MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29005	NC_013199	ACT	2	6	1822382	1822387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539998
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29011	NC_013199	CAA	2	6	1822744	1822749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258539998
29012	NC_013199	ATT	2	6	1822808	1822813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539998
29013	NC_013199	AATGC	2	10	1822890	1822899	40 %	20 %	20 %	20 %	258539998
29014	NC_013199	AGA	2	6	1823077	1823082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258539998
29015	NC_013199	GCCA	2	8	1823096	1823103	25 %	0 %	25 %	50 %	258539998
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29019	NC_013199	TCT	2	6	1823358	1823363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258539998
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29032	NC_013199	GTTT	2	8	1824181	1824188	0 %	75 %	25 %	0 %	258539999
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29102	NC_013199	CAT	2	6	1829150	1829155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540004
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29231	NC_013199	CCGC	2	8	1836777	1836784	0 %	0 %	25 %	75 %	258540011
29232	NC_013199	ATGA	2	8	1836811	1836818	50 %	25 %	25 %	0 %	258540011
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29234	NC_013199	GCG	2	6	1836911	1836916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540011
29235	NC_013199	GCCGAT	2	12	1836976	1836987	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	258540011
29236	NC_013199	TATT	2	8	1836992	1836999	25 %	75 %	0 %	0 %	258540011
29237	NC_013199	ATC	2	6	1837003	1837008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540011
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29241	NC_013199	CTGA	2	8	1837255	1837262	25 %	25 %	25 %	25 %	258540012
29242	NC_013199	GC	3	6	1837281	1837286	0 %	0 %	50 %	50 %	258540012
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29466	NC_013199	TAC	2	6	1852203	1852208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540028
29467	NC_013199	CTG	2	6	1852221	1852226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540028
29468	NC_013199	ATGC	2	8	1852242	1852249	25 %	25 %	25 %	25 %	258540028
29469	NC_013199	T	6	6	1852260	1852265	0 %	100 %	0 %	0 %	258540028
29470	NC_013199	CAGC	2	8	1852326	1852333	25 %	0 %	25 %	50 %	258540028
29471	NC_013199	GGC	2	6	1852366	1852371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258540028
29472	NC_013199	ATC	2	6	1852418	1852423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258540028
29473	NC_013199	GTT	2	6	1852472	1852477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540028
29474	NC_013199	GC	3	6	1852671	1852676	0 %	0 %	50 %	50 %	258540028
29475	NC_013199	TTC	2	6	1852678	1852683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540028
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29479	NC_013199	CGA	2	6	1852805	1852810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258540028
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29485	NC_013199	GC	3	6	1853014	1853019	0 %	0 %	50 %	50 %	258540028
29486	NC_013199	CTT	2	6	1853029	1853034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540028
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29488	NC_013199	CTT	2	6	1853121	1853126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540028
29489	NC_013199	CTT	2	6	1853133	1853138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258540028
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29491	NC_013199	AGT	2	6	1853371	1853376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540029
29492	NC_013199	CTCA	2	8	1853682	1853689	25 %	25 %	0 %	50 %	258540030
29493	NC_013199	AAAT	2	8	1853702	1853709	75 %	25 %	0 %	0 %	258540030
29494	NC_013199	GAT	2	6	1853762	1853767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540030
29495	NC_013199	TGA	2	6	1853844	1853849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258540030
29496	NC_013199	GTC	2	6	1853964	1853969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258540030
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29498	NC_013199	T	6	6	1854141	1854146	0 %	100 %	0 %	0 %	258540030
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29500	NC_013199	TGT	2	6	1854231	1854236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258540030

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