MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 60814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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44002	NC_013766	TCC	2	6	2194579	2194584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284802450
44003	NC_013766	ATTTG	2	10	2194619	2194628	20 %	60 %	20 %	0 %	284802450
44004	NC_013766	TCA	2	6	2194666	2194671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802450
44005	NC_013766	ACT	2	6	2194693	2194698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802450
44006	NC_013766	TTC	2	6	2194770	2194775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802450
44007	NC_013766	ATT	2	6	2194833	2194838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284802450
44008	NC_013766	TTA	2	6	2194906	2194911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284802450
44009	NC_013766	TTC	2	6	2194919	2194924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802450
44010	NC_013766	CTA	2	6	2194994	2194999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802450
44011	NC_013766	ACT	2	6	2195043	2195048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802450
44012	NC_013766	ATTG	2	8	2195070	2195077	25 %	50 %	25 %	0 %	284802450
44013	NC_013766	T	6	6	2195114	2195119	0 %	100 %	0 %	0 %	284802450
44014	NC_013766	CTT	2	6	2195129	2195134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802450
44015	NC_013766	GCT	2	6	2195227	2195232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802450
44016	NC_013766	GTT	2	6	2195258	2195263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284802450
44017	NC_013766	CTG	2	6	2195276	2195281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802450
44018	NC_013766	ATT	2	6	2195474	2195479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284802451
44019	NC_013766	ACT	2	6	2195500	2195505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802451
44020	NC_013766	AT	3	6	2195515	2195520	50 %	50 %	0 %	0 %	284802451
44021	NC_013766	TTC	2	6	2195523	2195528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802451
44022	NC_013766	CTTT	2	8	2195593	2195600	0 %	75 %	0 %	25 %	284802451
44023	NC_013766	GAT	2	6	2195610	2195615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284802451
44024	NC_013766	TTTA	2	8	2195634	2195641	25 %	75 %	0 %	0 %	284802451
44025	NC_013766	GT	3	6	2195679	2195684	0 %	50 %	50 %	0 %	284802451
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44030	NC_013766	TTC	3	9	2195880	2195888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802451
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44032	NC_013766	TTTC	2	8	2195941	2195948	0 %	75 %	0 %	25 %	284802451
44033	NC_013766	CAT	2	6	2196029	2196034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802451
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44037	NC_013766	TTGT	2	8	2196194	2196201	0 %	75 %	25 %	0 %	284802451
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44039	NC_013766	CGA	2	6	2196260	2196265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802451
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44041	NC_013766	AATA	2	8	2196287	2196294	75 %	25 %	0 %	0 %	284802451
44042	NC_013766	T	7	7	2196333	2196339	0 %	100 %	0 %	0 %	284802451
44043	NC_013766	TAA	2	6	2196589	2196594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802452
44044	NC_013766	GTA	2	6	2196605	2196610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284802452
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44054	NC_013766	TCA	2	6	2197168	2197173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802452
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44060	NC_013766	TGGT	2	8	2197467	2197474	0 %	50 %	50 %	0 %	284802452
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44066	NC_013766	CGA	2	6	2197582	2197587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802452
44067	NC_013766	T	6	6	2197650	2197655	0 %	100 %	0 %	0 %	284802452
44068	NC_013766	GTTC	2	8	2197748	2197755	0 %	50 %	25 %	25 %	284802452
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44116	NC_013766	CGC	2	6	2199970	2199975	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284802454
44117	NC_013766	TAA	2	6	2199991	2199996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802454
44118	NC_013766	AAC	2	6	2200046	2200051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284802454
44119	NC_013766	GTT	2	6	2200139	2200144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284802454
44120	NC_013766	AAAG	2	8	2200269	2200276	75 %	0 %	25 %	0 %	284802454
44121	NC_013766	GCC	2	6	2200329	2200334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284802454
44122	NC_013766	CATAAT	2	12	2200376	2200387	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	284802454
44123	NC_013766	CATT	2	8	2200396	2200403	25 %	50 %	0 %	25 %	284802454
44124	NC_013766	AT	3	6	2200464	2200469	50 %	50 %	0 %	0 %	284802454
44125	NC_013766	CAC	2	6	2200483	2200488	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284802454
44126	NC_013766	A	6	6	2200502	2200507	100 %	0 %	0 %	0 %	284802454
44127	NC_013766	GAC	2	6	2200525	2200530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802454
44128	NC_013766	ATC	2	6	2200575	2200580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802454
44129	NC_013766	TACA	2	8	2200588	2200595	50 %	25 %	0 %	25 %	284802454
44130	NC_013766	GCC	2	6	2200716	2200721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284802454
44131	NC_013766	GAT	2	6	2200725	2200730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284802454
44132	NC_013766	AAT	2	6	2200751	2200756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802454
44133	NC_013766	AT	3	6	2200755	2200760	50 %	50 %	0 %	0 %	284802454
44134	NC_013766	ATA	2	6	2200800	2200805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802454
44135	NC_013766	AAT	2	6	2200838	2200843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802454
44136	NC_013766	T	6	6	2200860	2200865	0 %	100 %	0 %	0 %	284802454
44137	NC_013766	TCAC	2	8	2200902	2200909	25 %	25 %	0 %	50 %	284802454
44138	NC_013766	T	7	7	2200975	2200981	0 %	100 %	0 %	0 %	284802455
44139	NC_013766	TAGT	2	8	2200989	2200996	25 %	50 %	25 %	0 %	284802455
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44141	NC_013766	ACTCAT	2	12	2201048	2201059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802455
44142	NC_013766	AAAC	2	8	2201150	2201157	75 %	0 %	0 %	25 %	284802455
44143	NC_013766	TTG	2	6	2201246	2201251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284802455
44144	NC_013766	ATCA	2	8	2201267	2201274	50 %	25 %	0 %	25 %	284802455
44145	NC_013766	CGC	2	6	2201276	2201281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284802455
44146	NC_013766	GTA	2	6	2201285	2201290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284802455
44147	NC_013766	TGC	2	6	2201312	2201317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802455
44148	NC_013766	TCA	2	6	2201359	2201364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802455
44149	NC_013766	TGA	2	6	2201365	2201370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284802455
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44151	NC_013766	TCA	2	6	2201443	2201448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802455
44152	NC_013766	CAA	2	6	2201491	2201496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284802455
44153	NC_013766	CTC	2	6	2201545	2201550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284802455
44154	NC_013766	TTTA	2	8	2201552	2201559	25 %	75 %	0 %	0 %	284802455
44155	NC_013766	ATA	2	6	2201574	2201579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802455
44156	NC_013766	ATA	2	6	2201610	2201615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802455
44157	NC_013766	TAA	3	9	2201647	2201655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802455
44158	NC_013766	CGT	2	6	2201659	2201664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802455
44159	NC_013766	CCCA	2	8	2201697	2201704	25 %	0 %	0 %	75 %	284802455
44160	NC_013766	GCT	2	6	2201708	2201713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802455
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44168	NC_013766	AAT	2	6	2202297	2202302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802456
44169	NC_013766	GTTT	2	8	2202322	2202329	0 %	75 %	25 %	0 %	284802456
44170	NC_013766	TTC	2	6	2202393	2202398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802456
44171	NC_013766	CAT	2	6	2202447	2202452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802456
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44214	NC_013766	TTC	2	6	2204124	2204129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802457
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44222	NC_013766	AAGT	2	8	2204347	2204354	50 %	25 %	25 %	0 %	284802457
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44226	NC_013766	AT	3	6	2204441	2204446	50 %	50 %	0 %	0 %	284802457
44227	NC_013766	T	7	7	2204446	2204452	0 %	100 %	0 %	0 %	284802457
44228	NC_013766	ATT	2	6	2204537	2204542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284802457
44229	NC_013766	ATTTT	2	10	2204670	2204679	20 %	80 %	0 %	0 %	284802457
44230	NC_013766	TCC	2	6	2204727	2204732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284802457
44231	NC_013766	TTTC	2	8	2204749	2204756	0 %	75 %	0 %	25 %	284802457
44232	NC_013766	CAT	2	6	2204797	2204802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802457
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44234	NC_013766	TCA	2	6	2204832	2204837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802457
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44236	NC_013766	GCT	2	6	2205040	2205045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802457
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44253	NC_013766	CG	3	6	2206032	2206037	0 %	0 %	50 %	50 %	284802459
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44336	NC_013766	A	6	6	2210852	2210857	100 %	0 %	0 %	0 %	284802461
44337	NC_013766	GGC	2	6	2210883	2210888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284802461
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44341	NC_013766	CGG	2	6	2211111	2211116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284802461
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44343	NC_013766	GC	3	6	2211451	2211456	0 %	0 %	50 %	50 %	284802461
44344	NC_013766	TTG	2	6	2211461	2211466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284802461
44345	NC_013766	AAG	2	6	2211491	2211496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284802461
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44348	NC_013766	TGGCGG	2	12	2211534	2211545	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	284802461
44349	NC_013766	CGT	2	6	2211574	2211579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802461
44350	NC_013766	ATG	2	6	2211581	2211586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284802461
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44352	NC_013766	A	7	7	2211745	2211751	100 %	0 %	0 %	0 %	284802461
44353	NC_013766	ATT	2	6	2211889	2211894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284802461
44354	NC_013766	AAG	2	6	2211911	2211916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284802461
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44468	NC_013766	TTCAAT	2	12	2218849	2218860	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	284802466
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