MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34502	NC_013199	CGC	2	6	2184268	2184273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540343
34503	NC_013199	AGC	2	6	2184280	2184285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540343
34504	NC_013199	CCG	2	6	2184292	2184297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540343
34505	NC_013199	TCA	2	6	2184305	2184310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540343
34506	NC_013199	GAAA	2	8	2184396	2184403	75 %	0 %	25 %	0 %	258540343
34507	NC_013199	GTT	2	6	2184420	2184425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540343
34508	NC_013199	CAT	2	6	2184471	2184476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540343
34509	NC_013199	CTT	2	6	2184579	2184584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540343
34510	NC_013199	CAT	2	6	2184637	2184642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540343
34511	NC_013199	TTA	2	6	2184644	2184649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540343
34512	NC_013199	ACC	2	6	2184655	2184660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540343
34513	NC_013199	CAT	2	6	2184739	2184744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540343
34514	NC_013199	TTC	2	6	2184955	2184960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540344
34515	NC_013199	CCAT	2	8	2184994	2185001	25 %	25 %	0 %	50 %	258540344
34516	NC_013199	CAA	2	6	2185016	2185021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540344
34517	NC_013199	AGC	2	6	2185050	2185055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540344
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34519	NC_013199	CG	3	6	2185134	2185139	0 %	0 %	50 %	50 %	258540344
34520	NC_013199	TTC	2	6	2185294	2185299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540344
34521	NC_013199	TGCAGC	2	12	2185311	2185322	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258540344
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34524	NC_013199	T	7	7	2185621	2185627	0 %	100 %	0 %	0 %	258540344
34525	NC_013199	ATG	2	6	2185669	2185674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540344
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34527	NC_013199	T	7	7	2185811	2185817	0 %	100 %	0 %	0 %	258540344
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34532	NC_013199	CAT	2	6	2186018	2186023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540345
34533	NC_013199	GCCA	2	8	2186036	2186043	25 %	0 %	25 %	50 %	258540345
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34545	NC_013199	ACATTG	2	12	2186689	2186700	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	258540345
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34549	NC_013199	ATC	2	6	2186766	2186771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540346
34550	NC_013199	AGT	2	6	2186793	2186798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540346
34551	NC_013199	CAG	2	6	2186811	2186816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540346
34552	NC_013199	TGT	2	6	2186841	2186846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540346
34553	NC_013199	CAT	2	6	2186909	2186914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540346
34554	NC_013199	CTA	2	6	2186930	2186935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540346
34555	NC_013199	ACA	2	6	2186953	2186958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540346
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34558	NC_013199	ATC	2	6	2187108	2187113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540346
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34598	NC_013199	CA	3	6	2189837	2189842	50 %	0 %	0 %	50 %	258540350
34599	NC_013199	AT	3	6	2189896	2189901	50 %	50 %	0 %	0 %	258540350
34600	NC_013199	AAT	2	6	2189905	2189910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540350
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34604	NC_013199	TTTGA	2	10	2190285	2190294	20 %	60 %	20 %	0 %	258540350
34605	NC_013199	CAT	2	6	2190387	2190392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540350
34606	NC_013199	ATG	2	6	2190399	2190404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540350
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34615	NC_013199	T	6	6	2190893	2190898	0 %	100 %	0 %	0 %	258540350
34616	NC_013199	ATC	2	6	2191009	2191014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540350
34617	NC_013199	GAAC	2	8	2191020	2191027	50 %	0 %	25 %	25 %	258540350
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34722	NC_013199	CAA	2	6	2197214	2197219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540355
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34728	NC_013199	TTC	2	6	2197411	2197416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540355
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34962	NC_013199	AAC	2	6	2211953	2211958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540368
34963	NC_013199	GAA	2	6	2212093	2212098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540368
34964	NC_013199	ACC	2	6	2212132	2212137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540368
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34967	NC_013199	CAAGC	2	10	2212213	2212222	40 %	0 %	20 %	40 %	258540368
34968	NC_013199	CAT	2	6	2212237	2212242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540368
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34973	NC_013199	CAA	2	6	2212411	2212416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540368
34974	NC_013199	AAC	2	6	2212454	2212459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540368
34975	NC_013199	CAA	2	6	2212465	2212470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540368
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34977	NC_013199	CAA	2	6	2212729	2212734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540369
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34984	NC_013199	TTTG	2	8	2213139	2213146	0 %	75 %	25 %	0 %	258540369
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34989	NC_013199	GCTT	2	8	2213466	2213473	0 %	50 %	25 %	25 %	258540369
34990	NC_013199	AC	3	6	2213482	2213487	50 %	0 %	0 %	50 %	258540369
34991	NC_013199	AGC	2	6	2213532	2213537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540369
34992	NC_013199	GCA	2	6	2213553	2213558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540369
34993	NC_013199	CT	3	6	2213814	2213819	0 %	50 %	0 %	50 %	258540370
34994	NC_013199	CTC	2	6	2213834	2213839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258540370
34995	NC_013199	GTT	2	6	2213852	2213857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540370
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34997	NC_013199	GAT	2	6	2214200	2214205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540370
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34999	NC_013199	ATTG	2	8	2214536	2214543	25 %	50 %	25 %	0 %	258540370
35000	NC_013199	GAA	2	6	2214554	2214559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540370

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