MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus Lc 705 chromosome

Total Repeats: 46827

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013199	TGC	2	6	315674	315679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538506
5002	NC_013199	GC	3	6	315810	315815	0 %	0 %	50 %	50 %	258538506
5003	NC_013199	AAG	2	6	315822	315827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538506
5004	NC_013199	A	6	6	315863	315868	100 %	0 %	0 %	0 %	258538506
5005	NC_013199	GCCA	2	8	315950	315957	25 %	0 %	25 %	50 %	258538507
5006	NC_013199	ATG	2	6	315976	315981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538507
5007	NC_013199	ATG	2	6	316021	316026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538507
5008	NC_013199	CAGC	2	8	316095	316102	25 %	0 %	25 %	50 %	258538507
5009	NC_013199	A	6	6	316117	316122	100 %	0 %	0 %	0 %	258538507
5010	NC_013199	GTC	2	6	316144	316149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538507
5011	NC_013199	TTG	2	6	316151	316156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538507
5012	NC_013199	GC	3	6	316223	316228	0 %	0 %	50 %	50 %	258538507
5013	NC_013199	CAG	2	6	316254	316259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538507
5014	NC_013199	GCA	2	6	316329	316334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538507
5015	NC_013199	TG	4	8	316348	316355	0 %	50 %	50 %	0 %	258538507
5016	NC_013199	TAAA	2	8	316378	316385	75 %	25 %	0 %	0 %	258538507
5017	NC_013199	TCA	2	6	316421	316426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538507
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5019	NC_013199	GGC	2	6	316468	316473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538507
5020	NC_013199	AAT	2	6	316483	316488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	258538507
5021	NC_013199	CTG	2	6	316522	316527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538507
5022	NC_013199	TGG	2	6	316709	316714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538507
5023	NC_013199	TCT	2	6	316831	316836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538508
5024	NC_013199	TTG	2	6	316858	316863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538508
5025	NC_013199	GAT	2	6	316901	316906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538508
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5030	NC_013199	GC	3	6	317070	317075	0 %	0 %	50 %	50 %	258538508
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5033	NC_013199	CAAAA	2	10	317217	317226	80 %	0 %	0 %	20 %	258538508
5034	NC_013199	CTG	2	6	317319	317324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538508
5035	NC_013199	GTC	2	6	317358	317363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538508
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5037	NC_013199	ATG	2	6	317455	317460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538508
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5039	NC_013199	TCA	2	6	317573	317578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538509
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5041	NC_013199	CCTG	2	8	317627	317634	0 %	25 %	25 %	50 %	258538509
5042	NC_013199	ATAGGC	2	12	317662	317673	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	258538509
5043	NC_013199	CAAT	2	8	317766	317773	50 %	25 %	0 %	25 %	258538509
5044	NC_013199	GCC	2	6	317809	317814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538509
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5046	NC_013199	TGC	2	6	317929	317934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538509
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5051	NC_013199	GGC	2	6	318057	318062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538509
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5053	NC_013199	T	6	6	318223	318228	0 %	100 %	0 %	0 %	258538509
5054	NC_013199	CAT	2	6	318234	318239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538509
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5056	NC_013199	A	6	6	318361	318366	100 %	0 %	0 %	0 %	258538509
5057	NC_013199	CAG	2	6	318387	318392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538509
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5059	NC_013199	TGC	2	6	318481	318486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538509
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5061	NC_013199	CG	3	6	318657	318662	0 %	0 %	50 %	50 %	258538509
5062	NC_013199	TCA	2	6	318686	318691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538509
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5064	NC_013199	A	7	7	318737	318743	100 %	0 %	0 %	0 %	258538509
5065	NC_013199	AATA	2	8	318755	318762	75 %	25 %	0 %	0 %	258538509
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5071	NC_013199	CAAA	2	8	319176	319183	75 %	0 %	0 %	25 %	258538509
5072	NC_013199	CG	4	8	319184	319191	0 %	0 %	50 %	50 %	258538509
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5109	NC_013199	AAGA	2	8	321598	321605	75 %	0 %	25 %	0 %	258538511
5110	NC_013199	CG	3	6	321646	321651	0 %	0 %	50 %	50 %	258538511
5111	NC_013199	TGG	2	6	321686	321691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538511
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5115	NC_013199	TGA	2	6	321858	321863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538511
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5117	NC_013199	GCCAA	2	10	321964	321973	40 %	0 %	20 %	40 %	258538511
5118	NC_013199	AAG	2	6	321986	321991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538511
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5120	NC_013199	GCGA	2	8	322035	322042	25 %	0 %	50 %	25 %	258538511
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5122	NC_013199	AAG	2	6	322078	322083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538511
5123	NC_013199	GGC	2	6	322101	322106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538511
5124	NC_013199	ACG	2	6	322117	322122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538511
5125	NC_013199	A	7	7	322126	322132	100 %	0 %	0 %	0 %	258538511
5126	NC_013199	ACT	2	6	322147	322152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538511
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5128	NC_013199	GCT	2	6	322473	322478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538512
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5130	NC_013199	TGA	2	6	322733	322738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538512
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5132	NC_013199	GAC	2	6	322752	322757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538512
5133	NC_013199	GAT	2	6	322786	322791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538512
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5155	NC_013199	AT	3	6	324360	324365	50 %	50 %	0 %	0 %	258538512
5156	NC_013199	ATGA	2	8	324386	324393	50 %	25 %	25 %	0 %	258538512
5157	NC_013199	TGC	2	6	324448	324453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538513
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5161	NC_013199	GCCA	2	8	324660	324667	25 %	0 %	25 %	50 %	258538513
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5178	NC_013199	TGA	2	6	325420	325425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538514
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5211	NC_013199	GC	4	8	328593	328600	0 %	0 %	50 %	50 %	258538516
5212	NC_013199	TCA	2	6	328622	328627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538516
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5221	NC_013199	ATCAG	2	10	329075	329084	40 %	20 %	20 %	20 %	258538517
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5224	NC_013199	CAGC	2	8	329155	329162	25 %	0 %	25 %	50 %	258538517
5225	NC_013199	CATG	2	8	329204	329211	25 %	25 %	25 %	25 %	258538517
5226	NC_013199	TGCTT	2	10	329220	329229	0 %	60 %	20 %	20 %	258538517
5227	NC_013199	TGA	3	9	329247	329255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538517
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5230	NC_013199	CGG	2	6	329379	329384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538517
5231	NC_013199	TGT	2	6	329504	329509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538517
5232	NC_013199	CAA	2	6	329523	329528	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	258538517
5233	NC_013199	GAA	2	6	329563	329568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538517
5234	NC_013199	GAC	2	6	329575	329580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538517
5235	NC_013199	ATGTT	2	10	329699	329708	20 %	60 %	20 %	0 %	258538517
5236	NC_013199	ACCG	2	8	329769	329776	25 %	0 %	25 %	50 %	258538517
5237	NC_013199	TCAGG	2	10	329821	329830	20 %	20 %	40 %	20 %	258538517
5238	NC_013199	TTA	2	6	329917	329922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	258538518
5239	NC_013199	CGC	2	6	329929	329934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538518
5240	NC_013199	TTCT	2	8	329939	329946	0 %	75 %	0 %	25 %	258538518
5241	NC_013199	GAT	2	6	329987	329992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538518
5242	NC_013199	GTTG	2	8	330076	330083	0 %	50 %	50 %	0 %	258538518
5243	NC_013199	AGGC	2	8	330168	330175	25 %	0 %	50 %	25 %	258538518
5244	NC_013199	CAC	2	6	330193	330198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538518
5245	NC_013199	GAA	2	6	330260	330265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538518
5246	NC_013199	ATTT	2	8	330287	330294	25 %	75 %	0 %	0 %	258538518
5247	NC_013199	A	7	7	330407	330413	100 %	0 %	0 %	0 %	258538518
5248	NC_013199	TGA	2	6	330634	330639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538518
5249	NC_013199	TCA	2	6	330658	330663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538518
5250	NC_013199	CCA	2	6	330681	330686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	258538518
5251	NC_013199	GC	3	6	330739	330744	0 %	0 %	50 %	50 %	258538518
5252	NC_013199	ATG	2	6	330749	330754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538518
5253	NC_013199	GCT	2	6	330935	330940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538518
5254	NC_013199	GCT	2	6	330986	330991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538518
5255	NC_013199	GAC	2	6	331217	331222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538519
5256	NC_013199	TCGA	2	8	331227	331234	25 %	25 %	25 %	25 %	258538519
5257	NC_013199	CATT	2	8	331283	331290	25 %	50 %	0 %	25 %	258538519
5258	NC_013199	GAA	2	6	331544	331549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	258538519
5259	NC_013199	GAT	2	6	331566	331571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538519
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5264	NC_013199	GGC	2	6	331715	331720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	258538519
5265	NC_013199	GCA	2	6	331736	331741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	258538519
5266	NC_013199	GCCA	2	8	331784	331791	25 %	0 %	25 %	50 %	258538519
5267	NC_013199	TGAT	2	8	331810	331817	25 %	50 %	25 %	0 %	258538519
5268	NC_013199	TCGGC	2	10	331843	331852	0 %	20 %	40 %	40 %	258538519
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5273	NC_013199	TGG	2	6	332048	332053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538519
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5275	NC_013199	A	6	6	332182	332187	100 %	0 %	0 %	0 %	258538519
5276	NC_013199	CAAGC	2	10	332217	332226	40 %	0 %	20 %	40 %	258538519
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5281	NC_013199	CAT	2	6	332541	332546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538519
5282	NC_013199	TCA	2	6	332656	332661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	258538519
5283	NC_013199	TTTGA	2	10	332760	332769	20 %	60 %	20 %	0 %	258538519
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5344	NC_013199	TGAATG	2	12	336726	336737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	258538524
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5347	NC_013199	TTC	2	6	336821	336826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538524
5348	NC_013199	ATGA	2	8	336827	336834	50 %	25 %	25 %	0 %	258538524
5349	NC_013199	TTAA	2	8	336860	336867	50 %	50 %	0 %	0 %	258538524
5350	NC_013199	ATTA	2	8	336880	336887	50 %	50 %	0 %	0 %	258538524
5351	NC_013199	GTT	2	6	336902	336907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	258538524
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5353	NC_013199	ATGA	2	8	337019	337026	50 %	25 %	25 %	0 %	258538524
5354	NC_013199	TTC	2	6	337079	337084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	258538524
5355	NC_013199	GTG	3	9	337100	337108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	258538524
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5359	NC_013199	A	6	6	337322	337327	100 %	0 %	0 %	0 %	258538524
5360	NC_013199	A	6	6	337384	337389	100 %	0 %	0 %	0 %	258538524
5361	NC_013199	CGC	2	6	337399	337404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538524
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5484	NC_013199	GCC	2	6	342738	342743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	258538528
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5486	NC_013199	GCT	2	6	342863	342868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	258538528
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