MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43502	NC_013199	CTT	2	6	2758342	2758347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540912
43503	NC_013199	TCAA	2	8	2758542	2758549	50 %	25 %	0 %	25 %	258540912
43504	NC_013199	CCAG	2	8	2758563	2758570	25 %	0 %	25 %	50 %	258540912
43505	NC_013199	GCAAC	2	10	2758630	2758639	40 %	0 %	20 %	40 %	258540912
43506	NC_013199	CAG	2	6	2758813	2758818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540912
43507	NC_013199	TCG	2	6	2758824	2758829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540912
43508	NC_013199	TGC	2	6	2758832	2758837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540912
43509	NC_013199	GTT	2	6	2758857	2758862	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540912
43510	NC_013199	GCA	2	6	2758887	2758892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540912
43511	NC_013199	TGC	2	6	2758893	2758898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540912
43512	NC_013199	CAT	2	6	2758957	2758962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540912
43513	NC_013199	AT	3	6	2759019	2759024	50 %	50 %	0 %	0 %	258540912
43514	NC_013199	TTC	2	6	2759079	2759084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540912
43515	NC_013199	CGCAG	2	10	2759095	2759104	20 %	0 %	40 %	40 %	258540912
43516	NC_013199	TGGC	2	8	2759212	2759219	0 %	25 %	50 %	25 %	258540912
43517	NC_013199	TCGG	2	8	2759259	2759266	0 %	25 %	50 %	25 %	258540912
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43519	NC_013199	T	6	6	2759327	2759332	0 %	100 %	0 %	0 %	258540912
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43522	NC_013199	CAGA	2	8	2759417	2759424	50 %	0 %	25 %	25 %	258540913
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43533	NC_013199	AT	3	6	2759953	2759958	50 %	50 %	0 %	0 %	258540913
43534	NC_013199	ATG	2	6	2759962	2759967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540913
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43547	NC_013199	CG	3	6	2760858	2760863	0 %	0 %	50 %	50 %	258540915
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43966	NC_013199	GCT	2	6	2788095	2788100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540941
43967	NC_013199	GCC	2	6	2788158	2788163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540941
43968	NC_013199	AGC	2	6	2788199	2788204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540941
43969	NC_013199	CGC	2	6	2788394	2788399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540941
43970	NC_013199	GTT	2	6	2788404	2788409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540941
43971	NC_013199	GCA	2	6	2788482	2788487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540941
43972	NC_013199	CGT	2	6	2788523	2788528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540941
43973	NC_013199	TGC	2	6	2788539	2788544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540941
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43975	NC_013199	TGGCT	2	10	2788631	2788640	0 %	40 %	40 %	20 %	258540941
43976	NC_013199	GCA	2	6	2788641	2788646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540941
43977	NC_013199	CT	3	6	2788671	2788676	0 %	50 %	0 %	50 %	258540941
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43980	NC_013199	CGTTA	2	10	2788814	2788823	20 %	40 %	20 %	20 %	258540941
43981	NC_013199	CTGC	2	8	2788867	2788874	0 %	25 %	25 %	50 %	258540941
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43983	NC_013199	GC	3	6	2788957	2788962	0 %	0 %	50 %	50 %	258540941
43984	NC_013199	CGGTGC	2	12	2788988	2788999	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	258540941
43985	NC_013199	ATTG	2	8	2789023	2789030	25 %	50 %	25 %	0 %	258540941
43986	NC_013199	TTCG	2	8	2789085	2789092	0 %	50 %	25 %	25 %	258540941
43987	NC_013199	CTG	2	6	2789135	2789140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540941
43988	NC_013199	TTCA	2	8	2789570	2789577	25 %	50 %	0 %	25 %	258540941
43989	NC_013199	CGTC	2	8	2789580	2789587	0 %	25 %	25 %	50 %	258540941
43990	NC_013199	CAG	2	6	2789636	2789641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540941
43991	NC_013199	CGC	2	6	2789665	2789670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540941
43992	NC_013199	GCC	2	6	2789840	2789845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540941
43993	NC_013199	GGC	2	6	2789934	2789939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540941
43994	NC_013199	GTG	2	6	2789940	2789945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540941
43995	NC_013199	CG	3	6	2790143	2790148	0 %	0 %	50 %	50 %	258540941
43996	NC_013199	TCGG	2	8	2790324	2790331	0 %	25 %	50 %	25 %	258540941
43997	NC_013199	ATC	2	6	2790374	2790379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540941
43998	NC_013199	T	6	6	2790433	2790438	0 %	100 %	0 %	0 %	258540941
43999	NC_013199	TTA	2	6	2790516	2790521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540941
44000	NC_013199	CGG	2	6	2790568	2790573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540941

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