MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 35523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32005	NC_013504	CCAA	2	8	1583601	1583608	50 %	0 %	0 %	50 %	268320110
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32011	NC_013504	AAACA	2	10	1583885	1583894	80 %	0 %	0 %	20 %	268320111
32012	NC_013504	TTAA	2	8	1583922	1583929	50 %	50 %	0 %	0 %	268320111
32013	NC_013504	CTT	2	6	1583941	1583946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268320111
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32018	NC_013504	TAAA	2	8	1584136	1584143	75 %	25 %	0 %	0 %	268320111
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32117	NC_013504	GCA	2	6	1589330	1589335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268320116
32118	NC_013504	TAC	2	6	1589344	1589349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268320116
32119	NC_013504	TTC	2	6	1589365	1589370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268320116
32120	NC_013504	AGA	2	6	1589389	1589394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268320116
32121	NC_013504	CTT	2	6	1589415	1589420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268320116
32122	NC_013504	CAT	2	6	1589448	1589453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268320116
32123	NC_013504	ATT	2	6	1589464	1589469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268320116
32124	NC_013504	TTC	2	6	1589470	1589475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268320116
32125	NC_013504	TTC	2	6	1590129	1590134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268320117
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32129	NC_013504	GAG	2	6	1590235	1590240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268320117
32130	NC_013504	CAA	2	6	1590265	1590270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268320117
32131	NC_013504	ACC	2	6	1590275	1590280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268320117
32132	NC_013504	CTG	2	6	1590283	1590288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268320117
32133	NC_013504	AGGA	2	8	1590301	1590308	50 %	0 %	50 %	0 %	268320117
32134	NC_013504	GCA	2	6	1590330	1590335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268320117
32135	NC_013504	AATG	2	8	1590356	1590363	50 %	25 %	25 %	0 %	268320117
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32137	NC_013504	AAAG	2	8	1590425	1590432	75 %	0 %	25 %	0 %	268320117
32138	NC_013504	GGA	2	6	1590456	1590461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268320117
32139	NC_013504	ACC	2	6	1590467	1590472	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268320117
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32142	NC_013504	GCA	2	6	1590498	1590503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268320117
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32144	NC_013504	TTG	2	6	1590558	1590563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268320117
32145	NC_013504	ACC	2	6	1590569	1590574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268320117
32146	NC_013504	CAT	2	6	1590587	1590592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268320117
32147	NC_013504	AAG	2	6	1590645	1590650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268320117
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32151	NC_013504	CAATC	2	10	1590797	1590806	40 %	20 %	0 %	40 %	268320117
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32153	NC_013504	ACC	2	6	1590839	1590844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268320117
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32155	NC_013504	CCA	2	6	1590927	1590932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268320117
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32162	NC_013504	CAT	2	6	1591198	1591203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268320117
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32175	NC_013504	CTT	2	6	1591663	1591668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268320117
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32193	NC_013504	GCT	2	6	1592482	1592487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268320118
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32202	NC_013504	ACC	2	6	1592859	1592864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268320118
32203	NC_013504	ACC	2	6	1592931	1592936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268320118
32204	NC_013504	CCT	2	6	1593049	1593054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268320119
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32213	NC_013504	CTG	2	6	1593262	1593267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268320119
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32220	NC_013504	TGA	2	6	1593701	1593706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268320119
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32222	NC_013504	TTG	2	6	1593773	1593778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268320119
32223	NC_013504	ATTAA	2	10	1593966	1593975	60 %	40 %	0 %	0 %	268320120
32224	NC_013504	AT	3	6	1593985	1593990	50 %	50 %	0 %	0 %	268320120
32225	NC_013504	T	6	6	1593990	1593995	0 %	100 %	0 %	0 %	268320120
32226	NC_013504	TAAA	2	8	1594003	1594010	75 %	25 %	0 %	0 %	268320120
32227	NC_013504	T	7	7	1594016	1594022	0 %	100 %	0 %	0 %	268320120
32228	NC_013504	TAG	2	6	1594025	1594030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268320120
32229	NC_013504	T	6	6	1594211	1594216	0 %	100 %	0 %	0 %	268320120
32230	NC_013504	CTC	2	6	1594247	1594252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268320120
32231	NC_013504	TAA	2	6	1594277	1594282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268320120
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32459	NC_013504	AAGT	2	8	1603134	1603141	50 %	25 %	25 %	0 %	268320127
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32467	NC_013504	TCA	3	9	1603369	1603377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268320127
32468	NC_013504	T	6	6	1603474	1603479	0 %	100 %	0 %	0 %	268320127
32469	NC_013504	CAT	2	6	1603502	1603507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268320127
32470	NC_013504	ATA	2	6	1603681	1603686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268320127
32471	NC_013504	TTA	2	6	1603762	1603767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268320127
32472	NC_013504	TCT	2	6	1603810	1603815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268320127
32473	NC_013504	GCTAAA	2	12	1603840	1603851	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	268320127
32474	NC_013504	TTG	2	6	1603866	1603871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268320127
32475	NC_013504	AAGA	2	8	1603915	1603922	75 %	0 %	25 %	0 %	268320127
32476	NC_013504	GCA	2	6	1603963	1603968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268320127
32477	NC_013504	CTC	2	6	1603970	1603975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	268320127
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32479	NC_013504	CTT	2	6	1604099	1604104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268320127
32480	NC_013504	GA	3	6	1604120	1604125	50 %	0 %	50 %	0 %	268320127
32481	NC_013504	TCG	2	6	1604161	1604166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268320127
32482	NC_013504	TTG	2	6	1604193	1604198	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268320127
32483	NC_013504	ATA	2	6	1604263	1604268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268320127
32484	NC_013504	TAAAC	2	10	1604295	1604304	60 %	20 %	0 %	20 %	268320127
32485	NC_013504	ATC	2	6	1604368	1604373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268320127
32486	NC_013504	AGT	2	6	1604534	1604539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268320127
32487	NC_013504	GTG	2	6	1604627	1604632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268320127
32488	NC_013504	ATCA	2	8	1604643	1604650	50 %	25 %	0 %	25 %	268320127
32489	NC_013504	AATA	2	8	1604658	1604665	75 %	25 %	0 %	0 %	268320127
32490	NC_013504	CAG	2	6	1604678	1604683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268320127
32491	NC_013504	AGC	2	6	1604685	1604690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268320127
32492	NC_013504	ATA	2	6	1604698	1604703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268320127
32493	NC_013504	ATT	2	6	1604707	1604712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268320127
32494	NC_013504	AAC	2	6	1604715	1604720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268320127
32495	NC_013504	GTT	2	6	1604737	1604742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268320127
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32497	NC_013504	T	6	6	1604798	1604803	0 %	100 %	0 %	0 %	268320127
32498	NC_013504	ATT	2	6	1604845	1604850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268320128
32499	NC_013504	TTC	2	6	1604851	1604856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268320128
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