MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii FI9785 chromosome

Total Repeats: 35523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013504	T	6	6	28	33	0 %	100 %	0 %	0 %	268318563
2	NC_013504	A	7	7	46	52	100 %	0 %	0 %	0 %	268318563
3	NC_013504	TAA	2	6	108	113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318563
4	NC_013504	AAG	2	6	197	202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318563
5	NC_013504	AAG	2	6	254	259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318563
6	NC_013504	AGTA	2	8	358	365	50 %	25 %	25 %	0 %	268318563
7	NC_013504	GCA	2	6	406	411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318563
8	NC_013504	GCC	2	6	415	420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318563
9	NC_013504	TGG	2	6	471	476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318563
10	NC_013504	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318563
11	NC_013504	A	6	6	600	605	100 %	0 %	0 %	0 %	268318563
12	NC_013504	TAA	2	6	627	632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318563
13	NC_013504	TAG	2	6	656	661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318563
14	NC_013504	A	6	6	682	687	100 %	0 %	0 %	0 %	268318563
15	NC_013504	AGG	2	6	698	703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318563
16	NC_013504	TTC	2	6	706	711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318563
17	NC_013504	A	6	6	879	884	100 %	0 %	0 %	0 %	268318563
18	NC_013504	GAC	2	6	910	915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318563
19	NC_013504	CAA	2	6	998	1003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318563
20	NC_013504	A	7	7	1067	1073	100 %	0 %	0 %	0 %	268318563
21	NC_013504	AAG	2	6	1100	1105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318563
22	NC_013504	ATT	2	6	1115	1120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318563
23	NC_013504	ACT	2	6	1132	1137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318563
24	NC_013504	AAG	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318563
25	NC_013504	TGG	2	6	1248	1253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318563
26	NC_013504	CA	3	6	1261	1266	50 %	0 %	0 %	50 %	268318563
27	NC_013504	ATGC	2	8	1273	1280	25 %	25 %	25 %	25 %	268318563
28	NC_013504	AGC	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318563
29	NC_013504	AAT	2	6	1588	1593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318564
30	NC_013504	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318564
31	NC_013504	CTA	2	6	1619	1624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318564
32	NC_013504	GAT	2	6	1726	1731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318564
33	NC_013504	GATC	2	8	1751	1758	25 %	25 %	25 %	25 %	268318564
34	NC_013504	A	7	7	1791	1797	100 %	0 %	0 %	0 %	268318564
35	NC_013504	AAAG	2	8	1828	1835	75 %	0 %	25 %	0 %	268318564
36	NC_013504	CAAA	2	8	1840	1847	75 %	0 %	0 %	25 %	268318564
37	NC_013504	CAT	2	6	1931	1936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318564
38	NC_013504	ATT	2	6	1966	1971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318564
39	NC_013504	AAT	2	6	2041	2046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318564
40	NC_013504	TCA	2	6	2047	2052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318564
41	NC_013504	ATT	2	6	2137	2142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318564
42	NC_013504	TAG	2	6	2156	2161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318564
43	NC_013504	ACA	2	6	2314	2319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318564
44	NC_013504	TTGAAT	2	12	2324	2335	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	268318564
45	NC_013504	TC	3	6	2353	2358	0 %	50 %	0 %	50 %	268318564
46	NC_013504	TCT	2	6	2370	2375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318564
47	NC_013504	GAA	3	9	2473	2481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318564
48	NC_013504	ATT	2	6	2575	2580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318564
49	NC_013504	GAA	2	6	3147	3152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318565
50	NC_013504	ATTT	2	8	3231	3238	25 %	75 %	0 %	0 %	268318565
51	NC_013504	T	6	6	3236	3241	0 %	100 %	0 %	0 %	268318565
52	NC_013504	AACA	2	8	3263	3270	75 %	0 %	0 %	25 %	268318565
53	NC_013504	AATT	2	8	3280	3287	50 %	50 %	0 %	0 %	268318565
54	NC_013504	A	7	7	3377	3383	100 %	0 %	0 %	0 %	268318565
55	NC_013504	AATG	2	8	3434	3441	50 %	25 %	25 %	0 %	268318565
56	NC_013504	AGA	2	6	3458	3463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318565
57	NC_013504	AATT	2	8	3527	3534	50 %	50 %	0 %	0 %	268318565
58	NC_013504	T	6	6	3548	3553	0 %	100 %	0 %	0 %	268318565
59	NC_013504	CAA	2	6	3576	3581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318565
60	NC_013504	A	7	7	3611	3617	100 %	0 %	0 %	0 %	268318565
61	NC_013504	T	7	7	3631	3637	0 %	100 %	0 %	0 %	268318565
62	NC_013504	AGA	2	6	3687	3692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318565
63	NC_013504	A	6	6	3705	3710	100 %	0 %	0 %	0 %	268318565
64	NC_013504	T	6	6	3772	3777	0 %	100 %	0 %	0 %	268318565
65	NC_013504	GAT	3	9	3807	3815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318565
66	NC_013504	TTA	2	6	3838	3843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318565
67	NC_013504	A	8	8	3852	3859	100 %	0 %	0 %	0 %	268318565
68	NC_013504	ACT	2	6	3885	3890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318565
69	NC_013504	T	6	6	3920	3925	0 %	100 %	0 %	0 %	268318565
70	NC_013504	GAT	2	6	4053	4058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318565
71	NC_013504	ATC	2	6	4075	4080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318565
72	NC_013504	AGT	2	6	4089	4094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318565
73	NC_013504	CAA	2	6	4135	4140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318565
74	NC_013504	CTG	2	6	4198	4203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318565
75	NC_013504	AGA	2	6	4235	4240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318566
76	NC_013504	GCA	2	6	4251	4256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318566
77	NC_013504	TAAA	2	8	4258	4265	75 %	25 %	0 %	0 %	268318566
78	NC_013504	GTAT	2	8	4354	4361	25 %	50 %	25 %	0 %	268318566
79	NC_013504	TAG	2	6	4373	4378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
80	NC_013504	ACC	2	6	4390	4395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318566
81	NC_013504	ATT	2	6	4407	4412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318566
82	NC_013504	ATA	2	6	4414	4419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318566
83	NC_013504	ACGA	2	8	4426	4433	50 %	0 %	25 %	25 %	268318566
84	NC_013504	GAT	2	6	4497	4502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
85	NC_013504	GTC	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318566
86	NC_013504	TGG	2	6	4580	4585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318566
87	NC_013504	CGG	2	6	4592	4597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	268318566
88	NC_013504	TGG	2	6	4616	4621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318566
89	NC_013504	GTA	2	6	4644	4649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
90	NC_013504	GA	3	6	4685	4690	50 %	0 %	50 %	0 %	268318566
91	NC_013504	GAAA	2	8	4693	4700	75 %	0 %	25 %	0 %	268318566
92	NC_013504	GTA	2	6	4728	4733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
93	NC_013504	GAA	2	6	4767	4772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318566
94	NC_013504	CGA	2	6	4832	4837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318566
95	NC_013504	AAAG	2	8	4914	4921	75 %	0 %	25 %	0 %	268318566
96	NC_013504	AAG	2	6	4990	4995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318566
97	NC_013504	TGA	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
98	NC_013504	TTGCA	2	10	5053	5062	20 %	40 %	20 %	20 %	268318566
99	NC_013504	GAT	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
100	NC_013504	TGT	2	6	5255	5260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318566
101	NC_013504	AGACTA	2	12	5296	5307	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	268318566
102	NC_013504	TCGA	2	8	5338	5345	25 %	25 %	25 %	25 %	268318566
103	NC_013504	TTG	2	6	5404	5409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318566
104	NC_013504	CTG	2	6	5440	5445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318566
105	NC_013504	GAA	2	6	5471	5476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318566
106	NC_013504	TTAT	2	8	5550	5557	25 %	75 %	0 %	0 %	268318566
107	NC_013504	TC	3	6	5697	5702	0 %	50 %	0 %	50 %	268318566
108	NC_013504	ATC	2	6	5769	5774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318566
109	NC_013504	AAGGT	2	10	5905	5914	40 %	20 %	40 %	0 %	268318566
110	NC_013504	TGA	2	6	5933	5938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318566
111	NC_013504	ATT	2	6	5950	5955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318566
112	NC_013504	GTT	2	6	5985	5990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318566
113	NC_013504	TCG	2	6	6059	6064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318566
114	NC_013504	AGG	2	6	6196	6201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	268318566
115	NC_013504	CAT	2	6	6275	6280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318567
116	NC_013504	CGT	2	6	6355	6360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	268318567
117	NC_013504	AAG	2	6	6409	6414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318567
118	NC_013504	TTG	2	6	6425	6430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318567
119	NC_013504	ATTG	2	8	6646	6653	25 %	50 %	25 %	0 %	268318567
120	NC_013504	GAT	2	6	6667	6672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
121	NC_013504	AGT	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
122	NC_013504	ACA	2	6	6754	6759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	268318567
123	NC_013504	TAC	2	6	6828	6833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318567
124	NC_013504	TAA	2	6	6842	6847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318567
125	NC_013504	TGG	2	6	6876	6881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318567
126	NC_013504	GTT	2	6	6940	6945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	268318567
127	NC_013504	A	7	7	6971	6977	100 %	0 %	0 %	0 %	268318567
128	NC_013504	ATCAG	2	10	7101	7110	40 %	20 %	20 %	20 %	268318567
129	NC_013504	CGC	2	6	7138	7143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	268318567
130	NC_013504	AAT	2	6	7168	7173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318567
131	NC_013504	GCAA	2	8	7194	7201	50 %	0 %	25 %	25 %	268318567
132	NC_013504	GAAT	2	8	7208	7215	50 %	25 %	25 %	0 %	268318567
133	NC_013504	TGG	2	6	7217	7222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	268318567
134	NC_013504	TAC	2	6	7273	7278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318567
135	NC_013504	CAC	2	6	7282	7287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	268318567
136	NC_013504	AAG	2	6	7289	7294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318567
137	NC_013504	TTA	2	6	7298	7303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318567
138	NC_013504	AAG	2	6	7327	7332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318567
139	NC_013504	TGA	2	6	7386	7391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
140	NC_013504	ATT	2	6	7402	7407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318567
141	NC_013504	AATT	2	8	7442	7449	50 %	50 %	0 %	0 %	268318567
142	NC_013504	GCAA	2	8	7557	7564	50 %	0 %	25 %	25 %	268318567
143	NC_013504	TGA	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
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145	NC_013504	TGA	2	6	7656	7661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
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150	NC_013504	GAT	3	9	7837	7845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	268318567
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153	NC_013504	TTC	2	6	7891	7896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318567
154	NC_013504	AAAG	2	8	7920	7927	75 %	0 %	25 %	0 %	268318567
155	NC_013504	GAA	2	6	7949	7954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318567
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157	NC_013504	TCT	2	6	8054	8059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318567
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161	NC_013504	GAA	2	6	8261	8266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318567
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167	NC_013504	GAA	3	9	8671	8679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	268318567
168	NC_013504	TAA	2	6	8695	8700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	268318567
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256	NC_013504	CT	3	6	12832	12837	0 %	50 %	0 %	50 %	268318572
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262	NC_013504	TTA	2	6	13155	13160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	268318573
263	NC_013504	GGTAAA	2	12	13172	13183	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	268318573
264	NC_013504	CTT	2	6	13225	13230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	268318573
265	NC_013504	CTA	2	6	13257	13262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	268318573
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268	NC_013504	GAC	2	6	13361	13366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	268318573
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