MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 60814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_013766	CAT	3	9	2144186	2144194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802396
43002	NC_013766	GGT	2	6	2144212	2144217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284802396
43003	NC_013766	TAAAA	2	10	2144222	2144231	80 %	20 %	0 %	0 %	284802396
43004	NC_013766	CTT	2	6	2144243	2144248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802396
43005	NC_013766	CTT	2	6	2144270	2144275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802396
43006	NC_013766	TCT	2	6	2144323	2144328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802396
43007	NC_013766	TGC	2	6	2144406	2144411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802396
43008	NC_013766	GAA	2	6	2144540	2144545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284802396
43009	NC_013766	CTA	2	6	2144610	2144615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802397
43010	NC_013766	TGG	2	6	2144700	2144705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284802397
43011	NC_013766	TCT	2	6	2144860	2144865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802397
43012	NC_013766	CAT	2	6	2144897	2144902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802397
43013	NC_013766	CAT	2	6	2144909	2144914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802397
43014	NC_013766	GCC	2	6	2144943	2144948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284802397
43015	NC_013766	CTT	2	6	2144981	2144986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802397
43016	NC_013766	GTT	2	6	2145010	2145015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284802397
43017	NC_013766	CAA	2	6	2145026	2145031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284802397
43018	NC_013766	AATATC	2	12	2145063	2145074	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	284802397
43019	NC_013766	TCT	2	6	2145145	2145150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802397
43020	NC_013766	CCA	2	6	2145175	2145180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284802397
43021	NC_013766	ATA	2	6	2145238	2145243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802397
43022	NC_013766	CGA	2	6	2145244	2145249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802397
43023	NC_013766	GTT	2	6	2145268	2145273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284802397
43024	NC_013766	ACCAAA	2	12	2145378	2145389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284802397
43025	NC_013766	ATC	2	6	2145396	2145401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802397
43026	NC_013766	AT	3	6	2145491	2145496	50 %	50 %	0 %	0 %	284802397
43027	NC_013766	TAA	2	6	2145501	2145506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802397
43028	NC_013766	ATA	2	6	2145516	2145521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802397
43029	NC_013766	AGC	2	6	2145536	2145541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802397
43030	NC_013766	TCT	2	6	2145571	2145576	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802397
43031	NC_013766	TAT	2	6	2145584	2145589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284802397
43032	NC_013766	AGG	2	6	2145612	2145617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284802397
43033	NC_013766	ACA	2	6	2145658	2145663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284802397
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43035	NC_013766	CAT	2	6	2145806	2145811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802397
43036	NC_013766	CATT	2	8	2145893	2145900	25 %	50 %	0 %	25 %	284802397
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43038	NC_013766	TGGT	2	8	2146194	2146201	0 %	50 %	50 %	0 %	284802398
43039	NC_013766	GCC	2	6	2146213	2146218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	284802398
43040	NC_013766	ATT	2	6	2146273	2146278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284802398
43041	NC_013766	CAT	2	6	2146323	2146328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802398
43042	NC_013766	CAG	2	6	2146337	2146342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802398
43043	NC_013766	TCA	2	6	2146486	2146491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802398
43044	NC_013766	CAG	2	6	2146556	2146561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284802398
43045	NC_013766	CAC	2	6	2146577	2146582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284802398
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43047	NC_013766	CTT	2	6	2146703	2146708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802398
43048	NC_013766	GGTT	2	8	2146801	2146808	0 %	50 %	50 %	0 %	284802398
43049	NC_013766	A	6	6	2146957	2146962	100 %	0 %	0 %	0 %	284802399
43050	NC_013766	TAATTC	2	12	2147037	2147048	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	284802399
43051	NC_013766	ACC	2	6	2147052	2147057	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284802399
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43055	NC_013766	CTA	2	6	2147192	2147197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802399
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43058	NC_013766	CTA	2	6	2147273	2147278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802399
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43071	NC_013766	TTGT	2	8	2148172	2148179	0 %	75 %	25 %	0 %	284802400
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43083	NC_013766	AT	3	6	2148824	2148829	50 %	50 %	0 %	0 %	284802400
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43086	NC_013766	CT	4	8	2148999	2149006	0 %	50 %	0 %	50 %	284802400
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43088	NC_013766	A	6	6	2149022	2149027	100 %	0 %	0 %	0 %	284802400
43089	NC_013766	TCAT	2	8	2149040	2149047	25 %	50 %	0 %	25 %	284802400
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43098	NC_013766	GA	3	6	2149406	2149411	50 %	0 %	50 %	0 %	284802401
43099	NC_013766	AATT	2	8	2149424	2149431	50 %	50 %	0 %	0 %	284802401
43100	NC_013766	CAT	2	6	2149610	2149615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802401
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43104	NC_013766	AATA	2	8	2149717	2149724	75 %	25 %	0 %	0 %	284802401
43105	NC_013766	TAA	2	6	2149732	2149737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802401
43106	NC_013766	TAAA	2	8	2149741	2149748	75 %	25 %	0 %	0 %	284802401
43107	NC_013766	TAT	3	9	2149889	2149897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284802402
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43111	NC_013766	AAT	2	6	2150012	2150017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802402
43112	NC_013766	GCT	2	6	2150033	2150038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802402
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43114	NC_013766	ACC	2	6	2150116	2150121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	284802402
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43117	NC_013766	CCAT	2	8	2150337	2150344	25 %	25 %	0 %	50 %	284802402
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43471	NC_013766	T	6	6	2168003	2168008	0 %	100 %	0 %	0 %	284802422
43472	NC_013766	GCT	2	6	2168034	2168039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802422
43473	NC_013766	ACT	2	6	2168144	2168149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802422
43474	NC_013766	TAA	2	6	2168176	2168181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802422
43475	NC_013766	CATCT	2	10	2168405	2168414	20 %	40 %	0 %	40 %	284802422
43476	NC_013766	TTC	2	6	2168438	2168443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802422
43477	NC_013766	AATT	2	8	2168446	2168453	50 %	50 %	0 %	0 %	284802422
43478	NC_013766	CCT	2	6	2168544	2168549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	284802422
43479	NC_013766	ACT	2	6	2168561	2168566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802422
43480	NC_013766	TAA	2	6	2168567	2168572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802422
43481	NC_013766	CATG	2	8	2168599	2168606	25 %	25 %	25 %	25 %	284802422
43482	NC_013766	TAA	2	6	2168611	2168616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802422
43483	NC_013766	T	6	6	2168620	2168625	0 %	100 %	0 %	0 %	284802422
43484	NC_013766	GATG	2	8	2168729	2168736	25 %	25 %	50 %	0 %	284802422
43485	NC_013766	A	7	7	2168778	2168784	100 %	0 %	0 %	0 %	284802422
43486	NC_013766	TCG	2	6	2169239	2169244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284802423
43487	NC_013766	TTC	2	6	2169261	2169266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284802423
43488	NC_013766	CTA	2	6	2169341	2169346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284802423
43489	NC_013766	ATG	2	6	2169355	2169360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284802423
43490	NC_013766	TGA	2	6	2169401	2169406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284802423
43491	NC_013766	GGT	2	6	2169429	2169434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284802423
43492	NC_013766	GAA	2	6	2169576	2169581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284802423
43493	NC_013766	ATT	2	6	2169637	2169642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284802423
43494	NC_013766	TAT	2	6	2169692	2169697	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284802423
43495	NC_013766	AAT	2	6	2169711	2169716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802423
43496	NC_013766	ATA	2	6	2169727	2169732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284802423
43497	NC_013766	CG	3	6	2169903	2169908	0 %	0 %	50 %	50 %	284802423
43498	NC_013766	AAG	2	6	2169937	2169942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284802423
43499	NC_013766	AAG	2	6	2170015	2170020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284802423
43500	NC_013766	TTG	2	6	2170054	2170059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284802423

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