MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45002	NC_013199	CAT	2	6	2853564	2853569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540996
45003	NC_013199	AGC	2	6	2853707	2853712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540996
45004	NC_013199	CAA	2	6	2853747	2853752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540996
45005	NC_013199	GCTG	2	8	2853788	2853795	0 %	25 %	50 %	25 %	258540996
45006	NC_013199	GCA	2	6	2853909	2853914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540996
45007	NC_013199	CAC	2	6	2853930	2853935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540996
45008	NC_013199	CGT	2	6	2854079	2854084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540996
45009	NC_013199	CG	3	6	2854133	2854138	0 %	0 %	50 %	50 %	258540996
45010	NC_013199	TCA	2	6	2854225	2854230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540996
45011	NC_013199	GGC	2	6	2854315	2854320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540997
45012	NC_013199	CATC	2	8	2854364	2854371	25 %	25 %	0 %	50 %	258540997
45013	NC_013199	CAA	2	6	2854381	2854386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540997
45014	NC_013199	CAT	2	6	2854446	2854451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540997
45015	NC_013199	GCCGAC	2	12	2854459	2854470	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258540997
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45017	NC_013199	GCA	2	6	2854510	2854515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540997
45018	NC_013199	CGAC	2	8	2854640	2854647	25 %	0 %	25 %	50 %	258540997
45019	NC_013199	CGC	2	6	2854737	2854742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540997
45020	NC_013199	GCA	2	6	2854770	2854775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540997
45021	NC_013199	ATT	2	6	2854799	2854804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540997
45022	NC_013199	CTGG	2	8	2854897	2854904	0 %	25 %	50 %	25 %	258540997
45023	NC_013199	TGG	2	6	2854931	2854936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540997
45024	NC_013199	GCA	2	6	2855037	2855042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540997
45025	NC_013199	GAA	2	6	2855059	2855064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540997
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45031	NC_013199	ACT	2	6	2855414	2855419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540997
45032	NC_013199	CAA	2	6	2855423	2855428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540997
45033	NC_013199	CCGCA	2	10	2855537	2855546	20 %	0 %	20 %	60 %	258540997
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45050	NC_013199	GCG	2	6	2856399	2856404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540998
45051	NC_013199	CTG	2	6	2856428	2856433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540998
45052	NC_013199	CTCA	2	8	2856455	2856462	25 %	25 %	0 %	50 %	258540998
45053	NC_013199	ATG	2	6	2856531	2856536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540998
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45055	NC_013199	A	7	7	2856668	2856674	100 %	0 %	0 %	0 %	258540998
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45101	NC_013199	GGCT	2	8	2859465	2859472	0 %	25 %	50 %	25 %	258541001
45102	NC_013199	CCAG	2	8	2859524	2859531	25 %	0 %	25 %	50 %	258541001
45103	NC_013199	GTT	2	6	2859546	2859551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258541001
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45105	NC_013199	GCC	2	6	2859860	2859865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258541002
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45115	NC_013199	ACA	2	6	2860443	2860448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258541003
45116	NC_013199	TTGA	2	8	2860575	2860582	25 %	50 %	25 %	0 %	258541004
45117	NC_013199	TAG	2	6	2860646	2860651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258541004
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45221	NC_013199	AGGCGG	2	12	2866848	2866859	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	258541012
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45231	NC_013199	GC	3	6	2867515	2867520	0 %	0 %	50 %	50 %	258541013
45232	NC_013199	CGG	2	6	2867561	2867566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258541013
45233	NC_013199	ACGT	2	8	2867733	2867740	25 %	25 %	25 %	25 %	258541013
45234	NC_013199	T	7	7	2867740	2867746	0 %	100 %	0 %	0 %	258541013
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45332	NC_013199	TTAT	2	8	2873484	2873491	25 %	75 %	0 %	0 %	258541019
45333	NC_013199	TCA	2	6	2873502	2873507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258541019
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45348	NC_013199	TTA	2	6	2874370	2874375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258541020
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