MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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40002	NC_013199	GTA	2	6	2529159	2529164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540688
40003	NC_013199	GTCA	2	8	2529312	2529319	25 %	25 %	25 %	25 %	258540688
40004	NC_013199	AC	3	6	2529359	2529364	50 %	0 %	0 %	50 %	258540688
40005	NC_013199	TTC	2	6	2529400	2529405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540688
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40014	NC_013199	T	6	6	2530126	2530131	0 %	100 %	0 %	0 %	258540688
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40116	NC_013199	CAT	2	6	2537259	2537264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540692
40117	NC_013199	GACT	2	8	2537269	2537276	25 %	25 %	25 %	25 %	258540692
40118	NC_013199	CTT	2	6	2537298	2537303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540692
40119	NC_013199	AGC	2	6	2537377	2537382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540692
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40123	NC_013199	CAT	2	6	2537593	2537598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540692
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40146	NC_013199	CAT	2	6	2538540	2538545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540692
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40151	NC_013199	TGC	2	6	2538953	2538958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540692
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40230	NC_013199	ATC	2	6	2543530	2543535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540695
40231	NC_013199	CCG	2	6	2543570	2543575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540695
40232	NC_013199	CAA	2	6	2543589	2543594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540695
40233	NC_013199	TAAT	2	8	2543633	2543640	50 %	50 %	0 %	0 %	258540695
40234	NC_013199	AAT	2	6	2543734	2543739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540695
40235	NC_013199	CTTA	2	8	2547826	2547833	25 %	50 %	0 %	25 %	258540699
40236	NC_013199	ATGCG	2	10	2547945	2547954	20 %	20 %	40 %	20 %	258540699
40237	NC_013199	TAT	2	6	2547961	2547966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540699
40238	NC_013199	GT	3	6	2548313	2548318	0 %	50 %	50 %	0 %	258540700
40239	NC_013199	AGG	2	6	2548357	2548362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258540700
40240	NC_013199	GCTC	2	8	2548435	2548442	0 %	25 %	25 %	50 %	258540700
40241	NC_013199	GT	3	6	2548501	2548506	0 %	50 %	50 %	0 %	258540700
40242	NC_013199	GGC	2	6	2550440	2550445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540705
40243	NC_013199	TCA	2	6	2550476	2550481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540705
40244	NC_013199	TGCC	2	8	2550501	2550508	0 %	25 %	25 %	50 %	258540705
40245	NC_013199	T	6	6	2550510	2550515	0 %	100 %	0 %	0 %	258540705
40246	NC_013199	GCT	2	6	2550518	2550523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540705
40247	NC_013199	ACGCTG	2	12	2550535	2550546	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258540705
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40250	NC_013199	CAA	2	6	2550711	2550716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540705
40251	NC_013199	AAG	2	6	2550725	2550730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540705
40252	NC_013199	ATA	2	6	2550737	2550742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540705
40253	NC_013199	TCA	2	6	2550782	2550787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540705
40254	NC_013199	AGTT	2	8	2550913	2550920	25 %	50 %	25 %	0 %	258540705
40255	NC_013199	GGC	2	6	2550943	2550948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540705
40256	NC_013199	GCG	2	6	2551001	2551006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540705
40257	NC_013199	CCA	2	6	2551097	2551102	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540705
40258	NC_013199	CAATG	2	10	2551129	2551138	40 %	20 %	20 %	20 %	258540705
40259	NC_013199	TGA	2	6	2551176	2551181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540705
40260	NC_013199	CAC	2	6	2551197	2551202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540705
40261	NC_013199	CGC	2	6	2551470	2551475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540705
40262	NC_013199	CTT	2	6	2551504	2551509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540705
40263	NC_013199	CTTTAC	2	12	2551599	2551610	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	258540705
40264	NC_013199	CAT	2	6	2551621	2551626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540705
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40266	NC_013199	GTC	2	6	2551675	2551680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540705
40267	NC_013199	TTC	2	6	2551690	2551695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540705
40268	NC_013199	TGC	2	6	2551705	2551710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540705
40269	NC_013199	GTGC	2	8	2551714	2551721	0 %	25 %	50 %	25 %	258540705
40270	NC_013199	CATC	2	8	2551767	2551774	25 %	25 %	0 %	50 %	258540705
40271	NC_013199	CGC	2	6	2551781	2551786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540705
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40278	NC_013199	TGTAAC	2	12	2552192	2552203	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258540706
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40280	NC_013199	CG	3	6	2552223	2552228	0 %	0 %	50 %	50 %	258540706
40281	NC_013199	TGC	2	6	2552302	2552307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540706
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40301	NC_013199	AG	3	6	2553447	2553452	50 %	0 %	50 %	0 %	258540707
40302	NC_013199	ATA	2	6	2553489	2553494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540707
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40307	NC_013199	CGT	2	6	2553841	2553846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540707
40308	NC_013199	ATC	2	6	2554055	2554060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540708
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40311	NC_013199	CGT	2	6	2554332	2554337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540709
40312	NC_013199	TCA	2	6	2554342	2554347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540709
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40319	NC_013199	TCA	3	9	2554660	2554668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540709
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40322	NC_013199	AAT	2	6	2554857	2554862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540709
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40328	NC_013199	ATG	2	6	2554984	2554989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540709
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40331	NC_013199	CTT	2	6	2555160	2555165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540709
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40333	NC_013199	CAAC	2	8	2555180	2555187	50 %	0 %	0 %	50 %	258540709
40334	NC_013199	TTCA	2	8	2555193	2555200	25 %	50 %	0 %	25 %	258540709
40335	NC_013199	CCAA	2	8	2555335	2555342	50 %	0 %	0 %	50 %	258540709
40336	NC_013199	GCA	2	6	2555369	2555374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540709
40337	NC_013199	GCA	2	6	2555407	2555412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540709
40338	NC_013199	CCAT	2	8	2555443	2555450	25 %	25 %	0 %	50 %	258540709
40339	NC_013199	CCG	2	6	2555494	2555499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540709
40340	NC_013199	GAC	2	6	2555519	2555524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540709
40341	NC_013199	TCA	2	6	2555539	2555544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540709
40342	NC_013199	GAT	2	6	2555550	2555555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540709
40343	NC_013199	GCT	2	6	2555563	2555568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540709
40344	NC_013199	T	6	6	2555568	2555573	0 %	100 %	0 %	0 %	258540709
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