MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_013199	TGT	2	6	1954046	1954051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540129
31003	NC_013199	T	6	6	1954058	1954063	0 %	100 %	0 %	0 %	258540129
31004	NC_013199	CTT	2	6	1954083	1954088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540129
31005	NC_013199	CAG	2	6	1954095	1954100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540129
31006	NC_013199	TGC	2	6	1954114	1954119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540129
31007	NC_013199	GCA	2	6	1954241	1954246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540129
31008	NC_013199	CAA	2	6	1954311	1954316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540129
31009	NC_013199	TTG	2	6	1954354	1954359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540129
31010	NC_013199	CAAAC	2	10	1954417	1954426	60 %	0 %	0 %	40 %	258540129
31011	NC_013199	TTC	2	6	1954455	1954460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540129
31012	NC_013199	TGC	2	6	1954480	1954485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540129
31013	NC_013199	TTG	2	6	1954507	1954512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540129
31014	NC_013199	AAT	2	6	1954582	1954587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540129
31015	NC_013199	TGC	2	6	1954690	1954695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540129
31016	NC_013199	TGC	2	6	1954774	1954779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540129
31017	NC_013199	ACC	2	6	1954852	1954857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540129
31018	NC_013199	CTG	2	6	1954869	1954874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540129
31019	NC_013199	ACA	2	6	1954877	1954882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540129
31020	NC_013199	CAT	3	9	1954885	1954893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540129
31021	NC_013199	AAT	2	6	1954978	1954983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540129
31022	NC_013199	CACC	2	8	1955050	1955057	25 %	0 %	0 %	75 %	258540130
31023	NC_013199	CAG	2	6	1955071	1955076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540130
31024	NC_013199	ATC	2	6	1955103	1955108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540130
31025	NC_013199	GCA	2	6	1955166	1955171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540130
31026	NC_013199	CGC	2	6	1955244	1955249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540130
31027	NC_013199	GAA	2	6	1955278	1955283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540130
31028	NC_013199	TCA	2	6	1955512	1955517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540130
31029	NC_013199	GTT	2	6	1955520	1955525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540130
31030	NC_013199	TAA	2	6	1955594	1955599	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258540130
31031	NC_013199	TGA	2	6	1955696	1955701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540130
31032	NC_013199	AG	3	6	1955730	1955735	50 %	0 %	50 %	0 %	258540130
31033	NC_013199	GTT	2	6	1955740	1955745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540130
31034	NC_013199	AAGC	2	8	1955855	1955862	50 %	0 %	25 %	25 %	258540130
31035	NC_013199	AAAT	2	8	1955895	1955902	75 %	25 %	0 %	0 %	258540130
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31039	NC_013199	AAAT	2	8	1956119	1956126	75 %	25 %	0 %	0 %	258540130
31040	NC_013199	AACT	2	8	1956214	1956221	50 %	25 %	0 %	25 %	258540130
31041	NC_013199	CAAC	2	8	1956235	1956242	50 %	0 %	0 %	50 %	258540130
31042	NC_013199	GCA	2	6	1956244	1956249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540130
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31044	NC_013199	CGT	2	6	1956387	1956392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540130
31045	NC_013199	TGC	2	6	1956449	1956454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540130
31046	NC_013199	TCA	2	6	1957111	1957116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540131
31047	NC_013199	CTT	2	6	1957124	1957129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540131
31048	NC_013199	GCC	2	6	1957134	1957139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258540131
31049	NC_013199	CAT	2	6	1957291	1957296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540131
31050	NC_013199	ATCCGG	2	12	1957316	1957327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258540131
31051	NC_013199	TCA	2	6	1957329	1957334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540131
31052	NC_013199	CCGC	2	8	1957391	1957398	0 %	0 %	25 %	75 %	258540131
31053	NC_013199	CAT	2	6	1957402	1957407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540131
31054	NC_013199	CAA	2	6	1957415	1957420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540131
31055	NC_013199	TCT	2	6	1957426	1957431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540131
31056	NC_013199	CTT	3	9	1957442	1957450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540131
31057	NC_013199	ATCAA	2	10	1957452	1957461	60 %	20 %	0 %	20 %	258540131
31058	NC_013199	TGA	2	6	1957588	1957593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540132
31059	NC_013199	CCA	2	6	1957640	1957645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540132
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31061	NC_013199	A	7	7	1957681	1957687	100 %	0 %	0 %	0 %	258540132
31062	NC_013199	CT	3	6	1957754	1957759	0 %	50 %	0 %	50 %	258540132
31063	NC_013199	CGA	2	6	1957813	1957818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540132
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31066	NC_013199	TGC	2	6	1957990	1957995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540132
31067	NC_013199	TGC	2	6	1958008	1958013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540132
31068	NC_013199	TGC	2	6	1958091	1958096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540132
31069	NC_013199	CAAA	2	8	1958252	1958259	75 %	0 %	0 %	25 %	258540132
31070	NC_013199	GCCAT	2	10	1958318	1958327	20 %	20 %	20 %	40 %	258540132
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31083	NC_013199	AGCCA	2	10	1959075	1959084	40 %	0 %	20 %	40 %	258540133
31084	NC_013199	CATG	2	8	1959224	1959231	25 %	25 %	25 %	25 %	258540133
31085	NC_013199	CG	3	6	1959295	1959300	0 %	0 %	50 %	50 %	258540133
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31091	NC_013199	TAT	2	6	1959932	1959937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540135
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31099	NC_013199	ATG	2	6	1960613	1960618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540136
31100	NC_013199	GTT	2	6	1960648	1960653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540136
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31102	NC_013199	GC	3	6	1960880	1960885	0 %	0 %	50 %	50 %	258540136
31103	NC_013199	CTT	2	6	1960978	1960983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540136
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31232	NC_013199	ATG	2	6	1969582	1969587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540143
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31463	NC_013199	CAT	2	6	1987507	1987512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540161
31464	NC_013199	GGC	2	6	1987547	1987552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540161
31465	NC_013199	TCA	4	12	1987707	1987718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540161
31466	NC_013199	ATTC	2	8	1987744	1987751	25 %	50 %	0 %	25 %	258540161
31467	NC_013199	CAC	2	6	1987789	1987794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540161
31468	NC_013199	GTT	2	6	1987837	1987842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540161
31469	NC_013199	CTG	2	6	1987868	1987873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540161
31470	NC_013199	CTG	2	6	1987961	1987966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540161
31471	NC_013199	CTG	3	9	1987970	1987978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540161
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31474	NC_013199	GCG	2	6	1988027	1988032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540161
31475	NC_013199	CAC	2	6	1988044	1988049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540161
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31478	NC_013199	CTT	2	6	1988215	1988220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540161
31479	NC_013199	TTC	2	6	1988231	1988236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540161
31480	NC_013199	TCA	2	6	1988325	1988330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540161
31481	NC_013199	GGCA	2	8	1988386	1988393	25 %	0 %	50 %	25 %	258540161
31482	NC_013199	CCA	4	12	1988403	1988414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540161
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31484	NC_013199	TG	3	6	1988510	1988515	0 %	50 %	50 %	0 %	258540161
31485	NC_013199	TTC	2	6	1988540	1988545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540161
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31489	NC_013199	ACC	2	6	1988870	1988875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540161
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31491	NC_013199	TGA	2	6	1988989	1988994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540161
31492	NC_013199	GAC	2	6	1989074	1989079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540161
31493	NC_013199	CTC	2	6	1989120	1989125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	258540161
31494	NC_013199	ACC	2	6	1989153	1989158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258540161
31495	NC_013199	AAC	2	6	1989391	1989396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258540162
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31497	NC_013199	CACG	2	8	1989490	1989497	25 %	0 %	25 %	50 %	258540162
31498	NC_013199	GAA	2	6	1989518	1989523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258540162
31499	NC_013199	ATT	2	6	1989591	1989596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258540162
31500	NC_013199	A	6	6	1989614	1989619	100 %	0 %	0 %	0 %	258540162

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