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800448
4033	NC_013766	TAAA	2	8	201840	201847	75 %	25 %	0 %	0 %	284800448
4034	NC_013766	TAT	2	6	201970	201975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800449
4035	NC_013766	AAAG	2	8	202012	202019	75 %	0 %	25 %	0 %	284800449
4036	NC_013766	TTA	2	6	202071	202076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800449
4037	NC_013766	CAA	2	6	202109	202114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800449
4038	NC_013766	ATT	2	6	202145	202150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800449
4039	NC_013766	CAG	3	9	202164	202172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800449
4040	NC_013766	GCA	2	6	202199	202204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800449
4041	NC_013766	TTC	2	6	202247	202252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800449
4042	NC_013766	TTGATA	2	12	202269	202280	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	284800449
4043	NC_013766	GCA	2	6	202304	202309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800449
4044	NC_013766	TGG	2	6	202333	202338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800449
4045	NC_013766	TGG	2	6	202343	202348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800449
4046	NC_013766	CAT	2	6	202366	202371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800449
4047	NC_013766	CAGA	2	8	202398	202405	50 %	0 %	25 %	25 %	284800449
4048	NC_013766	AGA	2	6	202420	202425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800449
4049	NC_013766	CAG	2	6	202467	202472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800449
4050	NC_013766	GGTT	2	8	202495	202502	0 %	50 %	50 %	0 %	284800449
4051	NC_013766	ATG	3	9	202589	202597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800449
4052	NC_013766	GCA	2	6	202805	202810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800449
4053	NC_013766	GTA	2	6	202949	202954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800449
4054	NC_013766	TTC	2	6	202974	202979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800449
4055	NC_013766	CTT	2	6	203018	203023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800449
4056	NC_013766	ATG	2	6	203057	203062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800449
4057	NC_013766	CTT	2	6	203125	203130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800449
4058	NC_013766	TC	3	6	203151	203156	0 %	50 %	0 %	50 %	284800449
4059	NC_013766	AGC	2	6	203221	203226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800450
4060	NC_013766	AAT	2	6	203240	203245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800450
4061	NC_013766	TAA	2	6	203247	203252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800450
4062	NC_013766	TGA	2	6	203266	203271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800450
4063	NC_013766	CTG	2	6	203373	203378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800450
4064	NC_013766	ATT	2	6	203490	203495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800450
4065	NC_013766	TGG	2	6	203535	203540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800450
4066	NC_013766	TGT	2	6	203572	203577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800450
4067	NC_013766	CAA	2	6	203587	203592	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800450
4068	NC_013766	GAT	2	6	203632	203637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800450
4069	NC_013766	CTT	2	6	203750	203755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800450
4070	NC_013766	A	6	6	203795	203800	100 %	0 %	0 %	0 %	284800450
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4072	NC_013766	A	6	6	203845	203850	100 %	0 %	0 %	0 %	284800450
4073	NC_013766	GAA	2	6	203959	203964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800450
4074	NC_013766	A	6	6	203963	203968	100 %	0 %	0 %	0 %	284800450
4075	NC_013766	GAA	2	6	204017	204022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800450
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4078	NC_013766	TGA	2	6	204237	204242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800450
4079	NC_013766	AGT	2	6	204278	204283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800451
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4081	NC_013766	CAA	2	6	204427	204432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800451
4082	NC_013766	AAC	2	6	204527	204532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800451
4083	NC_013766	TATT	2	8	204554	204561	25 %	75 %	0 %	0 %	284800451
4084	NC_013766	TCG	2	6	204593	204598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800451
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4086	NC_013766	AGC	3	9	204692	204700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800451
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4089	NC_013766	AGA	2	6	204926	204931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800451
4090	NC_013766	GAA	2	6	205034	205039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800451
4091	NC_013766	A	6	6	205038	205043	100 %	0 %	0 %	0 %	284800451
4092	NC_013766	GAAAA	2	10	205074	205083	80 %	0 %	20 %	0 %	284800451
4093	NC_013766	TGA	2	6	205091	205096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800451
4094	NC_013766	TAT	2	6	205103	205108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800451
4095	NC_013766	TCT	2	6	205152	205157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800451
4096	NC_013766	ACTT	2	8	205174	205181	25 %	50 %	0 %	25 %	284800451
4097	NC_013766	GAAAT	2	10	205270	205279	60 %	20 %	20 %	0 %	284800451
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4101	NC_013766	AGA	2	6	205633	205638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800452
4102	NC_013766	AGT	2	6	205651	205656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800452
4103	NC_013766	TGC	2	6	205741	205746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800452
4104	NC_013766	GTT	2	6	205748	205753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800452
4105	NC_013766	CTA	2	6	205776	205781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800452
4106	NC_013766	ATA	3	9	205788	205796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800452
4107	NC_013766	TTG	2	6	205851	205856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800452
4108	NC_013766	CGC	2	6	205898	205903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284800452
4109	NC_013766	GAAA	2	8	205925	205932	75 %	0 %	25 %	0 %	284800452
4110	NC_013766	TG	3	6	205970	205975	0 %	50 %	50 %	0 %	284800453
4111	NC_013766	TGA	2	6	205995	206000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800453
4112	NC_013766	CTG	2	6	206018	206023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800453
4113	NC_013766	ACT	2	6	206031	206036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800453
4114	NC_013766	AAT	2	6	206068	206073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800453
4115	NC_013766	ACAT	2	8	206132	206139	50 %	25 %	0 %	25 %	284800453
4116	NC_013766	CTA	2	6	206144	206149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800453
4117	NC_013766	AT	3	6	206163	206168	50 %	50 %	0 %	0 %	284800453
4118	NC_013766	AT	3	6	206196	206201	50 %	50 %	0 %	0 %	284800453
4119	NC_013766	ATC	2	6	206239	206244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800453
4120	NC_013766	ATCG	2	8	206274	206281	25 %	25 %	25 %	25 %	284800453
4121	NC_013766	GAT	2	6	206326	206331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800453
4122	NC_013766	ATG	2	6	206347	206352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800453
4123	NC_013766	TAA	2	6	206475	206480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800453
4124	NC_013766	TAA	2	6	206617	206622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800453
4125	NC_013766	A	7	7	206656	206662	100 %	0 %	0 %	0 %	284800454
4126	NC_013766	TAGA	2	8	206666	206673	50 %	25 %	25 %	0 %	284800454
4127	NC_013766	TTCG	2	8	206690	206697	0 %	50 %	25 %	25 %	284800454
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4131	NC_013766	ATG	2	6	206897	206902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800454
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4241	NC_013766	A	7	7	212440	212446	100 %	0 %	0 %	0 %	284800459
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4243	NC_013766	AG	3	6	212513	212518	50 %	0 %	50 %	0 %	284800460
4244	NC_013766	ACT	2	6	212582	212587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800460
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4491	NC_013766	AGA	2	6	224270	224275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800470
4492	NC_013766	AGCT	2	8	224422	224429	25 %	25 %	25 %	25 %	284800470
4493	NC_013766	AG	3	6	224463	224468	50 %	0 %	50 %	0 %	284800470
4494	NC_013766	ATT	2	6	224546	224551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800471
4495	NC_013766	GAA	2	6	224555	224560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800471
4496	NC_013766	GTG	2	6	224581	224586	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800471
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4498	NC_013766	GA	3	6	224661	224666	50 %	0 %	50 %	0 %	284800471
4499	NC_013766	AAAT	2	8	224674	224681	75 %	25 %	0 %	0 %	284800471
4500	NC_013766	AAT	2	6	224766	224771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800471

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