MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_013199	TGC	2	6	561095	561100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538747
9003	NC_013199	CGA	2	6	561130	561135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538747
9004	NC_013199	AGCC	2	8	561168	561175	25 %	0 %	25 %	50 %	258538747
9005	NC_013199	TGAC	2	8	561243	561250	25 %	25 %	25 %	25 %	258538747
9006	NC_013199	CGG	2	6	561253	561258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538747
9007	NC_013199	GGT	2	6	561551	561556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538747
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9012	NC_013199	GCA	2	6	561828	561833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538747
9013	NC_013199	GCC	2	6	561881	561886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538747
9014	NC_013199	GAA	2	6	561950	561955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538747
9015	NC_013199	GAA	2	6	561959	561964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538747
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9017	NC_013199	A	6	6	562038	562043	100 %	0 %	0 %	0 %	258538747
9018	NC_013199	CAAG	2	8	562072	562079	50 %	0 %	25 %	25 %	258538747
9019	NC_013199	TTG	2	6	562085	562090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538747
9020	NC_013199	GGT	2	6	562121	562126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538747
9021	NC_013199	ATGA	2	8	562178	562185	50 %	25 %	25 %	0 %	258538747
9022	NC_013199	AAG	2	6	562206	562211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538747
9023	NC_013199	GCG	2	6	562257	562262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538747
9024	NC_013199	GTAATG	2	12	562279	562290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538747
9025	NC_013199	CGG	2	6	562294	562299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538747
9026	NC_013199	CCAG	2	8	562338	562345	25 %	0 %	25 %	50 %	258538747
9027	NC_013199	AAATT	2	10	562366	562375	60 %	40 %	0 %	0 %	258538747
9028	NC_013199	CAAA	2	8	562396	562403	75 %	0 %	0 %	25 %	258538747
9029	NC_013199	GAC	2	6	562415	562420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538747
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9033	NC_013199	ATCGCC	2	12	563544	563555	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	258538748
9034	NC_013199	ATGG	2	8	563637	563644	25 %	25 %	50 %	0 %	258538748
9035	NC_013199	TGGA	2	8	563693	563700	25 %	25 %	50 %	0 %	258538748
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9042	NC_013199	CTG	2	6	564127	564132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538749
9043	NC_013199	TGCA	2	8	564173	564180	25 %	25 %	25 %	25 %	258538749
9044	NC_013199	GATC	2	8	564228	564235	25 %	25 %	25 %	25 %	258538749
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9048	NC_013199	CTA	2	6	564375	564380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538749
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9054	NC_013199	CTTC	2	8	564853	564860	0 %	50 %	0 %	50 %	258538749
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9089	NC_013199	A	6	6	567458	567463	100 %	0 %	0 %	0 %	258538751
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9485	NC_013199	ATC	2	6	593437	593442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538774
9486	NC_013199	CGG	2	6	593468	593473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538774
9487	NC_013199	CACGGC	2	12	593499	593510	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	258538774
9488	NC_013199	GAT	2	6	593521	593526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538774
9489	NC_013199	TGC	2	6	593556	593561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538774
9490	NC_013199	GGC	2	6	593568	593573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538774
9491	NC_013199	AGA	2	6	593610	593615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538774
9492	NC_013199	AGA	2	6	593962	593967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538775
9493	NC_013199	GT	3	6	593973	593978	0 %	50 %	50 %	0 %	258538775
9494	NC_013199	GCGT	2	8	594015	594022	0 %	25 %	50 %	25 %	258538775
9495	NC_013199	TTTCT	2	10	594120	594129	0 %	80 %	0 %	20 %	258538775
9496	NC_013199	GCG	2	6	594134	594139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538775
9497	NC_013199	TGG	2	6	594153	594158	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538775
9498	NC_013199	TGCCA	2	10	594184	594193	20 %	20 %	20 %	40 %	258538775
9499	NC_013199	TGT	2	6	594223	594228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538775
9500	NC_013199	TTC	2	6	594239	594244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538775

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