MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_013199	CTG	2	6	2884359	2884364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541029
45502	NC_013199	AGT	2	6	2884424	2884429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258541029
45503	NC_013199	GTCTT	2	10	2884453	2884462	0 %	60 %	20 %	20 %	258541029
45504	NC_013199	CAT	2	6	2884553	2884558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541029
45505	NC_013199	TTA	2	6	2884591	2884596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258541029
45506	NC_013199	GCT	2	6	2884628	2884633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541029
45507	NC_013199	GAT	2	6	2884676	2884681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258541029
45508	NC_013199	ATA	2	6	2884743	2884748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258541029
45509	NC_013199	TGG	2	6	2884769	2884774	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258541029
45510	NC_013199	CAG	2	6	2884802	2884807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541029
45511	NC_013199	CTG	2	6	2884827	2884832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541029
45512	NC_013199	AAT	2	6	2884872	2884877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258541029
45513	NC_013199	TCG	2	6	2884898	2884903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541029
45514	NC_013199	CAA	2	6	2884973	2884978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258541029
45515	NC_013199	TTG	2	6	2885032	2885037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258541029
45516	NC_013199	GCT	2	6	2885112	2885117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541029
45517	NC_013199	TCA	2	6	2885177	2885182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541029
45518	NC_013199	ATC	2	6	2885376	2885381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541030
45519	NC_013199	GCTCAC	2	12	2885525	2885536	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258541030
45520	NC_013199	A	7	7	2885663	2885669	100 %	0 %	0 %	0 %	258541030
45521	NC_013199	AATC	2	8	2885680	2885687	50 %	25 %	0 %	25 %	258541030
45522	NC_013199	CTTT	2	8	2885691	2885698	0 %	75 %	0 %	25 %	258541030
45523	NC_013199	TGC	2	6	2885719	2885724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541030
45524	NC_013199	TTGT	2	8	2885725	2885732	0 %	75 %	25 %	0 %	258541030
45525	NC_013199	AGC	2	6	2885819	2885824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541031
45526	NC_013199	AGACCC	2	12	2886021	2886032	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	258541031
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45530	NC_013199	ATTG	2	8	2886203	2886210	25 %	50 %	25 %	0 %	258541031
45531	NC_013199	ATTC	2	8	2886225	2886232	25 %	50 %	0 %	25 %	258541031
45532	NC_013199	GCC	2	6	2886326	2886331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258541031
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45534	NC_013199	ATA	2	6	2886370	2886375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258541031
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45538	NC_013199	CG	3	6	2886785	2886790	0 %	0 %	50 %	50 %	258541032
45539	NC_013199	GCG	2	6	2886796	2886801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258541032
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45541	NC_013199	AT	3	6	2886826	2886831	50 %	50 %	0 %	0 %	258541032
45542	NC_013199	GATC	2	8	2887025	2887032	25 %	25 %	25 %	25 %	258541033
45543	NC_013199	GTC	2	6	2887059	2887064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258541033
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45551	NC_013199	A	6	6	2887275	2887280	100 %	0 %	0 %	0 %	258541033
45552	NC_013199	TTA	2	6	2887658	2887663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258541034
45553	NC_013199	A	6	6	2887702	2887707	100 %	0 %	0 %	0 %	258541034
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45556	NC_013199	CCA	2	6	2887825	2887830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258541035
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45558	NC_013199	ACA	2	6	2888020	2888025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258541035
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45560	NC_013199	A	7	7	2888068	2888074	100 %	0 %	0 %	0 %	258541035
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45585	NC_013199	GAT	2	6	2889232	2889237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258541036
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45588	NC_013199	CCG	2	6	2889311	2889316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258541036
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45599	NC_013199	GAT	2	6	2890106	2890111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258541037
45600	NC_013199	TTCAT	2	10	2890112	2890121	20 %	60 %	0 %	20 %	258541037
45601	NC_013199	TATT	2	8	2890319	2890326	25 %	75 %	0 %	0 %	258541037
45602	NC_013199	TCAGC	2	10	2890360	2890369	20 %	20 %	20 %	40 %	258541037
45603	NC_013199	ATC	2	6	2890415	2890420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541037
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45606	NC_013199	TCAA	2	8	2890769	2890776	50 %	25 %	0 %	25 %	258541038
45607	NC_013199	GCAG	2	8	2890881	2890888	25 %	0 %	50 %	25 %	258541038
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45609	NC_013199	CGTTT	2	10	2891070	2891079	0 %	60 %	20 %	20 %	258541038
45610	NC_013199	CATC	2	8	2891115	2891122	25 %	25 %	0 %	50 %	258541038
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45613	NC_013199	A	6	6	2891216	2891221	100 %	0 %	0 %	0 %	258541038
45614	NC_013199	CAT	2	6	2891233	2891238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541038
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45616	NC_013199	GAC	2	6	2891361	2891366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258541038
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