MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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34002	NC_013199	TGT	2	6	2152207	2152212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540307
34003	NC_013199	CGAG	2	8	2152243	2152250	25 %	0 %	50 %	25 %	258540307
34004	NC_013199	CG	3	6	2152279	2152284	0 %	0 %	50 %	50 %	258540307
34005	NC_013199	CATT	2	8	2152287	2152294	25 %	50 %	0 %	25 %	258540307
34006	NC_013199	TGCT	2	8	2152345	2152352	0 %	50 %	25 %	25 %	258540307
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34009	NC_013199	CTG	2	6	2152464	2152469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540307
34010	NC_013199	TGA	2	6	2152529	2152534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540307
34011	NC_013199	TCA	2	6	2152548	2152553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540307
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34013	NC_013199	GCT	2	6	2152637	2152642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540307
34014	NC_013199	GAT	2	6	2152696	2152701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540307
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34016	NC_013199	TTG	2	6	2152744	2152749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540307
34017	NC_013199	CAT	2	6	2152755	2152760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540307
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34021	NC_013199	GTC	2	6	2153070	2153075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540308
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34023	NC_013199	CTT	2	6	2153197	2153202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540308
34024	NC_013199	CTT	2	6	2153304	2153309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540308
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34034	NC_013199	TGC	2	6	2154836	2154841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540310
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34045	NC_013199	TGC	2	6	2155807	2155812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540311
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34098	NC_013199	CAAG	2	8	2159894	2159901	50 %	0 %	25 %	25 %	258540315
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34100	NC_013199	CTTG	2	8	2159981	2159988	0 %	50 %	25 %	25 %	258540315
34101	NC_013199	TCG	2	6	2159996	2160001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540315
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34103	NC_013199	AATTT	2	10	2160304	2160313	40 %	60 %	0 %	0 %	258540315
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34105	NC_013199	T	8	8	2160473	2160480	0 %	100 %	0 %	0 %	258540316
34106	NC_013199	CTG	2	6	2160637	2160642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540316
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34112	NC_013199	TGC	2	6	2161306	2161311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540316
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34116	NC_013199	GCCA	2	8	2161461	2161468	25 %	0 %	25 %	50 %	258540317
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34232	NC_013199	ATC	2	6	2168181	2168186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540323
34233	NC_013199	CATTC	2	10	2168267	2168276	20 %	40 %	0 %	40 %	258540323
34234	NC_013199	CTT	2	6	2168307	2168312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540324
34235	NC_013199	ATCG	2	8	2168401	2168408	25 %	25 %	25 %	25 %	258540324
34236	NC_013199	TAA	2	6	2168470	2168475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540324
34237	NC_013199	GC	3	6	2168478	2168483	0 %	0 %	50 %	50 %	258540324
34238	NC_013199	GTAA	2	8	2168572	2168579	50 %	25 %	25 %	0 %	258540324
34239	NC_013199	CGG	2	6	2168586	2168591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540324
34240	NC_013199	GTG	2	6	2168641	2168646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258540324
34241	NC_013199	ATC	2	6	2168723	2168728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540324
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34243	NC_013199	ACAA	2	8	2168923	2168930	75 %	0 %	0 %	25 %	258540324
34244	NC_013199	CGTT	2	8	2169017	2169024	0 %	50 %	25 %	25 %	258540324
34245	NC_013199	TGA	2	6	2169134	2169139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540324
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34247	NC_013199	TG	3	6	2169201	2169206	0 %	50 %	50 %	0 %	258540324
34248	NC_013199	GCCTGC	2	12	2169233	2169244	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	258540324
34249	NC_013199	CGG	2	6	2169292	2169297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540324
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34252	NC_013199	CAG	2	6	2169364	2169369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540324
34253	NC_013199	CAT	2	6	2169414	2169419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540324
34254	NC_013199	GAAA	2	8	2169527	2169534	75 %	0 %	25 %	0 %	258540324
34255	NC_013199	ACA	2	6	2169563	2169568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540324
34256	NC_013199	CCAA	2	8	2169629	2169636	50 %	0 %	0 %	50 %	258540324
34257	NC_013199	TTG	2	6	2169697	2169702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540325
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34262	NC_013199	TGC	2	6	2169870	2169875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540325
34263	NC_013199	CAT	2	6	2169904	2169909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540325
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34269	NC_013199	CCGAT	2	10	2170189	2170198	20 %	20 %	20 %	40 %	258540325
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34330	NC_013199	CCAG	2	8	2174210	2174217	25 %	0 %	25 %	50 %	258540331
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34333	NC_013199	ATC	4	12	2174373	2174384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540331
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34336	NC_013199	CCGG	2	8	2174611	2174618	0 %	0 %	50 %	50 %	258540331
34337	NC_013199	GTCG	2	8	2174701	2174708	0 %	25 %	50 %	25 %	258540331
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34340	NC_013199	ATG	2	6	2175239	2175244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540332
34341	NC_013199	TGA	2	6	2175249	2175254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540332
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34345	NC_013199	GTCA	2	8	2175378	2175385	25 %	25 %	25 %	25 %	258540333
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34460	NC_013199	A	6	6	2181736	2181741	100 %	0 %	0 %	0 %	258540341
34461	NC_013199	TTGG	2	8	2181749	2181756	0 %	50 %	50 %	0 %	258540341
34462	NC_013199	TCT	2	6	2181796	2181801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540341
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34465	NC_013199	T	6	6	2181991	2181996	0 %	100 %	0 %	0 %	258540341
34466	NC_013199	TGT	2	6	2182158	2182163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540341
34467	NC_013199	TA	3	6	2182498	2182503	50 %	50 %	0 %	0 %	258540342
34468	NC_013199	ATC	2	6	2182518	2182523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540342
34469	NC_013199	ACT	2	6	2182525	2182530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540342
34470	NC_013199	CGG	2	6	2182538	2182543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540342
34471	NC_013199	ACC	2	6	2182548	2182553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540342
34472	NC_013199	T	6	6	2182572	2182577	0 %	100 %	0 %	0 %	258540342
34473	NC_013199	TTC	2	6	2182650	2182655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540342
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34480	NC_013199	CGC	2	6	2183002	2183007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540343
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34484	NC_013199	AATC	2	8	2183265	2183272	50 %	25 %	0 %	25 %	258540343
34485	NC_013199	ATT	2	6	2183341	2183346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540343
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34488	NC_013199	CGC	2	6	2183413	2183418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540343
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34490	NC_013199	CAT	2	6	2183674	2183679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540343
34491	NC_013199	GCT	2	6	2183737	2183742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540343
34492	NC_013199	TCA	2	6	2183750	2183755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540343
34493	NC_013199	TTC	2	6	2183771	2183776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540343
34494	NC_013199	TG	3	6	2183812	2183817	0 %	50 %	50 %	0 %	258540343
34495	NC_013199	AAT	2	6	2184007	2184012	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540343
34496	NC_013199	TCA	2	6	2184066	2184071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540343
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34498	NC_013199	ACAT	2	8	2184104	2184111	50 %	25 %	0 %	25 %	258540343
34499	NC_013199	AATC	2	8	2184133	2184140	50 %	25 %	0 %	25 %	258540343
34500	NC_013199	CGC	2	6	2184199	2184204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540343

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