MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes 08-5578 chromosome

Total Repeats: 60814

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013766	GAC	2	6	257	262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800256
2	NC_013766	TTA	2	6	275	280	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800256
3	NC_013766	CAG	2	6	300	305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800256
4	NC_013766	ATAA	2	8	341	348	75 %	25 %	0 %	0 %	284800256
5	NC_013766	A	8	8	371	378	100 %	0 %	0 %	0 %	284800256
6	NC_013766	GAA	2	6	419	424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800256
7	NC_013766	TAA	2	6	516	521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800256
8	NC_013766	CTG	2	6	546	551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800256
9	NC_013766	GA	3	6	628	633	50 %	0 %	50 %	0 %	284800256
10	NC_013766	AT	3	6	637	642	50 %	50 %	0 %	0 %	284800256
11	NC_013766	AAT	2	6	654	659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800256
12	NC_013766	TAAT	2	8	820	827	50 %	50 %	0 %	0 %	284800257
13	NC_013766	A	7	7	861	867	100 %	0 %	0 %	0 %	284800257
14	NC_013766	GTC	3	9	923	931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800257
15	NC_013766	GAA	2	6	938	943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800257
16	NC_013766	A	9	9	1053	1061	100 %	0 %	0 %	0 %	284800258
17	NC_013766	A	8	8	1071	1078	100 %	0 %	0 %	0 %	284800258
18	NC_013766	TGT	2	6	1133	1138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800258
19	NC_013766	AAG	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800258
20	NC_013766	A	7	7	1194	1200	100 %	0 %	0 %	0 %	284800258
21	NC_013766	AATC	2	8	1271	1278	50 %	25 %	0 %	25 %	284800258
22	NC_013766	AT	3	6	1289	1294	50 %	50 %	0 %	0 %	284800258
23	NC_013766	ATC	2	6	1296	1301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800258
24	NC_013766	CGG	2	6	1312	1317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	284800258
25	NC_013766	TGAAG	2	10	1334	1343	40 %	20 %	40 %	0 %	284800258
26	NC_013766	AGTG	2	8	1405	1412	25 %	25 %	50 %	0 %	284800258
27	NC_013766	GAA	3	9	1452	1460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800259
28	NC_013766	GTT	2	6	1660	1665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800259
29	NC_013766	AAACA	2	10	1790	1799	80 %	0 %	0 %	20 %	284800259
30	NC_013766	ACA	2	6	1806	1811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800259
31	NC_013766	ATG	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800259
32	NC_013766	GTT	2	6	1859	1864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800259
33	NC_013766	ATT	2	6	1869	1874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800259
34	NC_013766	CTA	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800259
35	NC_013766	TAG	2	6	1914	1919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800259
36	NC_013766	CAG	2	6	1922	1927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800259
37	NC_013766	ATTC	2	8	1940	1947	25 %	50 %	0 %	25 %	284800259
38	NC_013766	GTT	2	6	1993	1998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800259
39	NC_013766	AAC	2	6	2007	2012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800259
40	NC_013766	ATC	2	6	2019	2024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800259
41	NC_013766	ATG	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800259
42	NC_013766	AAAT	2	8	2055	2062	75 %	25 %	0 %	0 %	284800259
43	NC_013766	CAT	2	6	2082	2087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800259
44	NC_013766	ATTAC	2	10	2113	2122	40 %	40 %	0 %	20 %	284800259
45	NC_013766	TGCTCT	2	12	2127	2138	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	284800259
46	NC_013766	TAAT	2	8	2183	2190	50 %	50 %	0 %	0 %	284800259
47	NC_013766	AGG	2	6	2216	2221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	284800259
48	NC_013766	GCTG	2	8	2223	2230	0 %	25 %	50 %	25 %	284800259
49	NC_013766	GAA	2	6	2256	2261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800259
50	NC_013766	A	6	6	2260	2265	100 %	0 %	0 %	0 %	284800259
51	NC_013766	A	6	6	2287	2292	100 %	0 %	0 %	0 %	284800259
52	NC_013766	AAGAA	2	10	2299	2308	80 %	0 %	20 %	0 %	284800259
53	NC_013766	GA	3	6	2312	2317	50 %	0 %	50 %	0 %	284800259
54	NC_013766	GAA	2	6	2343	2348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800260
55	NC_013766	ACA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800260
56	NC_013766	A	6	6	2421	2426	100 %	0 %	0 %	0 %	284800260
57	NC_013766	AGA	2	6	2477	2482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800260
58	NC_013766	GATT	2	8	2498	2505	25 %	50 %	25 %	0 %	284800260
59	NC_013766	AGA	2	6	2555	2560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800260
60	NC_013766	AATT	2	8	2659	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	284800260
61	NC_013766	TAA	2	6	2669	2674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800260
62	NC_013766	AAC	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800260
63	NC_013766	ATT	2	6	2697	2702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800260
64	NC_013766	CAAA	2	8	2755	2762	75 %	0 %	0 %	25 %	284800260
65	NC_013766	GC	3	6	2789	2794	0 %	0 %	50 %	50 %	284800260
66	NC_013766	GAAA	2	8	2823	2830	75 %	0 %	25 %	0 %	284800260
67	NC_013766	ATT	2	6	2832	2837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800260
68	NC_013766	AAAT	2	8	2925	2932	75 %	25 %	0 %	0 %	284800260
69	NC_013766	GAT	2	6	3044	3049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800261
70	NC_013766	AAGT	2	8	3053	3060	50 %	25 %	25 %	0 %	284800261
71	NC_013766	TGG	2	6	3107	3112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800261
72	NC_013766	ATGG	2	8	3120	3127	25 %	25 %	50 %	0 %	284800261
73	NC_013766	AGC	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800261
74	NC_013766	GAA	2	6	3225	3230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800261
75	NC_013766	TAT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800261
76	NC_013766	CTTA	2	8	3298	3305	25 %	50 %	0 %	25 %	284800261
77	NC_013766	GAAGGA	2	12	3306	3317	50 %	0 %	50 %	0 %	284800261
78	NC_013766	AATG	2	8	3366	3373	50 %	25 %	25 %	0 %	284800261
79	NC_013766	GAA	2	6	3396	3401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800261
80	NC_013766	GTT	2	6	3411	3416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800261
81	NC_013766	GTT	2	6	3432	3437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800261
82	NC_013766	T	6	6	3499	3504	0 %	100 %	0 %	0 %	284800262
83	NC_013766	AAGT	2	8	3557	3564	50 %	25 %	25 %	0 %	284800262
84	NC_013766	AAT	2	6	3589	3594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800262
85	NC_013766	TGC	2	6	3634	3639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800262
86	NC_013766	T	6	6	3645	3650	0 %	100 %	0 %	0 %	284800262
87	NC_013766	T	8	8	3686	3693	0 %	100 %	0 %	0 %	284800262
88	NC_013766	TAA	2	6	3783	3788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800262
89	NC_013766	TGG	2	6	3798	3803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800262
90	NC_013766	GTG	2	6	3806	3811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800262
91	NC_013766	ATC	2	6	3832	3837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	284800262
92	NC_013766	TGA	2	6	3907	3912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800262
93	NC_013766	TTC	3	9	3916	3924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800262
94	NC_013766	A	6	6	3926	3931	100 %	0 %	0 %	0 %	284800262
95	NC_013766	TTG	2	6	3958	3963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800262
96	NC_013766	ATA	2	6	3992	3997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800262
97	NC_013766	GAA	3	9	4032	4040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800262
98	NC_013766	T	8	8	4058	4065	0 %	100 %	0 %	0 %	284800262
99	NC_013766	TTG	2	6	4096	4101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800262
100	NC_013766	TGA	2	6	4119	4124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800262
101	NC_013766	ATG	2	6	4156	4161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800262
102	NC_013766	TAAAAG	2	12	4174	4185	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	284800262
103	NC_013766	GTATG	2	10	4274	4283	20 %	40 %	40 %	0 %	284800262
104	NC_013766	TA	3	6	4312	4317	50 %	50 %	0 %	0 %	284800262
105	NC_013766	GAA	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	284800262
106	NC_013766	TAA	2	6	4348	4353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	284800262
107	NC_013766	TGC	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	284800262
108	NC_013766	T	6	6	4419	4424	0 %	100 %	0 %	0 %	284800262
109	NC_013766	T	6	6	4428	4433	0 %	100 %	0 %	0 %	284800262
110	NC_013766	T	6	6	4456	4461	0 %	100 %	0 %	0 %	284800262
111	NC_013766	A	6	6	4620	4625	100 %	0 %	0 %	0 %	284800263
112	NC_013766	TGG	2	6	4793	4798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800263
113	NC_013766	ATTT	2	8	4826	4833	25 %	75 %	0 %	0 %	284800263
114	NC_013766	ATT	2	6	4872	4877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800263
115	NC_013766	TTA	2	6	4902	4907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800263
116	NC_013766	AT	3	6	4964	4969	50 %	50 %	0 %	0 %	284800263
117	NC_013766	CTTTA	2	10	5051	5060	20 %	60 %	0 %	20 %	284800263
118	NC_013766	ATT	2	6	5064	5069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800263
119	NC_013766	ATTG	2	8	5117	5124	25 %	50 %	25 %	0 %	284800263
120	NC_013766	GAAA	2	8	5198	5205	75 %	0 %	25 %	0 %	284800263
121	NC_013766	GT	3	6	5284	5289	0 %	50 %	50 %	0 %	284800263
122	NC_013766	TAG	2	6	5305	5310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800263
123	NC_013766	GGTG	2	8	5351	5358	0 %	25 %	75 %	0 %	284800263
124	NC_013766	TAT	2	6	5395	5400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	284800263
125	NC_013766	CAG	2	6	5410	5415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800263
126	NC_013766	GTT	2	6	5468	5473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800263
127	NC_013766	T	6	6	5472	5477	0 %	100 %	0 %	0 %	284800263
128	NC_013766	CTT	2	6	5500	5505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	284800263
129	NC_013766	TACT	2	8	5512	5519	25 %	50 %	0 %	25 %	284800263
130	NC_013766	TTG	2	6	5521	5526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	284800263
131	NC_013766	CAG	2	6	5575	5580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	284800263
132	NC_013766	CAA	2	6	5629	5634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	284800263
133	NC_013766	GTG	2	6	5641	5646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	284800263
134	NC_013766	GTA	2	6	5680	5685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800263
135	NC_013766	TTAC	2	8	5763	5770	25 %	50 %	0 %	25 %	284800263
136	NC_013766	TGA	2	6	5825	5830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	284800263
137	NC_013766	TGAA	2	8	5950	5957	50 %	25 %	25 %	0 %	284800264
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