MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42003	NC_013199	ACA	2	6	2660315	2660320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540816
42004	NC_013199	ACCA	2	8	2660346	2660353	50 %	0 %	0 %	50 %	258540816
42005	NC_013199	A	6	6	2660437	2660442	100 %	0 %	0 %	0 %	258540816
42006	NC_013199	TAA	2	6	2660993	2660998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540817
42007	NC_013199	T	7	7	2661005	2661011	0 %	100 %	0 %	0 %	258540817
42008	NC_013199	ATT	2	6	2661038	2661043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540817
42009	NC_013199	AAC	2	6	2661056	2661061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540817
42010	NC_013199	AAACAT	2	12	2661202	2661213	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	258540817
42011	NC_013199	TAA	2	6	2661309	2661314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540817
42012	NC_013199	ATA	2	6	2661475	2661480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540817
42013	NC_013199	TTG	2	6	2661527	2661532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540817
42014	NC_013199	TAA	2	6	2661570	2661575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540817
42015	NC_013199	CAA	2	6	2661606	2661611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540817
42016	NC_013199	AAACCC	2	12	2661620	2661631	50 %	0 %	0 %	50 %	258540817
42017	NC_013199	CTA	2	6	2661636	2661641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540817
42018	NC_013199	GGATC	2	10	2661648	2661657	20 %	20 %	40 %	20 %	258540817
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42020	NC_013199	TCA	2	6	2661771	2661776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540818
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42025	NC_013199	TTGA	2	8	2661988	2661995	25 %	50 %	25 %	0 %	258540818
42026	NC_013199	GTG	2	6	2662008	2662013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540818
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42043	NC_013199	CTGGA	2	10	2663174	2663183	20 %	20 %	40 %	20 %	258540819
42044	NC_013199	CGAA	2	8	2663185	2663192	50 %	0 %	25 %	25 %	258540819
42045	NC_013199	CAT	2	6	2663195	2663200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540819
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42054	NC_013199	ATAA	2	8	2663596	2663603	75 %	25 %	0 %	0 %	258540820
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42101	NC_013199	CG	3	6	2666526	2666531	0 %	0 %	50 %	50 %	258540822
42102	NC_013199	AAT	2	6	2666643	2666648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540822
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42106	NC_013199	CATG	2	8	2666759	2666766	25 %	25 %	25 %	25 %	258540822
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42112	NC_013199	GCCA	2	8	2667100	2667107	25 %	0 %	25 %	50 %	258540823
42113	NC_013199	T	6	6	2667131	2667136	0 %	100 %	0 %	0 %	258540823
42114	NC_013199	CAA	2	6	2667169	2667174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540823
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42116	NC_013199	TCA	2	6	2667449	2667454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540823
42117	NC_013199	AAT	2	6	2667706	2667711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540824
42118	NC_013199	TCCGGT	2	12	2667769	2667780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540824
42119	NC_013199	TGT	2	6	2667939	2667944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540824
42120	NC_013199	CCG	2	6	2668051	2668056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540824
42121	NC_013199	ATG	2	6	2668091	2668096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540824
42122	NC_013199	GAT	2	6	2668113	2668118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540824
42123	NC_013199	TGCC	2	8	2668188	2668195	0 %	25 %	25 %	50 %	258540824
42124	NC_013199	CAT	2	6	2668286	2668291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540824
42125	NC_013199	GGC	2	6	2668292	2668297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540824
42126	NC_013199	ATTGAC	2	12	2668342	2668353	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258540824
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42128	NC_013199	AACG	2	8	2668522	2668529	50 %	0 %	25 %	25 %	258540824
42129	NC_013199	GCT	2	6	2668810	2668815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540824
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42132	NC_013199	CATG	2	8	2668950	2668957	25 %	25 %	25 %	25 %	258540824
42133	NC_013199	GTC	3	9	2668984	2668992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540824
42134	NC_013199	CAT	2	6	2669007	2669012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540824
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42138	NC_013199	GCCAAG	2	12	2669188	2669199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540824
42139	NC_013199	TCA	2	6	2669235	2669240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540824
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42141	NC_013199	CTG	2	6	2669510	2669515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540824
42142	NC_013199	ACAA	2	8	2669522	2669529	75 %	0 %	0 %	25 %	258540824
42143	NC_013199	CAG	2	6	2669535	2669540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540824
42144	NC_013199	GGC	2	6	2669584	2669589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540824
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42146	NC_013199	GGT	2	6	2669848	2669853	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540824
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42221	NC_013199	TCAT	2	8	2675373	2675380	25 %	50 %	0 %	25 %	258540832
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42340	NC_013199	CAA	2	6	2683127	2683132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540841
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42342	NC_013199	AAACC	2	10	2683220	2683229	60 %	0 %	0 %	40 %	258540841
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42345	NC_013199	TG	3	6	2683642	2683647	0 %	50 %	50 %	0 %	258540842
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42463	NC_013199	ATC	2	6	2691510	2691515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540847
42464	NC_013199	GAA	2	6	2691545	2691550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540847
42465	NC_013199	TTG	2	6	2691597	2691602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540847
42466	NC_013199	TGG	2	6	2691649	2691654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540847
42467	NC_013199	CAT	2	6	2691670	2691675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540847
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42474	NC_013199	AGC	2	6	2692000	2692005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540847
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42476	NC_013199	ATTGA	2	10	2692049	2692058	40 %	40 %	20 %	0 %	258540848
42477	NC_013199	TAT	2	6	2692063	2692068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540848
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42487	NC_013199	A	6	6	2692627	2692632	100 %	0 %	0 %	0 %	258540848
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42490	NC_013199	TGG	2	6	2692797	2692802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540849
42491	NC_013199	TGC	2	6	2692814	2692819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540849
42492	NC_013199	TAT	2	6	2692992	2692997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540849
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42494	NC_013199	GATG	2	8	2693079	2693086	25 %	25 %	50 %	0 %	258540849
42495	NC_013199	TGG	2	6	2693087	2693092	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540849
42496	NC_013199	TTTA	2	8	2693251	2693258	25 %	75 %	0 %	0 %	258540849
42497	NC_013199	GAT	2	6	2693271	2693276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540849
42498	NC_013199	ATC	2	6	2693287	2693292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540849
42499	NC_013199	TGC	2	6	2693297	2693302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540849
42500	NC_013199	TCTT	2	8	2693303	2693310	0 %	75 %	0 %	25 %	258540849

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