MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_013199	ATT	2	6	1110529	1110534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539317
17503	NC_013199	AGCA	2	8	1110543	1110550	50 %	0 %	25 %	25 %	258539317
17504	NC_013199	TCA	2	6	1110621	1110626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539317
17505	NC_013199	TGC	3	9	1110670	1110678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539317
17506	NC_013199	TTG	2	6	1110723	1110728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539317
17507	NC_013199	GCAG	2	8	1110784	1110791	25 %	0 %	50 %	25 %	258539317
17508	NC_013199	CAT	2	6	1110823	1110828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539317
17509	NC_013199	AGC	2	6	1110848	1110853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539317
17510	NC_013199	ATT	2	6	1110968	1110973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539317
17511	NC_013199	ATT	2	6	1110979	1110984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539317
17512	NC_013199	ATT	2	6	1111010	1111015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539317
17513	NC_013199	GCC	2	6	1111050	1111055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539317
17514	NC_013199	GCTG	2	8	1111098	1111105	0 %	25 %	50 %	25 %	258539317
17515	NC_013199	ATT	3	9	1111154	1111162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539317
17516	NC_013199	ATT	2	6	1111173	1111178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539317
17517	NC_013199	T	6	6	1111177	1111182	0 %	100 %	0 %	0 %	258539317
17518	NC_013199	TCAAAA	2	12	1111191	1111202	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	258539317
17519	NC_013199	TGGC	2	8	1111240	1111247	0 %	25 %	50 %	25 %	258539317
17520	NC_013199	TA	3	6	1111272	1111277	50 %	50 %	0 %	0 %	258539317
17521	NC_013199	ATT	2	6	1111281	1111286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539317
17522	NC_013199	TCTT	2	8	1111300	1111307	0 %	75 %	0 %	25 %	258539317
17523	NC_013199	CAG	2	6	1111426	1111431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539317
17524	NC_013199	TACT	2	8	1111569	1111576	25 %	50 %	0 %	25 %	258539318
17525	NC_013199	CAAC	2	8	1111598	1111605	50 %	0 %	0 %	50 %	258539318
17526	NC_013199	TCT	2	6	1111639	1111644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258539318
17527	NC_013199	TGG	2	6	1111682	1111687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539318
17528	NC_013199	ATC	2	6	1111716	1111721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539318
17529	NC_013199	TCA	2	6	1111738	1111743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539318
17530	NC_013199	CAA	2	6	1111765	1111770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258539318
17531	NC_013199	TTC	2	6	1111806	1111811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258539318
17532	NC_013199	GTC	2	6	1111933	1111938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539318
17533	NC_013199	CTT	2	6	1111964	1111969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258539318
17534	NC_013199	ATT	2	6	1111992	1111997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539318
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17537	NC_013199	T	6	6	1113028	1113033	0 %	100 %	0 %	0 %	258539319
17538	NC_013199	ATG	2	6	1113104	1113109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539319
17539	NC_013199	GTC	2	6	1113160	1113165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539319
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17542	NC_013199	TGA	2	6	1113294	1113299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539319
17543	NC_013199	GTT	2	6	1113304	1113309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539319
17544	NC_013199	GAT	2	6	1113358	1113363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539319
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17546	NC_013199	TTGG	2	8	1113388	1113395	0 %	50 %	50 %	0 %	258539319
17547	NC_013199	CAAC	2	8	1113406	1113413	50 %	0 %	0 %	50 %	258539319
17548	NC_013199	GAT	2	6	1113501	1113506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539319
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17550	NC_013199	AAGT	2	8	1113582	1113589	50 %	25 %	25 %	0 %	258539319
17551	NC_013199	TCA	2	6	1113924	1113929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539320
17552	NC_013199	GCTC	2	8	1113979	1113986	0 %	25 %	25 %	50 %	258539320
17553	NC_013199	TG	3	6	1114013	1114018	0 %	50 %	50 %	0 %	258539320
17554	NC_013199	CGG	2	6	1114105	1114110	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539320
17555	NC_013199	TGA	2	6	1114177	1114182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539320
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17557	NC_013199	CGG	2	6	1114273	1114278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539320
17558	NC_013199	TGA	2	6	1114330	1114335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539320
17559	NC_013199	AGCC	2	8	1114412	1114419	25 %	0 %	25 %	50 %	258539320
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17562	NC_013199	TCA	2	6	1114585	1114590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539320
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17565	NC_013199	GAT	2	6	1114799	1114804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539320
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17567	NC_013199	TGA	2	6	1114885	1114890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539320
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17605	NC_013199	A	6	6	1118666	1118671	100 %	0 %	0 %	0 %	258539325
17606	NC_013199	ACA	2	6	1118770	1118775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258539325
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17612	NC_013199	ATTT	2	8	1119215	1119222	25 %	75 %	0 %	0 %	258539325
17613	NC_013199	AAC	2	6	1119312	1119317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258539325
17614	NC_013199	TAT	2	6	1119331	1119336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539325
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