MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_013199	TCA	2	6	954279	954284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539155
15003	NC_013199	GTT	2	6	954343	954348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539155
15004	NC_013199	TTG	2	6	954407	954412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539155
15005	NC_013199	GTT	2	6	954463	954468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539155
15006	NC_013199	ATG	2	6	954500	954505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539155
15007	NC_013199	GTTC	2	8	954511	954518	0 %	50 %	25 %	25 %	258539155
15008	NC_013199	CAG	2	6	954532	954537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539155
15009	NC_013199	CAT	3	9	954562	954570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539155
15010	NC_013199	ATT	2	6	955014	955019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539156
15011	NC_013199	CGGA	2	8	955049	955056	25 %	0 %	50 %	25 %	258539156
15012	NC_013199	AGA	2	6	955084	955089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258539156
15013	NC_013199	TTA	2	6	955094	955099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539156
15014	NC_013199	AGA	2	6	955120	955125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258539156
15015	NC_013199	ACC	2	6	955226	955231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258539156
15016	NC_013199	GCA	2	6	955284	955289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539156
15017	NC_013199	TGA	2	6	955405	955410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539156
15018	NC_013199	CCG	2	6	955460	955465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539156
15019	NC_013199	TTG	2	6	955478	955483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539156
15020	NC_013199	ACC	2	6	955550	955555	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258539156
15021	NC_013199	ATC	2	6	955700	955705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539156
15022	NC_013199	ATG	2	6	955746	955751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539156
15023	NC_013199	ATC	2	6	955779	955784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539156
15024	NC_013199	AGA	2	6	955812	955817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258539156
15025	NC_013199	GGA	2	6	955822	955827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	258539156
15026	NC_013199	TTA	2	6	955839	955844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539157
15027	NC_013199	TGGG	2	8	955870	955877	0 %	25 %	75 %	0 %	258539157
15028	NC_013199	ATT	2	6	955899	955904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539157
15029	NC_013199	GAAG	2	8	955943	955950	50 %	0 %	50 %	0 %	258539157
15030	NC_013199	AGA	2	6	955970	955975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258539157
15031	NC_013199	TTA	2	6	956033	956038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539157
15032	NC_013199	TTA	2	6	956057	956062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539157
15033	NC_013199	ATC	2	6	956082	956087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539157
15034	NC_013199	GCG	2	6	956199	956204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539157
15035	NC_013199	AAG	2	6	956257	956262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258539157
15036	NC_013199	ATT	2	6	956319	956324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539157
15037	NC_013199	CAA	2	6	956325	956330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258539157
15038	NC_013199	CGG	2	6	956339	956344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539157
15039	NC_013199	GCCA	2	8	956353	956360	25 %	0 %	25 %	50 %	258539157
15040	NC_013199	CTT	2	6	956363	956368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258539157
15041	NC_013199	TTG	2	6	956494	956499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539157
15042	NC_013199	CGGA	2	8	956508	956515	25 %	0 %	50 %	25 %	258539157
15043	NC_013199	GTG	2	6	956574	956579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539157
15044	NC_013199	CGG	2	6	956604	956609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539157
15045	NC_013199	ATT	2	6	956819	956824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539158
15046	NC_013199	TCGTGG	2	12	956973	956984	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	258539158
15047	NC_013199	ATT	2	6	956995	957000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539158
15048	NC_013199	GTG	2	6	957094	957099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539158
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15051	NC_013199	ATGA	2	8	957205	957212	50 %	25 %	25 %	0 %	258539158
15052	NC_013199	GCT	2	6	957262	957267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539158
15053	NC_013199	A	6	6	957270	957275	100 %	0 %	0 %	0 %	258539158
15054	NC_013199	ATA	2	6	957323	957328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258539158
15055	NC_013199	GCT	2	6	957334	957339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539158
15056	NC_013199	TGA	2	6	957341	957346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539158
15057	NC_013199	TGG	2	6	957533	957538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539158
15058	NC_013199	CAC	2	6	957568	957573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258539158
15059	NC_013199	TTTGAT	2	12	957694	957705	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	258539158
15060	NC_013199	A	7	7	957800	957806	100 %	0 %	0 %	0 %	258539159
15061	NC_013199	ATG	2	6	957808	957813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539159
15062	NC_013199	CAG	2	6	957847	957852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539159
15063	NC_013199	CCG	2	6	957928	957933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258539159
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15071	NC_013199	CGT	2	6	958314	958319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539159
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15090	NC_013199	TGA	2	6	960420	960425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539160
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15101	NC_013199	CCAA	2	8	961450	961457	50 %	0 %	0 %	50 %	258539161
15102	NC_013199	CG	3	6	961498	961503	0 %	0 %	50 %	50 %	258539161
15103	NC_013199	TTG	2	6	961510	961515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539161
15104	NC_013199	GAT	2	6	961566	961571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539161
15105	NC_013199	GCCAA	2	10	961575	961584	40 %	0 %	20 %	40 %	258539161
15106	NC_013199	TTA	2	6	961714	961719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258539162
15107	NC_013199	TGGT	2	8	961750	961757	0 %	50 %	50 %	0 %	258539162
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15113	NC_013199	CTTG	2	8	962058	962065	0 %	50 %	25 %	25 %	258539162
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15117	NC_013199	CAG	2	6	962119	962124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539162
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15119	NC_013199	GCG	2	6	962190	962195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539162
15120	NC_013199	GACC	2	8	962211	962218	25 %	0 %	25 %	50 %	258539162
15121	NC_013199	AGC	2	6	962226	962231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258539162
15122	NC_013199	CCA	2	6	962290	962295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258539162
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15124	NC_013199	GGC	2	6	962380	962385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539162
15125	NC_013199	TTATGA	2	12	962429	962440	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	258539162
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15127	NC_013199	TGC	2	6	962544	962549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539162
15128	NC_013199	ACT	2	6	962557	962562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258539162
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15130	NC_013199	TTG	2	6	962831	962836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258539163
15131	NC_013199	TGGA	2	8	963062	963069	25 %	25 %	50 %	0 %	258539163
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15135	NC_013199	AATC	2	8	963195	963202	50 %	25 %	0 %	25 %	258539163
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15139	NC_013199	GAT	2	6	963400	963405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258539164
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15154	NC_013199	TGG	2	6	964433	964438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258539165
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15233	NC_013199	A	6	6	970070	970075	100 %	0 %	0 %	0 %	258539168
15234	NC_013199	TGATAT	2	12	970192	970203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	258539168
15235	NC_013199	TGAT	2	8	970206	970213	25 %	50 %	25 %	0 %	258539168
15236	NC_013199	GCG	2	6	970265	970270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539168
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15477	NC_013199	GCT	2	6	986170	986175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258539182
15478	NC_013199	GGC	3	9	986181	986189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258539182
15479	NC_013199	TTGT	2	8	986215	986222	0 %	75 %	25 %	0 %	258539182
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