MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 35523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013504	CTA	2	6	247033	247038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318791
5002	NC_013504	ACTT	2	8	247055	247062	25 %	50 %	0 %	25 %	268318791
5003	NC_013504	TAA	2	6	247099	247104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318791
5004	NC_013504	T	6	6	247117	247122	0 %	100 %	0 %	0 %	268318791
5005	NC_013504	TTAC	2	8	247248	247255	25 %	50 %	0 %	25 %	268318791
5006	NC_013504	TTC	2	6	247262	247267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318791
5007	NC_013504	TTC	2	6	247282	247287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318791
5008	NC_013504	TCA	2	6	247658	247663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318792
5009	NC_013504	ATT	2	6	247778	247783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318792
5010	NC_013504	GAG	2	6	247813	247818	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318792
5011	NC_013504	A	6	6	247861	247866	100 %	0 %	0 %	0 %	268318792
5012	NC_013504	TAA	2	6	247919	247924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318792
5013	NC_013504	ATA	2	6	248028	248033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318792
5014	NC_013504	GAT	2	6	248097	248102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318793
5015	NC_013504	GAA	2	6	248232	248237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318793
5016	NC_013504	TGA	2	6	248348	248353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318793
5017	NC_013504	AGA	2	6	248369	248374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318793
5018	NC_013504	GAA	2	6	248376	248381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318793
5019	NC_013504	GAT	3	9	248439	248447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318793
5020	NC_013504	GAT	2	6	248466	248471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318793
5021	NC_013504	AGA	2	6	248474	248479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318793
5022	NC_013504	GAA	2	6	248499	248504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318793
5023	NC_013504	GAC	2	6	248517	248522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318793
5024	NC_013504	GAT	3	9	248529	248537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318793
5025	NC_013504	TGA	2	6	248540	248545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318793
5026	NC_013504	GAT	2	6	248565	248570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318793
5027	NC_013504	TCA	2	6	248597	248602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318793
5028	NC_013504	GAT	2	6	248604	248609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318793
5029	NC_013504	TGA	2	6	248612	248617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318793
5030	NC_013504	GAT	2	6	248619	248624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318793
5031	NC_013504	TGG	2	6	248783	248788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318794
5032	NC_013504	GTT	2	6	248790	248795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318794
5033	NC_013504	TCA	2	6	248796	248801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318794
5034	NC_013504	GAT	2	6	248946	248951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318794
5035	NC_013504	TTG	2	6	248992	248997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318794
5036	NC_013504	TAC	2	6	249026	249031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318794
5037	NC_013504	AAG	2	6	249046	249051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318794
5038	NC_013504	A	7	7	249129	249135	100 %	0 %	0 %	0 %	268318794
5039	NC_013504	TGC	2	6	249143	249148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318794
5040	NC_013504	AAC	2	6	249152	249157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318794
5041	NC_013504	ATT	2	6	249171	249176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318794
5042	NC_013504	TGG	2	6	249185	249190	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318794
5043	NC_013504	CGT	2	6	249243	249248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318794
5044	NC_013504	GAA	2	6	249258	249263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318794
5045	NC_013504	AATGT	2	10	249264	249273	40 %	40 %	20 %	0 %	268318794
5046	NC_013504	TGC	2	6	249305	249310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318794
5047	NC_013504	CAACA	2	10	249331	249340	60 %	0 %	0 %	40 %	268318794
5048	NC_013504	A	6	6	249422	249427	100 %	0 %	0 %	0 %	268318794
5049	NC_013504	ATT	2	6	249465	249470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318794
5050	NC_013504	GAA	2	6	249596	249601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318794
5051	NC_013504	TAG	2	6	249649	249654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318794
5052	NC_013504	AT	3	6	249680	249685	50 %	50 %	0 %	0 %	268318794
5053	NC_013504	AGA	2	6	249758	249763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318794
5054	NC_013504	TGG	2	6	249821	249826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318794
5055	NC_013504	AAT	2	6	249999	250004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318794
5056	NC_013504	ATT	2	6	250005	250010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318794
5057	NC_013504	TGA	2	6	250031	250036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318794
5058	NC_013504	TGG	2	6	250046	250051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318794
5059	NC_013504	AAG	2	6	250086	250091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318794
5060	NC_013504	ATG	2	6	250114	250119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318794
5061	NC_013504	AAGA	2	8	250135	250142	75 %	0 %	25 %	0 %	268318794
5062	NC_013504	CACCGT	2	12	250143	250154	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	268318794
5063	NC_013504	AAT	2	6	250164	250169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318794
5064	NC_013504	AGGC	2	8	250192	250199	25 %	0 %	50 %	25 %	268318794
5065	NC_013504	TCT	2	6	250204	250209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318794
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5068	NC_013504	A	6	6	250260	250265	100 %	0 %	0 %	0 %	268318794
5069	NC_013504	ATC	2	6	250285	250290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318794
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5072	NC_013504	GCA	2	6	250347	250352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318794
5073	NC_013504	GAT	2	6	250522	250527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318795
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5088	NC_013504	GTG	2	6	251136	251141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318795
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5090	NC_013504	TAT	2	6	251203	251208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318795
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5099	NC_013504	CTT	2	6	251456	251461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318795
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5101	NC_013504	AT	3	6	251501	251506	50 %	50 %	0 %	0 %	268318795
5102	NC_013504	AGA	2	6	251538	251543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318795
5103	NC_013504	AGA	2	6	251563	251568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318795
5104	NC_013504	TCA	2	6	251593	251598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318795
5105	NC_013504	TGCT	2	8	251652	251659	0 %	50 %	25 %	25 %	268318795
5106	NC_013504	TGAT	2	8	251766	251773	25 %	50 %	25 %	0 %	268318795
5107	NC_013504	TTAA	2	8	251776	251783	50 %	50 %	0 %	0 %	268318795
5108	NC_013504	TTTA	2	8	251848	251855	25 %	75 %	0 %	0 %	268318796
5109	NC_013504	T	6	6	251870	251875	0 %	100 %	0 %	0 %	268318796
5110	NC_013504	ACA	2	6	251959	251964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318796
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5112	NC_013504	CT	3	6	252095	252100	0 %	50 %	0 %	50 %	268318796
5113	NC_013504	ATA	2	6	252175	252180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318796
5114	NC_013504	TAA	2	6	252204	252209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318796
5115	NC_013504	CATTAA	2	12	252213	252224	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	268318796
5116	NC_013504	AGT	2	6	252300	252305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318796
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5119	NC_013504	TGG	2	6	252804	252809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318796
5120	NC_013504	CTA	2	6	252842	252847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318796
5121	NC_013504	GAT	2	6	252870	252875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318796
5122	NC_013504	CATA	2	8	252881	252888	50 %	25 %	0 %	25 %	268318796
5123	NC_013504	T	6	6	252903	252908	0 %	100 %	0 %	0 %	268318796
5124	NC_013504	ACA	2	6	252955	252960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318796
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5126	NC_013504	TGT	2	6	253129	253134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318796
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5129	NC_013504	TG	4	8	253168	253175	0 %	50 %	50 %	0 %	268318796
5130	NC_013504	ATTT	2	8	253180	253187	25 %	75 %	0 %	0 %	268318796
5131	NC_013504	ACACCA	2	12	253306	253317	50 %	0 %	0 %	50 %	268318797
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5135	NC_013504	TAT	2	6	253445	253450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318797
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5137	NC_013504	CAT	2	6	253493	253498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318797
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5141	NC_013504	CAT	2	6	253653	253658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318797
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5146	NC_013504	T	6	6	253961	253966	0 %	100 %	0 %	0 %	268318798
5147	NC_013504	TAT	2	6	253971	253976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318798
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5153	NC_013504	T	6	6	254149	254154	0 %	100 %	0 %	0 %	268318798
5154	NC_013504	GTA	2	6	254159	254164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318798
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5163	NC_013504	AAT	2	6	254368	254373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318798
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5231	NC_013504	AGCAA	2	10	258015	258024	60 %	0 %	20 %	20 %	268318801
5232	NC_013504	AAG	2	6	258052	258057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318801
5233	NC_013504	ATG	2	6	258113	258118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318801
5234	NC_013504	A	6	6	258203	258208	100 %	0 %	0 %	0 %	268318801
5235	NC_013504	ATT	2	6	258212	258217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318801
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5237	NC_013504	A	7	7	258263	258269	100 %	0 %	0 %	0 %	268318801
5238	NC_013504	AAAAT	2	10	258323	258332	80 %	20 %	0 %	0 %	268318801
5239	NC_013504	TAAA	2	8	258368	258375	75 %	25 %	0 %	0 %	268318801
5240	NC_013504	AGA	2	6	258531	258536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318802
5241	NC_013504	TGA	2	6	258669	258674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318802
5242	NC_013504	TAA	2	6	258748	258753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318802
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5244	NC_013504	TAA	2	6	258808	258813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318802
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5248	NC_013504	TGT	2	6	258862	258867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318802
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5369	NC_013504	TAA	2	6	263964	263969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318804
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5489	NC_013504	AGA	2	6	272599	272604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318818
5490	NC_013504	TAT	2	6	272616	272621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318818
5491	NC_013504	ACA	2	6	272739	272744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318818
5492	NC_013504	GAAA	2	8	272794	272801	75 %	0 %	25 %	0 %	268318818
5493	NC_013504	TGA	2	6	272828	272833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318818
5494	NC_013504	TTC	2	6	272851	272856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318818
5495	NC_013504	ACTA	2	8	272879	272886	50 %	25 %	0 %	25 %	268318818
5496	NC_013504	GTA	2	6	272913	272918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318818
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